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Detail for ZS11_A04G23510.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A04G23510.t1
ZS11_v0: BnaA04T0189000ZS
WE: WE_A04G24100.t1
WE_v0: BnaA04T0178900WE
Darmor: A04p22270.1_BnaDAR
BH: BnaA04T200800BH
Quinta: BnaA04T0185400QU
ZS2: BnaC04T475300ZS2
SW: BnaA04T206700SW
Express61: A04p018250.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA04G0192500XY
P202: BnaA04G014310P202.1
BL: BnaA04T200800BH
TA: BnaC04T478100TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g38270D
RB: BnaC04T531600RB
No2127: BnaA04T0135300NO
P130: BnaA04G019540P130.2
Length: 262
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 6.610000e-165
KOG Score: 458.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: XP_013744247.1
NR E-value: 9.400000e-147
NR Score: 524.6
NR Annotation: XP_013744247.1 tropinone reductase homolog At2g29310-like isoform X1 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9ZW14|TRNH8_ARATH
SwissProt E-value: 2.800000e-164
SwissProt Score: 458.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At2g29310 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g29310 PE=2 SV=1
CDS Sequence (800 bp)
ATGGATAAGAGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTTGTAACGGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGTATG
CCATAGTAGAGGAGTTAGCTAGCTTTGGGGCCAAAGTCCATGTATGCGACATATCTGAAACTTTGCTCAA
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Upstream Sequence
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TTCCTGCAGCTTCTTATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTAACGATTAACGGTTTCTC
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Downstream Sequence
GTTTGTCTTTCTTCTTTGTTAGATCTATATCAGCTCTTCTACTGAACACCCTGAATGGTC
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AGCTAGCTTTGGGGCCAAAGTCCATGTATGCGACATATCTGAAACTTTGCTCAATCAAAG
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ATAATTTTTAAAAATAAGATTTGATAAGAATTTGTGTATGCTCTTTCATTTTTGGTTAAT
TTTATATTATTAAAATAAAT
Pro Sequence
MDKRWSLQGMTALVTGGASGIGYAIVEELASFGAKVHVCDISETLLNQSL
SEWEKKGFQVSGSVCDVTSRPERETLIQKVSSLFDGKLNIFVNNVGVLRG
KPTIEYGADDFAFHISTNLESAYHISQLSHPLLKASGYGSIVFLSSVAGV
VFTSGGSIYSLTKGALNQLARNLACEWAKDSIRANAVAPNIIKTPLALPY
LEDVGFREGLFGRTPLGRAGEPHEVASLVVFLCLPAASYITGQTICVDGG
LTINGFSYQPQA
mRNA Sequence
ATGGATAAGAGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTTGTAACGGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGTATG
CCATAGTAGAGGAGTTAGCTAGCTTTGGGGCCAAAGTCCATGTATGCGACATATCTGAAACTTTGCTCAA
TCAAAGTTTAAGTGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTCTCGT
CCTGAGAGAGAAACTTTGATACAAAAAGTCTCCTCGCTGTTTGATGGCAAGCTCAACATTTTTGTGAACA
ATGTGGGAGTGCTTCGCGGAAAGCCAACAATAGAATATGGAGCAGACGATTTCGCTTTCCATATCTCAAC
AAACTTGGAATCTGCTTACCATATTAGCCAGCTTTCACATCCTCTCCTAAAGGCTTCAGGCTATGGGAGC
ATTGTCTTCTTGTCCTCTGTTGCAGGGGTTGTATTCACTAGCGGCGGATCCATTTACAGTCTAACCAAAG
GAGCTCTAAATCAGCTAGCTAGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACAGCATAAGAGCCAACGCTGT
TGCACCTAATATCATCAAGACTCCGCTGGCCCTACCTTATCTTGAGGACGTCGGGTTCAGGGAAGGCCTG
TTCGGTAGAACTCCACTTGGTCGAGCTGGAGAGCCGCATGAAGTTGCATCACTAGTGGTCTTCTTGTGTC
TTCCTGCAGCTTCTTATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTAACGATTAACGGTTTCTC
ATACCAACCACAAGCTTGA