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Detail for ZS11_A10G17160.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A10G17160.t1
ZS11_v0: BnaA10T0144600ZS
WE: WE_A10G16880.t1
WE_v0: BnaA10T0140300WE
Darmor: A10p15370.1_BnaDAR
BH: BnaA10T151100BH
Quinta: BnaA10T0129300QU
ZS2: BnaA10T133700ZS2
SW: BnaA10T155100SW
Express61: A10p012440.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC09G0438800XY
P202: BnaA10G011500P202.1
BL: BnaA10T151100BH
TA: BnaA10T141900TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g31580D
RB: BnaA10T149000RB
No2127: BnaA10T0089800NO
P130: BnaA05G006880P130.1
Length: 564
KOG ID: KOG1263
KOG E-value: Not available
KOG Score: 969.0
KOG Annotation: Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism
Biological Process: GO:0046274(lignin catabolic process)
Cellular Component: GO:0048046(apoplast)
Molecular Function: GO:0005507(copper ion binding),GO:0052716(hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity),GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K05909 E1.10.3.2; laccase [EC:1.10.3.2]
NR Protein: XP_009120399.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1164.1
NR Annotation: XP_009120399.1 PREDICTED: laccase-16 [Brassica rapa]
SwissProt Protein: Q1PDH6|LAC16_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 1053.0
SwissProt Annotation: Laccase-16 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LAC16 PE=2 SV=2
CDS Sequence (1719 bp)
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Upstream Sequence
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TCATCTTCACGGGTTTAACTTCTTTGAGGTTGGTAGAGGTTTAGGGAATTTTAACCCGGAAAAGGATCCA
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Downstream Sequence
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GCATGGGGCCATTGTCATCTTGCCTAAGCTTGGTGTCCCATACCCTTTCCCCAAGCCCTA
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TACAAAATACGGCGATGATCTTGTCGGAGAACCATCCGTTTCATCTTCACGGGTTTAACT
TCTTTGAGGTTGGTAGAGGT
Pro Sequence
MEIPRRFCVCILTLFVIFLLSPTTVHSIIRHYKFNVVMTNTTKLCSSKPI
VTVNGQFPGPTIVAREDDTVLIKVVNHVKYNVSIHWHGVRQLRTGWADGP
AYITQCPIQPRQNYLYNFTLTGQRGTLWWHAHILWLRATVHGAIVILPKL
GVPYPFPKPYKEKTIVLAEWWKSDVEQLINEATKNGTAPNASDAHTINGH
SGPISNCPSQSGYGLPVRPGKTYMLRIINAALNEELFFKIAGHKLTVVEV
DAVYTKPYKTDTVLIAPGQTTNVLLTANANTGSKYMVAATTFMDAPISFD
NVTATATLHYIGHTVSSKKTVLASLPQPNATLVASKFIKSLRSLNSREYP
AKVPTTVDHSLFFTVGLGANPCPSCNNGFRLVAGINNVTFTMPETALLQA
HYFNISHVFTDDFPAKPSNPFNYTAPVDQSVNAATMTGTKLYRLPYNATV
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RNTVGVPAGGWTAIRFIADNPGVWFMHCHLEIHTTWGLKMAFVVDNGHGP
DQSLLPPPADLPKC
mRNA Sequence
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ACTAAAGATGGCATTCGTCGTGGACAACGGTCACGGTCCTGACCAGTCACTGCTTCCTCCACCCGCCGAT
CTTCCCAAATGCTAG