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Detail for ZS11_C01G04280.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C01G04280.t1
ZS11_v0: BnaC01T0041100ZS
WE: WE_C01G03120.t1
WE_v0: BnaC01T0019500WE
Darmor: C03p31280.1_BnaDAR
BH: BnaC03T291400BH
Quinta: BnaC03T0259400QU
ZS2: BnaC03T276200ZS2
SW: BnaA03T259700SW
Express61: C01p003600.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA03G0236400XY
P202: BnaC03G031890P202.1
BL: BnaC03T291400BH
TA: BnaC01T039100TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g23870D
RB: BnaA03T255400RB
No2127: BnaC02T0411500NO
P130: BnaC03G024680P130.1
Length: 101
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 8.290000e-53
KOG Score: 167.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: XP_013744625.1
NR E-value: 6.800000e-45
NR Score: 184.9
NR Annotation: XP_013744625.1 tropinone reductase homolog At2g29320 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9ZW14|TRNH8_ARATH
SwissProt E-value: 3.510000e-52
SwissProt Score: 167.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At2g29310 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g29310 PE=2 SV=1
CDS Sequence (310 bp)
ATGAAAGTACTTCCGAGGCACTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATAAGAGCCAATGCTGTTGCAC
CTAATGTTGTCAAGACTCGACAGTCTCAATCTTATCTTGAGGACGTCAGTTTCAAGGAAGAATTGTTCTG
TAGAACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCGCTAGAGGTCTTCTTGTGTCTACCT
GCAGCTTCCTACATCACTGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACAGTTAACGGTTTCTCCTATC
AGTCATGGTCAAACCATTTGTGTTGA
Upstream Sequence
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CTAATGTTGTCAAGACTCGACAGTCTCAATCTTATCTTGAGGACGTCAGTTTCAAGGAAGAATTGTTCTG
TAGAACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCGCTAGAGGTCTTCTTGTGTCTACCT
GCAGCTTCCTACATCACTGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACAGTTAACGGTTTCTCCTATC
AGTCATGGTCAAACCATTTGTGTTGA
Downstream Sequence
TGTAATAATAATATATAATTTACATATCTTGTTTTGTGAATATAGCTACTGACTTCCTCT
AATCCTAACTCACTTTTGTTTCTTAAAGTATCTTGAGGACGTCAGTTTCAAGGAAGAATT
GTTCTGTAGAACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCGCTAGAGGT
CTTCTTGTGTCTACCTGCAGCTTCCTACATCACTGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGG
CCTCACAGTTAACGGTTTCTCCTATCAGTCATGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGCCC
TCGTTTTGATGTTGGTGTCAAGGAGATTGAATGCTGGACTGCTCATTTGCTTCCTTCGAG
ACAGGTTCGGTCTTCTTATACATTTTTCTTTGGGCACCATGTCATGTAATCACTCTGCCA
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TTTTTTTTTAATAACCCTTGAATAAGAAACTTGCAATGGAGGACATAAAAGTTGAAAGTT
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AAAAAACAAAAATCAAACAGAAAAAAAATAATAATAAAAAATGCTTTGCGAACCCTTCCA
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CCTTCTTCTTTTTTTAATCACTAGAATTTATTTCCTTGATTCACCGACATATAAAGCTAC
TGTTTCTTCAATTTAAATTTTGTAAAAGTGGTCTATAACCAAAACATGTCTAGGCATATT
ATCACCAACAAAGTCAATTAAAAAATATATCTACTGTTTCTTCAATTTAAATTTTGTAAA
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GTAAACATAGCAAATTTCTACAAAAAAAATATAAAAATAAATTACTATTAAAAGATAAAC
CTGGTAAAAACTTGGGAAAACCAGTGAACCGGGCCAATCAATAAACCTAGTTCCATCAAA
TACAAAACATAATTTGGCTAATCTTGTTTATTAAAATATTTATAAATGGCAATTCTTGAT
CGATTCAAGATTCTCAGTTTTCTTTTAAAAAACGAAAAATCATTTTTTCTTATTTTTTGG
TTTTATTATATATACCTTTCTATATATTATTATAAGCATCCATGGAAATAGTTTTACATA
CCCAATTCTAATGACTCACTACAAGAAAACAGGGAGATTCTAATGGTCGAAATCGTCGGA
AATTCGTCGGAATAAACCGATTCCGACGAATTTCGATGAACCAATTTGTCGGTATCATTT
TGTCGGAAAAAAGTATTCGTTGGAATTTCGTCAGATCTTCCGACGACTTTCCGACGAATA
CCAAGAAACGTCATTCGACAAACTTCCGACGATATTCCGATGCGGACACACGAGACCGAG
TTCATCGGAAAAACTATATA
Pro Sequence
MKVLPRHLACEWAKDGIRANAVAPNVVKTRQSQSYLEDVSFKEELFCRTP
LGRAGEPNEVASLEVFLCLPAASYITGQTICVDGGLTVNGFSYQSWSNHL
C
mRNA Sequence
ATGAAAGTACTTCCGAGGCACTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATAAGAGCCAATGCTGTTGCAC
CTAATGTTGTCAAGACTCGACAGTCTCAATCTTATCTTGAGGACGTCAGTTTCAAGGAAGAATTGTTCTG
TAGAACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCGCTAGAGGTCTTCTTGTGTCTACCT
GCAGCTTCCTACATCACTGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACAGTTAACGGTTTCTCCTATC
AGTCATGGTCAAACCATTTGTGTTGA