SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_A04G23570.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A04G23570.t1
ZS11_v0: BnaC04T0491300ZS
WE: WE_A04G24170.t1
WE_v0: BnaA04T0179400WE
Darmor: A04p22350.1_BnaDAR
BH: BnaA04T201500BH
Quinta: BnaA04T0186200QU
ZS2: BnaC04T475300ZS2
SW: BnaA04T207500SW
Express61: A04p018310.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA04G0193100XY
P202: BnaA04G014350P202.1
BL: BnaA04T201500BH
TA: BnaA04T196200TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g38270D
RB: BnaC04T531600RB
No2127: BnaA04T0136000NO
P130: BnaA04G019590P130.2
Length: 262
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 5.360000e-167
KOG Score: 463.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: XP_013747157.1
NR E-value: 9.400000e-147
NR Score: 524.6
NR Annotation: XP_013747157.1 tropinone reductase homolog At2g29310 isoform X1 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9ZW14|TRNH8_ARATH
SwissProt E-value: 2.270000e-166
SwissProt Score: 463.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At2g29310 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g29310 PE=2 SV=1
CDS Sequence (800 bp)
ATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGCATGACTGCTCTTGTAACCGGTGGAGCCGCAGGAATAGGGTATG
CCATAGTAGAGGAGTTAGCTAGCTTTGGGGCGAAAGTCCATGTATGCGACATATCTGAAACTTTGCTCAG
TCAAAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGTTTTAAAGTGAGTGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTCACGT
CCCGAGAGAGAAACTTTGATACAAAAAGTCTCCTCGTTATTTGATGGAAAACTCAACATTCTTGTGAACA
ATGTGGGTGTACTTCGAGGAAAGCCAACAACAGAATATGGGGCAGATGATTTTGCTTTCCATATCTCAAC
AAATTTGGAATCAGCTTACCATTTTTGCCAGCTTTCACACCCTCTCTTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGC
ATCGTTTTCATGTCCTCTGTTTCAGGGGCTGTATCGATTAACGGTGCATCCATATATAGTCTAACGAAAG
GAGCTCTGAATCAGCTAGCTAGGAATTTAGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATACGAGCCAACGCTGT
TGCACCTAATATCATCAAGACTCCTCAGGCTCAACCTTATCTTGAGGACGTCAGCTTCAGGGAAGGACTG
TTCGGTAGAACTCCACTTGGTCGAGCTGGAGAGCCTAATGAGGTTGCAGCACTAGTGGTTTTCTTGTGTC
TACCTGCAGCTTCATATATAACAGGTCAAACCATTTGCGCCGATGGAGGCCTCACGGTTAACTGTTTCTC
CTATCAACCACAGGCTTGA
Upstream Sequence
ATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGCATGACTGCTCTTGTAACCGGTGGAGCCGCAGGAATAGGGTATG
CCATAGTAGAGGAGTTAGCTAGCTTTGGGGCGAAAGTCCATGTATGCGACATATCTGAAACTTTGCTCAG
TCAAAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGTTTTAAAGTGAGTGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTCACGT
CCCGAGAGAGAAACTTTGATACAAAAAGTCTCCTCGTTATTTGATGGAAAACTCAACATTCTTGTGAACA
ATGTGGGTGTACTTCGAGGAAAGCCAACAACAGAATATGGGGCAGATGATTTTGCTTTCCATATCTCAAC
AAATTTGGAATCAGCTTACCATTTTTGCCAGCTTTCACACCCTCTCTTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGC
ATCGTTTTCATGTCCTCTGTTTCAGGGGCTGTATCGATTAACGGTGCATCCATATATAGTCTAACGAAAG
GAGCTCTGAATCAGCTAGCTAGGAATTTAGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATACGAGCCAACGCTGT
TGCACCTAATATCATCAAGACTCCTCAGGCTCAACCTTATCTTGAGGACGTCAGCTTCAGGGAAGGACTG
TTCGGTAGAACTCCACTTGGTCGAGCTGGAGAGCCTAATGAGGTTGCAGCACTAGTGGTTTTCTTGTGTC
TACCTGCAGCTTCATATATAACAGGTCAAACCATTTGCGCCGATGGAGGCCTCACGGTTAACTGTTTCTC
CTATCAACCACAGGCTTGA
Downstream Sequence
GTTTGTCTTACTTTCTCTTTATCATGTTTGTAACCGAAGGTTTTTCTTCTGTCAAAATTT
TAAAGAACTTGAATCTGTGGAATGTTTAGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTAGCTAGCTTT
GGGGCGAAAGTCCATGTATGCGACATATCTGAAACTTTGCTCAGTCAAAGTTTAAGCGAA
TGGGAAAAGAAAGGTTTTAAAGTGAGTGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTCACGTCCCGAG
AGAGAAACTTTGATACAAAAAGTCTCCTCGTTATTTGATGGAAAACTCAACATTCTTGTA
AGGATATTAATCATTCATATAGAAAGAACTAAGCATAATTCGTTTAAAAGAAATTGTGAC
AAAAAATCATTTGTTGTGTAACATAGGTGAACAATGTGGGTGTACTTCGAGGAAAGCCAA
CAACAGAATATGGGGCAGATGATTTTGCTTTCCATATCTCAACAAATTTGGAATCAGCTT
ACCATTTTTGCCAGCTTTCACACCCTCTCTTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTTT
TCATGTCCTCTGTTTCAGGGGCTGTATCGATTAACGGTGCATCCATATATAGTCTAACGA
AAGGTAATACTGACTAACCAACAACGACTTTATGTTTCTTTGTTTTGTTGACTCCTGAGT
CCTAAAACAAAATCTTATACAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCTAGGAATTTAGCATGTGAA
TGGGCAAAAGACGGCATACGAGCCAACGCTGTTGCACCTAATATCATCAAGACTCCTCAG
GCTCAACCTGTAATGAAAAAAAAAAAGAAATTTTACATTATTTTTTTCGTATTTGTGAAA
ACAACTTCCATTCCTCTAATCATCTCTCCATTTTTGTTTCTGGAAGTATCTTGAGGACGT
CAGCTTCAGGGAAGGACTGTTCGGTAGAACTCCACTTGGTCGAGCTGGAGAGCCTAATGA
GGTTGCAGCACTAGTGGTTTTCTTGTGTCTACCTGCAGCTTCATATATAACAGGTCAAAC
CATTTGCGCCGATGGAGGCCTCACGGTTAACTGTTTCTCCTATCAACCACAGGCTTGAAA
ATTGTCTTGTCATGTTTTGTGACTGTAATATTTTCTTTTGAATAAAAAAAACTCACGATA
TGAGGGTGTGCACGAACACATAAGCGAATTCACAATTCCATTCTGGAGATTCTAATCAGA
TTTGATTACACCAATACATTGCAGCAATGTCTCTCTCAGATATCAAAATGCTATATTGAA
TCATCTGTTTCTACTAAAACAAAATAGATTCTTAACTGAACATATAATCAGGGGAAACAA
AATTTTGGAATGATCACCCTGATTCTTTGGAAACATTTGGTCCTTTCAGTGTTTTTGCTT
TGAAACAGAGAGGCATAATTCACAAGATTCCAATTTGCCTTTGTGTAGATAAGCTTCTTT
ATACTGAATATTCAATCCTAGTATCATCTGATCTCCATACGAAGCTCTAAATTTCATACG
ATATTAAGTTGGGTATAAGTTCGCACATTGTGTTTTTGTTATCTTAAATGTTCCCTATGA
AGTAGTGTCTATATATGTAATATGTTATGTCTGCTACTCACAGGGAAAAAATGGTGACAG
ATGGAGTCTTGAAGGTGTGATTGCTCTTGGAACTGATGGAGTGAGCCCTTAGACCATCTC
CAATGGTTTATCCTATAATAGAATTGTGATATATTCTAATGGTAATTTATTTTAGAGTGA
AAAATAGAATGGTGAAAGAAAACAAAAACAACTTGCTCTATATATAAGTGTTCAAAAAGA
AAAAACTTGCTCTATATAGTAAACCCATTTTTTACGCTACCATAGAGTGAAAAAAAGAGC
AAGTTGATTTCATTTGTTAAATAAGCAAGTTGATGTCATTTGCAAGTTGTTAAATAAGCA
AGTTGATTTCATATGTTAATTTTATGCTTTGATGTTCTTTATTAAAGACGGATGCCCTTA
GAAGTCGTACCATGTCGCTC
Pro Sequence
MDKRWSLQGMTALVTGGAAGIGYAIVEELASFGAKVHVCDISETLLSQSL
SEWEKKGFKVSGSVCDVTSRPERETLIQKVSSLFDGKLNILVNNVGVLRG
KPTTEYGADDFAFHISTNLESAYHFCQLSHPLLKASGYGSIVFMSSVSGA
VSINGASIYSLTKGALNQLARNLACEWAKDGIRANAVAPNIIKTPQAQPY
LEDVSFREGLFGRTPLGRAGEPNEVAALVVFLCLPAASYITGQTICADGG
LTVNCFSYQPQA
mRNA Sequence
ATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGCATGACTGCTCTTGTAACCGGTGGAGCCGCAGGAATAGGGTATG
CCATAGTAGAGGAGTTAGCTAGCTTTGGGGCGAAAGTCCATGTATGCGACATATCTGAAACTTTGCTCAG
TCAAAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGTTTTAAAGTGAGTGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTCACGT
CCCGAGAGAGAAACTTTGATACAAAAAGTCTCCTCGTTATTTGATGGAAAACTCAACATTCTTGTGAACA
ATGTGGGTGTACTTCGAGGAAAGCCAACAACAGAATATGGGGCAGATGATTTTGCTTTCCATATCTCAAC
AAATTTGGAATCAGCTTACCATTTTTGCCAGCTTTCACACCCTCTCTTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGC
ATCGTTTTCATGTCCTCTGTTTCAGGGGCTGTATCGATTAACGGTGCATCCATATATAGTCTAACGAAAG
GAGCTCTGAATCAGCTAGCTAGGAATTTAGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATACGAGCCAACGCTGT
TGCACCTAATATCATCAAGACTCCTCAGGCTCAACCTTATCTTGAGGACGTCAGCTTCAGGGAAGGACTG
TTCGGTAGAACTCCACTTGGTCGAGCTGGAGAGCCTAATGAGGTTGCAGCACTAGTGGTTTTCTTGTGTC
TACCTGCAGCTTCATATATAACAGGTCAAACCATTTGCGCCGATGGAGGCCTCACGGTTAACTGTTTCTC
CTATCAACCACAGGCTTGA