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Detail for ZS11_C02G11810.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C02G11810.t1
ZS11_v0: Bnascaffold0507T0000200ZS
WE: WE_A02G09790.t1
WE_v0: BnaC02T0098300WE
Darmor: C02p10530.1_BnaDAR
BH: BnaC02T008200BH
Quinta: BnaC02T0058300QU
ZS2: BnaC02T102900ZS2
SW: BnaA02T101500SW
Express61: C02p009640.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC02G0100000XY
P202: BnaA03G008090P202.1
BL: BnaC02T008200BH
TA: BnaA02T071600TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaA02T101800RB
No2127: BnaA02T0088200NO
P130: BnaC02G010400P130.1
Length: 102
KOG ID: KOG1151
KOG E-value: 3.680000e-35
KOG Score: 127.0
KOG Annotation: Signal transduction mechanisms
Biological Process: GO:0010258(NADH dehydrogenase complex (plastoquinone) assembly)
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: -
NR Protein: RQL84402.1
NR E-value: 1.700000e-32
NR Score: 143.7
NR Annotation: RQL84402.1 hypothetical protein DY000_00010451 [Brassica cretica]
SwissProt Protein: -
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: Not available
SwissProt Annotation: -
CDS Sequence (313 bp)
ATGCAGTCAGGGGTATGGTACAGTGGATCCATCACGCCACGAGTCACTGTTAGATGCTGTGAAACCGCAA
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TTTATGGATTTAATCACATTGTTTATTATTGGAGAATCGTGTCAAGAAAACCTAAAGACTTGTGGGCAGT
TCGACTCTCCGTTGGGACGTATCTTTTAG
Upstream Sequence
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AAAAACAGCTGCTTCAATGCCTTGTCTTAGGGCTAACGCTGGCTTGGTCAAGCCTGGCGATGTTGGAAGT
TTTATGGATTTAATCACATTGTTTATTATTGGAGAATCGTGTCAAGAAAACCTAAAGACTTGTGGGCAGT
TCGACTCTCCGTTGGGACGTATCTTTTAG
Downstream Sequence
GTCATTCTTCTTCTTCTTTTTCCACAATCCATTTTTAATCATAGAATTCATATTAAACCA
TGCCTTCTTGGTAATAATAAAGACATTCTCGTTGAGTTAACATTCTTGTGTACGTTTTTA
TGTGATAATCAGTTTTATGGATTTAATCACATTGTTTATTATTGGAGAATCGTGTCAAGA
AAACCTAAAGACTTGTGGGCAGTTCGACTCTCCGTTGGGACGTATCTTTTAGATGGTAAA
TACTTCAAAGCTTTAGAGCTTGAAGACTAAGCTAAGCTTGTGAACTGAGAGACAATGTCA
TGTAAATTTCAGATTCATAAGCACATATAGCAAAACAGGCTGGTTCAAATCATAGACGCT
TACAACACACAAAAAAAAAACTGTTTATTTCGTTGCGTCCTTTTAGTATCTTTCTTTTGC
TTTGCTCAACAACTAAAACTTATTGCCTCCGAACCAGACAAGTCTTCTACAACTTGTTTG
GTTTTGTGGTCAACCCGTAACCAAACGGGTACAACGGGTCGTAATACTTATCGCCAACGT
TCATCGGCAGCTGCTTAACCGACTTAAACCAAGTCCTGGCCAACTTCCCAGTGAACCCAT
AATCACCAAACAGCGCATCAGCCACTCCTTGACCTTCAGTTCCCGGAAGCCAAGCTGCCA
CAAGAGCATCTATCTTCGAGACGTAAGGCTGCATCACCACGGGACGGCCAGAAACCACAA
CCACCACACACTTAACTGATCCACACACGTTCGCTATCGTGCTAGGACCAGGCTCACTTA
TGGTTAAGTTCGTACTGTCCCCAAACATCTCAGCATACGGCGGCTCTCCCACGACCACAA
TGGCGTAGTCAAATTTACCGGACTTCACGAAGTTTGCGTCAGGGTTTGCGTTGTAGACGA
CTTGTGTGGTCGGAGCCACTGTGTTCTTCACAGCGGTGAGGATCGTTGTACCTGTTGCAT
TGTTAAAACCAAACTCAGGATCAAGTTTTGTAACACTAAGAGGGAAAAGAGAAAGTTTAT
GAGTTTAACATACCGACGGTGAGGTCGTTGCCGTTAAGGCCTTGCCAGGTGATGGTCCAG
CCACCACATTGGTATCCCAAGTTATCAGCGTGTCCTCCCGCCACAAGAATCTTTCCCGTC
TTCTTAGGCAGAGGAAGCAACGGTTTATCTCCCTTGTTCTTACCGTTCTTGAGTAGCACT
AGAGACTTCCTCACGGCTTCACGAGCTAGCTCCCTATGTTCCTGTCAAAAAAATTGTAGA
AATGTTTTGTTCAGTTCTACACTGATGATTTTTTTATATAAAGATTATTACTAGGCATGC
GGTTTTGAACCGAACCAAAAATTTTGGTTAGTTCGATTACGAGTTTGGTTCAATTCGGCA
GGTTTATAAAAAAATCAGTTTTCAGTTCCATAACCGGTTAGTTTGATTTTTCCAAAAAAC
AATATTGTTAACCTTTTGAACCGAATTAACTAAAGAATTTAAACCGAACTAACCCAAATT
AACCAAATTTAAACTTATTTTAACAAAAATATTATCGAAACCAAAAACTTCGGTTATTTT
TGGTAAAACCAAACTGATTTTTGGTAAAACCAAACTGAACTTTTTACGGTTCAATTTGGC
AAGACTTTGGTTGAACTGAACTACCAGAACCCGCAGGCCTAAAGATTACTATGATGTGTA
ACAGATGATAAACTAAAACAACGTACCTTGCTACCAAGCTGGTTGGCAAAGCTAAGATCA
GCCAGTGGCTCCTCAAAGAGTCCCATTGTGAACTTAACCCTTAAGATTCTCTTCACGGCA
TCATCAATCCTGCTCATTGGGATCAGCTTTTTCTTTATCTGACTGTTGATTTCATCTATG
AACTCTGTGTAGTTGTATGGCACCATAATCTGCATCAGAGAACACAACAAGCCAAATCAA
GTAACTATGGAGCGCAATACCAAAACAACATGTAAGGTTAAAATCACTTCCTAGAACCAA
CCATGTCAATTCCAGCGCTG
Pro Sequence
MQSGVWYSGSITPRVTVRCCETAKEPPPKSKLQVGSPIIIVEAPKVIKTA
ASMPCLRANAGLVKPGDVGSFMDLITLFIIGESCQENLKTCGQFDSPLGR
IF
mRNA Sequence
ATGCAGTCAGGGGTATGGTACAGTGGATCCATCACGCCACGAGTCACTGTTAGATGCTGTGAAACCGCAA
AAGAGCCTCCACCAAAATCAAAGCTCCAAGTGGGATCACCAATAATCATCGTGGAAGCCCCCAAAGTTAT
AAAAACAGCTGCTTCAATGCCTTGTCTTAGGGCTAACGCTGGCTTGGTCAAGCCTGGCGATGTTGGAAGT
TTTATGGATTTAATCACATTGTTTATTATTGGAGAATCGTGTCAAGAAAACCTAAAGACTTGTGGGCAGT
TCGACTCTCCGTTGGGACGTATCTTTTAG