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Detail for ZS11_A05G16380.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A05G16380.t1
ZS11_v0: BnaA05T0141800ZS
WE: WE_A05G15740.t1
WE_v0: BnaA05T0140500WE
Darmor: A05p16100.1_BnaDAR
BH: BnaC04T190200BH
Quinta: BnaA05T0136900QU
ZS2: BnaC04T182400ZS2
SW: BnaC04T187700SW
Express61: A05p014100.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA05G0139700XY
P202: BnaA05G012810P202.1
BL: BnaC04T190200BH
TA: BnaA05T149100TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g27480D
RB: BnaC04T185800RB
No2127: BnaA05T0076500NO
P130: BnaC04G020280P130.1
Length: 262
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 9.480000e-163
KOG Score: 452.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: XP_013732596.1
NR E-value: 1.500000e-149
NR Score: 533.9
NR Annotation: XP_013732596.1 tropinone reductase homolog At2g29310 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9ZW14|TRNH8_ARATH
SwissProt E-value: 4.020000e-162
SwissProt Score: 452.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At2g29310 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g29310 PE=2 SV=1
CDS Sequence (800 bp)
ATGGATAAAAGATGGAGTCTTGAAGGTACGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGGCAGCGGAATCGGGTATG
CCATAGTAGAGGAGTTAGCTGGTTTTGGAGCTAAAATCCATGTTTGCGACATATCTGAAACACTGCTTAA
TAAAAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTAAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGA
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Upstream Sequence
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GCGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTAGCTGGTTTTGGAGCTAAAATCCATGTTTGCGACATATC
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Downstream Sequence
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ATAAGCTATTTGTTCACATTATTTTTAGGCCACTCTTATCATATTTATGATATTTATTTG
GGATCCTTTCTTTAATCCCTAACTAGTATATCTCGTTTCTGTGAAAGACAATTCTTCATA
TGAGATACTCAGTATAGTTCATGAGATTTAAGTTGTTCTACTAATTTAATAACTGTTAAT
GTAAATGATTACCATCTGATAACTTTCTATGTGGTGGAAAGCTGCTGAGAAACGTTTGCA
TGCTATAACCTGATTCCGTGAGCTTTCATTGGTTTGTTCTCTGTGTCATGATTTCTGGAT
TCTGACTTCATTGTGTCTTATCCGCATTATACACAAAAGTGGTTGAGAAAGATGGAAGTT
GCATATAGACATGAGTTTTCATTGGGAATAATTTGAGCTCAGATTTAATAACTTCACGTT
CTGAGAGAGAAACACTCAGAAGAAATCTGTACTATTATTTGCGAAGTAAATTTTTAGAAT
CGAGCTCTCACGTTAAAAGA
Pro Sequence
MDKRWSLEGTTALVTGGGSGIGYAIVEELAGFGAKIHVCDISETLLNKSL
SEWEKKGFKVSGSVCDVTSRPERETLMQTVSSLFNGKLDIFVNNVGGGRL
KPTTEYDADDFDFHIATNLEPAFHFCQLSHPLLKASGYGSIIFISSVAGV
VSFECGSIYSLAKGALNQLARNLACEWAKDGIRANAVAPNAIKTPLSQPY
LDDVSFKEELFGRTPLGRAGEPNEVASLVVFLCLPAASYITGQTICVDGG
LTVNGFSYQPHA
mRNA Sequence
CCAAACATACTCATTTATTCACacatatctgatctacactataaTATCTGCCATTTCTGACCATTTCTAG
CCACATTAAAAAAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTGAAGGTACGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGGCA
GCGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTAGCTGGTTTTGGAGCTAAAATCCATGTTTGCGACATATC
TGAAACACTGCTTAATAAAAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTAAAGTGAGTGGTTCAGTCTGT
GATGTAACTTCTCGACCCGAGAGAGAAACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCCCTGTTCAATGGCAAGCTCG
ATATTTTCGTGAACAATGTGGGTGGAGGTCGTCTAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGA
TTTCCATATTGCAACAAACTTGGAACCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTCCTAAAGGCT
TCAGGCTATGGAAGCATCATCTTCATTTCATCTGTTGCTGGGGTTGTATCTTTTGAATGTGGATCCATTT
ATAGTCTAGCAAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGATGGCAT
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TTCAAGGAGGAATTGTTTGGTAGAACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCACTGG
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ACCCGGAAGCCACAGCACCAACAGCCTTCAGCAATCTCTCTCATGCATCACAAAGTTTCTCCGCTATCCT
CTGTTTTGTACTTACAAAGAAAAAGACAGATAGTGTCTTAACTGAG