BrassicaPanDB

CDS Sequence (161 bp)

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TAATTGGTATTGGGATTTATCCTGATTTTGTGCTCTCATTAGCAAGTGACAAGGTCGAATCCATTTTATC
TAATTATTTTTATGGATAG

Upstream Sequence

ATGCCAAAAACTTTTCTTTTTGATTCTGGACCCCGAGAGTTATTTCTTTCAATCTCTATTCTTCTACCCA
TAATTGGTATTGGGATTTATCCTGATTTTGTGCTCTCATTAGCAAGTGACAAGGTCGAATCCATTTTATC
TAATTATTTTTATGGATAG

Downstream Sequence

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TTTTTAATTTATATGTATTC

Pro Sequence

MPKTFLFDSGPRELFLSISILLPIIGIGIYPDFVLSLASDKVESILSNYF
YG

mRNA Sequence

ATGCCAAAAACTTTTCTTTTTGATTCTGGACCCCGAGAGTTATTTCTTTCAATCTCTATTCTTCTACCCA
TAATTGGTATTGGGATTTATCCTGATTTTGTGCTCTCATTAGCAAGTGACAAGGTCGAATCCATTTTATC
TAATTATTTTTATGGATAG

Genome:
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Darmor:	C09p24620.1_BnaDAR
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SW:	BnaC02T044700SW
Express61:	Not available
Xiaoyun:	Not available
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RB:	BnaC02T274900RB
No2127:	Not available
P130:	BnaC09G042180P130.1
Length:	52
KOG ID:	KOG4845
KOG E-value:	9.420000e-16
KOG Score:	70.1
KOG Annotation:	Energy production and conversion
Biological Process:	-
Cellular Component:	-
Molecular Function:	-
KEGG Ortholog:	K05575 ndhD; NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4 [EC:7.1.1.2]
NR Protein:	YP_006666342.1
NR E-value:	1.800000e-17
NR Score:	92.8
NR Annotation:	YP_006666342.1 NADH dehydrogenase subunit 4 (chloroplast) [Pachycladon enysii]
SwissProt Protein:	A4QJG6\|NU4C_AETCO
SwissProt E-value:	5.010000e-21
SwissProt Score:	86.7
SwissProt Annotation:	NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic OS=Aethionema cordifolium OX=434059 GN=ndhD PE=3 SV=2

DETAIL

Detail for ZS11_A06G24670.t1

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