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Detail for ZS11_A04G23540.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A04G23540.t1
ZS11_v0: BnaC04T0492200ZS
WE: WE_C04G60110.t1
WE_v0: BnaC04T0479500WE
Darmor: C04p58360.1_BnaDAR
BH: BnaA05T152200BH
Quinta: BnaC04T0435000QU
ZS2: BnaA04T192900ZS2
SW: BnaA04T207400SW
Express61: A04p018270.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA04G0192800XY
P202: BnaA04G014330P202.1
BL: BnaA05T152200BH
TA: BnaC04T184500TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g27480D
RB: BnaA04T205900RB
No2127: BnaC04T0450300NO
P130: BnaA04G019570P130.1
Length: 263
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 9.040000e-169
KOG Score: 468.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: XP_013744231.1
NR E-value: 1.200000e-146
NR Score: 524.2
NR Annotation: XP_013744231.1 tropinone reductase homolog At2g30670 [Brassica napus]
SwissProt Protein: O49332|TRNHE_ARATH
SwissProt E-value: 3.830000e-168
SwissProt Score: 468.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At2g30670 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g30670 PE=3 SV=1
CDS Sequence (803 bp)
ATGGATAATAGATGGAGTCTTGAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGGCAGCGGGATCGGGCATG
CCATAGTAGAGGAGCTAGCCAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGCGACATATCTGAAACACTGCTCAA
TCAGAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCCATATGTGATGTATCCTCTCGT
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GTTTACCTGCAGCTTCATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTT
CTCCTATCAGCCAAAGGCTTGA
Upstream Sequence
ATGGATAATAGATGGAGTCTTGAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGGCAGCGGGATCGGGCATG
CCATAGTAGAGGAGCTAGCCAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGCGACATATCTGAAACACTGCTCAA
TCAGAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCCATATGTGATGTATCCTCTCGT
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ATTGTCATGATTTCCTCTGTTGGAGGGGTTGTATCAATGTGCTGTGGATCCATCTATAGTCTGGCGAAAG
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TGCTCCTAATTTTGTCAACAATACTACTATGGCTAAACCTTTTTTCAAAGACGCTGATTACGAGAAGAGT
TTGTTAAACAGAACTCCACTTGGTCGGGCTGGAGAGCCAAACGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTCCTGT
GTTTACCTGCAGCTTCATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTT
CTCCTATCAGCCAAAGGCTTGA
Downstream Sequence
GGTTTGCCTTACTACTCTATTGCTACATCATATTTCTTACCCATTGTTTTGATTTTATTC
AAGATTCTCTAAATTAATTTTATTTGATTTTGTGAAATTTTATAGGCATGCCATAGTAGA
GGAGCTAGCCAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGCGACATATCTGAAACACTGCTCAA
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GCTGAGTATACTTGTAAGAAACTAAGCATATTCTCACAGGAAAAATTCTATTAAGTTGCA
AAATATATAGTACGTAAGGTTTATGTTACTCTTTTTGTTCAACATAGGTGAACAACGTTG
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CTGGATTTGGAAGCATTGTCATGATTTCCTCTGTTGGAGGGGTTGTATCAATGTGCTGTG
GATCCATCTATAGTCTGGCGAAAGGTACGCAGACTTCACTTACGTATATAATTCCCAAAT
GATGTTTGGTAAAAATGAATTATATTTTGAGTTAACGTTAATAAGTTGTTTTAAAGTGGT
ACGTCATGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGGTGGTACGTCAAAATTTATAGTTGGAAC
GGTTAATATTTGCACTTGTATATTATAAGTTATTTTAGATCCTATAGAGTAATTTATATA
TGAGATTCCCATTATAGTAAGTGCAGCACTTTTTACCAAATATATATGATCCCAGTGTCA
GAATTCGTTTAACTCTAATTAATTAGCTCGATGGATAATCCTTAATTTCACCAAAAATTA
CTTCCAATGGCTAGTTGATGTGATCATTCATTTCTGTAAAACCTTGTTGTGTAACGTTCA
GTCTAATTTTTCATTTTCTTTGTGTGTGTATGCGCAGGAGCTTTGAACCAACTAGCCAAA
AATTTGGCGTGTGAATGGGCAAGAGATGGCATAAGAACCAACTCTGTTGCTCCTAATTTT
GTCAACAATACTACTATGGCTAAACCTGTAACTAAAGACACCCTCCAGATTCTTTGTTTT
TTTTTTCTAAGTTTTCAATTAACGTTATGCACTTCTCATTCTTATGTCTATCTTGTGAAT
AACCAGTTTTTCAAAGACGCTGATTACGAGAAGAGTTTGTTAAACAGAACTCCACTTGGT
CGGGCTGGAGAGCCAAACGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTCCTGTGTTTACCTGCAGCT
TCATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTTCTCC
TATCAGCCAAAGGCTTGAGCTGTGACTTGTGTGTGTTGGTGATGCAGCGTACAAGTATAT
TTTAAATTGTTGTTGGGTTTTGTTTTAACCTTTGCTTCTATCACTAATAAAAACAAAAAT
AAGAAACTCTAGTTTTCTGTTACTATTGCACTCTTTGAGAATTCAATAGATTTGTGATGG
TTTGGTTAACAGTTGTCTCTGAAATCAATGTTTATCCATATCTTGCATCTATTATTTTGT
GTTCAAGTTAGTTGTTTTTTATTTACCATGTGGTTTAGAAGTTTTTTTTATTAATCAAGA
GTTCTGGACCCTTAAGCGTATACTTCTTCCTTCTTGGGTCGGAATGAGCATTTCAAGATT
ACTCTCAAGTACTGAACCTAAGACCTGACTTTTCACTCTTTTGGAAGGGTCATATATATT
TGATCTCTAGCTCTTAAATCTTAATTATATGGTTTTATTTTACTTGTAAATTATTTTCTC
AAACTCTCTCAAACAATATGGCCCTTAGTCAAAACTATATTCGAAGAAACCTTTATAAAA
ACGATTAAGGAGCTGAATGC
Pro Sequence
MDNRWSLEGMTALVTGGGSGIGHAIVEELASFGARIHVCDISETLLNQSL
SEWEKKGFQVSGSICDVSSRPERETLMQTVSAIFDGKLSILVNNVAVVHT
KPTTEYDANDFSFQISTNLESAYHLSQLSHPLLKASGFGSIVMISSVGGV
VSMCCGSIYSLAKGALNQLAKNLACEWARDGIRTNSVAPNFVNNTTMAKP
FFKDADYEKSLLNRTPLGRAGEPNEVASLVAFLCLPAASYITGQTICVDG
GLTVNGFSYQPKA
mRNA Sequence
ATGGATAATAGATGGAGTCTTGAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGGCAGCGGGATCGGGCATG
CCATAGTAGAGGAGCTAGCCAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGCGACATATCTGAAACACTGCTCAA
TCAGAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCCATATGTGATGTATCCTCTCGT
CCCGAGAGAGAAACACTTATGCAAACCGTCTCAGCGATATTTGATGGCAAGCTGAGTATACTTGTGAACA
ACGTTGCCGTGGTTCACACTAAGCCAACAACCGAATATGACGCGAACGATTTCTCGTTCCAAATTTCAAC
AAACTTGGAATCTGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTCACATCCTCTCCTCAAGGCTTCTGGATTTGGAAGC
ATTGTCATGATTTCCTCTGTTGGAGGGGTTGTATCAATGTGCTGTGGATCCATCTATAGTCTGGCGAAAG
GAGCTTTGAACCAACTAGCCAAAAATTTGGCGTGTGAATGGGCAAGAGATGGCATAAGAACCAACTCTGT
TGCTCCTAATTTTGTCAACAATACTACTATGGCTAAACCTTTTTTCAAAGACGCTGATTACGAGAAGAGT
TTGTTAAACAGAACTCCACTTGGTCGGGCTGGAGAGCCAAACGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTCCTGT
GTTTACCTGCAGCTTCATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTT
CTCCTATCAGCCAAAGGCTTGA