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Detail for ZS11_A09G43300.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A09G43300.t1
ZS11_v0: BnaA09T0445200ZS
WE: WE_A09G41390.t1
WE_v0: BnaA09T0416000WE
Darmor: A09p40380.1_BnaDAR
BH: Bnascaffold0066T000900BH
Quinta: BnaA09T0422300QU
ZS2: BnaC02T164100ZS2
SW: BnaA02T149000SW
Express61: A09p031450.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA09G0422600XY
P202: BnaA02G008480P202.1
BL: Bnascaffold0066T000900BH
TA: BnaC02T167500TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g16770D
RB: BnaA02T147200RB
No2127: BnaA09T0376800NO
P130: BnaA09G038570P130.1
Length: 222
KOG ID: KOG3135
KOG E-value: 1.450000e-49
KOG Score: 162.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K03809 wrbA; NAD(P)H dehydrogenase (quinone) [EC:1.6.5.2]
NR Protein: CDY16208.1
NR E-value: 3.200000e-124
NR Score: 449.5
NR Annotation: CDY16208.1 BnaA09g29420D [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q6NQE2|FQRL1_ARATH
SwissProt E-value: 1.570000e-53
SwissProt Score: 173.0
SwissProt Annotation: Probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27270 PE=1 SV=1
CDS Sequence (678 bp)
ATGGCTGTAGAGTGTACAAGTAACGTCTACATTATTGAATATGCAACAGTTATTAAACCATGTGCCAGTG
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Upstream Sequence
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Downstream Sequence
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TGCTAAGACTTCTTCTCTATGGTAGGTAAATCGACTTTCAGGGAAACAGAAGTTAGCCAT
CACTGCTGTTCAAAATCCAT
Pro Sequence
MAVECTSNVYIIEYATVIKPCASGWMVARWSSVANQAKFESDYTQISLTR
GHRCFNILLPGSDLPFLFMYYSIYRHVENLAQEIRKLRCWLLLMVSMPNS
GRSVPETLQEDLLSKMSAPPKSDAPLVTPNDLAEADGFVFGFPTRFSMMA
AQFKVFLDATGGLRRTQQLAGNLAGILYSTRSQGGGQNRVNRLSGKQKLA
ITAVQNPFICEDRFIHFSQFQL
mRNA Sequence
ATGGCTGTAGAGTGTACAAGTAACGTCTACATTATTGAATATGCAACAGTTATTAAACCATGTGCCAGTG
GTTGGATGGTAGCACGGTGGTCCAGCGTCGCTAACCAAGCTAAGTTCGAATCTGACTACACTCAGATATC
CCTAACACGTGGCCACCGGTGTTTTAATATTCTCTTGCCGGGGAGCGATTTACCGTTTCTTTTTATGTAC
TACTCAATATACAGACATGTGGAGAACCTAGCACAAGAGATTAGGAAATTAAGGTGCTGGCTTCTGTTGA
TGGTGTCGATGCCAAACTCTGGCAGGTCAGTACCAGAGACGCTCCAAGAAGATCTGCTCTCTAAAATGAG
TGCACCGCCAAAGAGTGATGCTCCTCTTGTCACCCCCAACGACCTTGCTGAGGCTGATGGGTTTGTCTTT
GGCTTCCCAACAAGGTTCAGTATGATGGCTGCTCAGTTCAAGGTATTCTTAGATGCAACTGGTGGCCTCC
GGCGGACTCAACAACTTGCTGGTAATCTAGCTGGAATCTTATACAGCACCAGGTCTCAAGGTGGTGGTCA
AAACCGCGTAAATCGACTTTCAGGGAAACAGAAGTTAGCCATCACTGCTGTTCAAAATCCATTTATATGT
GAGGACCGTTTTATTCATTTTTCTCAGTTCCAGTTATGA