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Detail for ZS11_A01G00160.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A01G00160.t1
ZS11_v0: BnaA01T0003500ZS.1
WE: WE_scaffold0003G02940.t1
WE_v0: Bnascaffold286T0001900WE.1
Darmor: A01p00200.1_BnaDAR
BH: BnaA01T002000BH
Quinta: BnaC03T0654300QU
ZS2: BnaA01T002300ZS2
SW: BnaA01T002700SW
Express61: A01p000240.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA01G0002500XY
P202: BnaA01G000220P202.1
BL: BnaA01T002000BH
TA: BnaA01T002200TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g00340D
RB: BnaA01T001200RB
No2127: BnaC03T0584300NO
P130: BnaA01G000220P130.1
Length: 748
KOG ID: KOG2189
KOG E-value: Not available
KOG Score: 1397.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: GO:1902600(proton transmembrane transport)
Cellular Component: GO:0033179(proton-transporting V-type ATPase, V0 domain),GO:0000220(vacuolar proton-transporting V-type ATPase, V0 domain)
Molecular Function: GO:0046961(proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism)
KEGG Ortholog: K02154 ATPeV0A, ATP6N; V-type H+-transporting ATPase subunit a
NR Protein: VDC73524.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1466.1
NR Annotation: VDC73524.1 unnamed protein product [Brassica rapa]
SwissProt Protein: Q8W4S4|VHAA3_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 1422.0
SwissProt Annotation: V-type proton ATPase subunit a3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VHA-a3 PE=1 SV=1
CDS Sequence (2279 bp)
ATGGCACGTAAGATTCGTTTCTTCAAGGATCAAATGTCCAAAGCTGGAGTTTTACCCAAGGATTCGCTGG
AGAATGGAACTGATATCGACCTGGACGATGTCGAGGTTAAGCTTGGAGAGCTCGAAGCTGAACTTGTTGA
GATCAATGCCAATAATGACAAGTTACAGCGTTCCTATAATGAACTTATCGAGTACAAATTGGTCCTTGAG
AAGGCTGGCGAGTTCTTTTCTTCTGCTCATACAAGTGCTACGGCTCAACAGAGAGAGATAGATTCACAGC
AAGTGGGTGAAGATTTGCTGGAGGCTCCTTTATTGCAGGAAGACAAGTCTATTGATTCTTCAAAGCAAGT
AAAGCTTGGATTTCTCACCGGATTAGTACCCCGTGAAAAGTCAATGGTCTTTGAGAGGATTCTATTCCGT
GCTACTAGGGGCAACGTATTTATTCGACAGACTGTCATTGAGGAGCCGGTCATCGATCCCAACTCTGGGG
ACAAGGCTGAGAAAAATGTTTTTGTTGTCTTTTATTCCGGGGAAAGAGCAAAAAGCAAAATTCTTAAAAT
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GATGTGTCAGGTCGATTAACAGAGCTTAAAACCACCATAGATGCTGGTTTAGGTCACCGTAACATTTTGT
TGCACGCCATTGGAGATAAATTTGAGCTGTGGAACCTCAAGGTGCGCAAAGAGAAAGCTATCTATCATAC
TTTGAACATGCTTAGTCTTGATGTAACTAAGAAGTGCCTTGTGGCCGAGGGCTGGAGTCCTGTCTTTGCA
TCAAACGAAATTCAAAATGCATTAAAGCGTGCTGCAGTTGACTCCAATTCGCAAGTTGGATCAATATTCC
AGGTTCTGAGGACCAAAGAGTTGCCACCAACTTATTTTCGCACAAACAAATTTACTTCTGCAATTCAGGA
AATTGTTGATGCATATGGTGTGGCCAAGTATCAGGAAGCTAATCCTGGTGTATTCACAATCGTCACCTTC
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TGATAGTGAGAGAAAAGAAACTTTCCAGCCAGAAACTTGGGGACATTATGGAAATGGCTTTTGGTGGCCG
TTATGTTATAATGATGATGTCACTCTTCTCAATATACACTGGTTTAATCTACAACGAATTCTTCTCTATT
CCATACCCATTGTTTGCTCCCTCAGCCTATGACTGCCGTGATGCCTCATGCAGCGAGGCTACAACAATTG
GTTTGATAAAGGTGAGGGACACTTATCCATTTGGTCTAGATCCTGTGTGGCATGGTACCCGCAGCGAGCT
GCCGTTCCTGAACTCGCTGAAGATGAAAATGTCAATCCTTCTCGGAGTTTCTCAGATGAACCTCGGGATC
ATAATGAGCTACTTCAATGCAAGATTCTTCAAATCGAGTGTAAATATATGGTTCCAGTTCATTCCCCAGA
TGATATTCTTGAACAGCTTGTTTGGCTATCTCTCGGTCCTCATCATCATAAAGTGGTGCACTGGTTCTCA
AGCAGATTTGTATCATGTGATGATCTACATGTTCCTGAGCCCAACCGATGAGTTAGGAGAGAACCAACTT
TTCCCTCACCAGAAAACAGTGCAGCTGGTGCTTCTCTTTCTGGCTCTTGTTTCTGTTCCATGTATGTTGC
TTCCAAAGCCCTTCATCTTGAAGAAACAACATGAAGCTAGGCATCAAGGTCAGTCATACGCACCTCTTGA
GGAGACAGATGAGAGTCTTCATGTGGAGGCAAGCGGAGGATCCCATGGGCATGAGGAGTTTGAGTTCAGC
GAGATATTTGTGCATCAGCTGATTCACACCATAGAGTTTGTGCTCGGAGCTGTTTCCAACACCGCTTCTT
ACCTGCGTCTATGGGCTCTCAGTCTTGCACACTCAGAGCTATCGTCAGTCTTTTATGAGAAGGTCCTCCT
CCTCGCTTGGGGGTATAACAATTGGTTGATCCTGATCGTTGGGATAATCGTGTTCATATTCGCCACGGTG
GGAGTGCTGCTGGTGATGGAGACACTGAGTGCGTTCCTTCACGCACTGCGTCTACACTGGGTAGAGTTTC
AGAACAAATTCTACGAAGGAGATGGTTACAAGTTCGCTCCTTTCTCTTTCATTCTTACCGCAAACGAGGA
CGAGTGA
Upstream Sequence
atacgcatctatttcattttgacTTTGGCGTtTgGTTACTTTCGAGATCTTAAGAGATGATGATGAGATT
TAAGATTTTTACTCACCACAAAATTCATTGATCAATTGGTTTCTTTCACAGCTAAATTCAGAGAAGAGCC
CTTTTCAACGTACTTATGCTGCTCAGATAAAAAGATGTGGAGAGATGGCACGTAAGATTCGTTTCTTCAA
GGATCAAATGTCCAAAGCTGGAGTTTTACCCAAGGATTCGCTGGAGAATGGAACTGATATCGACCTGGAC
GATGTCGAGGTTAAGCTTGGAGAGCTCGAAGCTGAACTTGTTGAGATCAATGCCAATAATGACAAGTTAC
AGCGTTCCTATAATGAACTTATCGAGTACAAATTGGTCCTTGAGAAGGCTGGCGAGTTCTTTTCTTCTGC
TCATACAAGTGCTACGGCTCAACAGAGAGAGATAGATTCACAGCAAGTGGGTGAAGATTTGCTGGAGGCT
CCTTTATTGCAGGAAGACAAGTCTATTGATTCTTCAAAGCAAGTAAAGCTTGGATTTCTCACCGGATTAG
TACCCCGTGAAAAGTCAATGGTCTTTGAGAGGATTCTATTCCGTGCTACTAGGGGCAACGTATTTATTCG
ACAGACTGTCATTGAGGAGCCGGTCATCGATCCCAACTCTGGGGACAAGGCTGAGAAAAATGTTTTTGTT
GTCTTTTATTCCGGGGAAAGAGCAAAAAGCAAAATTCTTAAAATATGTGAAGCGTTTGGGGCCAATCGTT
ATCCTTTCAGTGAAGACCTTGGAAAACAAGCTCAAATGATAACTGATGTGTCAGGTCGATTAACAGAGCT
TAAAACCACCATAGATGCTGGTTTAGGTCACCGTAACATTTTGTTGCACGCCATTGGAGATAAATTTGAG
CTGTGGAACCTCAAGGTGCGCAAAGAGAAAGCTATCTATCATACTTTGAACATGCTTAGTCTTGATGTAA
CTAAGAAGTGCCTTGTGGCCGAGGGCTGGAGTCCTGTCTTTGCATCAAACGAAATTCAAAATGCATTAAA
GCGTGCTGCAGTTGACTCCAATTCGCAAGTTGGATCAATATTCCAGGTTCTGAGGACCAAAGAGTTGCCA
CCAACTTATTTTCGCACAAACAAATTTACTTCTGCAATTCAGGAAATTGTTGATGCATATGGTGTGGCCA
AGTATCAGGAAGCTAATCCTGGTGTATTCACAATCGTCACCTTCCCCTTCCTTTTCGCTGTTATGTTTGG
TGATTGGGGGCATGGAATATGTTTGCTGCTTGCAACTATGTACTTGATAGTGAGAGAAAAGAAACTTTCC
AGCCAGAAACTTGGGGACATTATGGAAATGGCTTTTGGTGGCCGTTATGTTATAATGATGATGTCACTCT
TCTCAATATACACTGGTTTAATCTACAACGAATTCTTCTCTATTCCATACCCATTGTTTGCTCCCTCAGC
CTATGACTGCCGTGATGCCTCATGCAGCGAGGCTACAACAATTGGTTTGATAAAGGTGAGGGACACTTAT
CCATTTGGTCTAGATCCTGTGTGGCATGGTACCCGCAGCGAGCTGCCGTTCCTGAACTCGCTGAAGATGA
AAATGTCAATCCTTCTCGGAGTTTCTCAGATGAACCTCGGGATCATAATGAGCTACTTCAATGCAAGATT
CTTCAAATCGAGTGTAAATATATGGTTCCAGTTCATTCCCCAGATGATATTCTTGAACAGCTTGTTTGGC
TATCTCTCGGTCCTCATCATCATAAAGTGGTGCACTGGTTCTCAAGCAGATTTGTATCATGTGATGATCT
ACATGTTCCTGAGCCCAACCGATGAGTTAGGAGAGAACCAACTTTTCCCTCACCAGAAAACAGTGCAGCT
GGTGCTTCTCTTTCTGGCTCTTGTTTCTGTTCCATGTATGTTGCTTCCAAAGCCCTTCATCTTGAAGAAA
CAACATGAAGCTAGGCATCAAGGTCAGTCATACGCACCTCTTGAGGAGACAGATGAGAGTCTTCATGTGG
AGGCAAGCGGAGGATCCCATGGGCATGAGGAGTTTGAGTTCAGCGAGATATTTGTGCATCAGCTGATTCA
CACCATAGAGTTTGTGCTCGGAGCTGTTTCCAACACCGCTTCTTACCTGCGTCTATGGGCTCTCAGTCTT
GCACACTCAGAGCTATCGTCAGTCTTTTATGAGAAGGTCCTCCTCCTCGCTTGGGGGTATAACAATTGGT
TGATCCTGATCGTTGGGATAATCGTGTTCATATTCGCCACGGTGGGAGTGCTGCTGGTGATGGAGACACT
GAGTGCGTTCCTTCACGCACTGCGTCTACACTGGGTAGAGTTTCAGAACAAATTCTACGAAGGAGATGGT
TACAAGTTCGCTCCTTTCTCTTTCATTCTTACCGCAAACGAGGACGAGTGATATGAATGGATGATGATGA
TTCATTCCCATCTCATCCTCTCTGCCATTTGCATATATAAAAGAGGCCCAGCTAGACCCAAGTTCTATTT
ATTTATTTTCCCCTTCTCTCTATATCTTTATTTATTTGCCTGTGTGGAGATCAGATTTTTTACAGACAAA
AAAAGAGAGGGGGATAATGGGATTTGTTTGAGACAAAACCCATTTGTTGTTGTGTTTGTGTTTGTTTGGA
ATTAAATAAAAATAATAATGAGCTGTGGGTATGACAAATAATGTGAGGATTTGGGACCTTTGTTTTATTA
ATAAGTAATAATTTTATGCTCG
Downstream Sequence
GTATTATTCAAGTCCCCACTCAATCTGCTTTCCTTTCCATTTTAACTCATATTTCTTTCT
CCTTATCAGGTTAAGCTTGGAGAGCTCGAAGCTGAACTTGTTGAGATCAATGCCAATAAT
GACAAGTTACAGCGTTCCTATAATGAACTTATCGAGTACAAATTGGTCCTTGAGAAGGTA
CACTTGTTTTCTTTTATTTTAGATTATTATTTACGGCCTTGAAGATGTTATGCTGTGCTT
CTCATGCTATATATATATCTGAATCTAGGCTGGCGAGTTCTTTTCTTCTGCTCATACAAG
TGCTACGGCTCAACAGAGAGAGATAGATTCACAGCAAGTGGGTGAAGATTTGCTGGAGGC
TCCTTTATTGCAGGAAGTACGATTGTTGCACCTCTTCTCGTTTTATATAGTTTGTTGTTT
AATCACTAATGCTTACAGTAATTCCTTCTAAACAGGACAAGTCTATTGATTCTTCAAAGC
AAGTAAAGCTTGGATTTCTCACCGGATTAGTACCCCGTGAAAAGTCAATGGTCTTTGAGA
GGATTCTATTCCGTGCTACTAGGGGCAACGTATTTATTCGACAGACTGTCATTGAGGAGC
CGGTCATCGATCCCAACTCTGGGGACAAGGTAGTTTGTCTCTTTGATCTAGAGAGCCAAG
AGTTCATTCAACACATGGAATGCTGATCTCGTTAGAAAACATATTTACTTTTCTGTCTCA
TTTCGAAATTGACTTTCTAACTCTAAAATAAATGCAGGCTGAGAAAAATGTTTTTGTTGT
CTTTTATTCCGGGGAAAGAGCAAAAAGCAAAATTCTTAAAATATGTGAAGCGTTTGGGGC
CAATCGTTATCCTTTCAGTGAAGACCTTGGAAAACAAGCTCAAATGATAACTGATGTATA
TATCATCTTTCTTGTGAATGTTGTTCTTGTGATAAACCTTTTTACTTCCCTGTATGGTTC
CTTCTTTGGACATGAGTTTTAGATGATAACAAAATATTGGGTATTCGCTAGTACTCAAGT
GTCCTGTAAAAGCTAATGCATGAGGTCATGATGTTTTGATGTACTGAAATTATGTGACTG
TTAGCTTTGAAGTTGGTTAGCGTCCATATAATGAAGATCCCGTTAACCCAGAAACTGTCT
AACCATGTTTAATTCTTTCACACCATTTCAGGTGTCAGGTCGATTAACAGAGCTTAAAAC
CACCATAGATGCTGGTTTAGGTCACCGTAACATTTTGTTGCACGCCATTGGAGATAAATT
TGAGCTGTGGAACCTCAAGGTATTATTCTGTTGAGTGGCCTGTGTTGACCCATCTGTTCT
AAACCATTCAAGTTTATGTTTACCAATTGCAGGTGCGCAAAGAGAAAGCTATCTATCATA
CTTTGAACATGCTTAGTCTTGATGTAACTAAGAAGTGCCTTGTGGCCGAGGGCTGGAGTC
CTGTCTTTGCATCAAACGAAGTGAGTTGTTCGTTTTGTTCACTGTCAATTGCATTTGAAT
ATTATATCGGGTGATCGTTTCAGAATACTTAAGTAGAATAAGGTTTGTTTGTGCAGATTC
AAAATGCATTAAAGCGTGCTGCAGTTGACTCCAATTCGCAAGTTGGATCAATATTCCAGG
TTCTGAGGACCAAAGAGTTGCCACCAACTTATTTTCGCACAAACAAATTTACTTCTGCAA
TTCAGGAAATTGTTGATGCATATGGGTAAGTGTCTTTCACTTTTTTCTGGAGCTTTTGAC
CCAGTTTAGGAAATATGAGATAGCCTTGGTATTATATAAAATGTGTAATAGACTGCATTT
AGTCTTGTCCTCGCTTCCTCTGATCAGTCTTCTATGATCACCACTTTGCAGTGTGGCCAA
GTATCAGGAAGCTAATCCTGGTGTATTCACAATCGTCACCTTCCCCTTCCTTTTCGCTGT
TATGTTTGGTGATTGGGGGCATGGAATATGTTTGCTGCTTGCAACTATGTACTTGATAGT
GAGAGAAAAGAAACTTTCCA
Pro Sequence
MARKIRFFKDQMSKAGVLPKDSLENGTDIDLDDVEVKLGELEAELVEINA
NNDKLQRSYNELIEYKLVLEKAGEFFSSAHTSATAQQREIDSQQVGEDLL
EAPLLQEDKSIDSSKQVKLGFLTGLVPREKSMVFERILFRATRGNVFIRQ
TVIEEPVIDPNSGDKAEKNVFVVFYSGERAKSKILKICEAFGANRYPFSE
DLGKQAQMITDVSGRLTELKTTIDAGLGHRNILLHAIGDKFELWNLKVRK
EKAIYHTLNMLSLDVTKKCLVAEGWSPVFASNEIQNALKRAAVDSNSQVG
SIFQVLRTKELPPTYFRTNKFTSAIQEIVDAYGVAKYQEANPGVFTIVTF
PFLFAVMFGDWGHGICLLLATMYLIVREKKLSSQKLGDIMEMAFGGRYVI
MMMSLFSIYTGLIYNEFFSIPYPLFAPSAYDCRDASCSEATTIGLIKVRD
TYPFGLDPVWHGTRSELPFLNSLKMKMSILLGVSQMNLGIIMSYFNARFF
KSSVNIWFQFIPQMIFLNSLFGYLSVLIIIKWCTGSQADLYHVMIYMFLS
PTDELGENQLFPHQKTVQLVLLFLALVSVPCMLLPKPFILKKQHEARHQG
QSYAPLEETDESLHVEASGGSHGHEEFEFSEIFVHQLIHTIEFVLGAVSN
TASYLRLWALSLAHSELSSVFYEKVLLLAWGYNNWLILIVGIIVFIFATV
GVLLVMETLSAFLHALRLHWVEFQNKFYEGDGYKFAPFSFILTANEDE
mRNA Sequence
atacgcatctatttcattttgacTTTGGCGTtTgGTTACTTTCGAGATCTTAAGAGATGATGATGAGATT
TAAGATTTTTACTCACCACAAAATTCATTGATCAATTGGTTTCTTTCACAGCTAAATTCAGAGAAGAGCC
CTTTTCAACGTACTTATGCTGCTCAGATAAAAAGATGTGGAGAGATGGCACGTAAGATTCGTTTCTTCAA
GGATCAAATGTCCAAAGCTGGAGTTTTACCCAAGGATTCGCTGGAGAATGGAACTGATATCGACCTGGAC
GATGTCGAGGTTAAGCTTGGAGAGCTCGAAGCTGAACTTGTTGAGATCAATGCCAATAATGACAAGTTAC
AGCGTTCCTATAATGAACTTATCGAGTACAAATTGGTCCTTGAGAAGGCTGGCGAGTTCTTTTCTTCTGC
TCATACAAGTGCTACGGCTCAACAGAGAGAGATAGATTCACAGCAAGTGGGTGAAGATTTGCTGGAGGCT
CCTTTATTGCAGGAAGACAAGTCTATTGATTCTTCAAAGCAAGTAAAGCTTGGATTTCTCACCGGATTAG
TACCCCGTGAAAAGTCAATGGTCTTTGAGAGGATTCTATTCCGTGCTACTAGGGGCAACGTATTTATTCG
ACAGACTGTCATTGAGGAGCCGGTCATCGATCCCAACTCTGGGGACAAGGCTGAGAAAAATGTTTTTGTT
GTCTTTTATTCCGGGGAAAGAGCAAAAAGCAAAATTCTTAAAATATGTGAAGCGTTTGGGGCCAATCGTT
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TAAAACCACCATAGATGCTGGTTTAGGTCACCGTAACATTTTGTTGCACGCCATTGGAGATAAATTTGAG
CTGTGGAACCTCAAGGTGCGCAAAGAGAAAGCTATCTATCATACTTTGAACATGCTTAGTCTTGATGTAA
CTAAGAAGTGCCTTGTGGCCGAGGGCTGGAGTCCTGTCTTTGCATCAAACGAAATTCAAAATGCATTAAA
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CCAACTTATTTTCGCACAAACAAATTTACTTCTGCAATTCAGGAAATTGTTGATGCATATGGTGTGGCCA
AGTATCAGGAAGCTAATCCTGGTGTATTCACAATCGTCACCTTCCCCTTCCTTTTCGCTGTTATGTTTGG
TGATTGGGGGCATGGAATATGTTTGCTGCTTGCAACTATGTACTTGATAGTGAGAGAAAAGAAACTTTCC
AGCCAGAAACTTGGGGACATTATGGAAATGGCTTTTGGTGGCCGTTATGTTATAATGATGATGTCACTCT
TCTCAATATACACTGGTTTAATCTACAACGAATTCTTCTCTATTCCATACCCATTGTTTGCTCCCTCAGC
CTATGACTGCCGTGATGCCTCATGCAGCGAGGCTACAACAATTGGTTTGATAAAGGTGAGGGACACTTAT
CCATTTGGTCTAGATCCTGTGTGGCATGGTACCCGCAGCGAGCTGCCGTTCCTGAACTCGCTGAAGATGA
AAATGTCAATCCTTCTCGGAGTTTCTCAGATGAACCTCGGGATCATAATGAGCTACTTCAATGCAAGATT
CTTCAAATCGAGTGTAAATATATGGTTCCAGTTCATTCCCCAGATGATATTCTTGAACAGCTTGTTTGGC
TATCTCTCGGTCCTCATCATCATAAAGTGGTGCACTGGTTCTCAAGCAGATTTGTATCATGTGATGATCT
ACATGTTCCTGAGCCCAACCGATGAGTTAGGAGAGAACCAACTTTTCCCTCACCAGAAAACAGTGCAGCT
GGTGCTTCTCTTTCTGGCTCTTGTTTCTGTTCCATGTATGTTGCTTCCAAAGCCCTTCATCTTGAAGAAA
CAACATGAAGCTAGGCATCAAGGTCAGTCATACGCACCTCTTGAGGAGACAGATGAGAGTCTTCATGTGG
AGGCAAGCGGAGGATCCCATGGGCATGAGGAGTTTGAGTTCAGCGAGATATTTGTGCATCAGCTGATTCA
CACCATAGAGTTTGTGCTCGGAGCTGTTTCCAACACCGCTTCTTACCTGCGTCTATGGGCTCTCAGTCTT
GCACACTCAGAGCTATCGTCAGTCTTTTATGAGAAGGTCCTCCTCCTCGCTTGGGGGTATAACAATTGGT
TGATCCTGATCGTTGGGATAATCGTGTTCATATTCGCCACGGTGGGAGTGCTGCTGGTGATGGAGACACT
GAGTGCGTTCCTTCACGCACTGCGTCTACACTGGGTAGAGTTTCAGAACAAATTCTACGAAGGAGATGGT
TACAAGTTCGCTCCTTTCTCTTTCATTCTTACCGCAAACGAGGACGAGTGATATGAATGGATGATGATGA
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AAAAGAGAGGGGGATAATGGGATTTGTTTGAGACAAAACCCATTTGTTGTTGTGTTTGTGTTTGTTTGGA
ATTAAATAAAAATAATAATGAGCTGTGGGTATGACAAATAATGTGAGGATTTGGGACCTTTGTTTTATTA
ATAAGTAATAATTTTATGCTCG