SEARCH

Sequence

GENOMES

Enrichment analyses (GO, KEGG, KOG, NR, SwissProt) were conducted,
including CDS regions and upstream 2k sequences.

SW - BnaC01T110100SW

CDS Sequence (760 bp)
ATGCGACCGTTTATGTCTGGCTCGAGAGCTTTGTTCAGCTTAATATCATGTCGAAACGCAATCAGGAGCC
CGATCAGGAGTCGTGGCGGGATCGGTCAGAGGAGTTTTATATCGAATCGAATTGGGTCTGTTTCGGGGGT
AGAGAGATGCGGGTCCATGTCCAATGAAGACGATGATGCTAGAAGAGTCTCTCCCGGGACAGGGAGCTTA
ATTCAGAGACGGCATTTTCTGGGTTGCGGAGATGGGGAGGAAGGCGGTGGTGAGTTATCCAAGATCTACG
AAGAGCGTCGTGTCTTGGGGTATTCTCAGGAGCAATTGTTTAATGTAGTTCTAGCTGTAGACTTGTACCA
CGGCTTTGTTCCTTGGTGCCAACGCTCCGAGGTTCTTAAACAATATCCTGATGGCTCTTTCGACGCTGAA
CTGGAGATTGGTTTCAAGTTTCTCGTTGAGAGTTACATCTCCCATGTTGACTTCGAGAGACCGAAATGGA
TTAAGACAACAGCGAGGGACACCGGCCTGTTTGACCATTTAATCAACCTCTGGCAATTTAAGCCTGGTCC
CATTCCAGGAACCTGCGAGCTCTCTATCCTTGTCGATTTCAAATTCAACTCTCCTCTCTATCGCCAGGTG
GCTTCGATGTTCTTAAAGGAGGTAGCAACAAGACTCATCGGGGCATTTAGTGACCGATGCCGACTTGTGT
ATGGTCCTGGAGTTCCAGTCGATGAAAACTCATATGAACAAAAAGCTTGA
Upstream Sequence
GCTTGTTTTTTTGTAATAATGCGACCGTTTATGTCTGGCTCGAGAGCTTTGTTCAGCTTAATATCATGTC
GAAACGCAATCAGGAGCCCGATCAGGAGTCGTGGCGGGATCGGTCAGAGGAGTTTTATATCGAATCGAAT
TGGGTCTGTTTCGGGGGTAGAGAGATGCGGGTCCATGTCCAATGAAGACGATGATGCTAGAAGAGTCTCT
CCCGGGACAGGGAGCTTAATTCAGAGACGGCATTTTCTGGGTTGCGGAGATGGGGAGGAAGGCGGTGGTG
AGTTATCCAAGATCTACGAAGAGCGTCGTGTCTTGGGGTATTCTCAGGAGCAATTGTTTAATGTAGTTCT
AGCTGTAGACTTGTACCACGGCTTTGTTCCTTGGTGCCAACGCTCCGAGGTTCTTAAACAATATCCTGAT
GGCTCTTTCGACGCTGAACTGGAGATTGGTTTCAAGTTTCTCGTTGAGAGTTACATCTCCCATGTTGACT
TCGAGAGACCGAAATGGATTAAGACAACAGCGAGGGACACCGGCCTGTTTGACCATTTAATCAACCTCTG
GCAATTTAAGCCTGGTCCCATTCCAGGAACCTGCGAGCTCTCTATCCTTGTCGATTTCAAATTCAACTCT
CCTCTCTATCGCCAGGTGGCTTCGATGTTCTTAAAGGAGGTAGCAACAAGACTCATCGGGGCATTTAGTG
ACCGATGCCGACTTGTGTATGGTCCTGGAGTTCCAGTCGATGAAAACTCATATGAACAAAAAGCTTGATA
CATATCTATATATATATATATATATATATATAATGGAACTAACAATATCAGGTTAGTTTTCATGTTGTTT
GCTAGAGAGCGAGATTACCCCACAGCTTTTGTTGCATTTTTTTACATACATGAATTGCTTTTGCATAAGA
AGATCCAATTCTGTTTAATGTAAAAGCTGAAATTTATTATATCCGTTTCTCTTTTC
Downstream Sequence
GTAAGCCCATTACACTAAACTTCCATCCCATTTCGTGTTTCTTTTTTTCTTTTTTCCTTA
TCAATCTATCTATCTTCAGTTTAGATGTTTCGTTTTTTTTTTTTAAGTAGTTTCTCTGTG
TCTTGCCTTCAATCATCTGAAATTGCAAAACTTTGAGAGAAACATTGTTACATTGAGAAT
CCAGCAATACATAATCTAAATCTAATAACAAAGATTGAATTCACTCTTCCTTGTTGATTG
CAGGTATTCTCAGGAGCAATTGTTTAATGTAGTTCTAGCTGTAGACTTGTACCACGGCTT
TGTTCCTTGGTGCCAACGCTCCGAGGTTCTTAAACAATATCCTGATGGCTCTTTCGACGC
TGAACTGGAGATTGGTTTCAAGTTTCTCGTTGAGAGTTACATCTCCCATGTTGACTTCGA
GAGACCGAAATGGATTAAGGTAAGTAAGGACTTGCTTTCTTTTGTTGCTTTGTTTGTTTG
AGGGATGGAATCTTTTATGACATGTACTTTTCAGACAACAGCGAGGGACACCGGCCTGTT
TGACCATTTAATCAACCTCTGGCAATTTAAGCCTGGTCCCATTCCAGGAACCTGCGAGCT
CTCTATCCTTGTCGATTTCAAATTCAACTCTCCTCTCTATCGCCAGGTACTAATATTTTT
GCAGCATTATTGACGAAACCTTGAAAGTAGATTGAAAGTGTATCTCCTTTTTTTTTTTCT
TCTGAAGGTGGCTTCGATGTTCTTAAAGGAGGTAGCAACAAGACTCATCGGGGCATTTAG
TGACCGATGCCGACTTGTGTATGGTCCTGGAGTTCCAGTCGATGAAAACTCATATGAACA
AAAAGCTTGATACATATCTATATATATATATATATATATATATAATGGAACTAACAATAT
CAGGTTAGTTTTCATGTTGTTTGCTAGAGAGCGAGATTACCCCACAGCTTTTGTTGCATT
TTTTTACATACATGAATTGCTTTTGCATAAGAAGATCCAATTCTGTTTAATGTAAAAGCT
GAAATTTATTATATCCGTTTCTCTTTTCTTTTTTTGGGAGTCGTTTCTTTTATTCACAAC
ATGTCTTTTTTTAGTGTAGATAGTGATTGATTACAACACACAGGCTGACGTATGTGGTGG
CATAACTTGTAGGAATAAGCTTTCAAAAGCTAAAAAATGAAGTAGAGAGGAATTCAATTA
GATGGAAATTGAACATTATAAAACGAAATCAAAGATGTTAAAGTCCAGTCATAACCATTG
AACTTAAATGAAGAAATGGTCTTCTTTAGTCTTGTGTGTTAGTCTTTAATAGATGTGTCT
TCCTTAAAACCAATGTTCCACTTGATCGTATGAATGTAGTGGTTTATTAAAGCCTGTTAA
ACAGTAAAATTAGAGCTTACATCTTTGGAAGATATGGATACTTCAAATGGCATAAGTTTT
GTGCCCCACTTGTGTCCCATTCTTAACTTTCAAGTCTGTTGCAAATCAAGAAACCTCGCG
AAAGGAAAATGGATGAAAGATATCTTGCTTAACTACCATGCTTCTTTTGATCTGTTATCT
GAATAAGTTTAATACTATTGGATTCAATGCGCTTGGAGAGATTTGGAGTAAGCAAGTTGC
CACATATCAGAACCATGTGTTTATCTCATAGATGCTAAAACATTATCAGCTCATTTAATT
TACACTAGTGTTGTTCTTTGTGAATGATGAGTCGATTATCCATACAGTTGCTCATTCTCT
CTTCTTAAAAGACAAACAATTGGTCCAAATCTACAAAAGTCTGTTATTTTTACCTATCTG
TTACTAACAAGTCACAAGATCTTGTCAGTGATGAGGTTTTGGATGACTGATAATGTCCAT
TAAAATCTGGTGATGAGTCATATTTGGAGAAGACACAAGGTTCACATCGCACATCTCACT
CTTTAGCAATTCTTCATATCCTAAGGATATCTTTATCACAACAACTGAAAAACTCAAATC
ATGACCATTAACCAATGAGT
mRNA Sequence
GCTTGTTTTTTTGTAATAATGCGACCGTTTATGTCTGGCTCGAGAGCTTTGTTCAGCTTAATATCATGTC
GAAACGCAATCAGGAGCCCGATCAGGAGTCGTGGCGGGATCGGTCAGAGGAGTTTTATATCGAATCGAAT
TGGGTCTGTTTCGGGGGTAGAGAGATGCGGGTCCATGTCCAATGAAGACGATGATGCTAGAAGAGTCTCT
CCCGGGACAGGGAGCTTAATTCAGAGACGGCATTTTCTGGGTTGCGGAGATGGGGAGGAAGGCGGTGGTG
AGTTATCCAAGATCTACGAAGAGCGTCGTGTCTTGGGGTATTCTCAGGAGCAATTGTTTAATGTAGTTCT
AGCTGTAGACTTGTACCACGGCTTTGTTCCTTGGTGCCAACGCTCCGAGGTTCTTAAACAATATCCTGAT
GGCTCTTTCGACGCTGAACTGGAGATTGGTTTCAAGTTTCTCGTTGAGAGTTACATCTCCCATGTTGACT
TCGAGAGACCGAAATGGATTAAGACAACAGCGAGGGACACCGGCCTGTTTGACCATTTAATCAACCTCTG
GCAATTTAAGCCTGGTCCCATTCCAGGAACCTGCGAGCTCTCTATCCTTGTCGATTTCAAATTCAACTCT
CCTCTCTATCGCCAGGTGGCTTCGATGTTCTTAAAGGAGGTAGCAACAAGACTCATCGGGGCATTTAGTG
ACCGATGCCGACTTGTGTATGGTCCTGGAGTTCCAGTCGATGAAAACTCATATGAACAAAAAGCTTGATA
CATATCTATATATATATATATATATATATATAATGGAACTAACAATATCAGGTTAGTTTTCATGTTGTTT
GCTAGAGAGCGAGATTACCCCACAGCTTTTGTTGCATTTTTTTACATACATGAATTGCTTTTGCATAAGA
AGATCCAATTCTGTTTAATGTAAAAGCTGAAATTTATTATATCCGTTTCTCTTTTC
Pro Sequence
MRPFMSGSRALFSLISCRNAIRSPIRSRGGIGQRSFISNRIGSVSGVERCGSMSNEDDDARRVSPGTGSL
IQRRHFLGCGDGEEGGGELSKIYEERRVLGYSQEQLFNVVLAVDLYHGFVPWCQRSEVLKQYPDGSFDAE
LEIGFKFLVESYISHVDFERPKWIKTTARDTGLFDHLINLWQFKPGPIPGTCELSILVDFKFNSPLYRQV
ASMFLKEVATRLIGAFSDRCRLVYGPGVPVDENSYEQKA