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Detail for ZS11_A09G51150.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A09G51150.t1
ZS11_v0: BnaA09T0510400ZS
WE: WE_A09G49350.t1
WE_v0: BnaA09T0479300WE
Darmor: A09p48140.1_BnaDAR
BH: BnaA09T490800BH
Quinta: BnaA09T0487400QU
ZS2: BnaA09T413600ZS2
SW: BnaC08T352000SW
Express61: A09p037580.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC08G0344600XY
P202: BnaA09G045120P202.1
BL: BnaA09T490800BH
TA: BnaA09T408800TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaA09T445400RB
No2127: BnaC08T0310600NO
P130: BnaA09G044870P130.1
Length: 243
KOG ID: -
KOG E-value: Not available
KOG Score: Not available
KOG Annotation: -
Biological Process: GO:0009813(flavonoid biosynthetic process)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0045430(chalcone isomerase activity),GO:0016872(intramolecular lyase activity)
KEGG Ortholog: K01859 E5.5.1.6; chalcone isomerase [EC:5.5.1.6]
NR Protein: XP_009116218.1
NR E-value: 4.200000e-133
NR Score: 479.2
NR Annotation: XP_009116218.1 PREDICTED: chalcone--flavonone isomerase-like isoform X1 [Brassica rapa]
SwissProt Protein: O22651|CFI_RAPSA
SwissProt E-value: 3.100000e-96
SwissProt Score: 284.0
SwissProt Annotation: Chalcone--flavonone isomerase OS=Raphanus sativus OX=3726 GN=CHI PE=2 SV=1
CDS Sequence (742 bp)
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Upstream Sequence
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Downstream Sequence
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AATATTGTCTAAGAAGCTTTCAATTGATATCATAGTTTAATTTTTATTAGTTTTTTTTGT
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CATAATATATATATATATATGTCATAAAAATTACCATCAAATCAGTTTTACTTTTTTTTT
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TTCTAACAATTTGATTGATTTAATTAATTTGCTTTGGTGGATAACTTAAAAAGTTTTCAT
ATGAATCGGGGAAAGCAAGC
Pro Sequence
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EFVISTVIGVYLDPNALEGLPFCGTTEELAESVPFFRQIVTGPFEKFIKV
TMKLPLTEQQYSEKVTENCEAIWESLGINAYSDSHICEHCDPPPSAKLRF
NKITKTFGPYRHYSRGHAVVRFLEIFKHKKFPPGASILFAISPKGSLTVA
FSSDDGIPKRGNTAIENKFLAEAILESIIGKNGVSPGARLSVA
mRNA Sequence
ATGTTTTCTTCCGGCATTCAGACACCGTTACCCTCCGTCACGAATCTTCAAGTTGATTCCGTTAACTTTC
CACCGTCCGTCATCTCACCGGCTTCCTCCAACCGACTCTTCCTCGCTGGCGCAGGTGTGCAAGGTTTGGA
TATCCAAGGAGAGTTTGTGATCTCCACCGTCATCGGAGTTTACCTAGATCCTAACGCCTTAGAGGGACTT
CCCTTTTGCGGTACGACAGAGGAGTTAGCGGAATCCGTCCCTTTCTTCCGTCAAATCGTCACAGGTCCTT
TTGAGAAATTCATTAAGGTGACGATGAAACTCCCGTTAACGGAACAGCAATATTCGGAAAAAGTAACAGA
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