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Detail for ZS11_A09G61800.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A09G61800.t1
ZS11_v0: BnaC08T0459600ZS
WE: WE_A09G60160.t1
WE_v0: BnaA09T0573100WE
Darmor: A09p58940.1_BnaDAR
BH: BnaA09T589700BH
Quinta: BnaA09T0581100QU
ZS2: BnaC08T428500ZS2
SW: BnaC08T459800SW
Express61: A09p046820.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC08G0450200XY
P202: BnaA07G000430P202.2
BL: BnaA09T589700BH
TA: BnaA09T506900TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaC08T460000RB
No2127: BnaC08T0403200NO
P130: BnaA07G006960P130.1
Length: 437
KOG ID: KOG2865
KOG E-value: Not available
KOG Score: 704.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K03953 NDUFA9; NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex subunit 9
NR Protein: XP_013664263.1
NR E-value: 6.600000e-230
NR Score: 801.6
NR Annotation: XP_013664263.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9SK66|NDUA9_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 721.0
SwissProt Annotation: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g20360 PE=1 SV=2
CDS Sequence (1332 bp)
ATGTTTGAGCCGAGCCCATCTACGTGTATCCTCGCGGCAGCAAATCCCTCCCATCTCCATTTCTCTCTCT
CTCATTCATCTGTGTGTTGTTGCTTCTCGAGGATGCAGGCAGTTTCCAGGAGACTAGTCCAACGGCCCCT
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CCTAACTTCGGTTCCACTGTCAGTGAAAAGATACCAACAGACTTCTACAATTGA
Upstream Sequence
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TCCATTTCTCTCTCTCTCATTCATCTGTGTGTTGTTGCTTCTCGAGGATGCAGGCAGTTTCCAGGAGACT
AGTCCAACGGCCCCTCGGCGGAGGAGCTTCGATCTATTCGTCGTCTTCTCTCAGATCGCTCTATGGAGTC
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GAGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGAATCTTGAACCCCTGGGCAATGTTCGTTAAAAAATAT
GGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACCAACAAATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTTGCTGCTG
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CTTGACGTTTCAGGACTTGGACCTTGTCCCTCATAAATTGAAGGGGTATCCGGTCGAGTTTCTTATTCAA
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GGGCGATTTGGTCCCCAGTTTCTGGTTCGTTTCAAACTTCATGAGCTACTTTGCTCTTGAAGCCATTTGT
TTTCGTATTTGCATTTCATATAGCTCAGAGTTGTATGTTTTACTTTGCGCTAAAACGTTTAAACGTGTAT
ATGCGTGTGCAATAAGTACACCCTTGGAGGGTATTTCTACTCCTTATCTGCGGATTATAAAACAATATTT
TGTTTTAGGGTGGGTAATGAATCTAGC
Downstream Sequence
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CTTGCTACAAAGGGCGTGGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCTTCCGTC
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CTCTTAGGGGTTTTGGAGTAGCTTTAGTATATAATGAGATCTTGATTCCTCCTTTGCTTT
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GTTCTTCCTTTGCATTTTTTGGGTTTGTAATTACTTGCAAATGAATCTTTTTTTTTTTTC
AGCTAAAATGGGATCACAAGTGCTAGTTCCGTTCCGAGGCTCAGAGGACAATCCTCGACA
TCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTAATGTTTTTTTTGTGTAACACAATGCTTTT
GAGGGTGTCACAAACACTTTTTTTTTGTGTGGAATGTTAAGCTTTGGATCGACAAACTTT
TGATGTGTGTTGACTGTATATACCAGGTTGTACCGATGAAATTTGATCCAAGAGATGAAG
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CTATTTTGTTTAAATCTTTTAGAAAGCAACACTGTTCTTTTCATTTGTGGATGATATATC
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CACATGGCCGAGAAACTTGCATTGGTATGTGTTCGAATTCTTACTAGTTGAAATTCTGGT
GAAGAGGTTTCCTTTTTTTAATCGTCAGGATGATACGGTCTGCTATGGCATGCTCTTCTG
GTTTGTCTAATTAGATTGGGGATTGGTGGATTTGTTGTTTCAGGTGGCTAAGGAACATGG
TGGGATAATGAGATTTATTCAGGTTTCTTGTCTGGGAGCTTCTCTGTCATCTCCTTCAAG
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CTTATCGCAGCTTTTGGAAGTTGGAACCTAAAACGCTCTCCTCTATAACTATCATCCTAA
TATCTCATTCACTATTGCCATGCTTCTACTTATTGTCAGATATAACGTAAATCATCTGGT
TGTTTCTTGTGGAACTGGAAAAACAGTATATGATATTATTATTGAATTCTAAAATCGTAA
ATTTTGAAAGCAACAATTAACCTGCGATGGCTTAACATATGCATTTTGCCATCAGCCTTC
TTCTAGTCAGTTCTTGATGTATGTTTTTTTCCTAGGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCA
TGATTGGTACAGAGGACAGAATCTTGAACCCCTGGGCAATGTTCGTTAAAAAATATGGTT
TCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACCAACAAGTATGTCCTAAACCTTTGTCTAATTCTTT
TCAACGGTTCATAGCAACTTACAGTGACCATGATCCATTTCTTTCTCTAACCATAACTTC
ATTGCAGATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTTGCTGCTGCAATCGTTGCAGCCCTAA
AGGATGATGGCTCCAGCATGGGGAAAATCTATGAATTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCC
CTCACGATTTGGTAAATTCATAGAGTCCTTCATCCTCTCTGTCACTGTATTAGCTCAATG
GGTTTGATTTTCTAGTGTTTACCTTGCAGGCAGAGATCATGTTTGATATGATTCGTGAAT
GGCCTCGATATGTGAAGCTT
Pro Sequence
MFEPSPSTCILAAANPSHLHFSLSHSSVCCCFSRMQAVSRRLVQRPLGGG
ASIYSSSSLRSLYGVSDHHLNGADNRRYSSSLATKGVGHLARKGTGGRSS
VSGIVATVFGATGFLGRYLVQQLAKMGSQVLVPFRGSEDNPRHLKLMGDL
GQVVPMKFDPRDEDSIKAVMAKANVVINLIGREYETRNFSFEEVNHHMAE
KLALVAKEHGGIMRFIQVSCLGASLSSPSRMQRAKAAAEEAVLSALPEAT
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KAMAGPRDFMVNKVPFPLPSPQIFNLDQINALTTDTLVSDKALTFQDLDL
VPHKLKGYPVEFLIQYRKGGPNFGSTVSEKIPTDFYN
mRNA Sequence
ATTGACCAAAAACTTATGTTTGAGCCGAGCCCATCTACGTGTATCCTCGCGGCAGCAAATCCCTCCCATC
TCCATTTCTCTCTCTCTCATTCATCTGTGTGTTGTTGCTTCTCGAGGATGCAGGCAGTTTCCAGGAGACT
AGTCCAACGGCCCCTCGGCGGAGGAGCTTCGATCTATTCGTCGTCTTCTCTCAGATCGCTCTATGGAGTC
TCCGATCACCACCTGAATGGAGCTGATAACCGTCGATACTCGTCCTCCCTTGCTACAAAGGGCGTGGGAC
ACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCTTCCGTCAGTGGCATTGTAGCTACGGTATTTGGAGCCAC
TGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCTTGCTAAAATGGGATCACAAGTGCTAGTTCCGTTCCGA
GGCTCAGAGGACAATCCTCGACATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTTGTACCGATGAAATTTG
ATCCAAGAGATGAAGACTCGATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAATCTTATTGGAAG
AGAGTACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACATGGCCGAGAAACTTGCATTGGTG
GCTAAGGAACATGGTGGGATAATGAGATTTATTCAGGTTTCTTGTCTGGGAGCTTCTCTGTCATCTCCTT
CAAGAATGCAGAGGGCAAAAGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTGAGCGCACTGCCTGAGGCGACAGTCAT
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CAATCGTTGCAGCCCTAAAGGATGATGGCTCCAGCATGGGGAAAATCTATGAATTGGGTGGTCCAGATGT
CTTTACCCCTCACGATTTGGCAGAGATCATGTTTGATATGATTCGTGAATGGCCTCGATATGTGAAGCTT
CCATTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTCCTCGGGATTTCATGGTGAACAAAGTCCCGTTCCCTCTAC
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