SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_A03G25570.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A03G25570.t1
ZS11_v0: BnaC03T0271500ZS
WE: WE_A03G26610.t1
WE_v0: BnaC03T0208400WE
Darmor: A03p26190.1_BnaDAR
BH: BnaC03T291400BH
Quinta: BnaC03T0259400QU
ZS2: BnaA03T239200ZS2
SW: BnaC03T279900SW
Express61: A03p022860.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA03G0236400XY
P202: BnaA03G020300P202.2
BL: BnaC03T291400BH
TA: BnaA03T221600TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g38270D
RB: BnaA03T255500RB
No2127: BnaC03T0193800NO
P130: BnaA03G021210P130.1
Length: 262
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 2.840000e-168
KOG Score: 467.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: XP_013734927.1
NR E-value: 2.700000e-146
NR Score: 523.1
NR Annotation: XP_013734927.1 tropinone reductase homolog At2g29320 isoform X1 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9ZW15|TRNH9_ARATH
SwissProt E-value: 1.210000e-167
SwissProt Score: 467.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At2g29320 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g29320 PE=2 SV=1
CDS Sequence (800 bp)
ATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGTATG
ccatagtagaggaattagctaattttggagctaaaatccacgtatgtgacatatctgaaactctGCTCAA
TCAAAGTTTAAGTGAATGGGAAAATAAAGGGTTTCAAGTCAAAGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTCACGC
TCTGAGAGAGAAACATtgatacaacatgtctcctccctgttcgatggtaaactcaacattcttGTAAATA
ACGTGGGAGGACTTCGCGGGAAGCCAACAATAGAATATGTGGCAGAAGATTTTGCTTACCATAGCTCAAC
AAACTTGGAAGCTGCTTTTCATTTTTGCCAGCTTTCATATCCACTCTTAAAGGCTTCAGGTTATGGAAGC
ATCGTCTTCTTGTCTTCTGTTGCAGGGGTTGTATCATTTGAGTGTGGATCCATTTATGGTGTAACCAAAG
GAGCTCTGAACCAGCTAGCTAGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATAAGAGCCAATGCTGT
TGCACCTAATGTTGTCAAGACTCGACAGTCTCAATCTTATCTTGAGGACGTCAGTTTCAAGGAAAAATTG
TTCTGTAGAACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCGCTAGTGGTCTTCTTGTGTC
TACCTGCAGCGTCCTACATCACTGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACAGTTAACGGTTTCTC
CTATCAGTCACGGGCTTGA
Upstream Sequence
TATATTATCTGTGGCATTTCTGGTCATTGCTAATCATCACAAACAAAAACAAAAAAAAATGGATAAAAGA
TGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGTATGccatagtagagg
aattagctaattttggagctaaaatccacgtatgtgacatatctgaaactctGCTCAATCAAAGTTTAAG
TGAATGGGAAAATAAAGGGTTTCAAGTCAAAGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTCACGCTCTGAGAGAGAA
ACATtgatacaacatgtctcctccctgttcgatggtaaactcaacattcttGTAAATAACGTGGGAGGAC
TTCGCGGGAAGCCAACAATAGAATATGTGGCAGAAGATTTTGCTTACCATAGCTCAACAAACTTGGAAGC
TGCTTTTCATTTTTGCCAGCTTTCATATCCACTCTTAAAGGCTTCAGGTTATGGAAGCATCGTCTTCTTG
TCTTCTGTTGCAGGGGTTGTATCATTTGAGTGTGGATCCATTTATGGTGTAACCAAAGGAGCTCTGAACC
AGCTAGCTAGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATAAGAGCCAATGCTGTTGCACCTAATGT
TGTCAAGACTCGACAGTCTCAATCTTATCTTGAGGACGTCAGTTTCAAGGAAAAATTGTTCTGTAGAACT
CCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCGCTAGTGGTCTTCTTGTGTCTACCTGCAGCGT
CCTACATCACTGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACAGTTAACGGTTTCTCCTATCAGTCACG
GGCTTGAGATAATGGCCTTTTAGCGTTTTGTAACTGTCTTTAAACTTGAATAAAAACCTCACGATGTGAG
TGTGTATACGAAAACATAAACTTTTTCGCAGTTCCATTAGTTTCTTTTCTTCAAAAATAGAGAAGCATGC
TTCATT
Downstream Sequence
GGTACACCTTTCTTCTCAGTTTGATCTACAATATCACCTCTTTTAACCTTTCTTCTGATT
CTATTTAACATAATATATTTAAGGAACTGGAATGTCTAGGTATGccatagtagaggaatt
agctaattttggagctaaaatccacgtatgtgacatatctgaaactctGCTCAATCAAAG
TTTAAGTGAATGGGAAAATAAAGGGTTTCAAGTCAAAGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTC
ACGCTCTGAGAGAGAAACATtgatacaacatgtctcctccctgttcgatggtaaactcaa
cattcttgtaagtaaatggttttaataaacaagtaaacaaCTAAGCATATTCGGTAACGG
AACTTTTCTAAAGAGAAATCTTCCTTTTGTTCATATAGGTAAATAACGTGGGAGGACTTC
GCGGGAAGCCAACAATAGAATATGTGGCAGAAGATTTTGCTTACCATAGCTCAACAAACT
TGGAAGCTGCTTTTCATTTTTGCCAGCTTTCATATCCACTCTTAAAGGCTTCAGGTTATG
GAAGCATCGTCTTCTTGTCTTCTGTTGCAGGGGTTGTATCATTTGAGTGTGGATCCATTT
ATGGTGTAACCAAAGGTATTAATAGTTACTACTAGATGCAGTTTGCATGACTGACTAATC
AACAAATTTTTCTTCATTTTTTTAATATTTTGTTGAATTGCTTTTATTAGGAGCTCTGAA
CCAGCTAGCTAGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATAAGAGCCAATGCTGT
TGCACCTAATGTTGTCAAGACTCGACAGTCTCAATCTGTAATAATAATATATAATTTACA
GATCTTATTTTGTGAATTTAGCTACTGGCTTCCTCTAATCCCTAACTCACTTTTGTTTCT
TAAAGTATCTTGAGGACGTCAGTTTCAAGGAAAAATTGTTCTGTAGAACTCCACTTGGTC
GTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCGCTAGTGGTCTTCTTGTGTCTACCTGCAGCGT
CCTACATCACTGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACAGTTAACGGTTTCTCCT
ATCAGTCACGGGCTTGAGATAATGGCCTTTTAGCGTTTTGTAACTGTCTTTAAACTTGAA
TAAAAACCTCACGATGTGAGTGTGTATACGAAAACATAAACTTTTTCGCAGTTCCATTAG
TTTCTTTTCTTCAAAAATAGAGAAGCATGCTTCATTACTGATCCTTTTAATGATTTTCAA
ATTTATTCAACAAAAAACCAGTTTTGTACAATAAATGCTTCTTAGtttttttttttaagc
tatggctttatataaataaacattcttcttgtattaggaacttaattgagctatttacaa
ttttatagtaaataatatgttattattaatatttttattttattaatttttatttttttt
gcagaaaatattaattttataaaaaatatctactttgtaaaagctacatttatcctaaaa
cacatgaatacaaattataaaacaatttttagatagattaattttataattatgtaaata
ataatttatactataaaagttatattaatttaattaaatttgttagttatagttagggga
aattacatgtttaccactttcatggtaccacttttcatttttatcaccactaatgagaca
ttttcaaaaaatacatttttcattaagtggcaaaagactcttatgcccttgttatttata
tatataataaatcattatttcaataagaaaacaaaaaaaaataaaaaaagtaaaaaaata
aaaaaaaattaaaaataaaaaaataaaaagttaaaataaaaagttaaaataaaaaaaaaa
aatgtaaattttttttatgttttcgaattatactttttcaaatccaaacttttttataaa
aaaaaagatttttgattttttttttcgattttttttaatgtttttcaaatttctttttga
aaaacgaaatttgtgtttga
Pro Sequence
MDKRWSLQGMTALVTGGASGIGYAIVEELANFGAKIHVCDISETLLNQSL
SEWENKGFQVKGSVCDVTSRSERETLIQHVSSLFDGKLNILVNNVGGLRG
KPTIEYVAEDFAYHSSTNLEAAFHFCQLSYPLLKASGYGSIVFLSSVAGV
VSFECGSIYGVTKGALNQLARNLACEWAKDGIRANAVAPNVVKTRQSQSY
LEDVSFKEKLFCRTPLGRAGEPNEVASLVVFLCLPAASYITGQTICVDGG
LTVNGFSYQSRA
mRNA Sequence
TATATTATCTGTGGCATTTCTGGTCATTGCTAATCATCACAAACAAAAACAAAAAAAAATGGATAAAAGA
TGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGTATGccatagtagagg
aattagctaattttggagctaaaatccacgtatgtgacatatctgaaactctGCTCAATCAAAGTTTAAG
TGAATGGGAAAATAAAGGGTTTCAAGTCAAAGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTCACGCTCTGAGAGAGAA
ACATtgatacaacatgtctcctccctgttcgatggtaaactcaacattcttGTAAATAACGTGGGAGGAC
TTCGCGGGAAGCCAACAATAGAATATGTGGCAGAAGATTTTGCTTACCATAGCTCAACAAACTTGGAAGC
TGCTTTTCATTTTTGCCAGCTTTCATATCCACTCTTAAAGGCTTCAGGTTATGGAAGCATCGTCTTCTTG
TCTTCTGTTGCAGGGGTTGTATCATTTGAGTGTGGATCCATTTATGGTGTAACCAAAGGAGCTCTGAACC
AGCTAGCTAGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATAAGAGCCAATGCTGTTGCACCTAATGT
TGTCAAGACTCGACAGTCTCAATCTTATCTTGAGGACGTCAGTTTCAAGGAAAAATTGTTCTGTAGAACT
CCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCGCTAGTGGTCTTCTTGTGTCTACCTGCAGCGT
CCTACATCACTGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACAGTTAACGGTTTCTCCTATCAGTCACG
GGCTTGAGATAATGGCCTTTTAGCGTTTTGTAACTGTCTTTAAACTTGAATAAAAACCTCACGATGTGAG
TGTGTATACGAAAACATAAACTTTTTCGCAGTTCCATTAGTTTCTTTTCTTCAAAAATAGAGAAGCATGC
TTCATT