SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_A08G10550.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A08G10550.t1
ZS11_v0: BnaA08T0083700ZS
WE: WE_A08G11120.t1
WE_v0: BnaA08T0076900WE
Darmor: A08p10460.1_BnaDAR
BH: BnaA08T103000BH
Quinta: BnaA08T0076400QU
ZS2: BnaA08T083100ZS2
SW: BnaA08T100400SW
Express61: A08p007220.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA08G0084400XY
P202: BnaA08G007730P202.1
BL: BnaA08T103000BH
TA: BnaA08T082600TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g20140D
RB: BnaA08T100700RB
No2127: BnaA08T0053900NO
P130: BnaA08G010000P130.1
Length: 279
KOG ID: KOG1186
KOG E-value: 2.770000e-178
KOG Score: 499.0
KOG Annotation: Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism
Biological Process: GO:0009308(amine metabolic process)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0005507(copper ion binding),GO:0008131(primary amine oxidase activity),GO:0048038(quinone binding)
KEGG Ortholog: K00276 AOC3, AOC2, tynA; primary-amine oxidase [EC:1.4.3.21]
NR Protein: VDD03568.1
NR E-value: 4.900000e-162
NR Score: 575.5
NR Annotation: VDD03568.1 unnamed protein product, partial [Brassica rapa]
SwissProt Protein: P0DO00|AMO2_ARATH
SwissProt E-value: 7.500000e-156
SwissProt Score: 452.0
SwissProt Annotation: Primary amine oxidase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g31672 PE=3 SV=1
CDS Sequence (851 bp)
ATGTTCGTACCCTACATGGACCCAGTTAGTGATGATTGGTACTCTATCACTTACCTTGATTGTGGTGACT
TCGGTTGTGGTCAATCTGCGGTGTCTCTTGAGCCGTATACTGATTGTCCCACGAATGCTGCTTTCATGGA
CGGTATTTTTGCAAGCCAAGATGGAACTCCTACAAAAATCACTGAGGTGAGACCTGATGTAAGTCTTGTA
GTCCGGATGGTTACAACTGTGGGCAACTACGACTACATAGTCGACTACGAGTTCAaacctagtggttcta
tcaaagtggggGTCGGTTTAACCGGTGTTCTAGAAGATAAACCTGTGGAATATGTTCACACATCAGAGAT
CAAAGAAGACGATATCTATGGGACCATTGTCGCAGATAATACCGTCGCAGTCAACCACGACCATTTCGTG
ACATTCCGTCTTGATCTTGACGTCGATGGTAAGGACAATTCATTTGTCCGTACCAAACTTGTGACCAAGA
GGACTCAAAAATCTGTCGGCACACCGAGAAAAAGCTATTGGACAACGAATCGAAAAGTTGCAAAGACCGA
GGCAGAGGCTCGGGTGAAACTTGGACTAAGAGCGGAGGAGCTGATGGTGGTTAACCCTAACCGGAGAACG
AAGCATGGCAATGAGGTTGGATACCGTTTACTTCCTGGGACGGTTTCAGGCCCCCTTCTAACCCAAGATG
ATTACCCTCAGATTCGGGCAGCATTTACCAACTACAACGTATGGATCACCCCCTATAACAAGTCGGAGGT
TTGGGCTAGCGGTTTGTACGCCGATCGTAGCCAAGGCGACGACACGTTGGCTGTATGGTCCCAAAGGTAA
Upstream Sequence
ATGTTCGTACCCTACATGGACCCAGTTAGTGATGATTGGTACTCTATCACTTACCTTGATTGTGGTGACT
TCGGTTGTGGTCAATCTGCGGTGTCTCTTGAGCCGTATACTGATTGTCCCACGAATGCTGCTTTCATGGA
CGGTATTTTTGCAAGCCAAGATGGAACTCCTACAAAAATCACTGAGGTGAGACCTGATGTAAGTCTTGTA
GTCCGGATGGTTACAACTGTGGGCAACTACGACTACATAGTCGACTACGAGTTCAaacctagtggttcta
tcaaagtggggGTCGGTTTAACCGGTGTTCTAGAAGATAAACCTGTGGAATATGTTCACACATCAGAGAT
CAAAGAAGACGATATCTATGGGACCATTGTCGCAGATAATACCGTCGCAGTCAACCACGACCATTTCGTG
ACATTCCGTCTTGATCTTGACGTCGATGGTAAGGACAATTCATTTGTCCGTACCAAACTTGTGACCAAGA
GGACTCAAAAATCTGTCGGCACACCGAGAAAAAGCTATTGGACAACGAATCGAAAAGTTGCAAAGACCGA
GGCAGAGGCTCGGGTGAAACTTGGACTAAGAGCGGAGGAGCTGATGGTGGTTAACCCTAACCGGAGAACG
AAGCATGGCAATGAGGTTGGATACCGTTTACTTCCTGGGACGGTTTCAGGCCCCCTTCTAACCCAAGATG
ATTACCCTCAGATTCGGGCAGCATTTACCAACTACAACGTATGGATCACCCCCTATAACAAGTCGGAGGT
TTGGGCTAGCGGTTTGTACGCCGATCGTAGCCAAGGCGACGACACGTTGGCTGTATGGTCCCAAAGGTAA
Downstream Sequence
AGTATCCAATGTTATGTGCATTTTTGAAAAATATGCGGGAAACATTATGTGGCGACATAC
CGAAGCTGAGATTCCGTGGTTAAAAGTAATAAATTATAACATCGTATTATGAAATCTATC
TACGTAAATTGTACAATTCTTTagtgatgtataatatTATAAAATAGTTATATTAACATA
AAATATTGTTGCAGATCACTGAGGTGAGACCTGATGTAAGTCTTGTAGTCCGGATGGTTA
CAACTGTGGGCAACTACGACTACATAGTCGACTACGAGTTCAaacctagtggttctatca
aagtgggggtaaAATTTTTGAAAATTTTCCATGTTCATTTATTCATTAGATAATTTTATT
TTGTTAAACTAAAAAAAACAAGTTATCAAATCAATAAATTAAGATGGAAaattttaattt
tggttacaaatgctttcaaatgCTTAACTGTTTATCATTTCCATTTTGGTTACAAATGCT
TTCATACATTAACAGATTATGTTTACGTTATAAAAACGAACCCGATACATTTCCATGTAT
ATATCGCCAAACATTTACAAATGATTTACAATTATTTAAATATGAAATATTAATTTATAG
GTAAACACAGAATGTATGTGATAAAGGGGATGATTGGTAAGTGTTGTTTCTTTATCTTTT
TTGCTGTGAAATTTAATCTGTAGATTTATTTGCTGTAGCTTTCCTTGTTGTAAATTTCTA
AAGCACTAATTTTTTGCTCTGAAAATAAAGCTCTCTACAGCCATATTTTGATTTTGCAGA
GATTTTTTTGCTGTGAGTTTTTTAAGGAAAGCAAAGCTCGATTGGTTGAGATATATAGCT
GTAGACTAAATTTTGGCTGTCCAGAGCATCTACAGCCCCAACCAATCATCCCCAAATCAA
TTGAGATTCCAACTCAAAAAAGAAGTAGATTCAGAGATGTTCTTTAAAAACGCAGAATTA
TTCTCTTAACAAAATTTATGATTTTTTCTCATATTTAATTATTTTTTAATATAGTATTTA
TTGATGTAAACATTTAGGATATGTTGATTCTTTTATTTTCTTATAAATGTATTAGAGCAC
ATTTATTCCAGTTGTTTAGGGGGTGCTTATCAGCTGTGGTCCCACAAAAACAATAAGCAT
CGCAACTTCTGACTCCAAATTAAGCGCCTTGTTCTTTCATTGCTTGCACTGTTTTGCGGG
CTCCATTGATACGTGGCGGTCCGCGATTGGTTCGTTTTTAATTTTTTTTTAAATCAGATA
AAAAAATTTAGAAAAAAAAAAATTTAAGCACCCCATTTGGGATGCTAGGGTTAATGGTGC
TCTTATGTAGTTAACTAGTTTCAACCTGCTATAACAATACAGCTTAGTTAATTTATTTTT
ATTTAAATTaatgtaatttcctaaaaatattatagattctttatttaaactaaaatttaa
ttaatatttagataataTTTTAATAATTATTTcTAATtTAATTAGTTATTCAAATAATaT
GAGTCAaATATTTATAAGAATTTTATGATAAATATGAAATATCTAAACCTAAAaCATATt
ATTTAAAATATctaataataatttaattcaatgacatttcccgtaaatcaaacGTAAAAC
TGAAGTTAGTTCCATATAGTTATTAATAGAAAATAATCAAATATTACTTTTAACCATGTA
CAATCATTTGATTTTCTTGTCCTTAACATTGTCACTTGTGCCTACCTAGGTCGGTTTAAC
CGGTGTTCTAGAAGATAAACCTGTGGAATATGTTCACACATCAGAGATCAAAGAAGACGA
TATCTATGGGACCATTGTCGCAGATAATACCGTCGCAGTCAACCACGACCATTTCGTGAC
ATTCCGTCTTGATCTTGACGTCGATGGTAAGGACAATTCATTTGTCCGTACCAAACTTGT
GACCAAGAGGACTCAAAAATCTGTCGGCACACCGAGAAAAAGCTATTGGACAACGAATCG
AAAAGTTGCAAAGACCGAGG
Pro Sequence
MFVPYMDPVSDDWYSITYLDCGDFGCGQSAVSLEPYTDCPTNAAFMDGIF
ASQDGTPTKITEVRPDVSLVVRMVTTVGNYDYIVDYEFKPSGSIKVGVGL
TGVLEDKPVEYVHTSEIKEDDIYGTIVADNTVAVNHDHFVTFRLDLDVDG
KDNSFVRTKLVTKRTQKSVGTPRKSYWTTNRKVAKTEAEARVKLGLRAEE
LMVVNPNRRTKHGNEVGYRLLPGTVSGPLLTQDDYPQIRAAFTNYNVWIT
PYNKSEVWASGLYADRSQGDDTLAVWSQR
mRNA Sequence
ATGTTCGTACCCTACATGGACCCAGTTAGTGATGATTGGTACTCTATCACTTACCTTGATTGTGGTGACT
TCGGTTGTGGTCAATCTGCGGTGTCTCTTGAGCCGTATACTGATTGTCCCACGAATGCTGCTTTCATGGA
CGGTATTTTTGCAAGCCAAGATGGAACTCCTACAAAAATCACTGAGGTGAGACCTGATGTAAGTCTTGTA
GTCCGGATGGTTACAACTGTGGGCAACTACGACTACATAGTCGACTACGAGTTCAaacctagtggttcta
tcaaagtggggGTCGGTTTAACCGGTGTTCTAGAAGATAAACCTGTGGAATATGTTCACACATCAGAGAT
CAAAGAAGACGATATCTATGGGACCATTGTCGCAGATAATACCGTCGCAGTCAACCACGACCATTTCGTG
ACATTCCGTCTTGATCTTGACGTCGATGGTAAGGACAATTCATTTGTCCGTACCAAACTTGTGACCAAGA
GGACTCAAAAATCTGTCGGCACACCGAGAAAAAGCTATTGGACAACGAATCGAAAAGTTGCAAAGACCGA
GGCAGAGGCTCGGGTGAAACTTGGACTAAGAGCGGAGGAGCTGATGGTGGTTAACCCTAACCGGAGAACG
AAGCATGGCAATGAGGTTGGATACCGTTTACTTCCTGGGACGGTTTCAGGCCCCCTTCTAACCCAAGATG
ATTACCCTCAGATTCGGGCAGCATTTACCAACTACAACGTATGGATCACCCCCTATAACAAGTCGGAGGT
TTGGGCTAGCGGTTTGTACGCCGATCGTAGCCAAGGCGACGACACGTTGGCTGTATGGTCCCAAAGGTAA