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Detail for ZS11_C04G21550.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C04G21550.t1
ZS11_v0: BnaC09T0319300ZS
WE: WE_C09G42610.t1
WE_v0: Bnascaffold2759T0000200WE
Darmor: C09p24620.1_BnaDAR
BH: BnaC09T196100BH
Quinta: BnaA05T0210600QU
ZS2: Bnascaffold0223T000600ZS2
SW: BnaC02T044700SW
Express61: Not available
Xiaoyun: BnaC01G0350500XY
P202: BnaC09G073710P202.1
BL: BnaC09T196100BH
TA: BnaC06T337000TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaC02T274900RB
No2127: BnaC04T0212300NO
P130: BnaC09G040780P130.1
Length: 304
KOG ID: KOG4845
KOG E-value: 2.220000e-180
KOG Score: 508.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: GO:0042773(ATP synthesis coupled electron transport)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0008137(NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity)
KEGG Ortholog: -
NR Protein: VDD24748.1
NR E-value: 4.100000e-146
NR Score: 522.7
NR Annotation: VDD24748.1 unnamed protein product, partial [Brassica rapa]
SwissProt Protein: A4QJQ0|NU4C_AETGR
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 520.0
SwissProt Annotation: NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic OS=Aethionema grandiflorum OX=72657 GN=ndhD PE=3 SV=2
CDS Sequence (928 bp)
ATGTTAGCAATGTACAGCAGCCAAATAGGATCATTTTCTTCTCGGGATATTTTACTTTTTTTCATCATGT
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Upstream Sequence
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Downstream Sequence
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TCATGCGTGAGGGTACTCCTAATGGGTTGAAGACCATATCCACGGGTCTCCCGTCTTGCA
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CGGCTACTTTATCACCTACTTTGATTTCACGTTTCTGTGAAAAATATACACGAATTATTT
CGGGGTTATAACTTGAAACCCCCTTTTTCTGAACCCATCTCACATCAATAACTCGACCTC
TACCACCTATAGGCAATTTTAAACAAGTATCTTTTGAAGTCGATACCTGAATGCCAAGTA
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TATCACCATATACtagacagtcactaatgagtaccgtacatcttcaaaattgtatccttc
ccatggcatataagccactaatatatttttcccaaggcgagttccccaccaactgtagca
gcaccatccgctaaaatttg
Pro Sequence
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PTLNLELLGNQAYPVTLEILFYIGFLIGFAVKSLIIPLHTWLPDTHGEAQ
YSTCMLLAGILLKMGAYGLVRINMELLPHAHSMFSPWLMVVGTIQIIYAA
STSIGQRNLKKRIAYSSVSHMGFIIIGIGSITAPGLNGAILQIISHGFIG
AALFSLAGTSYDRIRLVYLDEMGGIAISIPKIFTMFTILSLASLHYGMSG
FVAELIIFFGIITSQKYFLISKILIIFVMAIGMILTPIYLLSMSHQMFYG
YKLN
mRNA Sequence
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GGGAATTAGAATTAATGCCCCGAAGTTCTATTTTTTTATTAATAGGAGTTTTAGGTATAAGTTTATATGG
TTCGAACGAACCAACATTAAATTTAGAACTATTAGGGAATCAAGCCTATCCGGTCACACTCGAAATACTA
TTTTATATTGGATTTCTTATTGGTTTTGCCGTCAAATCACTGATTATACCTTTACATACTTGGTTACCTG
ACACCCACGGCGAGGCACAATACAGTACATGTATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAAATGGGAGCATA
TGGATTGGTTCGAATCAATATGGAATTATTACCTCACGCTCATTCTATGTTTTCTCCTTGGTTGATGGTA
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ATTGGAATGATATTAACTCCTATATATTTATTATCTATGTCACATCAAATGTTCTATGGATACAAGTTAA
ATTAA