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Detail for ZS11_C02G33540.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C02G33540.t1
ZS11_v0: BnaC02T0284200ZS
WE: WE_C02G37550.t1
WE_v0: BnaC02T0274600WE
Darmor: A02p19540.1_BnaDAR
BH: BnaC06T437900BH
Quinta: BnaC02T0234200QU
ZS2: BnaA02T224400ZS2
SW: BnaC02T016200SW
Express61: C02p027450.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC02G0284600XY
P202: BnaC02G013320P202.1
BL: BnaC06T437900BH
TA: BnaA02T203500TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaA02T162400RB
No2127: BnaC02T0235600NO
P130: BnaC02G031470P130.1
Length: 564
KOG ID: KOG1223
KOG E-value: Not available
KOG Score: 916.0
KOG Annotation: Amino acid transport and metabolism
Biological Process: GO:0009058(biosynthetic process)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0008909(isochorismate synthase activity)
KEGG Ortholog: K02552 menF; menaquinone-specific isochorismate synthase [EC:5.4.4.2]
NR Protein: XP_013672189.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1112.4
NR Annotation: XP_013672189.1 isochorismate synthase 1, chloroplastic-like [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9S7H8|ICS1_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 998.0
SwissProt Annotation: Isochorismate synthase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ICS1 PE=1 SV=2
CDS Sequence (1719 bp)
ATGGCCTCACTTCAACTCTCCTCTCACTTTCTTGGCACAAACACTAAGAAACACAGCTCCATGTCCATCT
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Upstream Sequence
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Downstream Sequence
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TTTTATATATCCAGTTCTCCGTTTGGTTCGGTTATTTTGGATAATTGAGGGTTTCAATTT
GGTTATGGTTTTGGTTATTT
Pro Sequence
MASLQLSSHFLGTNTKKHSSMSISRTYSPVPCTRLFSRKFMSCSMSMNGC
EGDFKTPLGTAETRTMAAVLSPTSATESLISAVSELKCQPPPFSSGVVRL
EVPINQQIGAIDWLQAQNEAHPRCFFSRRSDVGRPDLLLDLASEKDNNNG
GSSDRDLVSVAGIGSAVFFRDLDPFSHDDWRSIRRFLSSTSPLIRAYGGM
RFDPNGKISVEWKPFGAFYFAVPQVEFNEFEGSSMLAATLAWDDELSWTL
DNAVESLQETMLQVSSIVMKLRKESLGVSVLSKNHVPTKGAYYPAVEKAL
EMINQKSSSLNKVVLARNSRVITDTDIDPIAWLAQLQSEGHDAYQFCLQP
PGAPAFIGNTPERLFQRNQLGVCSEALAATRPRGASTARDKEIELDLLTS
LKDDLEFSIVRENIKEKLNSICDKVVVKPQKTVRKLARVQHLYSQLAGRL
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GQESEFAVGIRSALVEKGLGALIYAGTGIVAGSNPTSEWNELDLKISQFT
KSIEYKSTSLQRIN
mRNA Sequence
CTAGTCTCTTACTACAAACATCAAAACTTACAAATCAAACAAAATATTTATAAGTTCACTCACCATCTCT
GTTTCTTTCGTTCTCCAATGGCCTCACTTCAACTCTCCTCTCACTTTCTTGGCACAAACACTAAGAAACA
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TCGTGTTCCATGTCTATGAATGGATGCGAAGGTGATTTCAAGACGCCACTTGGTACAGCTGAGACGAGGA
CTATGGCGGCAGTTTTATCTCCAACATCCGCCACTGAGAGTCTAATCTCCGCCGTCTCCGAGCTTAAGTG
TCAACCTCCGCCATTTTCCTCCGGCGTCGTCCGCTTAGAGGTACCAATCAACCAGCAAATCGGAGCAATC
GATTGGCTCCAAGCGCAGAACGAGGCTCACCCTCGCTGCTTCTTCTCTCGCCGTAGCGACGTTGGTCGTC
CTGATCTTCTTCTCGACTTAGCGAGCGAGAAGGATAACAATAACGGAGGCTCATCAGATCGTGATCTGGT
CAGCGTTGCTGGTATCGGTTCAGCAGTGTTCTTCCGTGACCTTGACCCGTTCTCTCATGATGACTGGAGA
TCCATCAGAAGGTTTCTGTCGTCTACGTCACCTTTGATTCGTGCCTATGGTGGCATGAGGTTTGATCCTA
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TGAGTTTGAGGGAAGCTCAATGTTGGCTGCAACTCTTGCTTGGGACGATGAACTCTCTTGGACTTTGGAT
AATGCCGTTGAATCACTTCAAGAGACTATGCTCCAGGTTTCTTCTATTGTGATGAAGTTGCGGAAGGAAT
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GGAAGCAACCCAACCTCAGAGTGGAATGAGCTTGATCTAAAGATATCTCAGTTTACCAAGTCAATTGAAT
ATAAGTCAACAAGTCTACAGAGGATTAATTGAGGAAGAGTAACAACAACAACAACAACAACAACATTTGT
ATTTCATTGTATTATTGTATGGGAATGGAGGTTACAGTAAAAATCAGTGTGTTGTCATTTGTCAATGTAT
CTTTGTA