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Detail for ZS11_A03G62640.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A03G62640.t1
ZS11_v0: BnaA03T0551500ZS
WE: WE_A03G63300.t1
WE_v0: BnaA03T0557700WE
Darmor: A03p63820.1_BnaDAR
BH: BnaC07T559700BH
Quinta: BnaA03T0530500QU
ZS2: BnaC07T503900ZS2
SW: BnaC07T556300SW
Express61: A03p054290.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA03G0564700XY
P202: BnaA03G048630P202.1
BL: BnaC07T559700BH
TA: BnaA09T408700TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaC07T562200RB
No2127: BnaA03T0527000NO
P130: BnaA03G052450P130.1
Length: 187
KOG ID: -
KOG E-value: Not available
KOG Score: Not available
KOG Annotation: -
Biological Process: GO:0009813(flavonoid biosynthetic process)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016872(intramolecular lyase activity),GO:0045430(chalcone isomerase activity)
KEGG Ortholog: K01859 E5.5.1.6; chalcone isomerase [EC:5.5.1.6]
NR Protein: CDY47033.1
NR E-value: 3.700000e-97
NR Score: 359.4
NR Annotation: CDY47033.1 BnaAnng08210D [Brassica napus]
SwissProt Protein: O22651|CFI_RAPSA
SwissProt E-value: 9.970000e-92
SwissProt Score: 270.0
SwissProt Annotation: Chalcone--flavonone isomerase OS=Raphanus sativus OX=3726 GN=CHI PE=2 SV=1
CDS Sequence (572 bp)
ATGTTTTCTTCCGGCTCTCAGTTACCGTTACCCTCCGTCACGAATCTTCAAGTTGATTCCGTTAATTTTC
CACCGTCCGTCATCTCACCCGCTTCCTCCAACCCTCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGAGATAAGTTTGTGAT
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TTGA
Upstream Sequence
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CACCGTCCGTCATCTCACCCGCTTCCTCCAACCCTCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGAGATAAGTTTGTGAT
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TTGA
Downstream Sequence
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TTATTTGTTATTGCTAACATACGCAAGTGTGCAAGGTATTGATGTTGTAGGAGATAAGTT
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ATATCCAACTTTAATAAGATTATATTAAAATTGAAAAGATTTAGTGTTCATCAATCATCA
CAACTTAAAGTTTGTAGACA
Pro Sequence
MFSSGSQLPLPSVTNLQVDSVNFPPSVISPASSNPLFLGGAGDKFVITFF
GVYLDPVAVPLLSVKWKGKTTELMESVPFFREVVTGTFEKLIKVMMRVPL
PGQLYSQIITGTSVKIWKSLGIYTYSEAKAVERFLEVFKDEKFPRGASIL
FALSPEGSLTIAFSKDDSIPETGKAVIENKLLTEASS
mRNA Sequence
ATGTTTTCTTCCGGCTCTCAGTTACCGTTACCCTCCGTCACGAATCTTCAAGTTGATTCCGTTAATTTTC
CACCGTCCGTCATCTCACCCGCTTCCTCCAACCCTCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGAGATAAGTTTGTGAT
CACATTCTTCGGAGTTTACCTAGATCCTGTGGCCGTCCCGTTACTCTCCGTTAAGTGGAAAGGTAAAACG
ACGGAGTTAATGGAATCCGTCCCTTTCTTCCGTGAAGTCGTCACAGGTACTTTTGAGAAACTCATTAAGG
TGATGATGAGAGTGCCTTTACCGGGACAACTATATTCACAGATAATAACGGGGACCTCTGTGAAGATATG
GAAATCGTTAGGGATTTACACATACTCTGAGGCTAAAGCAGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGGAC
GAAAAGTTCCCTCGTGGTGCTTCCATCCTCTTCGCTCTCTCCCCTGAAGGCTCTCTTACGATTGCGTTTT
CGAAAGACGATAGCATTCCCGAAACGGGAAAAGCGGTGATCGAAAACAAGTTGTTGACAGAGGCCAGTTC
TTGA