BrassicaPanDB

CDS Sequence (161 bp)

ATGATACTCGAACATGTACTTGTTTTGAGTGCCTATTTATTTTTGATTGGTCTTTATGGATTGATCACGA
GTCGAAATATGGTTAGGGCTCTTATGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTTAATATGAATCTCGTAAC
ATTTGCTGATTTTTTTTGA

Upstream Sequence

ATGATACTCGAACATGTACTTGTTTTGAGTGCCTATTTATTTTTGATTGGTCTTTATGGATTGATCACGA
GTCGAAATATGGTTAGGGCTCTTATGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTTAATATGAATCTCGTAAC
ATTTGCTGATTTTTTTTGA

Downstream Sequence

ATAATTCCCAACTAAAAGGGGATATTTTCTGCATTTTTATTATAGCAATTGCAGCCGCTG
AAGCAGCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAACAGAAAATCAACTCGCA
TCAACCAATCGACCTTATTAAATAAGTAGCATAAATCAAAAAATTATAGGTTTAAATTTG
CATATATGATAGGTTATGACTTACTAGATTAAATTTGTGAAAATTTAAGAAATCAAAGTA
TTTTAGCCCCAtttttacCAATTGAGCCAGATTTCATTAAAAAATTCTATTAAAATAAAT
CATTGCTTCATCTAGTATTTTAATTTAATATATCATTTAGTTATAAGTTTACTAGATTGA
AAATTTATGACATTAAAAAAACTATAGATCCTATGTCACATTCAGTaaaagttatGATAC
CTGTATAGGATGTACTCAGTGTGTCCGAGCATGTCCTACAGACGTATTAGAAATGATACC
TTGGGATGGATGTAAAGCTAAGCAAATAGCTTCTGCCCCAAGAACCGAGGATTGTGTTGG
TTGTAAGAGATGTGAATCTGCCTGTCCAACGgacttttgaGCGTTCGGGTTTATTCATGG
CATGAAACAACTCGAAGCATGGGTCTAGCTTATTAATACGTTACCGAAAACCTGATTTGA
ATAAATTTGGAATAcattttatttttttattgacaagtactcgtactcaaaagttcaatt
atattttttatttatatatttttttgatgcagccgttctttggacctggtgtatcttgtc
tttaccatgaatgattttccttggttaacaataattgttgtttttccAATATCTGCCGGT
TCATTAATGTTATTTCTCCCgcataggaaacaaagttaataagtggtatactatatgcat
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ccattaattcaactgtccgaagattataaatggatcaatcttttgattTTTATTGGAGAC
TGGGAATAGATGGACTTTCTATAGGAACGATTTTACTGACCGGATTTATTACTACTTTAG
CTACTTTAGCGGCTTTTCCAGTTACTCGGGATTCCCGATTATTCTATTTCCTGATGTTAG
CAATGTACAGCGGCCAAATAGGATCGTTTTCTTCTCGGGATATTTTACTTTTTTTCATCA
TGTGGGAATTAGAATTAATTCCCGTTTATCTCCTTTTATCCATGTGGGGTGGAAAGAAAC
GTTTGTATTCAGCTACAAAATTTATTTTATACACTGCAGGAAGTTCTATTTTTTTATTAA
TAGGAGTTTTAGGTATAAGTTTATATGGTTCGAACGAACCAACATTAAATTTAGAACTAT
TAGGGAATCAAGCCTATCCGGTCACACTCGAAATACTTTTTTATATTGGATTTCTTATTG
CTTTTGCCGTCAAATCACCGATTATACCTTTACATACCTGGTTACATGACACCCACGGCG
AGGCACATTACAGTACCTGTATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAAATGGGAGCATATG
GATTGGTTCGAATCAATATGGAATTATTACCTCACGCTCATTCTATGTTTTCTCCTTGGT
TGATGGTAGTCGGTACAATCCAAATAATTTATGCAGCTTCAACATCTCCCGGTCAACGTA
ATTTAAAAAAGAGAATAGCCTATTCTTCTGTATCTCATATGGGTTTTATAATTATAGGTA
TTGGTTCTATAACGGATCCTGGGCTTAATGGAGCTATTTTACAAATAATCTCTCATGGAT
TTATTGGCGCAGCACTTTTTTTCTTGGCAGGAACTAGTTATGATAGAATCCGGCTTGTTT
ATCTTGATGAAATGGGTGGAATGGCTATCTCCATTCCAAAGATATTTACAATGTTCACTA
TCTTATCGATGGCTTCCCTTGCATTACCGGGCATGAGTGGTTTTGTTGCAGAATTAATca
tttttttggaataattacca

Pro Sequence

MILEHVLVLSAYLFLIGLYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNLVTFAD
FF

mRNA Sequence

ATGATACTCGAACATGTACTTGTTTTGAGTGCCTATTTATTTTTGATTGGTCTTTATGGATTGATCACGA
GTCGAAATATGGTTAGGGCTCTTATGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTTAATATGAATCTCGTAAC
ATTTGCTGATTTTTTTTGA

Genome:
ZS11:	ZS11_C02G48040.t1
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WE:	WE_A06G24490.t1
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No2127:	BnaC02T0398500NO
P130:	Not available
Length:	52
KOG ID:	KOG4669
KOG E-value:	2.300000e-29
KOG Score:	100.0
KOG Annotation:	Energy production and conversion
Biological Process:	GO:0042773(ATP synthesis coupled electron transport)
Cellular Component:	-
Molecular Function:	GO:0016651(oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H)
KEGG Ortholog:	-
NR Protein:	VDD25508.1
NR E-value:	3.600000e-18
NR Score:	95.1
NR Annotation:	VDD25508.1 unnamed protein product [Brassica rapa]
SwissProt Protein:	A4QL73\|NU4LC_DRANE
SwissProt E-value:	2.220000e-29
SwissProt Score:	102.0
SwissProt Annotation:	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic OS=Draba nemorosa OX=171822 GN=ndhE PE=3 SV=1

DETAIL

Detail for ZS11_C02G48040.t1

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