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Detail for ZS11_A05G33530.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A05G33530.t1
ZS11_v0: BnaA05T0381900ZS
WE: WE_C05G51930.t1
WE_v0: BnaA05T0332700WE
Darmor: A05p32070.1_BnaDAR
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Quinta: BnaC05T0367500QU
ZS2: BnaC05T404100ZS2
SW: BnaC05T440800SW
Express61: A05p025870.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC05G0424400XY
P202: BnaA05G023840P202.2
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TA: BnaA05T269500TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g31220D
RB: BnaC05T447500RB
No2127: BnaA05T0299600NO
P130: BnaA05G027480P130.1
Length: 1090
KOG ID: KOG2426
KOG E-value: Not available
KOG Score: 1055.0
KOG Annotation: Carbohydrate transport and metabolism
Biological Process: GO:0006071(glycerol metabolic process),GO:0019752(carboxylic acid metabolic process),GO:0006536(glutamate metabolic process)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0004371(glycerone kinase activity),GO:0005524(ATP binding),GO:0016830(carbon-carbon lyase activity),GO:0030170(pyridoxal phosphate binding),GO:0003824(catalytic activity),GO:0004351(glutamate decarboxylase activity)
KEGG Ortholog: -
NR Protein: XP_013749478.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1126.7
NR Annotation: XP_013749478.1 putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9LSH2|DCE5_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 971.0
SwissProt Annotation: Glutamate decarboxylase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GAD5 PE=2 SV=1
CDS Sequence (3319 bp)
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GTGTGCGTCGGAGATGGTTGGTACCATGGGTGTTGCATTATCTGTTTGTACGCTTCCTGGGCAGGTTACA
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ATCCAAGGCTTAACCTAGCTTCCTTTGTCACCACTTGGATGGAACCTGAATGTGACAAACTCATCCAGGA
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GTTCATCAGAGGCTATAATGCTTGCTGGTTTAGCTTTCAAAAGGAAATGGCAACAGAGGAGAAGAGCTCA
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AGGTACTTTGAGGTAGAGCTCAAAGAGGTGAAACTAAGTGAAGGCTATTACGTGATGGACCCAGCTAAAG
CTGTAGAGATGGTGGATGAGAACACAATCTGCGTTGCAGCTATTCTGGGATCCACACTTACCGGAGAGTT
CGAGGATGTGAAGCTACTGAACGATCTCTTGGCTGAGAAAAACGCAGAGACTGGTTGGGATGTTGCTATT
CACGTTGATGCAGCCAGTGGAGGATTCATTGCTCCTTTCCTCTACCCTGATCTTGAATGGGACTTTAGGC
TTCCATGGGTTAAGAGCATTAATGTCAGTGGTCATAAGTATGGACTTGTCTATGCAGGAGTTGGTTGGAT
TGTCTGGAGAACCAAAGATGATTTGCCAGAGGACCTTGTCTTTCACATCAACTACTTGGGAGCTGATCAA
CCCACTTTCACCCTTAACTTCTCTAAAGGGTCGAGCCAAATCATTGCTCAGTACTATCAGTTTATCCGAC
TAGGCTTTGAGGGATACAAGAACATTATGGAGAACTGCATGGACAATGCGAGGAGGCTAAGAGAAGGAAT
AGAGATGACAGGGAAGTTCGACATTGTCTCCAAAGACATAGGCGTGCCTCTAGTGGCATTCTCTCTCAAA
GACAGCAGCAAACACACCGTGTTTGAGATCGCAGAGTCTCTTAGGAAATTTGGGTGGATCATACCGGCCT
ACACTATGCCTGCAGATGCACAGCACATTGCTGTGCTCAGAGTTGTGATCAGGGAAGATTTTAGCCGAGG
ACTTGCGGACAGACTCATCACACATATCATTCAGGTACTGAAAGAGATCGATGGCCTTCCTAGCCGGGTT
GCTCATCTAGCTGCGGCTGCTGCGGTTAGTGGTGGTGAGGTGAAGACTGCTAAGATGTCGTTGGAGGATA
TCACTAAGTATTGGAAACGTCTTGTGGAACACAAGAGAAATATTGTCTGTTAG
Upstream Sequence
ATGGTTTACGCGGCGAAGAAATTCATCAACGACCCCAGCGATGTTGTGACTGAGTTCATCGAGGGACTTG
TGGAAACTTATCCTGGACTGCAGTATTTGGATGGCTTTCCCGAGGTTAAGGTTGTACTACGAGCTGATGT
CTCTGCTGAGAAGTATGATAAGGTTGCTGTTATATCAGGTGGAGGCAGTGGGCATGAGCCAGCTCATGCT
GGTTACGTTGGAGAAGGAATGCTTACAGCTGCTATCTGCGGAGATGTCTTTGCTTCTCCACCTGTTGATT
CCATCTTGGCTGGGATTCGGGCTGTCACTGGTCCTCAGGGATGTCTTTTGATCGTCAAGAACTATACTGG
TGACCGTTTGAACTTTGGTTTGGCTGCTGAGCAAGCGAAATCTGAAGGTTACAAAGTAGAGACTGTAATT
GTTGGAGAGGATTGCGCTTTACCCCCACCTCGTGGTATTGCTGGACGCAGAGGGTTAGCAGGAACCGTTC
TTGTACATAAGGTGGCTGGCGCAGCAGCAGCGGCTGGTCTTTCTCTAGAAAAAGTTGCGGCCGAGGCAAA
GTGTGCGTCGGAGATGGTTGGTACCATGGGTGTTGCATTATCTGTTTGTACGCTTCCTGGGCAGGTTACA
TCTGATCGTCTGGGCCAAGAGAAGATGGAACTCGGGCTTGGAATTCATGGAGAACCTGGTGCTGCTGTGG
TTGACGTTCAACCTGTGGACGTGGTGGTTTCACATGTTCTTCAGCAGATACTGAGTCCTGAGACCAATTA
TGTTCCCATTACCCGCGGTAACAGAGTGGTTCTCATGGTTAATGGCTTAGGAGGCACCCCTTTGATGGAA
CTTATGATAGCTGCTGGAAAAGCTGTCCCTAAACTGCAGCTGGAATTTGGACTTGCTGTTGATAGGGTGT
ACACAGGGCTTTTTATGACTTCGCTCGATATGGCAGGATTCTCGATTTCAATCATGAAGGCTGACCAGTC
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CCTGCAAAGATCCCTGTTCCTATACCCCCTTCTCGATCAGCAAAAAGCGCTGAGTCTCAGGCTCGACCTA
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CAGCTTCACAAGTTCTTGAAGAGAAGCTGAGCGCTGGAGAGGATCCAATATGTGCTTTTATTCTGTCAGC
TGAAGCAGCAACTAAAGGAGCGGAATCAACCATACAGATGCAAGCACAGGCTGGGAGATCGAGCTATGTG
TCTGCAGAGATGCTTGCAACAGTTCCAGATCCAGGTGCAATGGCTGCAGCAGGATGGTACAGTGCGGCAG
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CGACTCCGAAGAGCATTTGCACTCCACTTTCGCTTCCAGATATGTCCGTGCTGTTGTTCCCAGGTTCACT
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ATCCAAGGCTTAACCTAGCTTCCTTTGTCACCACTTGGATGGAACCTGAATGTGACAAACTCATCCAGGA
GTCTGTCAACAAGAACTATGTTGACATGGATGAATATCCCGTCACTACCGAGCTCCAGAACCGGTGTGTA
AACATGATAGCCAATTTGTTCCATGCTCCCATGGGAGAAGAGGAAGCTGCTATTGGATGTGGAACTGTTG
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AGGTACTTTGAGGTAGAGCTCAAAGAGGTGAAACTAAGTGAAGGCTATTACGTGATGGACCCAGCTAAAG
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CACGTTGATGCAGCCAGTGGAGGATTCATTGCTCCTTTCCTCTACCCTGATCTTGAATGGGACTTTAGGC
TTCCATGGGTTAAGAGCATTAATGTCAGTGGTCATAAGTATGGACTTGTCTATGCAGGAGTTGGTTGGAT
TGTCTGGAGAACCAAAGATGATTTGCCAGAGGACCTTGTCTTTCACATCAACTACTTGGGAGCTGATCAA
CCCACTTTCACCCTTAACTTCTCTAAAGGGTCGAGCCAAATCATTGCTCAGTACTATCAGTTTATCCGAC
TAGGCTTTGAGGGATACAAGAACATTATGGAGAACTGCATGGACAATGCGAGGAGGCTAAGAGAAGGAAT
AGAGATGACAGGGAAGTTCGACATTGTCTCCAAAGACATAGGCGTGCCTCTAGTGGCATTCTCTCTCAAA
GACAGCAGCAAACACACCGTGTTTGAGATCGCAGAGTCTCTTAGGAAATTTGGGTGGATCATACCGGCCT
ACACTATGCCTGCAGATGCACAGCACATTGCTGTGCTCAGAGTTGTGATCAGGGAAGATTTTAGCCGAGG
ACTTGCGGACAGACTCATCACACATATCATTCAGGTACTGAAAGAGATCGATGGCCTTCCTAGCCGGGTT
GCTCATCTAGCTGCGGCTGCTGCGGTTAGTGGTGGTGAGGTGAAGACTGCTAAGATGTCGTTGGAGGATA
TCACTAAGTATTGGAAACGTCTTGTGGAACACAAGAGAAATATTGTCTGTTAG
Downstream Sequence
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TATCCCCGATTGTGTTACTGTTTGCGATATATTCTTTGCATTGCTTGTTTATTGCTCGTG
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TTATAATTTTCCATATAATCGCAGTCGCAAGTTGTATTTTCTTGAAATTGAAGTGGCGGT
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CTTAAGACATTTTTGTTGTGGTTGATTTGGTGTTCTTGAACCTTTATGAAGTTATGCCTT
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AGGAATGCTTACAGCTGCTATCTGCGGAGATGTCTTTGCTTCTCCACCTGTTGATTCCAT
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TCTATCCATTCTTTTTTACAGAACTATACTGGTGACCGTTTGAACTTTGGTTTGGCTGCT
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TTCTTGTACATAAGGTTCTCTCTCCCTTTCCTTTCTTTCTCTAATTGCAATCTAAACTAA
TGTCTCCCCTTTCGGTTGATCTCATTTATGGTACTATATCTTCTTAAATTGTGATTCTAA
AACCTTGGTCTGCTATGAGTACTGTGTTTTGTTTAGTTTAGCCTAGTTTAGTTGAACAAG
CTTAGCATCTGTTTCTTAATTCGTTTCTGCTTGGTTACAGGTGGCTGGCGCAGCAGCAGC
GGCTGGTCTTTCTCTAGAAAAAGTTGCGGCCGAGGCAAAGTGTGCGTCGGAGATGGTTGG
TACCATGGGTGTTGCATTATCTGTTTGTACGCTTCCTGGGCAGGTTACATCTGATCGTCT
GGGCCAAGAGAAGATGGAACTCGGGCTTGGAATTGTATGTTATTTTCTCTTCATTTCCTC
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TTTCTCTCAGCATGGAGAACCTGGTGCTGCTGTGGTTGACGTTCAACCTGTGGACGTGGT
GGTTTCACATGTTCTTCAGCAGATACTGAGTCCTGTATGTGCTAATTTTTGTTTTCTCTA
TTGTGCTTTTGTCGCCATAGTCAAATATAAGTACCCAATGCTGATTCTTAACTTACTGTC
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TGGTTAATGGGTAAGCCCAT
Pro Sequence
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KYDKVAVISGGGSGHEPAHAGYVGEGMLTAAICGDVFASPPVDSILAGIR
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mRNA Sequence
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