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Detail for ZS11_C04G20630.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C04G20630.t1
ZS11_v0: BnaC04T0187300ZS
WE: WE_C04G22300.t1
WE_v0: BnaC04T0182000WE
Darmor: C04p21690.1_BnaDAR
BH: BnaC04T190100BH
Quinta: BnaC04T0178100QU
ZS2: BnaC04T182300ZS2
SW: BnaC04T187600SW
Express61: C04p015070.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA05G0139700XY
P202: BnaA05G012810P202.1
BL: BnaC04T190100BH
TA: BnaA05T149100TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g27480D
RB: BnaC04T185700RB
No2127: BnaA05T0076600NO
P130: BnaC04G020280P130.1
Length: 249
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 7.760000e-144
KOG Score: 404.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: CDY40185.1
NR E-value: 2.000000e-130
NR Score: 470.3
NR Annotation: CDY40185.1 BnaC04g14130D [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q42182|TRNH7_ARATH
SwissProt E-value: 3.290000e-143
SwissProt Score: 404.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At2g29300 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g29300 PE=2 SV=2
CDS Sequence (760 bp)
ATGGAAAAAAGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTAGTAACCGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATG
CAATAGTAGAGGAGTTAGCTGGTTTTGGAGCTAAAATCCATGTTTGCGACATATCCGAGACTTTGCTCAA
TCACAGTTTAAGCGAATGGGTAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGA
CCCGAGAGAGAAAATTTGATGCAAAAGGTCTCCACCCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTTAATATGA
TGCACAACGATATTGATTTCCATATCGCAACAAACTTGGAACCTGCTTTCCATTTTTGCCAACTTTCACA
TCCTCTCCTAAAGGCTTCAGGTTATGGAAGTATTATCTTCATTTCCTCTGTCGCCGGGGTTGTATCAATT
GAATGTGGATCTATTTGTAGTCTAGCAAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAAATTGGCATGTGAAT
GGGCAAAAGATGGCATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTATGTCTCAACCTTA
TCTAGATGACGTCAGATTCAAGAAGGGATTGTTTGGTAGAACTCCATTTGGTCGCACTGGTGAGCCAAAT
GAAGTTGCATCACTAGCCGTCTTCTTGTGTCTACCTGCAGCTTCCTACATTACAGGTCAAACCATTTGTG
TTGATGGAGGCCTCACGATTAACGGTTTCTCCGATCAACCGCATGCTTAA
Upstream Sequence
ATGGAAAAAAGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTAGTAACCGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATG
CAATAGTAGAGGAGTTAGCTGGTTTTGGAGCTAAAATCCATGTTTGCGACATATCCGAGACTTTGCTCAA
TCACAGTTTAAGCGAATGGGTAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGA
CCCGAGAGAGAAAATTTGATGCAAAAGGTCTCCACCCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTTAATATGA
TGCACAACGATATTGATTTCCATATCGCAACAAACTTGGAACCTGCTTTCCATTTTTGCCAACTTTCACA
TCCTCTCCTAAAGGCTTCAGGTTATGGAAGTATTATCTTCATTTCCTCTGTCGCCGGGGTTGTATCAATT
GAATGTGGATCTATTTGTAGTCTAGCAAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAAATTGGCATGTGAAT
GGGCAAAAGATGGCATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTATGTCTCAACCTTA
TCTAGATGACGTCAGATTCAAGAAGGGATTGTTTGGTAGAACTCCATTTGGTCGCACTGGTGAGCCAAAT
GAAGTTGCATCACTAGCCGTCTTCTTGTGTCTACCTGCAGCTTCCTACATTACAGGTCAAACCATTTGTG
TTGATGGAGGCCTCACGATTAACGGTTTCTCCGATCAACCGCATGCTTAA
Downstream Sequence
GGTTTGTCTTTCTATTGTCTATATCGTCTTGAATGGTCAAGATTTTAAATTATATTATGT
GTGTTGAATGTTTAGGTATGCAATAGTAGAGGAGTTAGCTGGTTTTGGAGCTAAAATCCA
TGTTTGCGACATATCCGAGACTTTGCTCAATCACAGTTTAAGCGAATGGGTAAAGAAAGG
GTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGACCCGAGAGAGAAAATTTGAT
GCAAAAGGTCTCCACCCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTTGTAAGTAACTGACCTTT
GATATAGAAACAACTAAGCATTTACATTCAAAGAAAACTTTGTTTATGTTTATCATAGGT
GAACAATGTGGGTGGAGTTCGTTCAAAGCCAATGACAGAATATGATGCACAACGATATTG
ATTTCCATATCGCAACAAACTTGGAACCTGCTTTCCATTTTTGCCAACTTTCACATCCTC
TCCTAAAGGCTTCAGGTTATGGAAGTATTATCTTCATTTCCTCTGTCGCCGGGGTTGTAT
CAATTGAATGTGGATCTATTTGTAGTCTAGCAAAAGGTAACCAAAGTACTATTAGAGCAA
GATTAAGTAGTCAACAAGGAGTGTTTGTGTTTTTTTTGTTGATTCCACATACAAGTCTTT
TACAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAAATTGGCATGTGAATGGGCAAAAGATGGCAT
AAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTATGTCTCAACCTGTAATCAA
CAAGACAACTTTTACACCTTTTAAGAAAAAATTTTAAACAATCTCATTTCCTCTAATCAT
CTCTCATATTTTGGTTCTTAAAGTATCTAGATGACGTCAGATTCAAGAAGGGATTGTTTG
GTAGAACTCCATTTGGTCGCACTGGTGAGCCAAATGAAGTTGCATCACTAGCCGTCTTCT
TGTGTCTACCTGCAGCTTCCTACATTACAGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCA
CGATTAACGGTTTCTCCGATCAACCGCATGCTTAAGAAATAGCCTTGTTTTGTTTTTCTT
TTTTCTTCTGCAACTGTCTTTAATCTCTTACAGTATTATCTATAATAAAAATTCTCACGC
TGTGAATGTTGCGCAAAAATATGAACGACTACACATTGCCATTTGTATGAATAGAAGATT
CAGTCACACAGGAGAACCTTAGCGAGCACCAACAACTTGAAGCAAAGCAATCTTTCTCAA
GAGAGACTCTCATGCATCATAAAGTTTCTCCTCTATACTCTGTTTTGTTCTAACAAAGAA
AACGCGAATCAAACTCGAAGAAAACAAGGAAACTGAGAGAGAGACTCAATCAACATGTCT
TAACTGAGCATAACAATGGTAACACTCATACATGTTCACTTCAAAACTCGTATCAACATG
TCTTTATGCTAATGTAGTTGGTTATTTGATATATGTTAAGAGTCTACACCATGTCAGATT
CAGTATAAGCGGTTAGTCACGTAATTAATTTACTTTGAAGGGTACAAAGAATAGGCTTAT
GTTTAGAGGCCAACAGTGTAATAACCCTCGCGAACAGATAGAATTTTGGTCGAGAAAAAT
TCCACTCGATCAGTTTGGAGTTGGTTCGACCAGAATTAAAAATAGAAGTCGACCCGGTGA
ATTAATGTCTCGACAAGACTATCTTGTGGCCGAAAGACCTTTCCTTTATAGTTCTGGCTG
AGTGTTAATTTTTTTATGGTTTATTTTTATTTTAGTTGGACGAGTTTATACAAAACCAGG
ACGAAAACCAATGGACGGGAAAAATTTTGTCGAGAACTGGCGGGAATAATTTCAGCTGCT
TGGTAATTTAAATCAGTCATGAGAGTTGCACCAGCTTGTGTGCTTGCTTGCTGGATCAGT
CATGTGACATGCACCTTCTTGCCTGCATGCTTTTTTTAATAATCAGTCATATGCAGGCAC
ACCTGCTTGGAGCTTGCTTC
Pro Sequence
MEKRWSLQGMTALVTGGGRGIGYAIVEELAGFGAKIHVCDISETLLNHSL
SEWVKKGFQVSGSVCDVTSRPERENLMQKVSTLFNGKLNIFNMMHNDIDF
HIATNLEPAFHFCQLSHPLLKASGYGSIIFISSVAGVVSIECGSICSLAK
GALNQLAKKLACEWAKDGIRANAVAPNVIKTPMSQPYLDDVRFKKGLFGR
TPFGRTGEPNEVASLAVFLCLPAASYITGQTICVDGGLTINGFSDQPHA
mRNA Sequence
ATGGAAAAAAGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTAGTAACCGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATG
CAATAGTAGAGGAGTTAGCTGGTTTTGGAGCTAAAATCCATGTTTGCGACATATCCGAGACTTTGCTCAA
TCACAGTTTAAGCGAATGGGTAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGA
CCCGAGAGAGAAAATTTGATGCAAAAGGTCTCCACCCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTTAATATGA
TGCACAACGATATTGATTTCCATATCGCAACAAACTTGGAACCTGCTTTCCATTTTTGCCAACTTTCACA
TCCTCTCCTAAAGGCTTCAGGTTATGGAAGTATTATCTTCATTTCCTCTGTCGCCGGGGTTGTATCAATT
GAATGTGGATCTATTTGTAGTCTAGCAAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAAATTGGCATGTGAAT
GGGCAAAAGATGGCATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTATGTCTCAACCTTA
TCTAGATGACGTCAGATTCAAGAAGGGATTGTTTGGTAGAACTCCATTTGGTCGCACTGGTGAGCCAAAT
GAAGTTGCATCACTAGCCGTCTTCTTGTGTCTACCTGCAGCTTCCTACATTACAGGTCAAACCATTTGTG
TTGATGGAGGCCTCACGATTAACGGTTTCTCCGATCAACCGCATGCTTAA