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Detail for ZS11_A01G00310.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A01G00310.t1
ZS11_v0: BnaA01T0004900ZS
WE: WE_scaffold0003G02770.t1
WE_v0: Bnascaffold286T0003500WE
Darmor: C01p00500.1_BnaDAR
BH: BnaA01T003500BH
Quinta: BnaA08T0188700QU
ZS2: BnaC01T004700ZS2
SW: BnaA01T004200SW
Express61: C01p000460.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC01G0004100XY
P202: BnaC01G000490P202.2
BL: BnaA01T003500BH
TA: BnaA01T003300TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g00530D
RB: BnaA01T002600RB
No2127: BnaA08T0164500NO
P130: BnaA01G000360P130.2
Length: 335
KOG ID: KOG1441
KOG E-value: Not available
KOG Score: 637.0
KOG Annotation: Amino acid transport and metabolism; Carbohydrate transport and metabolism
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: -
NR Protein: CDY42623.1
NR E-value: 2.000000e-181
NR Score: 640.2
NR Annotation: CDY42623.1 BnaC01g00350D [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q8RWW7|URGT4_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 645.0
SwissProt Annotation: UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=URGT4 PE=1 SV=1
CDS Sequence (1022 bp)
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TCAGCCTCATGTGGAACTCTGTTGGCTTCTACCAGATCGCGAAGCTGAGTATGATCCCTGTCTCTTGTCT
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AACTGCCGAGTCTGATGAAAAGGTCTAA
Upstream Sequence
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TCTCAGCTTCCCTGGCCCGATCTTCTCAAGTTCGTTTTGTTCGCTAACTTCTCTATCGTTGGCATGAACG
TCAGCCTCATGTGGAACTCTGTTGGCTTCTACCAGATCGCGAAGCTGAGTATGATCCCTGTCTCTTGTCT
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GGTGTTGCCGTCTGTACTGTTACCGATGTTAGTGTCAACCTCAACGGGTTCCTCGCTGCAGCCATTGCTG
TCTGGAGCACCGCCCTTCAGCAATACTATGTACATCATCTACAGCGGAAATATTCGCTTGGCTCTTTCAA
TCTGCTGGCTCATACGGCTCCAGTGCAAGCTGCATCCTTGTTGTTGGTTGGACCATTTCTAGACTACTGG
TTGACTAACCAAAGAGTTGATGCTTTCAACTTTTCATTTGTTTCTCTGTTCTTCCTAATACTCTCGTGCA
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AACTGCCGAGTCTGATGAAAAGGTCTAA
Downstream Sequence
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GATTTTTAATATCTGCTTTTGACACTCACACAGCTACGACGTTAACCGGTTTGCACTTCG
GAACCACCACACTGCTGACTACTTTCTTGACGTGGCTCGGTTACATCCAACCTTCTCAGC
TTCCCTGGCCCGATCTTCTCAAGTTCGTTTTGTTCGCTAACTTCTCTATCGTTGGCATGA
ACGTCAGCCTCATGTGGAACTCTGTTGGCTTCTACCAGATCGCGAAGCTGAGTATGATCC
CTGTCTCTTGTCTTCTAGAAGTTGTTCTTGACAAGGTCAGGTACTCGAGAGATACGAAGC
TCAGCATTTTGTTAGTTCTTGCTGGTGTTGCCGTCTGTACTGTTACCGATGTTAGTGTCA
ACCTCAACGGGTTCCTCGCTGCAGCCATTGCTGTCTGGAGCACCGCCCTTCAGCAATACG
TAATTGTTTTTATATCCTTATAGCCTTAAGCATGCTCAAATCTCTTTTCTAAATAACTGT
TACTTTTTTTTGCAGTATGTACATCATCTACAGCGGAAATATTCGCTTGGCTCTTTCAAT
CTGCTGGCTCATACGGCTCCAGTGCAAGCTGCATCCTTGTTGTTGGTTGGACCATTTCTA
GACTACTGGTTGACTAACCAAAGAGTTGATGCTTTCAACTTTTCATTTGTTTCTCTGGTA
AAGTGTCCCTCATCTGGTTCTTTACAAAGTCTTGTATGATTCCAAATAGGCATTTTGAAC
TCGCTTTTTAATTCAGTTTTGTTGTTGTTTGGGCAGTTCTTCCTAATACTCTCGTGCAGT
ATCGCGGTCGGGACGAATCTCAGCCAATTCATTTGTGTCGGTAGATTCACGGCGGTGTCT
TTCCAAGTACTTGGTCACATGAAGACGATCCTGGTTTTGGTTTTGGGATTCACTTTCTTC
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ATCTGGTACGGTAATGCATCTTCTAAACCTGGCGGTAAAGAGCGTCGTAGCCTCTCTATT
CCCATTACCAAGGCACATAAACTCAGTAGTTTATCTGAAACTGCCGAGTCTGATGAAAAG
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ACAACAGCTAGAGAGTATCAAATGGGGTCTTTACAAACAAAGGGGTTTAAATTATTTAAT
TTTCCATAAACTATATTTTTCTTTTCCTTACAGATCTTTTTTGTTGTTGTTTAATCCTTT
TTTTGCCTTTGCATATTGAATTTTTTGCTTAATTCTCCCAAAAGAAACATCATCTATACG
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ATTTTTTTTTTGTTCAATGAATTTTCGTACGAATAAAATCCATGCACTCAAAATGAATGG
AATTATTAAATTGTTTATGCTCTTGTTTACATTTATTGTTTCAGATAGCATGGTGTTTAC
GTAATCTTATTAGAAATGTCATTAACCGTATAAATACAAAGTTTATTGAAGATAATTATT
CTTTTTCAAGCACATGTAGTAACCCATTAATCGCCGGATTGTAAGTTTTTTAAATAATAC
TCTCCTTCGACGTCTCTTAAATTCTTTTAAGACTATGACCGACGGGATAATAAAGGGAGG
GGAGATATACACGAGCAATGCTCAGGTCGTTTGTTATTTGACGTTTGATTGTCCGAAGGA
CAAAATGTGTATGACGCTTATTTTTCTTTGTGGAAAAATAATACTCCATTCCCGTTAATG
GATGGAAGCCCACACGAATTTTCTCCTTTTCCTACTAAATGAGAAGAAAACTGAGTCTGT
TTCTACAATTAAAGAAACAAAAACTAATTGAATTTAAAATAGATAAATAGTTGAACTTCA
TCCGATATAGGTAACTAAAT
Pro Sequence
MGGTSKTDQKAALDIASWLFNVVTSVGIILVNKALMATYGFSFATTLTGL
HFGTTTLLTTFLTWLGYIQPSQLPWPDLLKFVLFANFSIVGMNVSLMWNS
VGFYQIAKLSMIPVSCLLEVVLDKVRYSRDTKLSILLVLAGVAVCTVTDV
SVNLNGFLAAAIAVWSTALQQYYVHHLQRKYSLGSFNLLAHTAPVQAASL
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TAVSFQVLGHMKTILVLVLGFTFFGKEGLNMQVVLGMLIAILGMIWYGNA
SSKPGGKERRSLSIPITKAHKLSSLSETAESDEKV
mRNA Sequence
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AACTGCCGAGTCTGATGAAAAGGTCTAA