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Detail for ZS11_C01G41750.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C01G41750.t1
ZS11_v0: BnaC09T0319500ZS
WE: WE_A06G24400.t1
WE_v0: Bnascaffold2759T0000500WE
Darmor: C09p40310.1_BnaDAR
BH: BnaC01T364200BH
Quinta: BnaC09T0303600QU
ZS2: Bnascaffold0223T000400ZS2
SW: BnaC02T044800SW
Express61: Not available
Xiaoyun: BnaC07G0292500XY
P202: BnaC05G046490P202.1
BL: BnaC01T364200BH
TA: BnaC05T449000TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaC02T275000RB
No2127: BnaC09T0266300NO
P130: BnaC05G055870P130.1
Length: 331
KOG ID: KOG4770
KOG E-value: Not available
KOG Score: 610.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: -
Cellular Component: GO:0016020(membrane)
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K05572 ndhA; NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1 [EC:7.1.1.2]
NR Protein: VDD65461.1
NR E-value: 8.100000e-172
NR Score: 608.2
NR Annotation: VDD65461.1 unnamed protein product [Brassica oleracea]
SwissProt Protein: A4QLG4|NU1C_LEPVR
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 611.0
SwissProt Annotation: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic OS=Lepidium virginicum OX=59292 GN=ndhA PE=3 SV=1
CDS Sequence (1010 bp)
ATGATAATTTATGCAACAGAAGTACAAACTATAAATTCTTTTCTTAGATTGGAATCTTTAAAAGAGGTCT
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ACTCTTTTCACTCTAA
Upstream Sequence
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ACTCTTTTCACTCTAA
Downstream Sequence
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GATCAAATTATTCATAGATAATTACAATATGCTTCCTATGATAACCGGGTTCATGAATTA
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TCGAGTATGTCCTATAGATCTGCCGGTTGTTGATTGGAAATTGGAAACCAATATTCGAAA
AAAACGATTGCTTAATTACA
Pro Sequence
MIIYATEVQTINSFLRLESLKEVYGLIWIFVPIFSLVLGIITGVLVIVWL
EREISAGIQQRIGPEYAGPLGILQALADGTKLLFKEDLRPSRGNTPLFSI
GPSIAVISILLSYSVIPVSNHLVLADLNIGIFLWIAISSVAPIGLLMSGY
GSNNKYSFLGGLRAAAQAISYEIPLTLCVLSISLRFIIFLISSLAECERL
PFDLPEAEEELIAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLISSLFVTVLYLGGW
NISIPYISMLELFEKDQIFGTTIGIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLR
MDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL
mRNA Sequence
ATGATAATTTATGCAACAGAAGTACAAACTATAAATTCTTTTCTTAGATTGGAATCTTTAAAAGAGGTCT
ATGGACTCATATGGATATTTGTCCCTATATTTTCTCTTGTCTTGGGAATCATAACTGGTGTACTAGTAAT
TGTGTGGTTAGAAAGAGAAATATCTGCAGGGATACAACAACGTATTGGACCTGAATACGCCGGCCCGTTA
GGAATTCTTCAAGCTTTAGCCGACGGGACAAAACTACTTTTCAAAGAAGATCTTCGTCCATCTAGAGGAA
ATACTCCTTTATTTAGTATTGGACCATCTATAGCAGTTATCTCTATTTTACTAAGTTATTCAGTAATTCC
TGTTAGCAATCACCTTGTTTTAGCGGATCTCAATATCGGTATTTTTTTATGGATTGCCATCTCAAGTGTT
GCTCCGATCGGACTTCTTATGTCAGGATATGGATCAAATAATAAATATTCTTTTTTAGGTGGTCTGCGAG
CTGCTGCTCAAGCGATTAGTTATGAAATACCATTAACTCTATGTGTTTTATCAATATCTCTACGTTTTAT
CATTTTTCTAATTTCTTCCCTAGCAGAATGCGAGAGGTTACCTTTTGATTTACCAGAAGCGGAAGAAGAA
TTAATAGCAGGTTATCAAACTGAATATTCCGGTATCAAATTTGGTTTATTTTATGTTGCTTCTTATCTAA
ATCTATTAATTTCCTCATTATTTGTAACAGTTCTATACTTAGGCGGTTGGAATATTTCTATTCCGTATAT
ATCTATGCTGGAGCTATTTGAAAAGGATCAAATTTTTGGAACAACAATTGGTATCTTTATTACATTAGCT
AAAACTTATTTGTTCTTGTTCATTTCTATCGCAACCAGATGGACTTTACCTAGGCTAAGAATGGATCAAC
TATTAAATCTTGGATGGAAATTTCTTTTACCGATTTCCCTTGGTAATTTATTATTAACAACTTCTTTCCA
ACTCTTTTCACTCTAA