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Detail for ZS11_C01G41730.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C01G41730.t1
ZS11_v0: Not available
WE: WE_C09G25950.t1
WE_v0: Not available
Darmor: C09p40180.1_BnaDAR
BH: Not available
Quinta: Not available
ZS2: Not available
SW: Not available
Express61: Not available
Xiaoyun: BnaC01G0351200XY
P202: Not available
BL: Not available
TA: Not available
Da-Ae: Not available
RB: Not available
No2127: Not available
P130: Not available
Length: 176
KOG ID: -
KOG E-value: Not available
KOG Score: Not available
KOG Annotation: -
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0008137(NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity)
KEGG Ortholog: -
NR Protein: YP_005090006.1
NR E-value: 6.200000e-86
NR Score: 322.0
NR Annotation: YP_005090006.1 ndhG gene product (chloroplast) [Brassica napus]
SwissProt Protein: A4QKG0|NU6C_BARVE
SwissProt E-value: 3.380000e-117
SwissProt Score: 332.0
SwissProt Annotation: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic OS=Barbarea verna OX=50458 GN=ndhG PE=3 SV=1
CDS Sequence (538 bp)
ATGGATTTGCCTGGACCAATAAATGATTTTCTTTTAGTTTTTCTGGGATCTGGTCTTCTAGTAGGAGGTC
TGGGAGTGGTATTACTTCCTAACCCAATATTTTCAGCCTTTTCCTTAGGATTTGTTCTTGTTTGTATATC
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Upstream Sequence
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Downstream Sequence
AAAAAGGTTCCAATTAGTAAAGACCAAAGAAAACTTTGTGTTTGTGTATGTTATGATATT
TTTTTCCGTTCATTCAATTTGATTTGATTGAATACTATTTCATTTTTTAAATATAAATTT
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GTCCTTTCATTGATTCCTCCTAAATTGCATTGATTTATCCTAAAGATTTCATTTCAATTG
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TACATAACGAATTGGTGTGGTATATTCATATCATAACATAACATATGAACAGTAAGAACT
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GTCGAATCAGGATCAACTAGGACAGAAATAAAGCATTGGGTCGAACTCTTCTTTGGTGTC
AAGGTAATAGCTATGAATAG
Pro Sequence
MDLPGPINDFLLVFLGSGLLVGGLGVVLLPNPIFSAFSLGFVLVCISLLY
ILANSHFVAAAQLLIYVGAINVLIIFAVMFMNDSEYSIDLNLWTVGNGIT
SVVCTTILFSLISTILDTSWYGVIWTTRLNQILEQDLISNSQQIGIHLST
DFFLPFELISIILLVALIGAISVARQ
mRNA Sequence
ATGGATTTGCCTGGACCAATAAATGATTTTCTTTTAGTTTTTCTGGGATCTGGTCTTCTAGTAGGAGGTC
TGGGAGTGGTATTACTTCCTAACCCAATATTTTCAGCCTTTTCCTTAGGATTTGTTCTTGTTTGTATATC
TTTATTGTATATTCTAGCAAACTCCCATTTTGTAGCTGCTGCACAACTCCTTATTTACGTGGGAGCCATA
AATGTTTTAATCATATTTGCTGTGATGTTCATGAATGATTCCGAATATTCCATAGATTTAAATCTGTGGA
CTGTTGGGAATGGGATTACTTCAGTGGTTTGTACAACTATTCTTTTTTCATTAATTTCTACTATTCTCGA
TACGTCATGGTACGGGGTTATTTGGACTACAAGATTAAACCAGATTTTAGAACAAGATTTAATAAGTAAT
AGTCAACAAATAGGAATTCATTTATCAACAGATTTTTTTCTTCCATTTGAACTCATTTCAATAATTCTTT
TAGTTGCTTTGATAGGTGCAATTTCTGTGGCTCGTCAATAA