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Detail for ZS11_A07G00460.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A07G00460.t1
ZS11_v0: BnaC08T0459600ZS
WE: WE_C07G00840.t1
WE_v0: BnaA07T0004000WE
Darmor: A07p00360.1_BnaDAR
BH: BnaA07T004500BH
Quinta: BnaC07T0007100QU
ZS2: BnaA07T003500ZS2
SW: BnaA07T004100SW
Express61: A07p000390.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC07G0007000XY
P202: BnaA07G000430P202.2
BL: BnaA07T004500BH
TA: BnaA07T003600TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaA07T004400RB
No2127: BnaA07T0003600NO
P130: BnaA07G006960P130.1
Length: 402
KOG ID: KOG2865
KOG E-value: Not available
KOG Score: 714.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K03953 NDUFA9; NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex subunit 9
NR Protein: CDY31970.1
NR E-value: 8.800000e-229
NR Score: 797.7
NR Annotation: CDY31970.1 BnaA07g00250D [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9SK66|NDUA9_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 729.0
SwissProt Annotation: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g20360 PE=1 SV=2
CDS Sequence (1226 bp)
ATGCAGGCAGTTTCCAGGAGATTAATTCAGCGGCCTCTCTCCGGAGGAGCTTCGATCTATTCATCATCTT
CTCCCAGATCGCTCCATGGAGTCTCAGATCACCTTAATGGAAGTGATAATCGTCGCTACTCATCTTCCCT
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Upstream Sequence
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TCTCTCTCTCATCTGTGTTTGTTGTCTCTATCGATCGTGCAAGTGAGGACGAAGATGCAGGCAGTTTCCA
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TGATGTGGCGTTTTGGTCCCCTTAGGAATTATGCAGTTTCTGGttcgtttcaaacttCATGTGTTACTTT
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Downstream Sequence
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GGTTTTCTAATTACTTCTAATCAATCTCCTTGCTCCAGCTAAAATGGGATCGCAAGTGCT
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GGAAGAGAGTACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAACCATCACATGGCCGAG
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TGGTTATCTCTAATTAGATTGGGGATTTGTGGATTTGTTGTTTCAGGTGGCAAAGGAACA
TGGTGGGATAATGAGATTTATTCAAGTTTCTTGTCTGGGAGCTTCTGTATCATCTCCTTC
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AAACTTATCCAGTTTTCAGCACACATAACTCTCTCTTCTATAATTATCATCCTACTATAT
TATTCTACTAATCCAGATATGAGGTAGATCCTTTACTTTTTTTCTTGTGTAGAACTGGAA
AACAGTATATGATGTTATTATTAAACTCTAAATCTCATAAAATTTTAAAGCAACAATGTA
GGCTTATACGTAGTTTGTCATAAGCCTGCTGCTTCTAGTCATTTCCTGATTTATATTTGT
TTCCTAGGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGGATCTTGAA
CCCCTGGGCAATGTTCGTTAAAAAATACGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACCAA
CAAGTATGTCCTAAACCTTTATCTTATTCTTTTCACCCGTTCACAGCAACCTACAGTGAC
GAAGATCCATTTCTTTCACTAACCATAACATCATTACAGATTCCAGCCCGTATATGTGGT
TGATGTTGCTGCTGCAATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGATGGCTCTAGCATGGGGAAAAC
CTATGAATTGGGTGGTCCTGATGTCTTTACACCTCATGATTTGGTAAATTCTTATTGTCC
TTAATTCTCTCTGTCACTGTGGCAGTTCAATGGGCTTGATTTTCAAAAAATTTCCTTGCA
GGCAGAGATCATGTTTGACA
Pro Sequence
MQAVSRRLIQRPLSGGASIYSSSSPRSLHGVSDHLNGSDNRRYSSSLATK
GVGHLARKGTGGRSSVSGIVATVFGATGFLGRYLVQQLAKMGSQVLVPFR
GSEDNPRHLKLMGDLGQVVPMKFDPRDEDSIKAVMAKANVVINLIGREYE
TRNFSFEEVNHHMAEKLALVAKEHGGIMRFIQVSCLGASVSSPSRMQRAK
AAAEEAVLSALPEATVMRPATMIGTEDRILNPWAMFVKKYGFLPLIGGGT
NKFQPVYVVDVAAAIVAALKDDGSSMGKTYELGGPDVFTPHDLAEIMFDM
IREWPRYVKLPFPIAKAMAGPRDFMVNKVPFPLPSPQIFNLDQINALTTD
TLVSDEALTFQDLDLVPHKLKGYPVEFLIQYRKGGPNFGSTVSEKIPTDF
YN
mRNA Sequence
AAAATCATATGTTTGGGCCCGGCCCATTACCTGTATTTCGCGGCAGCAAATCCATCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCATCTGTGTTTGTTGTCTCTATCGATCGTGCAAGTGAGGACGAAGATGCAGGCAGTTTCCA
GGAGATTAATTCAGCGGCCTCTCTCCGGAGGAGCTTCGATCTATTCATCATCTTCTCCCAGATCGCTCCA
TGGAGTCTCAGATCACCTTAATGGAAGTGATAATCGTCGCTACTCATCTTCCCTGGCTACAAAGGGCGTT
GGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCCTCCGTGAGTGGGATTGTAGCTACGGTGTTTGGAG
CCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCTAGCTAAAATGGGATCGCAAGTGCTAGTTCCTTT
CCGAGGCTCTGAGGACAATCCTCGACATCTCAAGTTGATGGGAGACTTAGGACAGGTAGTGCCGATGAAA
TTTGATCCAAGAGATGAAGACTCTATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTTGTTATCAATCTAATTG
GAAGAGAGTACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAACCATCACATGGCCGAGAAACTTGCATT
GGTGGCAAAGGAACATGGTGGGATAATGAGATTTATTCAAGTTTCTTGTCTGGGAGCTTCTGTATCATCT
CCTTCAAGAATGCAGAGAGCAAAGGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTGAGCGCGCTGCCTGAGGCGACAG
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ATACGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACCAACAAATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTTGCT
GCTGCAATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGATGGCTCTAGCATGGGGAAAACCTATGAATTGGGTGGTCCTG
ATGTCTTTACACCTCATGATTTGGCAGAGATCATGTTTGACATGATTCGTGAATGGCCTCGATATGTGAA
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AGGCCTTGACGTTTCAGGATTTGGACCTTGTCCCTCATAAATTGAAGGGATATCCAGTCGAGTTTCTTAT
CCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAATTTCGGTTCTACAGTCAGTGAAAAGATACCGACAGACTTCTACAAT
TGATGCTGCTTCTGCTCCAAGGTCGTTTTCCTGGACTAATTTTTTTCATGCAAGTGTCACAGTGATACCG
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GTTGTGATGTGGAGAAAAAAGTATAACCCATCAACGGGATCATAAGTTAGAGTGGGGATGTCATCTGTCT
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GCCATTGAGTATAACTAAA