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Detail for ZS11_A05G39690.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A05G39690.t1
ZS11_v0: BnaA05T0435000ZS
WE: WE_A05G39690.t1
WE_v0: BnaA05T0383300WE
Darmor: A05p38030.1_BnaDAR
BH: BnaA05T351500BH
Quinta: BnaA05T0336800QU
ZS2: BnaA05T323800ZS2
SW: BnaA05T361900SW
Express61: A05p030570.2_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA05G0341000XY
P202: BnaA05G028500P202.1
BL: BnaA05T351500BH
TA: BnaA05T324700TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g31580D
RB: BnaA05T347900RB
No2127: BnaA05T0349200NO
P130: BnaA05G032480P130.1
Length: 560
KOG ID: KOG1263
KOG E-value: Not available
KOG Score: 743.0
KOG Annotation: Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism
Biological Process: GO:0046274(lignin catabolic process)
Cellular Component: GO:0048046(apoplast)
Molecular Function: GO:0005507(copper ion binding),GO:0052716(hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity),GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K05909 E1.10.3.2; laccase [EC:1.10.3.2]
NR Protein: XP_013640166.2
NR E-value: Not available
NR Score: 1164.4
NR Annotation: XP_013640166.2 laccase-22 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q0IQU1|LAC22_ORYSJ
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 770.0
SwissProt Annotation: Laccase-22 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=LAC22 PE=2 SV=2
CDS Sequence (1707 bp)
ATGACTTATTCTTGTGCTAGAATTTTTCTTCTTGTGTTTCTCTCTTTGCTATATTTGGCTGAGGCAAACA
TTCGTCACTACAAGTTCAATGTAGTGATGAAGAACATGACCAAGCTCTGTTCAACCAAACCAATAGTTAC
CATTAATGGCAAGTTCCCTGGACCAACTCTATACGCAAGAGAAGATGATAATGTGATCGTTAACCTGACC
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GTTTCTAGTGGAAGACGGCAAAGATTCTAATGAAAAACTTCCACCGCCTCCAAGTGATCTTCCCAAATGC
TAA
Upstream Sequence
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TCATAGATTCGTCGTCACAACTTCAGTTCCAAGCAAAGACTGAGAGAGAGAGAAATGACTTATTCTTGTG
CTAGAATTTTTCTTCTTGTGTTTCTCTCTTTGCTATATTTGGCTGAGGCAAACATTCGTCACTACAAGTT
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GTGTACCTTACCCGTTTCCTCGGCCTCATACCGATAAAGTCATCGTTTTCGgTGAATGGTGGAAGTCAGA
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AGAGTTACCTCTTAAGGATCATAAACGCTGCAGTTAACGACGAGCTCTTCTTCAAGATCGCACAACACAA
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TCATGGACACCGTTGTCCCCGTTGATAACGCAACCGCAACCGCCTTTTTGCGTTACAAAAACACAACAAC
AACAGACTCCTTGACTATGTCCAAGACTCCTCCAATAAACGCTACAAGCATCGCTCAAAACTTCTCAGAC
TCTCTAAGAAGCCTAAACTCGCTCAAGTATCCGACCAACGTTCCTTTAAAGATCGACCACTCGCTGTTCT
TCGCTATAGGAGTTGGCGTAAACCCGTGTGCCACGTGCATTAACGGAACCAAGACCATTGCCGACATCAA
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TTCACCGATGATTTTCCGGGGAGACCCTTGACGCCGTTTGACTACACCGGCGGTAATAATAGTATACCGT
TGAGTAATCTTCAGACAAAGAACGGAACGCAAGTATATAGACTTGAGTTTAACGCAACGGTACAGATTGT
TATCCAAGGGACAAGTGTTATAGCACCGGAGAGCCATCCTACGCATCTGCATGGATCAAACTTCTTTGTG
GTTGGTAAGGGATTGGGGAACTTTGATCCGTTGATGGATCCTAAGAAGTTTAACCTCGTTGATCCGGTCG
AGAGGAACACTGTTAGTGTCCCTACTGCTGGATGGACAGCCATTCGGTTTATAGCAGACAATCCAGGTGT
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GGCAAAGATTCTAATGAAAAACTTCCACCGCCTCCAAGTGATCTTCCCAAATGCTAAAAGAGATCTTCTT
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GAAGACTTTCTCAGGTCTTTTGCCTATTTTCTTTCTCTATGTTTCTCAGGTCTTTGTTTCTCTTTGTTCT
TTCTCTTTGTTCTTGTTAAGTTTGTACAAAAAAGTAATTTATGATTGAAACATAAATGAAATTACAAGAC
TTCTACTTAGATAACCAGTAAC
Downstream Sequence
GTAAGTATTACACATTTGCTAGTCTTCTTGGAGAACAAGTAATCCACAACTAGTTTAATC
TTCTCCTTTATGAGACAGGTAGTGATGAAGAACATGACCAAGCTCTGTTCAACCAAACCA
ATAGTTACCATTAATGGCAAGTTCCCTGGACCAACTCTATACGCAAGAGAAGATGATAAT
GTGATCGTTAACCTGACCAACAACGTCAGCTACAACGTCACTATCCACTGGTAGGTACAA
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CTCCATTTTTTTTTCCAGGCATGGTGTGAAACAGTTAAGGACAGGATGGTCCGATGGTCC
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CACGGGACAACGAGGAACTCTTCTATGGCATGCTCATATCTCGTGGCTTAGAGCTACGGT
CCACGGTGCTATAGTCATTCTTCCAAAACGCGGTGTACCTTACCCGTTTCCTCGGCCTCA
TACCGATAAAGTCATCGTTTTCGGTTAGCTTTATATAGCTAGTTAGTTACTAGCTAGCAG
AGCATGAGATTTTGGTACCTTATAAAAAAATTAAAATATTTACCtattatttaatatttt
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CTCTCATGGTATGTAGTATGTACTAGGCTGAACATTATGCTATTTGGTTTAATCCGGTTT
GGTTATTTTAGGTTTGTTTGTCTATGATCGCAGGATACACAATACACGTTGAAACCGGGA
AGAGTTACCTCTTAAGGATCATAAACGCTGCAGTTAACGACGAGCTCTTCTTCAAGATCG
CACAACACAACTTAACCGTGGTTGAAGTAGACGCATCTTACACTAAACCGTATAATACCG
AAACGCTTTTCTTAGGTCCAGGCCAAACAGCAAACGCAGTCTTGACCGCTAACCATCCCA
CAGGAAACTTCTTAATGACCATTTCTCCCTTCATGGACACCGTTGTCCCCGTTGATAACG
CAACCGCAACCGCCTTTTTGCGTTACAAAAACACAACAACAACAGACTCCTTGACTATGT
CCAAGACTCCTCCAATAAACGCTACAAGCATCGCTCAAAACTTCTCAGACTCTCTAAGAA
GCCTAAACTCGCTCAAGTATCCGACCAACGTTCCTTTAAAGATCGACCACTCGCTGTTCT
TCGCTATAGGAGTTGGCGTAAACCCGTGTGCCACGTGCATTAACGGAACCAAGACCATTG
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TCAACAAAAGCCAAGGCGTTTTCACCGATGATTTTCCGGGGAGACCCTTGACGCCGTTTG
ACTACACCGGCGGTAATAATAGTATACCGTTGAGTAATCTTCAGACAAAGAACGGAACGC
AAGTATATAGACTTGAGTTTAACGCAACGGTACAGATTGTTATCCAAGGGACAAGTGTTA
TAGCACCGGAGAGCCATCCTACGCATCTGCATGGATCAAACTTCTTTGTGGTTGGTAAGG
GATTGGGGAACTTTGATCCGTTGATGGATCCTAAGAAGTTTAACCTCGTTGATCCGGTCG
AGAGGAACACTGTTAGTGTCCCTACTGCTGGATGGACAGCCATTCGGTTTATAGCAGACA
ATCCAGGTAACAAATCTTGA
Pro Sequence
MTYSCARIFLLVFLSLLYLAEANIRHYKFNVVMKNMTKLCSTKPIVTING
KFPGPTLYAREDDNVIVNLTNNVSYNVTIHWHGVKQLRTGWSDGPAYITQ
CPVQPGGNFIYNFTLTGQRGTLLWHAHISWLRATVHGAIVILPKRGVPYP
FPRPHTDKVIVFGEWWKSDVEDVIKQSTQSGLPPNLSDAHTINGLTGPIT
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KPYNTETLFLGPGQTANAVLTANHPTGNFLMTISPFMDTVVPVDNATATA
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GVFTDDFPGRPLTPFDYTGGNNSIPLSNLQTKNGTQVYRLEFNATVQIVI
QGTSVIAPESHPTHLHGSNFFVVGKGLGNFDPLMDPKKFNLVDPVERNTV
SVPTAGWTAIRFIADNPGVWFFHCHLEVHTSWGLKMAFLVEDGKDSNEKL
PPPPSDLPKC
mRNA Sequence
ATTTTAAAGTTAAAAAAACTCAATAATGAAACCTAGAAAATGACTACACACACAGCCTTTATTTATAGAC
TCATAGATTCGTCGTCACAACTTCAGTTCCAAGCAAAGACTGAGAGAGAGAGAAATGACTTATTCTTGTG
CTAGAATTTTTCTTCTTGTGTTTCTCTCTTTGCTATATTTGGCTGAGGCAAACATTCGTCACTACAAGTT
CAATGTAGTGATGAAGAACATGACCAAGCTCTGTTCAACCAAACCAATAGTTACCATTAATGGCAAGTTC
CCTGGACCAACTCTATACGCAAGAGAAGATGATAATGTGATCGTTAACCTGACCAACAACGTCAGCTACA
ACGTCACTATCCACTGGCATGGTGTGAAACAGTTAAGGACAGGATGGTCCGATGGTCCGGCCTATATAAC
GCAATGTCCGGTCCAACCAGGAGGAAATTTTATATACAATTTCACGCTCACGGGACAACGAGGAACTCTT
CTATGGCATGCTCATATCTCGTGGCTTAGAGCTACGGTCCACGGTGCTATAGTCATTCTTCCAAAACGCG
GTGTACCTTACCCGTTTCCTCGGCCTCATACCGATAAAGTCATCGTTTTCGgTGAATGGTGGAAGTCAGA
TGTTGAAGATGTGATTAAGCAATCAACACAATCCGGTTTACCACCAAATCTCTCAGACGCTCACACCATT
AACGGACTAACCGGTCCAATCACCGGTTGCAACAACTCTCATGGATACACAATACACGTTGAAACCGGGA
AGAGTTACCTCTTAAGGATCATAAACGCTGCAGTTAACGACGAGCTCTTCTTCAAGATCGCACAACACAA
CTTAACCGTGGTTGAAGTAGACGCATCTTACACTAAACCGTATAATACCGAAACGCTTTTCTTAGGTCCA
GGCCAAACAGCAAACGCAGTCTTGACCGCTAACCATCCCACAGGAAACTTCTTAATGACCATTTCTCCCT
TCATGGACACCGTTGTCCCCGTTGATAACGCAACCGCAACCGCCTTTTTGCGTTACAAAAACACAACAAC
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TTCACCGATGATTTTCCGGGGAGACCCTTGACGCCGTTTGACTACACCGGCGGTAATAATAGTATACCGT
TGAGTAATCTTCAGACAAAGAACGGAACGCAAGTATATAGACTTGAGTTTAACGCAACGGTACAGATTGT
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AGAGGAACACTGTTAGTGTCCCTACTGCTGGATGGACAGCCATTCGGTTTATAGCAGACAATCCAGGTGT
TTGGTTCTTCCATTGTCACTTGGAAGTGCATACTTCTTGGGGACTTAAGATGGCGTTTCTAGTGGAAGAC
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TTCTCTTTGTTCTTGTTAAGTTTGTACAAAAAAGTAATTTATGATTGAAACATAAATGAAATTACAAGAC
TTCTACTTAGATAACCAGTAAC