SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_A08G35660.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A08G35660.t1
ZS11_v0: BnaA08T0303900ZS
WE: WE_A08G36890.t1
WE_v0: BnaA08T0283300WE
Darmor: A08p35660.1_BnaDAR
BH: BnaA08T350900BH
Quinta: BnaA08T0295700QU
ZS2: BnaA08T306600ZS2
SW: BnaA08T346900SW
Express61: A08p028940.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA08G0308500XY
P202: BnaC08G004880P202.1
BL: BnaA08T350900BH
TA: BnaA08T310200TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g38270D
RB: BnaA08T343300RB
No2127: BnaA08T0272100NO
P130: BnaA08G031220P130.1
Length: 262
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 1.500000e-149
KOG Score: 419.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: XP_013657555.1
NR E-value: 2.700000e-146
NR Score: 523.1
NR Annotation: XP_013657555.1 tropinone reductase homolog At1g07450 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q8RX32|TRNH2_ARATH
SwissProt E-value: 6.350000e-149
SwissProt Score: 419.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At1g07450 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g07450 PE=2 SV=1
CDS Sequence (800 bp)
ATGGATAGCCGGTGGAGTCTTCGAGGTATGACAGCTCTTGTAACCGGTGGAACCAAGGGAATTGGGTATG
CGATAGTGGAGGAACTTGCTGGTTTTGGTGCAAGAGTTCACACGTGTGCTAGAGACCAAACTCTGCTTGA
TGAATGTTTAAGTGAATGGAAAGAGAAAGGGTTTCAAGTCACTGGCTCAGTCTGTGATGTATCCTCTCGA
CCTCAGAGAGATGAGTTGATGAAGACGGTCTCTTCTCTATTCAGTGGCAAACTCAACATCCTTATTAACA
CTGTTGGTACCCGTGTGTCAAAGCCGACTACAGAGTTTACAGCACAAGATTTCTCAGGTCAAATAGCTAC
CAATTTGGATTCTGCTTATCACTTCTCTCAACTGGCCCATCCTTTACTTAAGGCATCAGGATTTGGTAGC
ATTGTGTTCTTGTCTTCAGTATGTGGGGTTGTCTCATCTGGTTTTGTATCTATATACAGCTTAACAAAAG
GATGCATGAATCAACTGGCAAGGAACTTGGCATGTGAATGGGCAAGTGATGGCATAAGGGCTAACTCTGT
AGCTCCTTGGATGACAAAAACTCCTCTTGTCCAAAAACGTCTTGATGACGAGAAATTCGCGGAGGCTATC
TTCTCAAGAACTCCATTAGGTCGTGCGTGTGAGCCGCGTGAGGTTGCCTCGTTGGTTACCTTTCTTTGTC
TCCCTGCAGCTTCTTATATAACAGGACAAACCATTTGTATTGATGGAGGTTTCACTGTTAATGGCTTCTC
CTACAAGCCAGAGGTTTAA
Upstream Sequence
ACGTATTCTGACTGATACTTTACGATGGATAGCCGGTGGAGTCTTCGAGGTATGACAGCTCTTGTAACCG
GTGGAACCAAGGGAATTGGGTATGCGATAGTGGAGGAACTTGCTGGTTTTGGTGCAAGAGTTCACACGTG
TGCTAGAGACCAAACTCTGCTTGATGAATGTTTAAGTGAATGGAAAGAGAAAGGGTTTCAAGTCACTGGC
TCAGTCTGTGATGTATCCTCTCGACCTCAGAGAGATGAGTTGATGAAGACGGTCTCTTCTCTATTCAGTG
GCAAACTCAACATCCTTATTAACACTGTTGGTACCCGTGTGTCAAAGCCGACTACAGAGTTTACAGCACA
AGATTTCTCAGGTCAAATAGCTACCAATTTGGATTCTGCTTATCACTTCTCTCAACTGGCCCATCCTTTA
CTTAAGGCATCAGGATTTGGTAGCATTGTGTTCTTGTCTTCAGTATGTGGGGTTGTCTCATCTGGTTTTG
TATCTATATACAGCTTAACAAAAGGATGCATGAATCAACTGGCAAGGAACTTGGCATGTGAATGGGCAAG
TGATGGCATAAGGGCTAACTCTGTAGCTCCTTGGATGACAAAAACTCCTCTTGTCCAAAAACGTCTTGAT
GACGAGAAATTCGCGGAGGCTATCTTCTCAAGAACTCCATTAGGTCGTGCGTGTGAGCCGCGTGAGGTTG
CCTCGTTGGTTACCTTTCTTTGTCTCCCTGCAGCTTCTTATATAACAGGACAAACCATTTGTATTGATGG
AGGTTTCACTGTTAATGGCTTCTCCTACAAGCCAGAGGTTTAAACCCTAAAAACACTTCCAGAACAACAT
GTTGTAGTAATGTATTATAATTTAGTTAtatatgtTGTTGAAAACTAAATAATCTCAAGCTTATGAAACA
GAAAGTTGAGAATGGACTTTTAAGATTTTGTCTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTGTGCATCTTAAACTTTGT
CTTGGAAAGCAAGGAACTGATGCGTCAGCAGATCTATCAATGTAATAACAAAGGGAATACTTGAATGAAA
CATTTCTAAATGTAGCTATGCATATGTATCCA
Downstream Sequence
GTTCGTCTTCTTCCTCCAAAATCCTCTGTTTCTTAGCTTTCATCTCAAGACACGAAGTAA
GATTGATACATGAATGCTTGAGGAATATGATTTTGTAACTTCAGGTATGCGATAGTGGAG
GAACTTGCTGGTTTTGGTGCAAGAGTTCACACGTGTGCTAGAGACCAAACTCTGCTTGAT
GAATGTTTAAGTGAATGGAAAGAGAAAGGGTTTCAAGTCACTGGCTCAGTCTGTGATGTA
TCCTCTCGACCTCAGAGAGATGAGTTGATGAAGACGGTCTCTTCTCTATTCAGTGGCAAA
CTCAACATCCTTGTAAGTTAATCCTAAGGTTTTTCATTCATTTTTTTTTTGAATTACCAG
GAGATACGGGCCGAAGCCCTAATTCCCCCAGACCCGAAACCACATAATATAATATTAGTT
TTTTCTCAACGGTCATTCGAACTAGGGACCTCTGACATTTCATGAATTTTTAATGTCTTT
CATCACTATCATTACTTGCTTTGATGCAGATTAACACTGTTGGTACCCGTGTGTCAAAGC
CGACTACAGAGTTTACAGCACAAGATTTCTCAGGTCAAATAGCTACCAATTTGGATTCTG
CTTATCACTTCTCTCAACTGGCCCATCCTTTACTTAAGGCATCAGGATTTGGTAGCATTG
TGTTCTTGTCTTCAGTATGTGGGGTTGTCTCATCTGGTTTTGTATCTATATACAGCTTAA
CAAAAGGTTCACTCAAAACTCTTTTTTTTTAAATGATGTCTATATATACACATCTAAGCA
ACTTGAAATGCAGGATGCATGAATCAACTGGCAAGGAACTTGGCATGTGAATGGGCAAGT
GATGGCATAAGGGCTAACTCTGTAGCTCCTTGGATGACAAAAACTCCTCTTGTCCAAAAA
GTAATCTAAAACGTTTTTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTCTTGTAACCTGAATCTTGG
CTTTTTTTTCCAGCGTCTTGATGACGAGAAATTCGCGGAGGCTATCTTCTCAAGAACTCC
ATTAGGTCGTGCGTGTGAGCCGCGTGAGGTTGCCTCGTTGGTTACCTTTCTTTGTCTCCC
TGCAGCTTCTTATATAACAGGACAAACCATTTGTATTGATGGAGGTTTCACTGTTAATGG
CTTCTCCTACAAGCCAGAGGTTTAAACCCTAAAAACACTTCCAGAACAACATGTTGTAGT
AATGTATTATAATTTAGTTAtatatgtTGTTGAAAACTAAATAATCTCAAGCTTATGAAA
CAGAAAGTTGAGAATGGACTTTTAAGATTTTGTCTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTGTGCAT
CTTAAACTTTGTCTTGGAAAGCAAGGAACTGATGCGTCAGCAGATCTATCAATGTAATAA
CAAAGGGAATACTTGAATGAAACATTTCTAAATGTAGCTATGCATATGTATCCAACATTT
TATTTATTTTTCTCTAATAAAATCAAGAAAGTAATACATTTATAGAGTTCAATCACATCA
TAAAGAACATTATTACAAGTTTACAGATTATGATCAGTTTGGTGCCCTTAGCGTTTGCAG
TTGCTGAATCCGAAGGAGTATCTGAAATAAGATCAAAGTCATCTAACTCAGATGGCGACG
GAGCTGAAACTGAAGGAAGTAGAGTGAGATCAAACTCTTTTGCTTTGCCTTCTCTACTAA
AGCTCCATCCAAGAACATAATGATTACTCGTCATGTTTCCCGTGGATGCTGAGAATCCGA
CAAACATCTTGTCGTTAAAAATCTCTGTAAGATTCATCTTTCTTGACATAAGAGGAAGCT
TAGGTTTAGAAATGTCGAGAGGAGCCAATGTGACGTTGAGAACCATCTCCTCTCCATCGT
ATTCGATCCAAGCCCGTATCGGATCTTTGCTAGAAAGCTTCAAGGTTATATTCTTGCTAT
GCCGGTTTGAGAAAAACGCAGCTGGTGCAGATTCAACTGAGACCAAACCGTTGACGTCGA
TCCCCACGTGGTTACCGTCG
Pro Sequence
MDSRWSLRGMTALVTGGTKGIGYAIVEELAGFGARVHTCARDQTLLDECL
SEWKEKGFQVTGSVCDVSSRPQRDELMKTVSSLFSGKLNILINTVGTRVS
KPTTEFTAQDFSGQIATNLDSAYHFSQLAHPLLKASGFGSIVFLSSVCGV
VSSGFVSIYSLTKGCMNQLARNLACEWASDGIRANSVAPWMTKTPLVQKR
LDDEKFAEAIFSRTPLGRACEPREVASLVTFLCLPAASYITGQTICIDGG
FTVNGFSYKPEV
mRNA Sequence
ACGTATTCTGACTGATACTTTACGATGGATAGCCGGTGGAGTCTTCGAGGTATGACAGCTCTTGTAACCG
GTGGAACCAAGGGAATTGGGTATGCGATAGTGGAGGAACTTGCTGGTTTTGGTGCAAGAGTTCACACGTG
TGCTAGAGACCAAACTCTGCTTGATGAATGTTTAAGTGAATGGAAAGAGAAAGGGTTTCAAGTCACTGGC
TCAGTCTGTGATGTATCCTCTCGACCTCAGAGAGATGAGTTGATGAAGACGGTCTCTTCTCTATTCAGTG
GCAAACTCAACATCCTTATTAACACTGTTGGTACCCGTGTGTCAAAGCCGACTACAGAGTTTACAGCACA
AGATTTCTCAGGTCAAATAGCTACCAATTTGGATTCTGCTTATCACTTCTCTCAACTGGCCCATCCTTTA
CTTAAGGCATCAGGATTTGGTAGCATTGTGTTCTTGTCTTCAGTATGTGGGGTTGTCTCATCTGGTTTTG
TATCTATATACAGCTTAACAAAAGGATGCATGAATCAACTGGCAAGGAACTTGGCATGTGAATGGGCAAG
TGATGGCATAAGGGCTAACTCTGTAGCTCCTTGGATGACAAAAACTCCTCTTGTCCAAAAACGTCTTGAT
GACGAGAAATTCGCGGAGGCTATCTTCTCAAGAACTCCATTAGGTCGTGCGTGTGAGCCGCGTGAGGTTG
CCTCGTTGGTTACCTTTCTTTGTCTCCCTGCAGCTTCTTATATAACAGGACAAACCATTTGTATTGATGG
AGGTTTCACTGTTAATGGCTTCTCCTACAAGCCAGAGGTTTAAACCCTAAAAACACTTCCAGAACAACAT
GTTGTAGTAATGTATTATAATTTAGTTAtatatgtTGTTGAAAACTAAATAATCTCAAGCTTATGAAACA
GAAAGTTGAGAATGGACTTTTAAGATTTTGTCTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTGTGCATCTTAAACTTTGT
CTTGGAAAGCAAGGAACTGATGCGTCAGCAGATCTATCAATGTAATAACAAAGGGAATACTTGAATGAAA
CATTTCTAAATGTAGCTATGCATATGTATCCA