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Detail for ZS11_C02G00380.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C02G00380.t1
ZS11_v0: BnaC02T0003500ZS
WE: WE_C02G03460.t1
WE_v0: BnaA02T0005600WE
Darmor: C02p00270.1_BnaDAR
BH: BnaA02T003700BH
Quinta: BnaC02T0000400QU
ZS2: BnaA02T003400ZS2
SW: BnaA02T003600SW
Express61: C02p000310.3_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC02G0003400XY
P202: BnaA02G006360P202.1
BL: BnaA02T003700BH
TA: BnaC02T003500TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g31580D
RB: BnaA02T003700RB
No2127: BnaC04T0085400NO
P130: BnaC02G000280P130.1
Length: 558
KOG ID: KOG1263
KOG E-value: Not available
KOG Score: 1041.0
KOG Annotation: Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism
Biological Process: GO:0046274(lignin catabolic process)
Cellular Component: GO:0048046(apoplast)
Molecular Function: GO:0005507(copper ion binding),GO:0016491(oxidoreductase activity),GO:0052716(hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K05909 E1.10.3.2; laccase [EC:1.10.3.2]
NR Protein: XP_013640121.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1086.2
NR Annotation: XP_013640121.1 laccase-10 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q6ID18|LAC10_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 1056.0
SwissProt Annotation: Laccase-10 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LAC10 PE=2 SV=1
CDS Sequence (1700 bp)
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Upstream Sequence
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TCCGCAAGTACACTTTTAACGTGGTGACGAAGCAAATGACGCGGCTTTGCTCAACCAAACAGATAGTTAC
CGTTAACGGTAAGTTTCCAGGACCCACAATATATGCTAATGAAGACGACACAATTCTCGTTAACGTCGTC
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AGATGCTCATGTCATTAACGGCCATCCCGGTCTCGTCCCAAACTGCCCATCGCAAGGTAATTTTAAATTA
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ATCGCCGCCGCTCCATTCCAAGACTCAGCAGTCGTGGCTGTGGACAATCGCACAGCCACCGCCACAGTAC
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TTTCACGAGTAGTCGCCGCGATAAACAACATTACGTTCAAGATGCCTAAAACGGCTCTGCTTCAAGCGCA
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GGAAAACCACCTTCGAATCTAGCAACCATGAAAGCCACAAAGCTTTACAAGCTACCGTACAATTCAACGG
TGCAAGTTGTTTTACAGGATACCGGAAATGTGGCGCCGGAAAACCATCCAATTCATCTTCATGGGTTTAA
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GGTGGAGAATGGTAAAGGTCCCAACCAATCAATTCTTCCTCCTCCAAGTGATCTTCCCAAATGTTGA
Downstream Sequence
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GGACCTAAATATTATATATTTTTCGCAGGCATGGAATAAGACAATTAAGAACCGGTTGGG
CCGATGGACCAGCCTACATTACCCAATGCCCCATTAAACCGGGTCACAGCTACGTGTATA
ACTTCACGGTCACAGGGCAACGTGGAACACTCTGGTGGCACGCACATGTTCTCTGGCTCC
GAGCTACGGTTCATGGTGCCATCGTGATTCTGCCAAAACCGGGTCTACCTTACCCGTTCC
CTAAACCACACAGAGAAGAAGTCATCGTACTAGGTATTAGTCTAAAGAGAGATACTCACG
GAGTGCTTTAATTATTATTTGATCAATAATTTGGAACTCCCTGTTTATCTTTCTATAGGT
GAGTGGTGGAAATCCGATACCGAAAATGTTATTAATGAAGCATTAAAATCCGGTTTAGCA
CCTAATGTCTCAGATGCTCATGTCATTAACGGCCATCCCGGTCTCGTCCCAAACTGCCCA
TCGCAAGGTAGTTAGTCCTGTAATGTTTCCAACAATTTGAATTTATGGATTCTTACATCA
AATGAAACATCCTTAATTAATTTATTTGTAGTTTCAAAAAAAAATATTTATAACAAGCTA
AAATTAATTAGAATTTTATTTAATAATATTGATTTTTTTAATAATTTGATTTTTTTTTTT
GTTTTAGGTAATTTTAAATTAGCGGTAGAGAGCGGGAAAACATACATGCTACGACTAGTA
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GAAGTCGACGCCGTCTACGTCAAACCCTTCACCACCGACACAATCCTAATCGCTCCCGGC
CAAACCACCACCGCCTTGGTCTCGGCTGCCCGTCCCTCAGGCAAATACCTAATCGCCGCC
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CATTACTCCGGCACACTCTCCGCCACACCTACCAAAACCACTTCACCGCCACCTCAGAAC
GCCACTTCCGTCGCCAACTCGTTCGTCAGTTCTCTACGGAGTCTCAACTCAGCCACATAT
CCAGCTAAAGTTCCAACCACCGTAAATCATGATCTATTATTCACCGTGGGACTAGGAATC
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ATTACGTTCAAGATGCCTAAAACGGCTCTGCTTCAAGCGCATTACTTCAACCTAACCGGG
ATCTACACTACCGATTTTCCAGCTAAACCGCACCATGCTTTTGATTTTACCGGAAAACCA
CCTTCGAATCTAGCAACCATGAAAGCCACAAAGCTTTACAAGCTACCGTACAATTCAACG
GTGCAAGTTGTTTTACAGGATACCGGAAATGTGGCGCCGGAAAACCATCCAATTCATCTT
CATGGGTTTAATTTCTTTGTGGTTGGTATTGGATCTGGTAATTATAACTCCAAGAAAGAT
GCCAAGAAATTTAATCTTGTTGATCCGGTGGAGAGGAACACCGTTGGAGTACCTTCTGGT
GGTTGGGCGGCCATCAGATTCCGAGCAGATAATCCAGGTATATATATCATCATCTTTCCA
AATATATAACTAATCCAATA
Pro Sequence
MEFPIRILVLFALLAFPACVHGAIRKYTFNVVTKQMTRLCSTKQIVTVNG
KFPGPTIYANEDDTILVNVVNNVKYNVSIHWHGIRQLRTGWADGPAYITQ
CPIKPGHSYVYNFTVTGQRGTLWWHAHVLWLRATVHGAIVILPKPGLPYP
FPKPHREEVIVLGEWWKSDTENVINEALKSGLAPNVSDAHVINGHPGLVP
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ATVHYSGTLSATPTKTTSPPPQNATSVANSFVSSLRSLNSATYPAKVPTT
VNHDLLFTVGLGINRCHSCKAGNFSRVVAAINNITFKMPKTALLQAHYFN
LTGIYTTDFPAKPHHAFDFTGKPPSNLATMKATKLYKLPYNSTVQVVLQD
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PPSDLPKC
mRNA Sequence
ATGGAATTTCCAATCCGGATCTTAGTGCTCTTTGCATTGCTGGCCTTTCCGGCATGTGTCCACGGTGCAA
TCCGCAAGTACACTTTTAACGTGGTGACGAAGCAAATGACGCGGCTTTGCTCAACCAAACAGATAGTTAC
CGTTAACGGTAAGTTTCCAGGACCCACAATATATGCTAATGAAGACGACACAATTCTCGTTAACGTCGTC
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GACCAGCCTACATTACCCAATGCCCCATTAAACCGGGTCACAGCTACGTGTATAACTTCACGGTCACAGG
GCAACGTGGAACACTCTGGTGGCACGCACATGTTCTCTGGCTCCGAGCTACGGTTCATGGTGCCATCGTG
ATTCTGCCAAAACCGGGTCTACCTTACCCGTTCCCTAAACCACACAGAGAAGAAGTCATCGTACTAGGTG
AGTGGTGGAAATCCGATACCGAAAATGTTATTAATGAAGCATTAAAATCCGGTTTAGCACCTAATGTCTC
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AATCCTAATCGCTCCCGGCCAAACCACCACCGCCTTGGTCTCGGCTGCCCGTCCCTCAGGCAAATACCTA
ATCGCCGCCGCTCCATTCCAAGACTCAGCAGTCGTGGCTGTGGACAATCGCACAGCCACCGCCACAGTAC
ATTACTCCGGCACACTCTCCGCCACACCTACCAAAACCACTTCACCGCCACCTCAGAACGCCACTTCCGT
CGCCAACTCGTTCGTCAGTTCTCTACGGAGTCTCAACTCAGCCACATATCCAGCTAAAGTTCCAACCACC
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