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Detail for ZS11_C01G41740.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C01G41740.t1
ZS11_v0: BnaC09T0319400ZS
WE: WE_C01G42040.t1
WE_v0: Bnascaffold2759T0000400WE
Darmor: C09p40170.1_BnaDAR
BH: Bnascaffold0314T000500BH
Quinta: BnaC09T0316700QU
ZS2: Bnascaffold0223T000500ZS2
SW: BnaC02T044800SW
Express61: A06p011380.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC01G0351300XY
P202: BnaC01G063980P202.1
BL: Bnascaffold0314T000500BH
TA: BnaC02T256500TA
Da-Ae: Not available
RB: Bnascaffold0536T000100RB
No2127: BnaC09T0280600NO
P130: BnaC07G037630P130.1
Length: 167
KOG ID: KOG3256
KOG E-value: 4.390000e-124
KOG Score: 347.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: -
Cellular Component: GO:0016020(membrane)
Molecular Function: GO:0008137(NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity),GO:0016651(oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H),GO:0051539(4 iron, 4 sulfur cluster binding)
KEGG Ortholog: -
NR Protein: YP_007889996.1
NR E-value: 2.200000e-72
NR Score: 276.9
NR Annotation: YP_007889996.1 NADH dehydrogenase subunit I (chloroplast) [Pachycladon cheesemanii]
SwissProt Protein: A4QKP9|NDHI_CAPBU
SwissProt E-value: 3.050000e-124
SwissProt Score: 349.0
SwissProt Annotation: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic OS=Capsella bursa-pastoris OX=3719 GN=ndhI PE=3 SV=1
CDS Sequence (511 bp)
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AGGGTTTCATGATTACCTTATCCCACACAAATCGTTTACCTGTAACTATTCAATATCCCTATGAAAAATT
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Upstream Sequence
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Downstream Sequence
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ATGGTAGAATCAGTCAGGGGCCTGATAGGCGGTGGTTTACCCTGTGGCGGATGTCAGCGG
TTCGAGTCCGCTTATCTCCA
Pro Sequence
MLPMITGFMNYGQQTLRAARYIGQGFMITLSHTNRLPVTIQYPYEKLITS
ERFRGRIHFEFDKCIACEVCVRVCPIDLPVVDWKLETNIRKKRLLNYSID
FGICIFCGNCVEYCPTNCLSMTEEYEFSTYDRHELNYNQIALGRLPMSVI
DDYTIRTILNSPQTKNG
mRNA Sequence
ATGCTTCCTATGATAACCGGGTTCATGAATTATGGTCAACAAACCCTACGAGCTGCAAGGTATATTGGTC
AGGGTTTCATGATTACCTTATCCCACACAAATCGTTTACCTGTAACTATTCAATATCCCTATGAAAAATT
AATAACATCAGAACGTTTCCGCGGTCGAATCCATTTCGAATTTGATAAATGCATTGCTTGTGAAGTATGT
GTTCGAGTATGTCCTATAGATCTGCCGGTTGTTGATTGGAAATTGGAAACCAATATTCGAAAAAAACGAT
TGCTTAATTACAGTATTGATTTTGGAATTTGTATATTTTGTGGTAATTGTGTTGAGTATTGTCCAACAAA
TTGTTTGTCAATGACTGAAGAATATGAATTTTCAACTTATGATCGTCACGAGTTGAATTATAATCAAATC
GCTTTGGGGCGTTTACCAATGTCAGTAATTGACGATTATACTATTCGAACAATTTTGAATTCACCTCAAA
CAAAAAATGGGTAA