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Detail for ZS11_A01G00120.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A01G00120.t1
ZS11_v0: BnaA01T0003200ZS
WE: WE_scaffold0003G02980.t1
WE_v0: Bnascaffold1716T0016900WE
Darmor: A01p00170.1_BnaDAR
BH: BnaA01T001600BH
Quinta: BnaA06T0431100QU
ZS2: BnaA01T002000ZS2
SW: BnaA01T002300SW
Express61: A01p000210.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA01G0002200XY
P202: BnaA01G000190P202.1
BL: BnaA01T001600BH
TA: BnaA01T001900TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g13300D
RB: BnaA01T000800RB
No2127: BnaA06T0448000NO
P130: BnaA01G000190P130.1
Length: 475
KOG ID: -
KOG E-value: Not available
KOG Score: Not available
KOG Annotation: -
Biological Process: GO:0005975(carbohydrate metabolic process)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0004553(hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds)
KEGG Ortholog: K01179 E3.2.1.4; endoglucanase [EC:3.2.1.4]
NR Protein: RID77090.1
NR E-value: 1.300000e-284
NR Score: 983.4
NR Annotation: RID77090.1 hypothetical protein BRARA_A00023 [Brassica rapa]
SwissProt Protein: Q93YQ7|GUN24_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 904.0
SwissProt Annotation: Endoglucanase 24 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g39010 PE=2 SV=1
CDS Sequence (1448 bp)
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CTTTGCAGCCAATCCTAGTTTTAGCTGA
Upstream Sequence
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GTGATGAAAGTTACCTTAGCTACATTGAGAGTAACCGTGAACCCTTTGGTGCTAGTGAGAACGTCGACGA
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GAACCAAACCCGAACGTTTTGATTGGAGCGGTGGTGGGTGGCCCCGGAGAGGATGATAAGTACGATGATG
ACCGGTCTGATTTCCGCAAGTCAGAGCCCACTACTTACATCAATGCTCCTTTCGTTGGTGTATTGGCTTA
CTTTGCAGCCAATCCTAGTTTTAGCTGA
Downstream Sequence
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TATGCGTTAAGGAGAGGGGTAGTTTCGGGAATTTCATAAGCTAAGGGAAACTGAGTCGTT
TTGGTTTGCCAAAGAAAGAAACCCGTGATCGTGTGAGTGGCTGTTTTGTTAATTTGCACT
CTCTCTCTACATTCACCCCCTTTTTTTATTGGTCGTTGCGTCACACTTTTTTGGCCCCTT
CCCTTTCCTTTAATTTAATTTAATTTCTCCTTTCTCATTACGAAATATATCATAAATTAA
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TCGAATGATTACTGCAAGAAATTAACTCTAAATCATACTTTAAGAGGAAAAAGTAATTAA
TTACTCTGTGATTTTACATTTCTATATATATACTTTGATTGTGTGCCCGCTCTTTATAGT
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AATATATTAGTGAATTTGATTATAGAATTGATTAACATTGATTTCATGGGTCGTTAGTAT
GATCATTTAATAATACAAGTTGGGATATGCGATGATAGAGACTCGAGACTCTCAGAAATG
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GTAGGTGATCCGATTGCAGATCATAATTGCTGGGAAAGACCTGAAGATATGGATACACCA
CGTACTGCTTACGTCGTAAATGCCCCAAATCCAGCTTCTGAAGTGGCTGGAGAAATCACA
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TTGCTCCAAAACGCTGTAAAAACGTTTCAGTTTGCTGATATGCACCGTGGTGCTTATAGC
AGCAATGATGATATCAAAAATGACGTTTGCCCTTTCTACTGCGATTTCAACGGATTTCAG
GTATAAAAAAACCCGAGTAATAAAAATTTCAACACGCAAAAAATTCATACAATCTTGATC
ATTATATATTACATTTTTTCTTGGTGATTTTTAATATAATTAATGTTGTTGGGATGCATG
GGTACGTGTAGGATGAGTTATTGTGGGGAGCAGCTTGGCTAAGAAAAGCGACTGGTGATG
AAAGTTACCTTAGCTACATTGAGAGTAACCGTGAACCCTTTGGTGCTAGTGAGAACGTCG
ACGAATTCGGTTGGGACAACAAAATTGGTGGACTTAATGTTCTCGTGTCCAAGGTTAGAT
ATTAAAGAAACATATCTATACTAACCTTTTTGATCAGAGTTACGTGATCAAATAGAAATC
ATAACTTTAATTAACTCTCGCAAGTAAAGCAAATGTAAACACGAGCATTTCACGTGCATG
TAAAGATTATGGCTGTAACTGGAAACTTAATCTAGGAATGTATGGAATAAATGGAATTGG
AATCAATGGAATAAAATGGAATGGAATAGTGATAATTTTTGGAATTAAAGGAATGATATA
TGTATTTATTTTTTAATTATATTCAAATTATTTCATTCCATCCATCCCTTTCATTCCTCC
TCttttttatcatgaatgatttttaacgtgattcctttttttcctcattCATCCCACAGG
AATTTATGGAATCAAAATTTTTGTTTTTTCCACTTAACTGGTGAATTTTTTTTGGAATGT
CTATGAATGACTAATTCCACATGATTCCATTCATAAAAAAAGCATTCCAGTTACAGCCTA
CGTTCTTTTCTTTCCGTGTACGTGAAAAACCCAACATGGCCCGGTTAAGACACAAAACAC
GGTATATATGGTAACCGATG
Pro Sequence
MSSNQHDYSDALSKSILFFEGQRSGYLPNDQRLTWRRNSGLSDGWTHSTD
LTGGYYDAGDNVKFNFPMAFTTTMLAWSVIEFGELMPPPELRNALVALRW
SSDYLLKSVSQLPNRIFVQVGDPIADHNCWERPEDMDTPRTAYVVNAPNP
ASEVAGEITAALSAASIAVRSSDPGYSQTLLQNAVKTFQFADMHRGAYSS
NDDIKNDVCPFYCDFNGFQDELLWGAAWLRKATGDESYLSYIESNREPFG
ASENVDEFGWDNKIGGLNVLVSKEVITGNMYNLEAYKASAESFMCSLVPE
SPGQHVEYTPGGLLYKPGGSQLQHATTISFLLLVYAQYLSRSSLSLNCGS
LSVPPDHLRRLAKKQVDYILGENPMGLSYMVGYGERYPKRIHHRGSSLPS
IVDHPGTIGCKDGSVYFNSTEPNPNVLIGAVVGGPGEDDKYDDDRSDFRK
SEPTTYINAPFVGVLAYFAANPSFS
mRNA Sequence
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GTGATGAAAGTTACCTTAGCTACATTGAGAGTAACCGTGAACCCTTTGGTGCTAGTGAGAACGTCGACGA
ATTCGGTTGGGACAACAAAATTGGTGGACTTAATGTTCTCGTGTCCAAGGAAGTTATAACAGGGAATATG
TACAACCTAGAGGCGTACAAGGCGTCAGCGGAGAGCTTCATGTGTAGTTTGGTGCCGGAGTCTCCGGGAC
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