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Detail for ZS11_A01G00250.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A01G00250.t1
ZS11_v0: BnaA01T0004500ZS
WE: WE_scaffold0003G02850.t1
WE_v0: Bnascaffold286T0002900WE
Darmor: A01p00300.1_BnaDAR
BH: BnaA01T002800BH
Quinta: BnaC03T0655500QU
ZS2: BnaA01T003200ZS2
SW: BnaA01T003600SW
Express61: A01p000340.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA01G0003500XY
P202: BnaA01G000290P202.1
BL: BnaA01T002800BH
TA: BnaA01T002900TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g00440D
RB: BnaA01T002100RB
No2127: BnaC03T0586600NO
P130: BnaA01G000290P130.1
Length: 160
KOG ID: KOG0118
KOG E-value: 3.570000e-49
KOG Score: 157.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0003723(RNA binding),GO:0003676(nucleic acid binding)
KEGG Ortholog: -
NR Protein: XP_013642597.1
NR E-value: 1.100000e-44
NR Score: 184.9
NR Annotation: XP_013642597.1 glycine-rich RNA-binding protein 10-like isoform X1 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q05966|GRP10_BRANA
SwissProt E-value: 6.970000e-52
SwissProt Score: 166.0
SwissProt Annotation: Glycine-rich RNA-binding protein 10 OS=Brassica napus OX=3708 GN=GRP10 PE=2 SV=1
CDS Sequence (489 bp)
ATGTCTGCAGAAGTAGAGTACCGGTGCTTCGTCGGGGGCCTAGCATGGGCCACCGGAGATGCTGAGCTAG
AGAGGACGTTCTCACAGTTCGGCGAAGTTATCGATTCAAAGATCATTAACGATCGTGAGACTGGGAGATC
GAGGGGATTCGGATTCGTGACCTTCAAGGATGAGAAGTCCATGAGGGATGCTATCGATGAGATGAACGGA
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ACGTGGAGGTGGAGGTTACGGATCTGGAGGTGGCGGCCGTGGAGGTGGAGGATACGGTGGTGGTGGTGGC
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Upstream Sequence
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CTCTAATTGATAAGCTTCTCTTGATTTCTCTATTTTCACCGTCGCGTAATACTCATTCGTCGGCCGGTCA
GCTATTATGAACACAC
Downstream Sequence
GGTCCGTTACACACGAGAGATCGGACTCCAGGATGGTTCTGATCCTCGGCGGATCTGATT
CCGATCTGTGTTTCTCTGTTACTTGATTCGATTACTCTGTTACTATGTTCTTTGTTACTA
CTGTTACTTGCTTTGTCCCATCGGTACGTTTAATCTTCCTGCTGCTTTTACGAGCCCGGA
GAACGTTACGATTTCTTTGTTTCCATCCATCATCGCTTTTTTTGATTCATTCAGCTTGCT
CTGTTGCTGATGGTTGTTTTTGATATGGTTATTGACAGATCATTAACGATCGTGAGACTG
GGAGATCGAGGGGATTCGGATTCGTGACCTTCAAGGATGAGAAGTCCATGAGGGATGCTA
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GATTTAgaccagttcttatcttttgatttttgattaagaatatataagctaaaaagacag
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CCCAAAAAGGTTTATTTCAGTGTTGAATATAATAAATTTTGAAGTAACAAATTGGCCAAT
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TGTGCAGTTGTTGAACAGAGTTCTTGATTGCTTTGTCCGAAAAAAGTAACTCTGCGTTTG
TTCACAAAATTTAGAAGAGTGTGAAGATTCTCCATTTGCCAACTTCTTATGATCAAAGAT
ATCGAAACAAAGTAGGTTTCTGCATCTAATTGAGCTTACATAAGGATTTGTTTGTCAAGT
TGCAGAAGGACCAACCACTCGCTGAGGAATATAATATAAGTATATAACACTTGGTCTTCG
CAAGAAAATGCTTACCCTTCCCTTTCTTTTTTTTATTCCCTACATATTCGTGGAAAGCTA
CTGTGATGATAGTTTACACTGTCTAGGGGCAACGTGTTTCAAGTATGGCCTTGTTATCTT
CATATATAAGAAGAATGGAAGCCCAATATATGGAATAAAATCCAACAAATCTTTACTCAA
GTGTAACTTTTCATATATCACCAAAGTAAAGATGCAGAGTATCCCTCCCATATTGAGTAA
CAACCAATTCATTCAGATGTTCCTGTAAACGAATCACTGTACAGCTAAGGAGATTCCCCC
AAAGCTCAAACTTAAGTACT
Pro Sequence
MSAEVEYRCFVGGLAWATGDAELERTFSQFGEVIDSKIINDRETGRSRGF
GFVTFKDEKSMRDAIDEMNGKELDGRTITVNEAQSRGSGGGGGRGGGGYG
GRGGGGYGGGGGGYGDRRGGGGYGSGGGGRGGGGYGGGGGRREGGGYGGG
DGGYGGGGGW
mRNA Sequence
AGTCTCTTTCTCTCTCTCATTATTTTTCTCCGTTTTAAAACAAAAAAATGTCTGCAGAAGTAGAGTACCG
GTGCTTCGTCGGGGGCCTAGCATGGGCCACCGGAGATGCTGAGCTAGAGAGGACGTTCTCACAGTTCGGC
GAAGTTATCGATTCAAAGATCATTAACGATCGTGAGACTGGGAGATCGAGGGGATTCGGATTCGTGACCT
TCAAGGATGAGAAGTCCATGAGGGATGCTATCGATGAGATGAACGGAAAGGAGCTCGACGGACGTACCAT
CACCGTCAACGAGGCTCAGTCTAGAGGAAGCGGCGGTGGAGGAGGCCGTGGTGGAGGTGGATACGGTGGC
CGTGGAGGTGGTGGTTACGGTGGAGGCGGCGGTGGATACGGTGACAGACGTGGAGGTGGAGGTTACGGAT
CTGGAGGTGGCGGCCGTGGAGGTGGAGGATACGGTGGTGGTGGTGGCAGACGTGAAGGAGGTGGGTACGG
AGGTGGTGACGGTGGATACGGAGGAGGCGGTGGATGGTAATCGATAATGAAGTGGTTGTTTTGCTGCCTC
CTCTGTTATCGGTTTAGATTTGCTTCCGTATGAATGTTTCTCCGGTTTGGTTTGGTTCTGGATTTCTTGT
TTACTTTTTTGTTGTAACGGATCGTTAAAGTCTTGCTTGCCTGTAACGAAATGTTAAATCGCATCTTGTT
CTCTAATTGATAAGCTTCTCTTGATTTCTCTATTTTCACCGTCGCGTAATACTCATTCGTCGGCCGGTCA
GCTATTATGAACACAC