SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_C03G04490.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C03G04490.t1
ZS11_v0: BnaC03T0040700ZS.1
WE: WE_A10G30160.t1
WE_v0: BnaA03T0040600WE
Darmor: C03p04400.1_BnaDAR
BH: BnaC03T044200BH
Quinta: BnaC03T0033100QU
ZS2: BnaC03T040400ZS2
SW: BnaC03T037000SW
Express61: C03p005590.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC03G0038600XY
P202: BnaC03G004460P202.2
BL: BnaC03T044200BH
TA: BnaA10T256300TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaC03T044200RB
No2127: BnaC09T0502000NO
P130: BnaC03G003530P130.3
Length: 486
KOG ID: KOG2658
KOG E-value: Not available
KOG Score: 990.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0051539(4 iron, 4 sulfur cluster binding),GO:0010181(FMN binding),GO:0051287(NAD binding)
KEGG Ortholog: K03942 NDUFV1; NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 1 [EC:7.1.1.2]
NR Protein: XP_013680340.1
NR E-value: 6.600000e-279
NR Score: 964.5
NR Annotation: XP_013680340.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial-like isoform X1 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9FNN5|NDUV1_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 990.0
SwissProt Annotation: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g08530 PE=1 SV=1
CDS Sequence (1481 bp)
ATGGCACCCATGAGGGGGATTCTCGGCTTGCAGAGAGCAATATCAACTTGGAAGGGAAGTAACAGATTGG
CTCCATCTTTGAGATCACTCAGCACCCAAGCTGCGTCCACTTCCACCACTCCACAGCCACCACCACCACC
TCCGCCTCCGGAAAAGACTCATTTCGGTGGTCTCAAGGATGAAGATCGGATTTTCACCAACCTCTATGGC
CTACACGACCCTTTTCTCAAAGGAGCGATGAAGAGAGGTGATTGGCACAGGACTAAAGATTTGGTACTCA
AGGGTACTGATTGGATTGTTAATGAAATGAAAAAGTCTGGTCTTCGTGGTCGTGGTGGCGCTGGTTTCCC
TTCTGGTCTTAAGTGGTCCTTTATGCCGAAAGTCTCTGATGGACGTCCGTCTTATTTGGTTGTTAACGCT
GATGAGAGTGAGCCTGGGACTTGTAAAGATAGGGAGATCATGCGGCATGACCCTCATAAGTTGTTGGAAG
GGTGTTTGATTGCTGGTGTTGGGATGAGAGCTAGTGCGGCGTATATTTACATCAGGGGTGAGTATGTGAA
TGAGCGTTTGAATCTAGAAAAGGCTAGAAGGGAGGCATATGCAGCTGGTCTGTTGGGGAAGAATGCGTGT
GGTTCTGGTTATGATTTCGATGTGTATATCCACTTTGGTGCTGGTGCTTATATTTGTGGTGAAGAGACTG
CGCTTCTTGAGAGTCTCCAAGGGAAGCAAGGGAAGCCTAGGTTGAAGCCTCCATTCCCTGCTAATGCTGG
TTTATATGGTTGTCCCACTACTGTCACCAATGTGGAAACTGTTGCTGTGTCTCCTACTATTCTAAGGCGT
GGACCTGAGTGGTTTTCGAGTTTCGGTAGGAAGAATAACGCTGGGACAAAGCTGTTTTGTATCTCAGGGC
ATGTGAACAAGCCATGTACCGTTGAAGAGGAGATGAGTATACCTCTCAAGGAACTGATTGAGAGGCATTG
TGGAGGCGTTAGAGGTGGATGGGACAACCTACTTGCTATCATTCCTGGAGGTTCCTCTGTCCCTTTGATT
CCTAAGAATATATGCGAGGATGTGCTTATGGATTTCGATGCGCTCAAAGCTGTCCAATCAGGGCTAGGAA
CTGCAGCTGTCATTGTGATGGATAAATCAACCGATGTTGTGGATGCAATCGCGAGGCTCTCTTACTTCTA
CAAGCATGAAAGCTGTGGGCAGTGTACTCCATGCAGGGAGGGGACAGGTTGGCTTTGGATGATCATGGAG
AGGATGAAGGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCTTCAGGAGGTAACAAAACAGATCGAAG
GACACACAATCTGTGCCTTGGGAGATGCAGCTGCATGGCCCGTGCAAGGTCTGATAAGGCACTTTAGGCC
GGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGAACGCGCTGAAAGGGAGTTGTTACAGGCTGCTGCTTAA
Upstream Sequence
GCTGACTATATTATATGGGCCCGGCCCGATAAAGGCCTAGAAACATAGAAAGGTTATCTGAACCAAGCAG
TTATCTCGAGTTCGTCGGTCTCAGGTGCTGTCATCGCCTTCCTCCTCTACTTCCCCTCCGTGTAACCTTC
TCGCTTAGAGGAACCAATACTAAGTCTCAGCTGTATCCATGGCACCCATGAGGGGGATTCTCGGCTTGCA
GAGAGCAATATCAACTTGGAAGGGAAGTAACAGATTGGCTCCATCTTTGAGATCACTCAGCACCCAAGCT
GCGTCCACTTCCACCACTCCACAGCCACCACCACCACCTCCGCCTCCGGAAAAGACTCATTTCGGTGGTC
TCAAGGATGAAGATCGGATTTTCACCAACCTCTATGGCCTACACGACCCTTTTCTCAAAGGAGCGATGAA
GAGAGGTGATTGGCACAGGACTAAAGATTTGGTACTCAAGGGTACTGATTGGATTGTTAATGAAATGAAA
AAGTCTGGTCTTCGTGGTCGTGGTGGCGCTGGTTTCCCTTCTGGTCTTAAGTGGTCCTTTATGCCGAAAG
TCTCTGATGGACGTCCGTCTTATTTGGTTGTTAACGCTGATGAGAGTGAGCCTGGGACTTGTAAAGATAG
GGAGATCATGCGGCATGACCCTCATAAGTTGTTGGAAGGGTGTTTGATTGCTGGTGTTGGGATGAGAGCT
AGTGCGGCGTATATTTACATCAGGGGTGAGTATGTGAATGAGCGTTTGAATCTAGAAAAGGCTAGAAGGG
AGGCATATGCAGCTGGTCTGTTGGGGAAGAATGCGTGTGGTTCTGGTTATGATTTCGATGTGTATATCCA
CTTTGGTGCTGGTGCTTATATTTGTGGTGAAGAGACTGCGCTTCTTGAGAGTCTCCAAGGGAAGCAAGGG
AAGCCTAGGTTGAAGCCTCCATTCCCTGCTAATGCTGGTTTATATGGTTGTCCCACTACTGTCACCAATG
TGGAAACTGTTGCTGTGTCTCCTACTATTCTAAGGCGTGGACCTGAGTGGTTTTCGAGTTTCGGTAGGAA
GAATAACGCTGGGACAAAGCTGTTTTGTATCTCAGGGCATGTGAACAAGCCATGTACCGTTGAAGAGGAG
ATGAGTATACCTCTCAAGGAACTGATTGAGAGGCATTGTGGAGGCGTTAGAGGTGGATGGGACAACCTAC
TTGCTATCATTCCTGGAGGTTCCTCTGTCCCTTTGATTCCTAAGAATATATGCGAGGATGTGCTTATGGA
TTTCGATGCGCTCAAAGCTGTCCAATCAGGGCTAGGAACTGCAGCTGTCATTGTGATGGATAAATCAACC
GATGTTGTGGATGCAATCGCGAGGCTCTCTTACTTCTACAAGCATGAAAGCTGTGGGCAGTGTACTCCAT
GCAGGGAGGGGACAGGTTGGCTTTGGATGATCATGGAGAGGATGAAGGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGA
GATTGATATGCTTCAGGAGGTAACAAAACAGATCGAAGGACACACAATCTGTGCCTTGGGAGATGCAGCT
GCATGGCCCGTGCAAGGTCTGATAAGGCACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGAACGCGCTG
AAAGGGAGTTGTTACAGGCTGCTGCTTAAAAATCCTTGCTAATCACAGGGAATTTGCTATTATTCTCCAT
GGAAATAAAATCTGAAGCATACTATTAGAGTTTTTGGGTTGCAAAGCTACTTCAGAAGGAGAAGAAGGTA
ATGTGTTTGTGTTAAATGGTTCATGTTAAAACTTTATTCAAATTGTATCATAAAGAGCTTTATTTACTCT
TTTGATTACTATACTTTCTTCAGTATTTGCTTGTTTTCTTATGACTATTGAGAGCACATTTTGGGAACAA
CCAAACAAAACCTTTTCATGTTTGAAATAAAGGATGCTCCTTATTTTGGTTTAAATAGTTTAAATTCCAA
AA
Downstream Sequence
GGTATGTAATCAGTTTCATAATTAGATGATCTTCGTTTTCATTTCTCGATCGCAAATGTT
AGGGCTTGTGGAATTAAAGACTAGATTTTTATTGCGATTTTTTTTTCAAATTTCAGCTGA
ATAATTTCAAAAGGTGGAGTCttttcataTGGATCTAGCGGGTTATTATTGTTTCAGAAT
TTAATTTAATTTAATTTAATTTGATCTGCTCATTGTGCTTTGAGATTATCGATGCTTTTG
GGCTAGATCATGCGTTTCAGTGTTTGTTAGATTTGCTATATAACCTGTTATGTTCTGTGC
ATTCAATCACAGGCACCCATGAGGGGGATTCTCGGCTTGCAGAGAGCAATATCAACTTGG
AAGGGAAGTAACAGATTGGCTCCATCTTTGAGATCACTCAGCACCCAAGCTGCGTCCACT
TCCACCACTCCACAGCCACCACCACCACCTCCGCCTCCGGAAAAGACTCATTTCGGTGGT
CTCAAGGATGAAGATCGGATTTTCACCAACCTCTATGGCCTACACGACCCTTTTCTCAAA
GGAGCGATGAAGAGAGGTGATTGGCACAGGACTAAAGATTTGGTACTCAAGGGTACTGAT
TGGATTGTTAATGAAATGAAAAAGTCTGGTCTTCGTGGTCGTGGTGGCGCTGGTTTCCCT
TCTGGTCTTAAGTGGTCCTTTATGCCGAAAGTCTCTGATGGACGTCCGTCTTATTTGGTT
GTTAACGCTGATGAGAGTGAGCCTGGGACTTGTAAAGATAGGGAGATCATGCGGCATGAC
CCTCATAAGTTGTTGGAAGGGTGTTTGATTGCTGGTGTTGGGATGAGAGCTAGTGCGGCG
TATATTTACATCAGGGGTGAGTATGTGAATGAGCGTTTGAATCTAGAAAAGGCTAGAAGG
GAGGCATATGCAGCTGGTCTGTTGGGGAAGAATGCGTGTGGTTCTGGTTATGATTTCGAT
GTGTATATCCACTTTGGTGCTGGTGCTTATATTTGTGGTGAAGAGACTGCGCTTCTTGAG
AGTCTCCAAGGGAAGCAAGGGAAGCCTAGGTTGAAGCCTCCATTCCCTGCTAATGCTGGT
TTATATGGTTGTCCCACTACTGTCACCAATGTGGAAACTGTTGCTGTGTCTCCTACTATT
CTAAGGCGTGGACCTGAGTGGTTTTCGAGTTTCGGTAGGAAGAATAACGCTGGGACAAAG
CTGTTTTGTATCTCAGGGCATGTGAACAAGCCATGTACCGTTGAAGAGGAGATGAGTATA
CCTCTCAAGGAACTGATTGAGAGGCATTGTGGAGGCGTTAGAGGTGGATGGGACAACCTA
CTTGCTATCATTCCTGGAGGTTCCTCTGTCCCTTTGATTCCTAAGAATATATGCGAGGAT
GTGCTTATGGATTTCGATGCGCTCAAAGCTGTCCAATCAGGGCTAGGAACTGCAGCTGTC
ATTGTGATGGATAAATCAACCGATGTTGTGGATGCAATCGCGAGGCTCTCTTACTTCTAC
AAGCATGAAAGCTGTGGGCAGTGTACTCCATGCAGGGAGGGGACAGGTTGGCTTTGGATG
ATCATGGAGAGGATGAAGGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCTTCAGGAG
GTAACAAAACAGATCGAAGGACACACAATCTGTGCCTTGGGAGATGCAGCTGCATGGCCC
GTGCAAGGTCTGATAAGGCACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGAACGCGCT
GAAAGGGAGTTGTTACAGGCTGCTGCTTAAAAATCCTTGCTAATCACAGGTGTGCATCTT
CATTTCTTGCTCTCTTTTTAATCTCTTGTTGTAAACTTAAAAGTGAAAAAGATCTAGATT
TCACCTAGCCTTAGTTGACTGTTTCGGTAAAATGGTGGAGTTTGGTACGTCACTATTTGA
CTTTTCTAGGCTCTCTGGTCCTTCATAGTGTTTAACCCTTTGCAGGGAATTTGCTATTAT
TCTCCATGGAAATAAAATCT
Pro Sequence
MAPMRGILGLQRAISTWKGSNRLAPSLRSLSTQAASTSTTPQPPPPPPPP
EKTHFGGLKDEDRIFTNLYGLHDPFLKGAMKRGDWHRTKDLVLKGTDWIV
NEMKKSGLRGRGGAGFPSGLKWSFMPKVSDGRPSYLVVNADESEPGTCKD
REIMRHDPHKLLEGCLIAGVGMRASAAYIYIRGEYVNERLNLEKARREAY
AAGLLGKNACGSGYDFDVYIHFGAGAYICGEETALLESLQGKQGKPRLKP
PFPANAGLYGCPTTVTNVETVAVSPTILRRGPEWFSSFGRKNNAGTKLFC
ISGHVNKPCTVEEEMSIPLKELIERHCGGVRGGWDNLLAIIPGGSSVPLI
PKNICEDVLMDFDALKAVQSGLGTAAVIVMDKSTDVVDAIARLSYFYKHE
SCGQCTPCREGTGWLWMIMERMKVGNAKLEEIDMLQEVTKQIEGHTICAL
GDAAAWPVQGLIRHFRPELERRIRERAERELLQAAA
mRNA Sequence
GCTGACTATATTATATGGGCCCGGCCCGATAAAGGCCTAGAAACATAGAAAGGTTATCTGAACCAAGCAG
TTATCTCGAGTTCGTCGGTCTCAGGTGCTGTCATCGCCTTCCTCCTCTACTTCCCCTCCGTGTAACCTTC
TCGCTTAGAGGAACCAATACTAAGTCTCAGCTGTATCCATGGCACCCATGAGGGGGATTCTCGGCTTGCA
GAGAGCAATATCAACTTGGAAGGGAAGTAACAGATTGGCTCCATCTTTGAGATCACTCAGCACCCAAGCT
GCGTCCACTTCCACCACTCCACAGCCACCACCACCACCTCCGCCTCCGGAAAAGACTCATTTCGGTGGTC
TCAAGGATGAAGATCGGATTTTCACCAACCTCTATGGCCTACACGACCCTTTTCTCAAAGGAGCGATGAA
GAGAGGTGATTGGCACAGGACTAAAGATTTGGTACTCAAGGGTACTGATTGGATTGTTAATGAAATGAAA
AAGTCTGGTCTTCGTGGTCGTGGTGGCGCTGGTTTCCCTTCTGGTCTTAAGTGGTCCTTTATGCCGAAAG
TCTCTGATGGACGTCCGTCTTATTTGGTTGTTAACGCTGATGAGAGTGAGCCTGGGACTTGTAAAGATAG
GGAGATCATGCGGCATGACCCTCATAAGTTGTTGGAAGGGTGTTTGATTGCTGGTGTTGGGATGAGAGCT
AGTGCGGCGTATATTTACATCAGGGGTGAGTATGTGAATGAGCGTTTGAATCTAGAAAAGGCTAGAAGGG
AGGCATATGCAGCTGGTCTGTTGGGGAAGAATGCGTGTGGTTCTGGTTATGATTTCGATGTGTATATCCA
CTTTGGTGCTGGTGCTTATATTTGTGGTGAAGAGACTGCGCTTCTTGAGAGTCTCCAAGGGAAGCAAGGG
AAGCCTAGGTTGAAGCCTCCATTCCCTGCTAATGCTGGTTTATATGGTTGTCCCACTACTGTCACCAATG
TGGAAACTGTTGCTGTGTCTCCTACTATTCTAAGGCGTGGACCTGAGTGGTTTTCGAGTTTCGGTAGGAA
GAATAACGCTGGGACAAAGCTGTTTTGTATCTCAGGGCATGTGAACAAGCCATGTACCGTTGAAGAGGAG
ATGAGTATACCTCTCAAGGAACTGATTGAGAGGCATTGTGGAGGCGTTAGAGGTGGATGGGACAACCTAC
TTGCTATCATTCCTGGAGGTTCCTCTGTCCCTTTGATTCCTAAGAATATATGCGAGGATGTGCTTATGGA
TTTCGATGCGCTCAAAGCTGTCCAATCAGGGCTAGGAACTGCAGCTGTCATTGTGATGGATAAATCAACC
GATGTTGTGGATGCAATCGCGAGGCTCTCTTACTTCTACAAGCATGAAAGCTGTGGGCAGTGTACTCCAT
GCAGGGAGGGGACAGGTTGGCTTTGGATGATCATGGAGAGGATGAAGGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGA
GATTGATATGCTTCAGGAGGTAACAAAACAGATCGAAGGACACACAATCTGTGCCTTGGGAGATGCAGCT
GCATGGCCCGTGCAAGGTCTGATAAGGCACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGAACGCGCTG
AAAGGGAGTTGTTACAGGCTGCTGCTTAAAAATCCTTGCTAATCACAGGGAATTTGCTATTATTCTCCAT
GGAAATAAAATCTGAAGCATACTATTAGAGTTTTTGGGTTGCAAAGCTACTTCAGAAGGAGAAGAAGGTA
ATGTGTTTGTGTTAAATGGTTCATGTTAAAACTTTATTCAAATTGTATCATAAAGAGCTTTATTTACTCT
TTTGATTACTATACTTTCTTCAGTATTTGCTTGTTTTCTTATGACTATTGAGAGCACATTTTGGGAACAA
CCAAACAAAACCTTTTCATGTTTGAAATAAAGGATGCTCCTTATTTTGGTTTAAATAGTTTAAATTCCAA
AA