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Detail for ZS11_A05G16350.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A05G16350.t1
ZS11_v0: BnaA05T0141500ZS
WE: WE_A05G15710.t1
WE_v0: BnaA05T0140200WE
Darmor: A05p16070.1_BnaDAR
BH: BnaC04T189800BH
Quinta: BnaC04T0177800QU
ZS2: BnaA05T147100ZS2
SW: BnaA03T259800SW
Express61: A05p014080.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC04G0183400XY
P202: BnaA05G012810P202.7
BL: BnaC04T189800BH
TA: BnaA05T148900TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g38270D
RB: BnaC04T185300RB
No2127: BnaA05T0076500NO
P130: BnaC04G020230P130.2
Length: 262
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 5.650000e-158
KOG Score: 440.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: XP_013732594.1
NR E-value: 2.500000e-147
NR Score: 526.6
NR Annotation: XP_013732594.1 tropinone reductase homolog At2g29310 isoform X1 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9ZW14|TRNH8_ARATH
SwissProt E-value: 2.400000e-157
SwissProt Score: 440.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At2g29310 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g29310 PE=2 SV=1
CDS Sequence (800 bp)
ATGGATAAGCGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCCCTTGTAAACGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGTATG
CCATAGTAGAGGAGTTAGCTAGATTTGGAGCTAAAATCCATGTTTGCGACATATCTGAAGTTATTCTTAA
TCAAAGCTTAAGCGAATGGGAAAATAAAGGGTTTCACGTGAGTGGCTCAGTCTGTGATGTTACCTCTCTT
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Upstream Sequence
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AAACTTATCTGATCCACGCTATAACACATGCCATGTCTGGCCATTGCTAGTCACACTCAAAAACATGGAT
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TAATGTTATCAAGACTCCTCTGTCTCAATCTTATCTTGATGACGTCAAGTTCAATGAAGAATTATGCCGA
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Downstream Sequence
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TTGAATGTTTAGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTAGCTAGATTTGGAGCTAAAATCCATGT
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AGAGGCAATACTAGCTAATTATCGCTAGTTTAACTTTTATTTTGTTGATTCCACAAATCG
TAAGACAAAGTTTATTATAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAGAAATCTGGCATGTGAATG
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TTCAATGAAGAATTATGCCGAAGAACTCCACTTGGGCGCGCTGGTGAGCTGAATGAAGTT
GCATCACTAGTGGCATTCTTGTGTCTACCTGCAGCTTCCTATATCACAGGTCAAACTATT
TGTGTTGATGGAGGCCTTACGGTTAACGGTTTCTCCTATCAACCACATGCTTAAAAATGA
CCTTGTCGCGTTTTATCTCTTTGTCTTCAGTTCTCAAAGTTCTCTCTCTAAAAAAATCTC
ATTGTCCCGTTTTGTCAGTTTGTCATAATAAATGAGTTCTTACTTTCATTGTTGAGACTT
GAAAGCTACTTCCAAAGTTAATACATCTTAAAGCTACTTCCAATCTTATTTAAGATGTAT
TGATGCTTGTTATTTTTTCCGTCTTCTTTTGTTTAAAATTATCTGAACTACCATTTGTTT
ACATGTTTAAATCATCTACTCTTTTAATTACAACCACAAATACCAACTTAATCATTCATT
GTATATCTATAATCTATGGCATTTCTGGTAATTACTAATCACATGCAAACAAAAAATGGT
TAAAAGATGGAGTTTTCAAGGTATGACTAGGCCTGGCTCTTCGCATGTGCAAGAGGTGCA
GTGGGTCCAATATTTTTTACAATTTGTTGGTTAGATTTTGGAGCATTTACCAACAAAATT
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TCGGGTTCGTCTTTCGGTAGAACTCCAGTACTTTGTCGTGCTAGAAAATCAAATGAATTT
TGCATCCGGTCATTGACATATATATATGCCCCCAATTTGTTATAAAATTATTGTTATTAA
GCTTTATTCTAAAGTATTTTTTGGTCTCCAAAAACTCAAACCGACCGTATGCATGCATCA
CTAGTGGTCTTCTTGTGTCAAACCTTTGGATGATCACCCGGAGTTCTGGTTCTTTCAGTT
TTCTTGCTTTAATACAGAGAGGCATACTTGACAAAAATTTGTAGAGAAGCTTCTTTACTG
GACTTTCAAACCTAGTAGTA
Pro Sequence
MDKRWSLQGMTALVNGGASGIGYAIVEELARFGAKIHVCDISEVILNQSL
SEWENKGFHVSGSVCDVTSLSERESLIQSVSSLFDGKLNILVNNVGVLRG
KRTLEYAKEDFDFHISTNLEPAFNFCQLSHPLLKASGYGSIIFMSSITGI
LSFTAGSIYNLTKGALNQLARNLACEWAKDGIRANAVAPNVIKTPLSQSY
LDDVKFNEELCRRTPLGRAGELNEVASLVAFLCLPAASYITGQTICVDGG
LTVNGFSYQPHA
mRNA Sequence
TGCACAGACATTATTGCCATGCTCTCTCAGATAACATTTCCACCACACATCCAAACGTACTCATTCATTC
AAACTTATCTGATCCACGCTATAACACATGCCATGTCTGGCCATTGCTAGTCACACTCAAAAACATGGAT
AAGCGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCCCTTGTAAACGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGTATGCCATAG
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GAGTACTTCGTGGAAAGCGAACGTTAGAATATGCGAAAGAGGATTTTGATTTCCACATCTCAACAAACTT
GGAACCTGCTTTCAATTTTTGTCAGCTTTCACATCCTCTACTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGTATCATC
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AAAAATCTCATTGTCCCGTTTTGTCAGTTTGTCATAATAAATGAGTTCTTACTTTCATTGTTGAGACTTG
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ATTTTTTCC