SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_A08G10540.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A08G10540.t1
ZS11_v0: BnaA08T0083500ZS
WE: WE_A08G11110.t1
WE_v0: BnaA08T0076700WE
Darmor: A08p10450.1_BnaDAR
BH: BnaA08T102800BH
Quinta: BnaA08T0076200QU
ZS2: BnaA08T083000ZS2
SW: BnaA08T100300SW
Express61: A08p007200.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA08G0084300XY
P202: BnaA08G007730P202.1
BL: BnaA08T102800BH
TA: BnaA08T082500TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g20140D
RB: BnaA08T100600RB
No2127: BnaA08T0053700NO
P130: BnaA08G009990P130.1
Length: 680
KOG ID: KOG1186
KOG E-value: Not available
KOG Score: 1082.0
KOG Annotation: Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism
Biological Process: GO:0009308(amine metabolic process)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0005507(copper ion binding),GO:0008131(primary amine oxidase activity),GO:0048038(quinone binding)
KEGG Ortholog: K00276 AOC3, AOC2, tynA; primary-amine oxidase [EC:1.4.3.21]
NR Protein: XP_013698193.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1405.6
NR Annotation: XP_013698193.1 primary amine oxidase 2-like [Brassica napus]
SwissProt Protein: P0DO00|AMO2_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 1089.0
SwissProt Annotation: Primary amine oxidase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g31672 PE=3 SV=1
CDS Sequence (2072 bp)
ATGGCTCAACTCCACTTCACCATTTTCATCTTCTTTTCTTTCATTTTTGCAATCTCATCTTCAAGCTTTG
CTCCACCGCGTCACCCATTTGATCCCTTAACCGAAACCGAACTCAAACTCGTCCAAACCATCATTAACAA
GACGTACCCCATTGGTCCGAGCCACAAGTTTACTTTTCAATACGTTGGTCTCAACGAACCCGACAAGTCT
CTAGTCTTGTCTTGGTACTCATCACCGAAACACAACATCAAACCACCTCCACGTCAGGCTTTCGTCATCG
CTCGAGACAACGGAAAGTCTCGAGAGATTGTCGTTGACTTTTCTTCTCGAGCCATCGTCTCTGACAAGAT
CCACGTAGGCAATGGTTACCCTATGCTCACAAACGACGAGCAAGAAGCAGCCACCGAGCTTGTTCTCAAG
TTCAAGCCGTTTCTTGACTCGGTCACAAAACGTGGTTTAAACGTTTCGGAGATTGTGTTCACGACGTCAA
CAGTTGGCTGGTATGGTGAGAGTGAGGCGGAGACGGAGAGGGTTATTAGAATGATGCCGTTTTATCTTGA
CGGGACCGTTAATATGTATCTTAGACCTATTGAAGGAATGACGATTCTCGTTAACCTTGACGTGATGAAG
GTAACGGAGTTTACGGATAGGTTAACGGTTATTATGCCGAAGGCTAACGGAACGGAGTACCGTATCTCGG
AACTTAAGCCGCCGTTTGGCCCGACGCTTCAAAATGCCGTCTTTATGCAGCCGGACGGTCCAGGATTCAA
GATCGATGGACACGTCGTGAGATGGGCAAATTGGGAGTTTCACATATCGTTTGACGCTCGAGCCGGTATA
GTAATCTCTCTTGCATCCATGTTTGACATGGACGTTAAAAAATATCGGCAAGTTCTATACAAAGGCCACT
TGTCGGAGATGTTCATACCTTACATGGATCCTAGTGATGATTGGTATTTCATCACCTATCTTGATTGTGG
CGATTTCGGTTGCGGCCAGTGCGCCGTGTCCCTTGAACCATATAGAGATTGTCCAGCAGGTGCAGTTTTT
ATGGATGGGGTTTTTGCAGGTCAAGATGGAACTCCTGCGAAAATTCCAAATGTTATGTGCATTTTTGAGA
AATATGCTGGAGATATCATGTGGAGACATACGGAAGCTGAAATCCCAAACTTAGAAATTACAGAGGTTAG
ACCGGACGTAAGTCTTGTAGCCAGAATCGTGACCACCGTTGGGAACTACGACTACATAGTTGACTATGAG
TTCAAGCCTAGTGGTTCCATCAAAATGGGGGTGGGCTTAACCGGTGTTTTAGAAGTTAAACCGGTAGAAT
ATACCCACATATCCGAGATCAAAGAAGATGATATTCACGGGACAATTGTTGCCGACAATACCATCGGTGT
TAACCACGACCATTTCGTAACGTTCCGTCTTGATCTTGACATCGACGGTTCACCTAATTCTTTTGTCCGT
AACGAACTCGTGACAAAAAGAACCCCAAAATCTGTTAACACCCCGAGAAAGAGCTATTGGACAACGAGTC
CAAAGACGGCTAAGACCGAAACGGAAGCTCGGGTGAAACTAGGGTTGAAGGCGGAGGAGCTCGTGGTAGT
AAACCCAAACCGAAAAACTAAGCATGGCAATGAAGTTGGCTATCGTTTACTTTCTAGTCCACCATCAGGC
CCACTTCTGGTCCAGGATGATTATCCACAGATTAGAGCTGCATTCACCAACTATAACGTGTGGATCACCC
CGTATAATAGGACGGAGGTTTGGGCGGGAGGTTTGTACGCCGACCGGAGCCACGGAGACGATACATTAGC
CGTGTGGTCTCAGAGGAATAGAGAAATAGAGAATAAAGATATAGTGATGTGGTACACCATCGGATTCCAC
CATGTCCCAAGCCAAGAAGATTTCCCAACGATGCCTACATTATCCGGTGGCTTTGAACTCCGACCTACCA
ACTTTTTCGAACAAAATCCTGTCCTCAAAAGCAAACCCATCAAGATCGCCTCTGCTAAAAACTGCATTCC
CAAAAATGATTAA
Upstream Sequence
ATGGCTCAACTCCACTTCACCATTTTCATCTTCTTTTCTTTCATTTTTGCAATCTCATCTTCAAGCTTTG
CTCCACCGCGTCACCCATTTGATCCCTTAACCGAAACCGAACTCAAACTCGTCCAAACCATCATTAACAA
GACGTACCCCATTGGTCCGAGCCACAAGTTTACTTTTCAATACGTTGGTCTCAACGAACCCGACAAGTCT
CTAGTCTTGTCTTGGTACTCATCACCGAAACACAACATCAAACCACCTCCACGTCAGGCTTTCGTCATCG
CTCGAGACAACGGAAAGTCTCGAGAGATTGTCGTTGACTTTTCTTCTCGAGCCATCGTCTCTGACAAGAT
CCACGTAGGCAATGGTTACCCTATGCTCACAAACGACGAGCAAGAAGCAGCCACCGAGCTTGTTCTCAAG
TTCAAGCCGTTTCTTGACTCGGTCACAAAACGTGGTTTAAACGTTTCGGAGATTGTGTTCACGACGTCAA
CAGTTGGCTGGTATGGTGAGAGTGAGGCGGAGACGGAGAGGGTTATTAGAATGATGCCGTTTTATCTTGA
CGGGACCGTTAATATGTATCTTAGACCTATTGAAGGAATGACGATTCTCGTTAACCTTGACGTGATGAAG
GTAACGGAGTTTACGGATAGGTTAACGGTTATTATGCCGAAGGCTAACGGAACGGAGTACCGTATCTCGG
AACTTAAGCCGCCGTTTGGCCCGACGCTTCAAAATGCCGTCTTTATGCAGCCGGACGGTCCAGGATTCAA
GATCGATGGACACGTCGTGAGATGGGCAAATTGGGAGTTTCACATATCGTTTGACGCTCGAGCCGGTATA
GTAATCTCTCTTGCATCCATGTTTGACATGGACGTTAAAAAATATCGGCAAGTTCTATACAAAGGCCACT
TGTCGGAGATGTTCATACCTTACATGGATCCTAGTGATGATTGGTATTTCATCACCTATCTTGATTGTGG
CGATTTCGGTTGCGGCCAGTGCGCCGTGTCCCTTGAACCATATAGAGATTGTCCAGCAGGTGCAGTTTTT
ATGGATGGGGTTTTTGCAGGTCAAGATGGAACTCCTGCGAAAATTCCAAATGTTATGTGCATTTTTGAGA
AATATGCTGGAGATATCATGTGGAGACATACGGAAGCTGAAATCCCAAACTTAGAAATTACAGAGGTTAG
ACCGGACGTAAGTCTTGTAGCCAGAATCGTGACCACCGTTGGGAACTACGACTACATAGTTGACTATGAG
TTCAAGCCTAGTGGTTCCATCAAAATGGGGGTGGGCTTAACCGGTGTTTTAGAAGTTAAACCGGTAGAAT
ATACCCACATATCCGAGATCAAAGAAGATGATATTCACGGGACAATTGTTGCCGACAATACCATCGGTGT
TAACCACGACCATTTCGTAACGTTCCGTCTTGATCTTGACATCGACGGTTCACCTAATTCTTTTGTCCGT
AACGAACTCGTGACAAAAAGAACCCCAAAATCTGTTAACACCCCGAGAAAGAGCTATTGGACAACGAGTC
CAAAGACGGCTAAGACCGAAACGGAAGCTCGGGTGAAACTAGGGTTGAAGGCGGAGGAGCTCGTGGTAGT
AAACCCAAACCGAAAAACTAAGCATGGCAATGAAGTTGGCTATCGTTTACTTTCTAGTCCACCATCAGGC
CCACTTCTGGTCCAGGATGATTATCCACAGATTAGAGCTGCATTCACCAACTATAACGTGTGGATCACCC
CGTATAATAGGACGGAGGTTTGGGCGGGAGGTTTGTACGCCGACCGGAGCCACGGAGACGATACATTAGC
CGTGTGGTCTCAGAGGAATAGAGAAATAGAGAATAAAGATATAGTGATGTGGTACACCATCGGATTCCAC
CATGTCCCAAGCCAAGAAGATTTCCCAACGATGCCTACATTATCCGGTGGCTTTGAACTCCGACCTACCA
ACTTTTTCGAACAAAATCCTGTCCTCAAAAGCAAACCCATCAAGATCGCCTCTGCTAAAAACTGCATTCC
CAAAAATGATTAA
Downstream Sequence
GGTATAATGATTAACAACTGTTGCTCAAAAAAAAAGGATTAACAACTATGACTTAACGGG
AGACACACCGTTAAAGATGAGATCTTGCTATGCTCTATATGGAAACTAAAGGTTTAAATT
TGAGGGAATAAATAGTTATTATCTGAATGCTTTTTACAAAGGGAAAAAATTGTCTTTTTT
TTGTTATCGGTTCGTACATTATTTTATTTTTAACCTGAAACTTTAGAACTTAAAAAAAAA
AATTGAGTACAATGATTTCATCAGTAATACTTTAAAATAGTTATGATAAAACATGAATGT
TGCTTTCACTAATTAATTTTCAAGCCAGTTTGCCGATAAAATTTTAAGCACCAGTCAATT
ATTCTCTTAGCTAAAATATAAAGTACAAAAAACTGTGTGCTACCTTTTCATTATTTTAGT
ATTAATGATAAATACAATATATGGGCAGGCGAGTAGTTACCATCTGAAACATGTGTGAAA
AAGATAATTGAAAACTGAAAGTTCTTTGTGTAAAGGACCCATGGACAGTGAGTTTGGCTG
ATTTTTTCTATTTGGATTTGGAAATTTATCACATCTCTATTGTTTCCTTTCATGTGCGGT
TATAACATTTACGTGACTAAAAAAAACTAAAGATCGCCCTAACCCCACACAGATACTTCA
GATTTCAAACTTTGGAACTACTCTTATTTCTGAATTATTATTTTGCTATCTGTATAATTT
GAATACTAACAATAGGTTGTCCACAGCTAGAAAAAAGGAAAAAACTAGCGCCTTCCATAT
GATGCAAGCATATATCTATTAAACTTTCAATAGTTAAAATCAGAAGTTTTTTTCTGCTTA
AACTTAAATCAGAAGTTATTAAATACTTATTAACTGTATAAAATGTCGTGGTGAATAGAT
GGGCAAATTGGGAGTTTCACATATCGTTTGACGCTCGAGCCGGTATAGTAATCTCTCTTG
CATCCATGTTTGACATGGACGTTAAAAAATATCGGCAAGTTCTATACAAAGGCCACTTGT
CGGAGATGTTCATACCTTACATGGATCCTAGTGATGATTGGTATTTCATCACCTATCTTG
ATTGTGGCGATTTCGGTTGCGGCCAGTGCGCCGTGTCCCTTGAACCATATAGAGATTGTC
CAGCAGGTGCAGTTTTTATGGATGGGGTTTTTGCAGGTCAAGATGGAACTCCTGCGAAAA
TTCCAAATGTTATGTGCATTTTTGAGAAATATGCTGGAGATATCATGTGGAGACATACGG
AAGCTGAAATCCCAAACTTAGAAGTAATTTTACAAATATTATGTTTATATTATCATCGAG
AATGATTATATCTTATGCAGATTCTTATGATATAAAAATGATTTTTGTTTTTATATATGT
TGATGCAGATTACAGAGGTTAGACCGGACGTAAGTCTTGTAGCCAGAATCGTGACCACCG
TTGGGAACTACGACTACATAGTTGACTATGAGTTCAAGCCTAGTGGTTCCATCAAAATGG
GGGTAAAACAGTCTTATCCTGCCTTAGTCTATTATATAGCCTGCTATACATTTCCTTTAT
TATATAACTAGGTAATAATCCGCGCCTTACGCGGAATGTGATTATTAGTTTCGTTATTTT
TAATAAAAAGACATTAAATCTGTTTAATCTGGATATTCGTTCGGTTTTCAGTTTTTTTGT
TTtgtttttaatcttctaaaatataattattattttaaattaatatttatttagtttatt
cggttaaaatgtttgattttttttgtttttttagtaaaaaccaaaaattaatattattta
tttattttcatgttatgaattttagatagtcgtcatgtcgaactattagtttctaaacag
aaaatagtttaagaaaaagaaaagaAAATTATTAAGaTAAATTATTTCACTACAATTTGG
TCGGTAGCGAAAGAAGTATTAAGAAAAAATATTTCAACTTTCAAAAAATTAGATACTTCA
GTTGTGGtgaatacttagtt
Pro Sequence
MAQLHFTIFIFFSFIFAISSSSFAPPRHPFDPLTETELKLVQTIINKTYP
IGPSHKFTFQYVGLNEPDKSLVLSWYSSPKHNIKPPPRQAFVIARDNGKS
REIVVDFSSRAIVSDKIHVGNGYPMLTNDEQEAATELVLKFKPFLDSVTK
RGLNVSEIVFTTSTVGWYGESEAETERVIRMMPFYLDGTVNMYLRPIEGM
TILVNLDVMKVTEFTDRLTVIMPKANGTEYRISELKPPFGPTLQNAVFMQ
PDGPGFKIDGHVVRWANWEFHISFDARAGIVISLASMFDMDVKKYRQVLY
KGHLSEMFIPYMDPSDDWYFITYLDCGDFGCGQCAVSLEPYRDCPAGAVF
MDGVFAGQDGTPAKIPNVMCIFEKYAGDIMWRHTEAEIPNLEITEVRPDV
SLVARIVTTVGNYDYIVDYEFKPSGSIKMGVGLTGVLEVKPVEYTHISEI
KEDDIHGTIVADNTIGVNHDHFVTFRLDLDIDGSPNSFVRNELVTKRTPK
SVNTPRKSYWTTSPKTAKTETEARVKLGLKAEELVVVNPNRKTKHGNEVG
YRLLSSPPSGPLLVQDDYPQIRAAFTNYNVWITPYNRTEVWAGGLYADRS
HGDDTLAVWSQRNREIENKDIVMWYTIGFHHVPSQEDFPTMPTLSGGFEL
RPTNFFEQNPVLKSKPIKIASAKNCIPKND
mRNA Sequence
ATGGCTCAACTCCACTTCACCATTTTCATCTTCTTTTCTTTCATTTTTGCAATCTCATCTTCAAGCTTTG
CTCCACCGCGTCACCCATTTGATCCCTTAACCGAAACCGAACTCAAACTCGTCCAAACCATCATTAACAA
GACGTACCCCATTGGTCCGAGCCACAAGTTTACTTTTCAATACGTTGGTCTCAACGAACCCGACAAGTCT
CTAGTCTTGTCTTGGTACTCATCACCGAAACACAACATCAAACCACCTCCACGTCAGGCTTTCGTCATCG
CTCGAGACAACGGAAAGTCTCGAGAGATTGTCGTTGACTTTTCTTCTCGAGCCATCGTCTCTGACAAGAT
CCACGTAGGCAATGGTTACCCTATGCTCACAAACGACGAGCAAGAAGCAGCCACCGAGCTTGTTCTCAAG
TTCAAGCCGTTTCTTGACTCGGTCACAAAACGTGGTTTAAACGTTTCGGAGATTGTGTTCACGACGTCAA
CAGTTGGCTGGTATGGTGAGAGTGAGGCGGAGACGGAGAGGGTTATTAGAATGATGCCGTTTTATCTTGA
CGGGACCGTTAATATGTATCTTAGACCTATTGAAGGAATGACGATTCTCGTTAACCTTGACGTGATGAAG
GTAACGGAGTTTACGGATAGGTTAACGGTTATTATGCCGAAGGCTAACGGAACGGAGTACCGTATCTCGG
AACTTAAGCCGCCGTTTGGCCCGACGCTTCAAAATGCCGTCTTTATGCAGCCGGACGGTCCAGGATTCAA
GATCGATGGACACGTCGTGAGATGGGCAAATTGGGAGTTTCACATATCGTTTGACGCTCGAGCCGGTATA
GTAATCTCTCTTGCATCCATGTTTGACATGGACGTTAAAAAATATCGGCAAGTTCTATACAAAGGCCACT
TGTCGGAGATGTTCATACCTTACATGGATCCTAGTGATGATTGGTATTTCATCACCTATCTTGATTGTGG
CGATTTCGGTTGCGGCCAGTGCGCCGTGTCCCTTGAACCATATAGAGATTGTCCAGCAGGTGCAGTTTTT
ATGGATGGGGTTTTTGCAGGTCAAGATGGAACTCCTGCGAAAATTCCAAATGTTATGTGCATTTTTGAGA
AATATGCTGGAGATATCATGTGGAGACATACGGAAGCTGAAATCCCAAACTTAGAAATTACAGAGGTTAG
ACCGGACGTAAGTCTTGTAGCCAGAATCGTGACCACCGTTGGGAACTACGACTACATAGTTGACTATGAG
TTCAAGCCTAGTGGTTCCATCAAAATGGGGGTGGGCTTAACCGGTGTTTTAGAAGTTAAACCGGTAGAAT
ATACCCACATATCCGAGATCAAAGAAGATGATATTCACGGGACAATTGTTGCCGACAATACCATCGGTGT
TAACCACGACCATTTCGTAACGTTCCGTCTTGATCTTGACATCGACGGTTCACCTAATTCTTTTGTCCGT
AACGAACTCGTGACAAAAAGAACCCCAAAATCTGTTAACACCCCGAGAAAGAGCTATTGGACAACGAGTC
CAAAGACGGCTAAGACCGAAACGGAAGCTCGGGTGAAACTAGGGTTGAAGGCGGAGGAGCTCGTGGTAGT
AAACCCAAACCGAAAAACTAAGCATGGCAATGAAGTTGGCTATCGTTTACTTTCTAGTCCACCATCAGGC
CCACTTCTGGTCCAGGATGATTATCCACAGATTAGAGCTGCATTCACCAACTATAACGTGTGGATCACCC
CGTATAATAGGACGGAGGTTTGGGCGGGAGGTTTGTACGCCGACCGGAGCCACGGAGACGATACATTAGC
CGTGTGGTCTCAGAGGAATAGAGAAATAGAGAATAAAGATATAGTGATGTGGTACACCATCGGATTCCAC
CATGTCCCAAGCCAAGAAGATTTCCCAACGATGCCTACATTATCCGGTGGCTTTGAACTCCGACCTACCA
ACTTTTTCGAACAAAATCCTGTCCTCAAAAGCAAACCCATCAAGATCGCCTCTGCTAAAAACTGCATTCC
CAAAAATGATTAA