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Detail for ZS11_A05G04960.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A05G04960.t1
ZS11_v0: BnaA05T0045900ZS
WE: WE_A05G04760.t1
WE_v0: BnaA05T0035400WE
Darmor: A05p04680.1_BnaDAR
BH: BnaA05T050900BH
Quinta: BnaA05T0041800QU
ZS2: BnaC04T050100ZS2
SW: BnaC04T051400SW
Express61: A05p004300.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA05G0043100XY
P202: BnaA05G004560P202.2
BL: BnaA05T050900BH
TA: BnaA05T045600TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaC04T048200RB
No2127: BnaC04T0049800NO
P130: BnaA05G004180P130.3
Length: 170
KOG ID: KOG3363
KOG E-value: 1.190000e-117
KOG Score: 331.0
KOG Annotation: Function unknown
Biological Process: GO:0032981(mitochondrial respiratory chain complex I assembly)
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K09008 NDUFAF3; NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3
NR Protein: XP_013748008.1
NR E-value: 6.200000e-91
NR Score: 338.6
NR Annotation: XP_013748008.1 uncharacterized protein LOC106450790 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q6DFN1|NDUF3_XENTR
SwissProt E-value: 4.650000e-17
SwissProt Score: 77.4
SwissProt Annotation: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=ndufaf3 PE=2 SV=1
CDS Sequence (520 bp)
ATGGCGACGAGGCTGAAATCGATGACGACTTTGCCAAAACTAATTCAAACCATGAGAAAGGAAGCTCCTA
AGCATTCTAATCCAGTTTTGCCATCGTTAAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACCAGATCAATCTCATTGA
CAATGTCCCCGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGAGTTTAATGAGACGAGTTTCACGGTGAATGGAGTCAAA
TACGAAGGTAGCTTGCTCTGTGTCGGGAACTTGCTTATGTCGTGGAGCCCTCGTCAATTCTCCGACATCA
CCCCTGATAGTTTGTCTATCTTCAAGACGATTCGACCCATTCCAGAGCTCTTAATTGTTGGTTGTGGAAG
AAACATTCACCCTGTAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCAAGTCTATTGGCATGAAGCTAGAAACCGTT
GATTCTAGAAACGCTGCATCAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTGCATTGC
TTCCTTATGGAGTTACATCTTAA
Upstream Sequence
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ATTCTAATCCAGTTTTGCCATCGTTAAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACCAGATCAATCTCATTGACAA
TGTCCCCGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGAGTTTAATGAGACGAGTTTCACGGTGAATGGAGTCAAATAC
GAAGGTAGCTTGCTCTGTGTCGGGAACTTGCTTATGTCGTGGAGCCCTCGTCAATTCTCCGACATCACCC
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TCTAGAAACGCTGCATCAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTGCATTGCTTC
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GCTTAATAACATTGTAACAAACACACATGACCGGTTCTGAGATTTATGGAAATTTGAAATAGTTACAGTT
TGTAACAAACAGAAAC
Downstream Sequence
GTAATCAATCAATTCGAAAGCATCTGCCTTTTTGGGTTTTAGTGAATGATCTGCGTTGGT
TTGGTTTGTTCAGGTTTAATGAGACGAGTTTCACGGTGAATGGAGTCAAATACGAAGGTA
GCTTGCTCTGTGTCGGGAACTTGCTTATGTCGTGGAGCCCTCGTCAATTCTCCGACATCA
CCCCTGATAGGTAGGCAAAAAGCTCTTGTCCCATGACAAAAGGTTGAGACTTTAAGCTAT
GTACATACTTGGTCTTGGATTCTAACCAATGCTATGTCACAAACTAATGTTTTGAGTGAA
ATTAAGTGTTTTTGATGTTCGTTGTCATCAAAGTTATGTGCTTTTTGATAACTAGTGGCT
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CTTTGATTGAGGGGTTTGTGGTATATGTTTGATAAGTGTTCTCTGTATAGTATATGGATA
AGTGTTTTTGATAAGCAGTGGCTTAACGTCTCTACATTTCGCTTTTCATGGTTGCAGTTT
GTCTATCTTCAAGACGATTCGACCCATTCCAGGTGATAATACATCAAATACTATTTGTTT
CTCGGTCAATTTGTACAACAAAGAAACTAAATGATACATATGAAAAAAACAGCCGCATTG
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GTAATATGTTGAGCTGTGTTTTTTTTTTTTTCATTTCAGAGCTCTTAATTGTTGGTTGTG
GAAGAAACATTCACCCTGTAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCAAGTCTATTGGCATGA
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ACCCAAGCTTGCTTCTTATGCATTTATATTGATTTGCTTGATTCAGAGAAACGCTGCATC
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AGTTACATCTTAAGGAATTAAAAAAAAGGCTAGCAGCTCTGAGTTCGGTCCTGTAGATCT
ATAGATGAATGTTGAGACTTCCTATTGTGAAAATAAACCGAAATCAAACGGCTTTTTTTT
TCTTGCTTCTCGAGCTTAATAACATTGTAACAAACACACATGACCGGTTCTGAGATTTAT
GGAAATTTGAAATAGTTACAGTTTGTAACAAACAGAAACCTTTATTGCATTTTTCACTTT
TCAATATGTTCCGTTTAGATATAAGTTTCAGAGAAAAAAATTGTTTCGCAAAGATAAATT
TTCTATGCAGAAATTATAAGCTTCAAAAATTCATTTTAGTTTATTGAATCGCTATTAGTT
GAAAGTTATTGGAAACGATAATTACAAAAAGTTATAACAATTTAATATATATTTTTAGAT
GTGTGGAAACTCTAAAAAAAATATAAGAACAGATGTAGTCTAGAGTTTTCTTTCTGTGAT
GATTCTGTTGTGGCAATGAGTGAttaaaggttcgctttcagtctaggattccgagtgTTT
GGTTATATAGATAACTAGACTGTAAGAATATAAATGTTGTCAGTGCCTTGCTTACATGAA
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CTTATAATTTGTATCATGTAATGGTATTCTATATAAACATGTAGCTTCGTTAATAGCTTC
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AATTGAAAACATTTGTTAATTATTTAAAAGTTGTATATATAAAAAATTTTGTTGCACACA
AAACTACAATAGCTTTCATATTATTGTAGATATTTTTTATTTGATCTTGGTTTTCGCTTG
CGGCAGCTGTTAACGTTGGC
Pro Sequence
MATRLKSMTTLPKLIQTMRKEAPKHSNPVLPSLRRAFSLYDQINLIDNVP
EDQLRFQEFNETSFTVNGVKYEGSLLCVGNLLMSWSPRQFSDITPDSLSI
FKTIRPIPELLIVGCGRNIHPVTPELRQFVKSIGMKLETVDSRNAASTYN
ILNEEGRVVAAALLPYGVTS
mRNA Sequence
GTTAAATGCTTCGACGGCTACCATCAGGAGGAAGACAGTAACCTGGTGGTTGGGAGGCTGAGATTCGATG
GCGACGAGGCTGAAATCGATGACGACTTTGCCAAAACTAATTCAAACCATGAGAAAGGAAGCTCCTAAGC
ATTCTAATCCAGTTTTGCCATCGTTAAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACCAGATCAATCTCATTGACAA
TGTCCCCGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGAGTTTAATGAGACGAGTTTCACGGTGAATGGAGTCAAATAC
GAAGGTAGCTTGCTCTGTGTCGGGAACTTGCTTATGTCGTGGAGCCCTCGTCAATTCTCCGACATCACCC
CTGATAGTTTGTCTATCTTCAAGACGATTCGACCCATTCCAGAGCTCTTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAA
CATTCACCCTGTAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCAAGTCTATTGGCATGAAGCTAGAAACCGTTGAT
TCTAGAAACGCTGCATCAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTGCATTGCTTC
CTTATGGAGTTACATCTTAAGGAATTAAAAAAAAGGCTAGCAGCTCTGAGTTCGGTCCTGTAGATCTATA
GATGAATGTTGAGACTTCCTATTGTGAAAATAAACCGAAATCAAACGGCTTTTTTTTTCTTGCTTCTCGA
GCTTAATAACATTGTAACAAACACACATGACCGGTTCTGAGATTTATGGAAATTTGAAATAGTTACAGTT
TGTAACAAACAGAAAC