SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_C02G62740.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C02G62740.t1
ZS11_v0: BnaC07T0364600ZS
WE: WE_C02G67670.t1
WE_v0: BnaC02T0497900WE
Darmor: C02p60220.1_BnaDAR
BH: BnaA02T462900BH
Quinta: BnaC02T0481500QU
ZS2: BnaC02T503200ZS2
SW: BnaA02T417000SW
Express61: C02p038000.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC02G0519200XY
P202: BnaC02G040910P202.1
BL: BnaA02T462900BH
TA: BnaC02T516100TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g19060D
RB: BnaC02T399300RB
No2127: BnaC02T0462500NO
P130: BnaC02G064830P130.1
Length: 341
KOG ID: KOG0143
KOG E-value: Not available
KOG Score: 650.0
KOG Annotation: Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism; General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K24028 DMR6, DLO; salicylic acid 3-hydroxylase [EC:1.14.11.-]
NR Protein: XP_013620820.1
NR E-value: 1.800000e-203
NR Score: 713.4
NR Annotation: XP_013620820.1 PREDICTED: flavanone 3-dioxygenase-like [Brassica oleracea var. oleracea]
SwissProt Protein: Q9FLV0|DMR6_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 650.0
SwissProt Annotation: Protein DOWNY MILDEW RESISTANCE 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DMR6 PE=1 SV=1
CDS Sequence (1040 bp)
ATGGCGGCAAAGCTTTTATCCACCGGTTTCCGTCACTCTACTTTGCCGGAAAACTATGTCCGGCCACTCT
CTGACCGTCCACGTCTCTCCCAAGTTTCTCAGCTTGAAGATTTCCCTCTCATCGATATATCTTCAACAGA
TCGATCTCGGCTCGTCCAAAAAATCCACCAAGCTTGCGCCCGATTTGGTTTCTTTCAGGTTATAAATCAT
GGTGTTAGCAAAGCAACTATAGATGAGATGGTGAGTGTTGCGCATGAGTTTTTTGGCATGCCTATGGACG
AAAAAATGAAGCTATACTCGGACGATCCAACAAAGACACCGAGATTATCGACGAGCTTTAATGTGAAGGA
AGAAGAGGTTAATAATTGGAGAGACTATCTAAGACTTCATTGTTATCCTATCGACAAGTATGTCCATGAG
TGGCCTTCCAACCCACCTTCTTTCAAGGAAGTTGTGAGTAAATACAGTAGAGAAATAAGAGAATTGGGAC
TTAAAATAGAGGAATTGATATCAGAGAGCTTAGGTTTAGAAAAAGATTACATGAAGAAAGTGCTTGGTGA
ACAAGGTCAACACATGGCAGTCAACTATTATCCTCCATGTCCTGAGCCTGAGCTCACCTATGGTTTACCT
GCTCATACCGACCCAAATGCCCTCACCATTCTTCTCCAAGATGCTACCGTTTGCGGTCTCCAGATCTTGA
TCGACGGTCACTGGTTTGCTGTTAATCCTCGTCCTGATGCTTTTGTCATCAACATTGGTGACCAGTTGCA
GGCATTGAGTAACGGAGTATACAAAAGTGTTTGGCATCGAGCAGTGACAAACACTGAAAACCCGAGACTA
TCGATCGCATCATTTATGTGTCCTGATAACGGTGCTGTCATAAGCCCGGCAAAGCCCCTGTGGGAAGCCA
AGGAGGAAGAGGCCAAGCCAATCTACAGAGACTACACTTATGCAGAGTACTACAAGAAGTTTTGGAGTAG
GAATCTGGACCAAGAACATTGCCTCGAAAACTTTCTAAACGACTAG
Upstream Sequence
GTCAAGCCTTCCTTTATCTCTTCCCCTTTACAACTTCTTTCATCTCCGAAATCATAACATGGCGGCAAAG
CTTTTATCCACCGGTTTCCGTCACTCTACTTTGCCGGAAAACTATGTCCGGCCACTCTCTGACCGTCCAC
GTCTCTCCCAAGTTTCTCAGCTTGAAGATTTCCCTCTCATCGATATATCTTCAACAGATCGATCTCGGCT
CGTCCAAAAAATCCACCAAGCTTGCGCCCGATTTGGTTTCTTTCAGGTTATAAATCATGGTGTTAGCAAA
GCAACTATAGATGAGATGGTGAGTGTTGCGCATGAGTTTTTTGGCATGCCTATGGACGAAAAAATGAAGC
TATACTCGGACGATCCAACAAAGACACCGAGATTATCGACGAGCTTTAATGTGAAGGAAGAAGAGGTTAA
TAATTGGAGAGACTATCTAAGACTTCATTGTTATCCTATCGACAAGTATGTCCATGAGTGGCCTTCCAAC
CCACCTTCTTTCAAGGAAGTTGTGAGTAAATACAGTAGAGAAATAAGAGAATTGGGACTTAAAATAGAGG
AATTGATATCAGAGAGCTTAGGTTTAGAAAAAGATTACATGAAGAAAGTGCTTGGTGAACAAGGTCAACA
CATGGCAGTCAACTATTATCCTCCATGTCCTGAGCCTGAGCTCACCTATGGTTTACCTGCTCATACCGAC
CCAAATGCCCTCACCATTCTTCTCCAAGATGCTACCGTTTGCGGTCTCCAGATCTTGATCGACGGTCACT
GGTTTGCTGTTAATCCTCGTCCTGATGCTTTTGTCATCAACATTGGTGACCAGTTGCAGGCATTGAGTAA
CGGAGTATACAAAAGTGTTTGGCATCGAGCAGTGACAAACACTGAAAACCCGAGACTATCGATCGCATCA
TTTATGTGTCCTGATAACGGTGCTGTCATAAGCCCGGCAAAGCCCCTGTGGGAAGCCAAGGAGGAAGAGG
CCAAGCCAATCTACAGAGACTACACTTATGCAGAGTACTACAAGAAGTTTTGGAGTAGGAATCTGGACCA
AGAACATTGCCTCGAAAACTTTCTAAACGACTAGTTAATTGCCTCGAGATCTTTGTGTTTACGCAGTAAC
GCAGAGTACTACAATAAGTGTTTAAGTGTATACTACGTATCCATTTTTCATTTAAGAAATGATTAACAAT
AATAGTAACCATTTATCAGTTCTATTCTATCAATCTATTCTAGCTAGATTGATAAATGTCTTGATTACAA
CTATTTTGTTACCTTGTGTCCAAAATTAAATATATAGTATATATGTAAGCAATTATTTCATCAAGATAAA
TGTGAC
Downstream Sequence
GGTACCTATATACACATATTATACACGCTTTGATAAGGTATATGAACTTTTGAATCAATT
AAAGAATAAATATACTGATTTTCATTATTATTATTTGGTTACTTATATCAAACGGAGTAA
ACAAAAAAAAAACTTTTTTCTTGCACTAGCCTTTGTTTCTATTATGAATATAAAGAGCGC
TAGCATTACTGGTTTGCTGTGCGCTTCGACGTAATAACCAAATTATGTTTCATGAATTAT
TTAAATTGAACTTCAATATTTCACTAACTATTATTTGTTTGTTTataatattttttatct
ataataaattttagatacttcatgaattaatataaaataacttttattatgactttccgc
ttaagccgaccttagtatttactataatatagctaagtatttaaactaacaattaatact
ctttctgtttttaaaaaatgtcaatttgacattttcacataaattataaaaataattaaa
atgtatttatatttttaataattataaccatttaacaaatgatatttgaggcaaataaaa
atatttataaaatcaatgcattttacaatttatattaaatttaaataattataaattttt
ataatttttttaaaaacattcttttgtaacaataaaaaaTGTCATAATGACATCATTTAT
AAAACAGAAAGAATAGTTTTTTCTCGGCTAACCTTTTTTTTGTCAGGATTTCTCGGCTAA
CCTTTTCAATGGATATAGGTTATAAATCATGGTGTTAGCAAAGCAACTATAGATGAGATG
GTGAGTGTTGCGCATGAGTTTTTTGGCATGCCTATGGACGAAAAAATGAAGCTATACTCG
GACGATCCAACAAAGACACCGAGATTATCGACGAGCTTTAATGTGAAGGAAGAAGAGGTT
AATAATTGGAGAGACTATCTAAGACTTCATTGTTATCCTATCGACAAGTATGTCCATGAG
TGGCCTTCCAACCCACCTTCTTTCAAGTAAGCACTTAACTCACTCTTTTTTCAGGTTGTA
ATTTGGGTTTGCATCTTCTTTCTCAAATATTTCTagtaactttttttatcaactaatatt
tctagtaatttaaaatccctttttcaaaaaaaaaaaaaCCATTCTTGTAATTTGTATTGA
TATATAGTCAATAATAATATAAACAATATTTCATATTTTGAATAGGTAAAGAACGGTCCG
TCAGATTCTATGGTATATGCCATGGTTTTATTTTATTGGTGAATTCTGATATGTCAGAAT
TGCCAAAAATAGACTTATAAAGCTAGTTTTAGACTATAAATAGACTTATATATCTATCTT
AAGACTATCATTTACCTCATCAGATTCTATTTTCTCTGTCTCTGGTCCCTATATAGATAA
TCATACTATACTATAAGAATGAAAACAAACTAATGGCTGAAAGCAAATATAGGCTGCCTA
TCAAGAAAAGACATAAGCTGAGCTATAGATATTCAGAGCTATATCGTGATTCCTTAAAAA
CACACAATAAAACAAAATTAGAGCAAGCTAATTTGTTTTCCAGCAGGAAGTAGCCTTAAT
GTGAGCATTTTTCTCATATGACATCGTCTATCGTATTATAACATTATAAAATAAACAAGC
ATATGCCCTATTTAAATCACCATTAAATTATTTTCATTTTTATAACGAGAATATTGGGTA
TATTCATTCCTAAACACAAAAGTCGATTTTGGATTTGAACAAAGAAAATTGGAACTTCAT
CCGAGTCAAGTCAACTGATTTTGTTTTTCTTCAAACTAGTTATATATTTTAAAATTTGAT
TGGTAAAAGATACATTAAATTATGCTCCCATGTATTTTATCTTTTCTgatttggttcccc
atgtgatcacaTGGACTgCTAAGaTGTGTACAtTGCACAATTCCTATGCATACATGTGGC
TGTTGGGCTTATAATAAGTGGTCACCATACTTCATATTCTTCAAAGACGTGTGAATTAAT
TCGGCCGACTATTAACTTAC
Pro Sequence
MAAKLLSTGFRHSTLPENYVRPLSDRPRLSQVSQLEDFPLIDISSTDRSR
LVQKIHQACARFGFFQVINHGVSKATIDEMVSVAHEFFGMPMDEKMKLYS
DDPTKTPRLSTSFNVKEEEVNNWRDYLRLHCYPIDKYVHEWPSNPPSFKE
VVSKYSREIRELGLKIEELISESLGLEKDYMKKVLGEQGQHMAVNYYPPC
PEPELTYGLPAHTDPNALTILLQDATVCGLQILIDGHWFAVNPRPDAFVI
NIGDQLQALSNGVYKSVWHRAVTNTENPRLSIASFMCPDNGAVISPAKPL
WEAKEEEAKPIYRDYTYAEYYKKFWSRNLDQEHCLENFLND
mRNA Sequence
GTCAAGCCTTCCTTTATCTCTTCCCCTTTACAACTTCTTTCATCTCCGAAATCATAACATGGCGGCAAAG
CTTTTATCCACCGGTTTCCGTCACTCTACTTTGCCGGAAAACTATGTCCGGCCACTCTCTGACCGTCCAC
GTCTCTCCCAAGTTTCTCAGCTTGAAGATTTCCCTCTCATCGATATATCTTCAACAGATCGATCTCGGCT
CGTCCAAAAAATCCACCAAGCTTGCGCCCGATTTGGTTTCTTTCAGGTTATAAATCATGGTGTTAGCAAA
GCAACTATAGATGAGATGGTGAGTGTTGCGCATGAGTTTTTTGGCATGCCTATGGACGAAAAAATGAAGC
TATACTCGGACGATCCAACAAAGACACCGAGATTATCGACGAGCTTTAATGTGAAGGAAGAAGAGGTTAA
TAATTGGAGAGACTATCTAAGACTTCATTGTTATCCTATCGACAAGTATGTCCATGAGTGGCCTTCCAAC
CCACCTTCTTTCAAGGAAGTTGTGAGTAAATACAGTAGAGAAATAAGAGAATTGGGACTTAAAATAGAGG
AATTGATATCAGAGAGCTTAGGTTTAGAAAAAGATTACATGAAGAAAGTGCTTGGTGAACAAGGTCAACA
CATGGCAGTCAACTATTATCCTCCATGTCCTGAGCCTGAGCTCACCTATGGTTTACCTGCTCATACCGAC
CCAAATGCCCTCACCATTCTTCTCCAAGATGCTACCGTTTGCGGTCTCCAGATCTTGATCGACGGTCACT
GGTTTGCTGTTAATCCTCGTCCTGATGCTTTTGTCATCAACATTGGTGACCAGTTGCAGGCATTGAGTAA
CGGAGTATACAAAAGTGTTTGGCATCGAGCAGTGACAAACACTGAAAACCCGAGACTATCGATCGCATCA
TTTATGTGTCCTGATAACGGTGCTGTCATAAGCCCGGCAAAGCCCCTGTGGGAAGCCAAGGAGGAAGAGG
CCAAGCCAATCTACAGAGACTACACTTATGCAGAGTACTACAAGAAGTTTTGGAGTAGGAATCTGGACCA
AGAACATTGCCTCGAAAACTTTCTAAACGACTAGTTAATTGCCTCGAGATCTTTGTGTTTACGCAGTAAC
GCAGAGTACTACAATAAGTGTTTAAGTGTATACTACGTATCCATTTTTCATTTAAGAAATGATTAACAAT
AATAGTAACCATTTATCAGTTCTATTCTATCAATCTATTCTAGCTAGATTGATAAATGTCTTGATTACAA
CTATTTTGTTACCTTGTGTCCAAAATTAAATATATAGTATATATGTAAGCAATTATTTCATCAAGATAAA
TGTGAC