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Detail for ZS11_A09G08680.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A09G08680.t1
ZS11_v0: BnaC09T0081800ZS
WE: WE_C09G09990.t1
WE_v0: BnaC09T0090900WE
Darmor: C09p09730.1_BnaDAR
BH: BnaA09T098500BH
Quinta: BnaC09T0085900QU
ZS2: BnaC09T082200ZS2
SW: BnaC09T055800SW
Express61: A09p007120.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC09G0085500XY
P202: BnaC09G010320P202.1
BL: BnaA09T098500BH
TA: BnaA09T078000TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaA09T084300RB
No2127: BnaC09T0050800NO
P130: BnaC09G006820P130.1
Length: 427
KOG ID: KOG1284
KOG E-value: Not available
KOG Score: 665.0
KOG Annotation: Coenzyme transport and metabolism
Biological Process: GO:0009231(riboflavin biosynthetic process)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0003935(GTP cyclohydrolase II activity),GO:0008686(3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase activity)
KEGG Ortholog: K14652 ribBA; 3,4-dihydroxy 2-butanone 4-phosphate synthase / GTP cyclohydrolase II [EC:4.1.99.12 3.5.4.25]
NR Protein: XP_013661292.1
NR E-value: 1.400000e-200
NR Score: 704.1
NR Annotation: XP_013661292.1 bifunctional riboflavin biosynthesis protein RIBA 1, chloroplastic [Brassica napus]
SwissProt Protein: P47924|RIBA1_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 665.0
SwissProt Annotation: Bifunctional riboflavin biosynthesis protein RIBA 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RIBA1 PE=1 SV=2
CDS Sequence (1302 bp)
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CCTCTACTACTACATTGCTCCACCCTGAAGACGATGACTACGAGCTGGATCTACCCACACCTGGCTTCTC
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GAAAACGAAGGAGACTTGGTAATGGCTGCTCAGTTAGCTACACCTGAGGCTATGGCTTTTATTGTCAAAC
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GAAGAGGGCCAAGATGGGTCACATGTATGGTTTGAAGTTTAATGGTGATGATGTTGTAGAGAAGATTGAT
GATTCTGCAACCACCGAGTCATGA
Upstream Sequence
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CCTCTACTACTACATTGCTCCACCCTGAAGACGATGACTACGAGCTGGATCTACCCACACCTGGCTTCTC
TTCAATCCCTGAAGCCATCGAAGACATACGCCAAGGAAAGCTTGTGGTGGTTGTTGATGATGAAGACAGA
GAAAACGAAGGAGACTTGGTAATGGCTGCTCAGTTAGCTACACCTGAGGCTATGGCTTTTATTGTCAAAC
ATGGAACTGGGATTGTTTGTGTGAGTATGAAAGATGATGATCTCCAGAGGTTGAACCTTCCTCTGATGGT
TAACCAGAAGGAGAACGAAGAGAAGCTCTGCACTGCATTCACAGTCACTGTCGATGCAAAACATGGTACA
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AGATTTCATCCGTCCAGGGCATATCTTTCCTCTCAACTGGACTAGAACCTGTTGGAGTACTCTGTGAGAT
TGTTGATGATGATGGTTCCATGGCTAGATTACCAAAGCTCATGAAGTTTGCAGCTGAAAACAACCTCAAA
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CTCGGATTCCGACAATGTGGGGACCTTTCACAGCTTATTGCTACAAGTCTATACTAGACGGTATCGAACA
CATTGCAATGGTTAAGGGAGAGATTGGTGACGGTCAAGACATTCTAGTGAGGGTTCATTCAGAATGTCTC
ACGGGAGACATATTTGGATCACAGATTGAGTCTGCTGGTCGTGGTGTGTTGGTTTACTTGCGTGGACATG
AAGGAAGAGGGATTGGTTTAGGACACAAGCTTAGAGCTTATAATCTGCAAGATGCTGGGAGGGATACAGT
TGAAGCTAATGAGGAGCTAGGACTTCCTGTTGATTCTAGAGAGTATGGTATTGGTGCACAGGTACTGAGG
GATTTGGGAGTGAGGACGATGAAGCTGATGACGAATAATCCGGCTAAGTATGTTGGTTTGAAGGGGTATG
GATTAGCTATTGTGGGGAGAGTGCCTCTCTTGAGTCTTATCACAAAGGAGAATAAGAGATATTTGGAGAC
GAAGAGGGCCAAGATGGGTCACATGTATGGTTTGAAGTTTAATGGTGATGATGTTGTAGAGAAGATTGAT
GATTCTGCAACCACCGAGTCATGA
Downstream Sequence
GTCAGCTTCCTCTCTTCCTCATCTCAAAGATTAAAGCTTTATTTCTTCCCTTACGTTTAA
TGCCAATCTCAAATGATTTGATTTGATGATGATGATGATTCCATGTGCAGACTTAGCCAA
ACCTCTACTACTACATTGCTCCACCGTATCACTCTCCCATCATCATCCTTCTCAATTAAA
ACCACTTCAAAAGTCAAAGCTTCAGTGATCTCTAGAGAAGATGATCTCTCTCTTCTTACA
ACACCAATGGTTCTCTCGTTGACCAAGACTCCTCATCCCCTGCACCACCCAATGGCTTCG
TAGCTGAAGACGATGACTACGAGCTGGATCTACCCACACCTGGCTTCTCTTCAATCCCTG
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GTTTCAACCTTTTTTTTTTTGGTTTCCTTTGATTGATTTGGTTGGTAATGTTTGTGTGTA
GCTTGTGGTGGTTGTTGATGATGAAGACAGAGAAAACGAAGGAGACTTGGTAATGGCTGC
TCAGTTAGCTACACCTGAGGCTATGGCTTTTATTGTCAAACATGGAACTGGGATTGTTTG
TGTGAGTATGAAAGATGATGATCTCCAGAGGTTGAACCTTCCTCTGATGGTTAACCAGAA
GGAGAACGAAGAGAAGCTCTGCACTGCATTCACAGTCACTGTCGTATGTCTTTCTTCTCC
TCTCAATAAAAAGTTCCCATCTTAGTGCTGAGTTTTGGAGAATCTGTTGCTCATTGTTTT
GTCATGGTTCCAAAAATTTGTATTGAGTTTAAACCGATTTAAACCGTTTTAAATCGGTTT
AAATTGATCTAAATAGTCTAAATATGTTAAATTAAGTAATACAAATCCATAAATTTGTCT
AATTACTTTTGTTAAAGAACTCAAAACTAAAATATCTTATAAAAATGTAAAATATATATT
TAATATAAATTAAAAATTTGTTAAAATCTAGGCATAGTTTACTGCCTAGCAATTTTTTGA
ACATTGTGTTTTGTTTGCTTTGTAGGATGCAAAACATGGTACAACGACAGAGTATCAGCA
CGTGACAGGGCAACAACGATACTGTCACTTGCGTCTAGAGACTCAAAGCCTGAAGATTTC
ATCCGTCCAGGGCATATCTTTCCTCTCAAGTACCGAGAAGGCGGAGTTTTAAGAAGAGCT
GGACACACTGAAGCATCTCTTGATCTTACTGTCTTAGCTGGACTAGAACCTGTTGGAGTA
CTCTGTGAGATTGTTGATGATGATGGTTCCATGGCTAGATTACCAAAGCTCATGAAGTTT
GCAGCTGAAAACAACCTCAAAATTGTTTCCATTGCAGATTTGATCAGGTTAGGCCACTCT
AAAGTCTTAAGGTTTTGTGTTTTTTTTTTTTTGTTTGGGTAATTAAAAGGTGGTTTTCAT
CTCTTTGCCGGTAAACCAATCAATATAAATAGTTTCTCCCAACGAGAATTGAACCCGAGT
GCTTACTAGACACTTCTTTACCACTAGACCGACCAACAGCTTGTTGGCTTTGTGTCTCTT
TGAAGCTGAGAGTCTAAACTTTATGGTTTCTGTTAATGAACAGATATCGAAGGAAGAGAG
ATAAGCTAGTGGAACGTTCTTCTGCAGCTCGGATTCCGACAATGTGGGGACCTTTCACAG
CTTATTGCTACAAGTCTATACTAGACGGTATCGAACACATTGCAATGGTTAAGGTTAGTA
GCAACATCTCTTGTTGCTTTGGACTTGAGAACAAGATCTCATTTGTCTGAAACTGTGTGC
AGGGAGAGATTGGTGACGGTCAAGACATTCTAGTGAGGGTTCATTCAGAATGTCTCACGG
GAGACATATTTGGATCAGCAAGGTGTGACTGCGGGAATCAGCTAGTTTGCGATGCAGCAG
ATTGAGTCTGCTGGTCGTGGTGTGTTGGTTTACTTGCGTGGACATGAAGGAAGAGGGATT
GGTTTAGGACACAAGCTTAG
Pro Sequence
MSSINLTSSSPSTISLSCSRLSQTSTTTLLHPEDDDYELDLPTPGFSSIP
EAIEDIRQGKLVVVVDDEDRENEGDLVMAAQLATPEAMAFIVKHGTGIVC
VSMKDDDLQRLNLPLMVNQKENEEKLCTAFTVTVDAKHGTTTEYQHVTGQ
QRYCHLRLETQSLKISSVQGISFLSTGLEPVGVLCEIVDDDGSMARLPKL
MKFAAENNLKIVSIADLIRYRRKRDKLVERSSAARIPTMWGPFTAYCYKS
ILDGIEHIAMVKGEIGDGQDILVRVHSECLTGDIFGSQIESAGRGVLVYL
RGHEGRGIGLGHKLRAYNLQDAGRDTVEANEELGLPVDSREYGIGAQVLR
DLGVRTMKLMTNNPAKYVGLKGYGLAIVGRVPLLSLITKENKRYLETKRA
KMGHMYGLKFNGDDVVEKIDDSATTES
mRNA Sequence
ATGTCTTCGATCAATCTAACGTCTTCCTCTCCTTCCACCATATCTCTCTCCTGCTCAAGACTTAGCCAAA
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TTCAATCCCTGAAGCCATCGAAGACATACGCCAAGGAAAGCTTGTGGTGGTTGTTGATGATGAAGACAGA
GAAAACGAAGGAGACTTGGTAATGGCTGCTCAGTTAGCTACACCTGAGGCTATGGCTTTTATTGTCAAAC
ATGGAACTGGGATTGTTTGTGTGAGTATGAAAGATGATGATCTCCAGAGGTTGAACCTTCCTCTGATGGT
TAACCAGAAGGAGAACGAAGAGAAGCTCTGCACTGCATTCACAGTCACTGTCGATGCAAAACATGGTACA
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AAGGAAGAGGGATTGGTTTAGGACACAAGCTTAGAGCTTATAATCTGCAAGATGCTGGGAGGGATACAGT
TGAAGCTAATGAGGAGCTAGGACTTCCTGTTGATTCTAGAGAGTATGGTATTGGTGCACAGGTACTGAGG
GATTTGGGAGTGAGGACGATGAAGCTGATGACGAATAATCCGGCTAAGTATGTTGGTTTGAAGGGGTATG
GATTAGCTATTGTGGGGAGAGTGCCTCTCTTGAGTCTTATCACAAAGGAGAATAAGAGATATTTGGAGAC
GAAGAGGGCCAAGATGGGTCACATGTATGGTTTGAAGTTTAATGGTGATGATGTTGTAGAGAAGATTGAT
GATTCTGCAACCACCGAGTCATGA