SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_C02G03980.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C02G03980.t1
ZS11_v0: BnaC09T0561500ZS
WE: WE_C02G07030.t1
WE_v0: BnaC09T0534000WE
Darmor: C02p03950.1_BnaDAR
BH: BnaC09T450000BH
Quinta: Not available
ZS2: BnaA10T252700ZS2
SW: BnaA10T270000SW
Express61: C02p003210.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA10G0253200XY
P202: BnaA10G020570P202.1
BL: BnaC09T450000BH
TA: BnaA10T251900TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaA10T263900RB
No2127: BnaA10T0190900NO
P130: BnaA10G026240P130.1
Length: 70
KOG ID: -
KOG E-value: Not available
KOG Score: Not available
KOG Annotation: -
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K00236 SDHC, SDH3; succinate dehydrogenase (ubiquinone) cytochrome b560 subunit
NR Protein: CDY44808.1
NR E-value: 8.100000e-21
NR Score: 104.4
NR Annotation: CDY44808.1 BnaC02g00790D [Brassica napus]
SwissProt Protein: P0DKI1|SDH32_ARATH
SwissProt E-value: 2.060000e-08
SwissProt Score: 51.2
SwissProt Annotation: Succinate dehydrogenase subunit 3-2, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SDH3-2 PE=1 SV=1
CDS Sequence (216 bp)
ATGGAACGTGTTTGTTTTTGTTATCTGCTCTTGAAACGTTCTTGTTCGCAGCTTGCTGGTAATGCTCAAC
CTTCATGGGTTCACACACTGCTCAAAACTATGCGAGTTTCTTCAAAGCTTTCGGGTATATCGAAACCTGG
TGTGAATGACATTGTTGGAACCGGTTTGGGAACTACCAACACAAGCAATGCTCTTAGAGAGGCAAAAGAG
TAA
Upstream Sequence
ATGGAACGTGTTTGTTTTTGTTATCTGCTCTTGAAACGTTCTTGTTCGCAGCTTGCTGGTAATGCTCAAC
CTTCATGGGTTCACACACTGCTCAAAACTATGCGAGTTTCTTCAAAGCTTTCGGGTATATCGAAACCTGG
TGTGAATGACATTGTTGGAACCGGTTTGGGAACTACCAACACAAGCAATGCTCTTAGAGAGGCAAAAGAG
TAA
Downstream Sequence
GTTTCCTTTCTTCCATGGGATGCAAAAACGTATAGTCACACTTTGTAGTTGTGCTTTTGA
CTATGTGTATCTGTTCCTTATAGATCGAAACCTGGTGTGAATGACATTGTTGGAACCGGT
TTGGGAACTACCAACACAAGCAATGCTCTTAGAGAGGCAAAAGAGTAATAAAAGAGAGGA
GAAAAGTTTTGTCAAACTATCATTGTCTTTGAGAAAGTAAGATCTAACTTTTTTTTTGTT
TTGGGATGTTAGGCTTTTGAAGGCTATGTTTTTTTTGCTTTCTTTTCTTTGTTCTTAGAT
CATGTCGAAGGTGTTGAAATGTTGGATGTAATAAATGTTATTACTCAGCTGCTACGTTTA
ACTCTTCTCTTACAAGTGTGCTTCATGAGATTTATGTAAAATCCATCGTTCACTGTATCA
ATCTTATCCATTTTCTTCTGATTAATCTGCAACGTGCAATTAGTTTGATCAAACAATATT
AGCCATGGGGTAAAAGGAGAAACAGAGTTGCTTATGTTGACTTGGACGAAGATTTATCAA
ACACTCTGAGCTGCTGAGAGGGTTTGCTTTAATAAATATAAGTAGAATGATTGTGTTTGT
CTTCTTAATCACAGAGTATTGTACAAGAGATTAAGGTTTGAATGAACGTCGTAAAATGAC
GGTTATGCTCGTGAGAGAATCGTCGCTTACGATAAGGACGAATTGTAATTTGATTGTTAT
CAGGTTGTTAAAAGTTGAGACAAACGAGAAAAAAACGAAGAACAGACTAAACAGGTGTTA
CGTTTCACATTGGTTTGGTTGTGGAGCCTTGAAGTTACTCTATTTAACCGGTCCAACCGG
TCCAACCGGTCAGGTTAACAAAACACTGAAGTTAGCCGCCAACACGCTTATTACGTAAAC
GGTAGCCACGTTTCGAGCACTGCGTTTGCTAATTTGTCTTCACTCAAATTCGCAGTCTTC
TTTCTTCGCATTTGGGCTCAAGCTTCGTTGAGCTACTGATTCGCATGCAAGGCTAGTGAC
ACCAAGAAGCGGAGAAAATGAGAAATCTTTACTTTCTAGTCTTATTTCCGTTGAGCATCT
TGATTTTGGTTGATGCTTCTTTGCATGTGAAGTATCTTCCTGGTCTTGAAGGTCCTCTTC
CTTTTGAGCTAGAGACTGGGTAAAACAAACTCCACCTCTTCACTCCAGTTTGTTATAAAA
AAAAATCCTTAATCTAAGACATGTCTCTTTCTTCTTTGCTGCATGTGGTTTTATATAACA
AGGTATGTGAGTGTTGGTGAATCTGGAGATGTTGAGCTCTTTTACTACTTTGTGAAATCA
GAGAGCAATCCAGATAAAGATCCTCTCATGATTTGGCTAACTGGTGGGCCTGGATGCAGC
TCAATTTGTGGTTTACTCTTTGCAAATGGTAAACAAATCTTTGTTTTTTTGGATTTATTG
TATTTAATGAGACCTAACTAACTAGTTTTACTTAGGGATCCCATCTTGAAAATTAAGGCT
TAATTAAACACATCTAATTGATATGCACGTCTTCAGTATTAAATAGTTTAATTGCATGTA
TGTTGTAAGGGTTAAGACAAGTGTAATTAATGCATGTGTTCTGTAAAAAATAGTTTAGTT
GCATGTGTTGTGTGATTTTTATAATGTTTGGAGGGTTAAGACAAGTCTAATTAATGCATG
TGTTCTGTGCTAAATAATTTAGTTTATGCATGTGGTGTGTGATTTTTTTATTAATTTTAA
ATGTTTTTGTCAGGTCCTTTGGCTTTTAAAGGGGATGAGTATAATGGGACACTGCCTCCT
TTAGAGCTAACATCTTTTTCTTGGACAAAGGCGAGAGATTAGTTACCAATTTTATAATGC
TTTCCTCTGTAATACCAACATCTTGCTTCTAAAGAGAATGTGTAATATGTATACTCAATT
TTTTTCAGGTGGCTAACATTTTATATTTGGAATCTCCTGCTGGTTCTGGATATTCTTATG
CCAAAACTCGGCGTGCTGCT
Pro Sequence
MERVCFCYLLLKRSCSQLAGNAQPSWVHTLLKTMRVSSKLSGISKPGVND
IVGTGLGTTNTSNALREAKE
mRNA Sequence
ATGGAACGTGTTTGTTTTTGTTATCTGCTCTTGAAACGTTCTTGTTCGCAGCTTGCTGGTAATGCTCAAC
CTTCATGGGTTCACACACTGCTCAAAACTATGCGAGTTTCTTCAAAGCTTTCGGGTATATCGAAACCTGG
TGTGAATGACATTGTTGGAACCGGTTTGGGAACTACCAACACAAGCAATGCTCTTAGAGAGGCAAAAGAG
TAA