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Detail for ZS11_A04G07660.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A04G07660.t1
ZS11_v0: BnaA04T0062700ZS
WE: WE_A04G07530.t1
WE_v0: BnaA04T0071300WE
Darmor: A04p07160.1_BnaDAR
BH: BnaA04T064000BH
Quinta: BnaA04T0052400QU
ZS2: BnaA04T063600ZS2
SW: BnaA03T143600SW
Express61: A04p005820.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA04G0064400XY
P202: BnaA03G011390P202.1
BL: BnaA04T064000BH
TA: BnaA04T065100TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g16770D
RB: BnaA04T067900RB
No2127: BnaA05T0068600NO
P130: BnaA03G011700P130.1
Length: 163
KOG ID: KOG3135
KOG E-value: 6.720000e-27
KOG Score: 101.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K03809 wrbA; NAD(P)H dehydrogenase (quinone) [EC:1.6.5.2]
NR Protein: RID62213.1
NR E-value: 3.200000e-52
NR Score: 209.9
NR Annotation: RID62213.1 hypothetical protein BRARA_E01300 [Brassica rapa]
SwissProt Protein: Q6NQE2|FQRL1_ARATH
SwissProt E-value: 4.660000e-27
SwissProt Score: 103.0
SwissProt Annotation: Probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27270 PE=1 SV=1
CDS Sequence (499 bp)
ATGTGGTTAGAGAATTTTTACAAGTTGATCAGAAGCTTGGCATCAAAGAAGTTAATGACTGAATTGTACT
ACTCAATGTACGGATATGTGGAGAAACTATTACAAGAGATTAGGAAAGTGCTGCTTCTCTTGATGGTGAT
CGATGCCAAACTCTGGCAGAATGACATGTACCAGAGACGCTCCAAAAAGACGTGCTCTCTAAATGAGTGG
ACCGCCAAAGAGTTTGGTATGATGGCTGCCCAGTTCAAGGTATTCTTAGACAAAATTGGTGGCCTCTGGA
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TTCCAAGAGTCCGACGAAGACGTCTGTGGGTTGTCATTTTTTTTTGAATCTTCAATTCTCACGACATATT
AA
Upstream Sequence
ATGTGGTTAGAGAATTTTTACAAGTTGATCAGAAGCTTGGCATCAAAGAAGTTAATGACTGAATTGTACT
ACTCAATGTACGGATATGTGGAGAAACTATTACAAGAGATTAGGAAAGTGCTGCTTCTCTTGATGGTGAT
CGATGCCAAACTCTGGCAGAATGACATGTACCAGAGACGCTCCAAAAAGACGTGCTCTCTAAATGAGTGG
ACCGCCAAAGAGTTTGGTATGATGGCTGCCCAGTTCAAGGTATTCTTAGACAAAATTGGTGGCCTCTGGA
GGATTCTACAACTTGCTGGTAAGCCAGCCGGAATCTTCTACAGCACCGGGGCTCAACGTGCTGGTCAAGA
ACCTCATCAACACTTGCTTCGATCCACCAGGACTTCTCGAATCCTATCTCTTAAGGTGATTTGGAATGGT
TTCCAAGAGTCCGACGAAGACGTCTGTGGGTTGTCATTTTTTTTTGAATCTTCAATTCTCACGACATATT
AA
Downstream Sequence
GGTTTTAACTTATTTCCCCTTCCATCCTGAAGGTTTTATAGGTTTCTTCTGCGATTTATT
GCTCGATTGCAAAACTTTTCAAAGTAGGTTTTGTTTAGATTAGCGCTGAACCGTCCCGTA
TTTATTCAATTTTGGGTTGGGGTTGTAGCTTAATCTTGACCTGTTCACGATTTTAAGAAA
CAAGATCTGTTTCCCTGAAGACGTATGAAATTCTGAGAGTGTGGCTCTGTTTAGTGTCCT
TAAACTTGTAGTTTCTTCCTGGATGCTTTAGTTATTACCAATAGACACGAGAATCTGTTT
TTTTATTATCTGCTATTAAGTTTGATGGCTTTTCTGACTGAGAATTTTTTTATCTTTAGA
ATTTTTACAAGTTGATCAGAAGCTTGGCATCAAAGAAGTTAATGACTGAATTGTAGGCAA
CGACTTTTCTCTCTTGGTTAATGTTATTGAGTTTGCCCTATAATTGTGATGGAGTGTAAC
AGGTACTACTCAATGTACGGATATGTGGAGAAACTATTACAAGAGATTAGGAAAGTGCTG
CTTCTCTTGATGGTGATCGATGCCAAACTCTGGCAGGTTAGTCAGTGATCTCTTTACTAG
CTTTTCTATGAAGCATATCTGACAATTATAGGCTACAATGAGACACAGAAACTGACCATG
AAATCTTTGAAACAGAATAGGAGTTGAAGTTAAAAACAAGTTCTTATGTGTGAATGAAAG
AGGGAATACATTTCTATATTTTTATTTACTGGTGAATGTCTTTTATTTGTCACCATTTTT
ATGCTATGTGATAATCTTTTGAGTGATTTAACATTTTTTATCTCACTGATGCATGTTTTC
AGCTACCTTAAATTTAACTTGCATCCTCTCAAAGAAATAAGAAGACATTCATACTGAAGC
ATCGAGCTAAGCTTTTGTTCTTAACAGAATGACATGTACCAGAGACGCTCCAAAAAGACG
TGCTCTCTAAATGAGTGGACCGCCAAAGAGTGATGCTCCTCTTATCACCCTCAATGACCT
TGCCAAGGCTGATGGCTTTGTCTTTTGCTTCCCAACAAGGTTTGGTATGATGGCTGCCCA
GTTCAAGGTATTCTTAGACAAAATTGGTGGCCTCTGGAGGATTCTACAACTTGCTGGTAA
GCCAGCCGGAATCTTCTACAGCACCGGGGCTCAACGTGCTGGTCAAGAACCTCATCAACA
CTTGCTTCGGTTTTTACGTTTTGGAGTGTTTACTTGTGTTGTCATTGATTTCTAACACAT
TTTTTTGTAATCTTTGTAAGCAGGATTCAGAACTATCGAACTAATTCTATTTTTATAAAT
CTTGATCTCATGCCAGTTAAGCAAACACCTTGAGCCTTTCCTCACTTTTTTTTTTTCTAA
ACATAACAATCAATATATATGTTTACAAGTACATGATTGGCCGCTTATGACATTTATAGC
ATATGGTGAGTTGTTTTTCAGTCACTTTTAACTCATTTTTAGTTATAGGATGAAAAATAA
AAAAAAAACAAATCCAGAAAGATCAAAGTTTAAAAATATAGTTATTTTAGTCAGAATCAA
GATTGAAAATTGATCCACGCACTTGAATTGAACTCGGAATTTTATCATATTTCAACTTTA
CTATTTGAATCAAACCAAAAACTAAATAACTAACTAAAACCAAACTTAAATTCATAAATA
ACCGAACAATTACTATATTTCTTGAACCAAAAACCAAAAACCACAACCAAATCGGAAACA
AAAAATACATTTTAGAAGTAAACTAAAAATCGAACGCACATAACTAAACATATTAGTGAA
CAAATTGACATGTTAATAAATTAATAATTACGCGCTTTGAAAGCGCGGGTCATATCCTAG
TCTATTCTATTAAAAGGGAATTAGTATTGAAAAATCTACTTAAACAAGGTTACTGCACCC
TTTCATTTAATTAATAGTATATTGGTCTACCTATTATTTCTCCTATCTATACTATTAAAA
GAGAATGAGTCTTAAAACAT
Pro Sequence
MWLENFYKLIRSLASKKLMTELYYSMYGYVEKLLQEIRKVLLLLMVIDAK
LWQNDMYQRRSKKTCSLNEWTAKEFGMMAAQFKVFLDKIGGLWRILQLAG
KPAGIFYSTGAQRAGQEPHQHLLRSTRTSRILSLKVIWNGFQESDEDVCG
LSFFFESSILTTY
mRNA Sequence
ATGTGGTTAGAGAATTTTTACAAGTTGATCAGAAGCTTGGCATCAAAGAAGTTAATGACTGAATTGTACT
ACTCAATGTACGGATATGTGGAGAAACTATTACAAGAGATTAGGAAAGTGCTGCTTCTCTTGATGGTGAT
CGATGCCAAACTCTGGCAGAATGACATGTACCAGAGACGCTCCAAAAAGACGTGCTCTCTAAATGAGTGG
ACCGCCAAAGAGTTTGGTATGATGGCTGCCCAGTTCAAGGTATTCTTAGACAAAATTGGTGGCCTCTGGA
GGATTCTACAACTTGCTGGTAAGCCAGCCGGAATCTTCTACAGCACCGGGGCTCAACGTGCTGGTCAAGA
ACCTCATCAACACTTGCTTCGATCCACCAGGACTTCTCGAATCCTATCTCTTAAGGTGATTTGGAATGGT
TTCCAAGAGTCCGACGAAGACGTCTGTGGGTTGTCATTTTTTTTTGAATCTTCAATTCTCACGACATATT
AA