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Detail for ZS11_C04G20750.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C04G20750.t1
ZS11_v0: BnaC04T0188200ZS
WE: WE_C04G22410.t1
WE_v0: BnaC04T0183000WE
Darmor: C04p21820.1_BnaDAR
BH: BnaC04T190900BH
Quinta: BnaC04T0179400QU
ZS2: BnaC04T183100ZS2
SW: BnaC04T188500SW
Express61: C04p017650.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC04G0184800XY
P202: BnaC04G013860P202.1
BL: BnaC04T190900BH
TA: BnaC04T187200TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g31580D
RB: BnaC04T186600RB
No2127: BnaC04T0179900NO
P130: BnaC04G020350P130.1
Length: 578
KOG ID: KOG1263
KOG E-value: Not available
KOG Score: 1070.0
KOG Annotation: Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism
Biological Process: GO:0046274(lignin catabolic process)
Cellular Component: GO:0048046(apoplast)
Molecular Function: GO:0005507(copper ion binding),GO:0016491(oxidoreductase activity),GO:0052716(hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K05909 E1.10.3.2; laccase [EC:1.10.3.2]
NR Protein: XP_013635167.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1207.6
NR Annotation: XP_013635167.1 PREDICTED: laccase-2 [Brassica oleracea var. oleracea]
SwissProt Protein: O81081|LAC2_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 1070.0
SwissProt Annotation: Laccase-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LAC2 PE=2 SV=1
CDS Sequence (1761 bp)
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CATCTGCAGGAATCGCTCGACACTACACCTTCCATATTCAACTTAAAAACATCACACGATTATGCAAGAC
AAAAACAATTGTGGCAGTCAACGGAAAATTTCCAGGACCGAAGGTTACTGCAAGAGAAGGAGATAATCTT
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AGTTTGGCAAATTCTAGATTCCCGGCAAACGTTCCAAAAATCGTGGATAAGAAGTTTTTCTTTACGGTCG
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AGCTATCAACAATGTGTCTTTCATCTTACCAAACACTACTTCTTTATTACAATCATACTTCTCTGGCATG
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CAAACAACACAATGGTCTCAAGAGGGACCAAAGTCGTGGTCTTGAAGTACAACACGACTGTCGAATTGGT
CTTGCAGGGCACTAGCATCTTGGGTATCGAGACACACCCTATTCATCTTCATGGCTACAACTTTTATGTG
GTAGGTCAAGGCTTTGGTAATTTTGACCCGACCCGTGACCCAAAACAGTATAACCTAGCTGACCCGGTTG
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GTGGTTCATGCATTGCCACATTGAGATTCATTTGAGTTGGGGTTTGACCATGGCTTGGGTGGTTCTGGAT
GGAGACCTTCCAAATCAGAAGCTACCTCCTCCTCCCTCGGATTTCCCTAAATGTTGA
Upstream Sequence
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AAAACGATATAACAAGAAAATCATACTTCTTACATAAATGTTCTGAAATTTAAAAACAGATTTTCCTTCA
ATATTCAGATAAATAGTATACATGGCTATGTGGGTTTTGCATTATCTTCTTGTGACATTTCTGATCACCA
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ATGGGATCCGGCAGCTAAGGAGCGGATGGGCGGATGGACCGTCGTATGTGACACAATGTCCAATTCAGAC
GGGACAAAGTTATGTTTACAACTTCACGATTATTGGACAAAGAGGAACCTTGTGGTGGCATGCACACATT
CAATGGATGAGAGCCACCGTGTACGGACCATTGATCATTCTCCCTAAACTCCACCAACCTTATCCTTTTC
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ACAAGCTCTTCAGACCGGTGCAGGTCCAAATGCGTCAGATGCTCATACTTTTAATGGGTTACCAGGCCCA
TTATATAATTGCTCCACAAAAGAAACATACAAGTTGGTTGTGAAACCTGGAAAGACATATCTACTACAAC
TGATCAATGCTGCACTCGATGATGAACTCTTCTTTATCATAGCCAATCACACATTGACAGTGGTTGAAGC
TGACGCAAGCTACGTTAAACCATTCCAAACAAACATTGTTCTTCTCGGTCCGGGACAAACCACCAACGTT
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AAGGAACAATCGATAATACAACCGTCGCAGGGATTCTCAAATACCATCACAAACCTACTTCAAACCATTT
TAACTCTTCTAAAAACCTTCCTGTTATTAAACCTTCTCTACCTCCTATCAACAGTACGAGCTATGCAGCG
AACTTTACAAAAATGTTTAGAAGTTTGGCAAATTCTAGATTCCCGGCAAACGTTCCAAAAATCGTGGATA
AGAAGTTTTTCTTTACGGTCGGTTTAGGAACCAACCCTTGTCCTAAAAACCAGACCTGCCAAGGACCAAC
TAATACCACAAAATTTGCAGCAGCTATCAACAATGTGTCTTTCATCTTACCAAACACTACTTCTTTATTA
CAATCATACTTCTCTGGCATGTCTAAGAAAGTTTTCACAACCAATTTCCCAAGTACCCCTGTTTTCCCAT
TTAATTACACCGGCGTGCCACCAAACAACACAATGGTCTCAAGAGGGACCAAAGTCGTGGTCTTGAAGTA
CAACACGACTGTCGAATTGGTCTTGCAGGGCACTAGCATCTTGGGTATCGAGACACACCCTATTCATCTT
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ATAACCTAGCTGACCCGGTTGAACGAAACACTATTAATGTCCCCTCTGGTGGTTGGGTTGCTATCCGCTT
CCTCGCTGATAACCCTGGTGTGTGGTTCATGCATTGCCACATTGAGATTCATTTGAGTTGGGGTTTGACC
ATGGCTTGGGTGGTTCTGGATGGAGACCTTCCAAATCAGAAGCTACCTCCTCCTCCCTCGGATTTCCCTA
AATGTTGACTCTGACCAATCCGACGCCTAGACCGTTGCCACATCACTTTTCCCCTTCTCGATATATTTCT
TTAAATTGTGCAATATGTTTTCGTTTTCCTTTTGTTTTTGTGTGTTTTTGATTCAACACCTGAGAGTTCT
GAGTTTTTATTTTATTATCTTTCTCCTTTCATATTGTAAAAAGAAGAGTGAACTGAAGAGCCTTGTTCGC
GGTAATAATATCTTTGTACATAATTTTGACGCAAAAAAAATAATTATTATAACCAACGGAAAACTCA
Downstream Sequence
GTAATTATAAATTAGTCTCAGTTTGAGTCAATATATATTAGTTAACGACTTAATTTTTTT
TTTTTTTTTTATATGATATGTTTTAGTCACTTAGTCCAATTCCCCTCTGGCAGATTCAAC
TTAAAAACATCACACGATTATGCAAGACAAAAACAATTGTGGCAGTCAACGGAAAATTTC
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TATCCAATAACATTTCCATACACTGGTAAATTATTAGTTGCTTATAGTCTTACAATGATA
ATAAAATTTTCAGCTCTTGTTTAATTTTCTTTAAGCCTCAATAAATAAATGAATGTATAA
AATTTAGGCATGGGATCCGGCAGCTAAGGAGCGGATGGGCGGATGGACCGTCGTATGTGA
CACAATGTCCAATTCAGACGGGACAAAGTTATGTTTACAACTTCACGATTATTGGACAAA
GAGGAACCTTGTGGTGGCATGCACACATTCAATGGATGAGAGCCACCGTGTACGGACCAT
TGATCATTCTCCCTAAACTCCACCAACCTTATCCTTTTCCCAAACCCTACAAACAAGTCC
CTATAATCTTTGGTAATTTATCTTCTGAACGCATAAATTTTATATATGTCCCACATGGTT
AGCGATCTGTTTAAAGGATTGATGTATTTAATTTGTGTATAGGTGAGTGGTTTAATGCTG
ATCCTCAAGCAGTGGTACAACAAGCTCTTCAGACCGGTGCAGGTCCAAATGCGTCAGATG
CTCATACTTTTAATGGGTTACCAGGCCCATTATATAATTGCTCCACAAAAGGTAATTATC
GTATTTCTTGTTCTTGTCTAAAATTAAAAACTGATTTAGTTTTGCAACGATTAAATATAT
CTACTTTTTCAGAAACATACAAGTTGGTTGTGAAACCTGGAAAGACATATCTACTACAAC
TGATCAATGCTGCACTCGATGATGAACTCTTCTTTATCATAGCCAATCACACATTGACAG
TGGTTGAAGCTGACGCAAGCTACGTTAAACCATTCCAAACAAACATTGTTCTTCTCGGTC
CGGGACAAACCACCAACGTTCTACTCAAAACCAAACCTATTTACCCGAATGCAACCTTCT
ACATGCTAGCAAGACCTTACTTCACGGGCCAAGGAACAATCGATAATACAACCGTCGCAG
GGATTCTCAAATACCATCACAAACCTACTTCAAACCATTTTAACTCTTCTAAAAACCTTC
CTGTTATTAAACCTTCTCTACCTCCTATCAACAGTACGAGCTATGCAGCGAACTTTACAA
AAATGTTTAGAAGTTTGGCAAATTCTAGATTCCCGGCAAACGTTCCAAAAATCGTGGATA
AGAAGTTTTTCTTTACGGTCGGTTTAGGAACCAACCCTTGTCCTAAAAACCAGACCTGCC
AAGGACCAACTAATACCACAAAATTTGCAGCAGCTATCAACAATGTGTCTTTCATCTTAC
CAAACACTACTTCTTTATTACAATCATACTTCTCTGGCATGTCTAAGAAAGTTTTCACAA
CCAATTTCCCAAGTACCCCTGTTTTCCCATTTAATTACACCGGCGTGCCACCAAACAACA
CAATGGTCTCAAGAGGGACCAAAGTCGTGGTCTTGAAGTACAACACGACTGTCGAATTGG
TCTTGCAGGGCACTAGCATCTTGGGTATCGAGACACACCCTATTCATCTTCATGGCTACA
ACTTTTATGTGGTAGGTCAAGGCTTTGGTAATTTTGACCCGACCCGTGACCCAAAACAGT
ATAACCTAGCTGACCCGGTTGAACGAAACACTATTAATGTCCCCTCTGGTGGTTGGGTTG
CTATCCGCTTCCTCGCTGATAACCCTGGTAATGATTTAAGTTTTTTTTTTTTTTAATGCG
TGTCACAAGTTACAACATATATTATGCGGTTTTGAATATGACTGATGATAATTTTAATGT
TTAATAAAACAGTAATTTCT
Pro Sequence
MAMWVLHYLLVTFLITITYGIDAASAGIARHYTFHIQLKNITRLCKTKTI
VAVNGKFPGPKVTAREGDNLQIKVVNHVSNNISIHWHGIRQLRSGWADGP
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HQPYPFPKPYKQVPIIFGEWFNADPQAVVQQALQTGAGPNASDAHTFNGL
PGPLYNCSTKETYKLVVKPGKTYLLQLINAALDDELFFIIANHTLTVVEA
DASYVKPFQTNIVLLGPGQTTNVLLKTKPIYPNATFYMLARPYFTGQGTI
DNTTVAGILKYHHKPTSNHFNSSKNLPVIKPSLPPINSTSYAANFTKMFR
SLANSRFPANVPKIVDKKFFFTVGLGTNPCPKNQTCQGPTNTTKFAAAIN
NVSFILPNTTSLLQSYFSGMSKKVFTTNFPSTPVFPFNYTGVPPNNTMVS
RGTKVVVLKYNTTVELVLQGTSILGIETHPIHLHGYNFYVVGQGFGNFDP
TRDPKQYNLADPVERNTINVPSGGWVAIRFLADNPGVWFMHCHIEIHLSW
GLTMAWVVLDGDLPNQKLPPPPSDFPKC
mRNA Sequence
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AAAACGATATAACAAGAAAATCATACTTCTTACATAAATGTTCTGAAATTTAAAAACAGATTTTCCTTCA
ATATTCAGATAAATAGTATACATGGCTATGTGGGTTTTGCATTATCTTCTTGTGACATTTCTGATCACCA
TAACTTACGGCATCGACGCAGCATCTGCAGGAATCGCTCGACACTACACCTTCCATATTCAACTTAAAAA
CATCACACGATTATGCAAGACAAAAACAATTGTGGCAGTCAACGGAAAATTTCCAGGACCGAAGGTTACT
GCAAGAGAAGGAGATAATCTTCAGATCAAAGTTGTTAATCATGTATCCAATAACATTTCCATACACTGGC
ATGGGATCCGGCAGCTAAGGAGCGGATGGGCGGATGGACCGTCGTATGTGACACAATGTCCAATTCAGAC
GGGACAAAGTTATGTTTACAACTTCACGATTATTGGACAAAGAGGAACCTTGTGGTGGCATGCACACATT
CAATGGATGAGAGCCACCGTGTACGGACCATTGATCATTCTCCCTAAACTCCACCAACCTTATCCTTTTC
CCAAACCCTACAAACAAGTCCCTATAATCTTTGGTGAGTGGTTTAATGCTGATCCTCAAGCAGTGGTACA
ACAAGCTCTTCAGACCGGTGCAGGTCCAAATGCGTCAGATGCTCATACTTTTAATGGGTTACCAGGCCCA
TTATATAATTGCTCCACAAAAGAAACATACAAGTTGGTTGTGAAACCTGGAAAGACATATCTACTACAAC
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TGACGCAAGCTACGTTAAACCATTCCAAACAAACATTGTTCTTCTCGGTCCGGGACAAACCACCAACGTT
CTACTCAAAACCAAACCTATTTACCCGAATGCAACCTTCTACATGCTAGCAAGACCTTACTTCACGGGCC
AAGGAACAATCGATAATACAACCGTCGCAGGGATTCTCAAATACCATCACAAACCTACTTCAAACCATTT
TAACTCTTCTAAAAACCTTCCTGTTATTAAACCTTCTCTACCTCCTATCAACAGTACGAGCTATGCAGCG
AACTTTACAAAAATGTTTAGAAGTTTGGCAAATTCTAGATTCCCGGCAAACGTTCCAAAAATCGTGGATA
AGAAGTTTTTCTTTACGGTCGGTTTAGGAACCAACCCTTGTCCTAAAAACCAGACCTGCCAAGGACCAAC
TAATACCACAAAATTTGCAGCAGCTATCAACAATGTGTCTTTCATCTTACCAAACACTACTTCTTTATTA
CAATCATACTTCTCTGGCATGTCTAAGAAAGTTTTCACAACCAATTTCCCAAGTACCCCTGTTTTCCCAT
TTAATTACACCGGCGTGCCACCAAACAACACAATGGTCTCAAGAGGGACCAAAGTCGTGGTCTTGAAGTA
CAACACGACTGTCGAATTGGTCTTGCAGGGCACTAGCATCTTGGGTATCGAGACACACCCTATTCATCTT
CATGGCTACAACTTTTATGTGGTAGGTCAAGGCTTTGGTAATTTTGACCCGACCCGTGACCCAAAACAGT
ATAACCTAGCTGACCCGGTTGAACGAAACACTATTAATGTCCCCTCTGGTGGTTGGGTTGCTATCCGCTT
CCTCGCTGATAACCCTGGTGTGTGGTTCATGCATTGCCACATTGAGATTCATTTGAGTTGGGGTTTGACC
ATGGCTTGGGTGGTTCTGGATGGAGACCTTCCAAATCAGAAGCTACCTCCTCCTCCCTCGGATTTCCCTA
AATGTTGACTCTGACCAATCCGACGCCTAGACCGTTGCCACATCACTTTTCCCCTTCTCGATATATTTCT
TTAAATTGTGCAATATGTTTTCGTTTTCCTTTTGTTTTTGTGTGTTTTTGATTCAACACCTGAGAGTTCT
GAGTTTTTATTTTATTATCTTTCTCCTTTCATATTGTAAAAAGAAGAGTGAACTGAAGAGCCTTGTTCGC
GGTAATAATATCTTTGTACATAATTTTGACGCAAAAAAAATAATTATTATAACCAACGGAAAACTCA