BrassicaPanDB

CDS Sequence (228 bp)

ATGATACTCGAACATGTACTTGTTTTGAGTGCCTATTTATTTTTGATTGGTCTTTATGGATTGATCACGA
GTCGAATTATGGTTAGGGCTCTTATGGGATATTTTCTGCATTTTTTTATAGCAATTGCAGCCGCTGAAGC
AGCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAACAGAAAATCAACTCGCATCAACCAATCGACC
TTATTAAATAAGTAG

Upstream Sequence

ATGATACTCGAACATGTACTTGTTTTGAGTGCCTATTTATTTTTGATTGGTCTTTATGGATTGATCACGA
GTCGAATTATGGTTAGGGCTCTTATGGGATATTTTCTGCATTTTTTTATAGCAATTGCAGCCGCTGAAGC
AGCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAACAGAAAATCAACTCGCATCAACCAATCGACC
TTATTAAATAAGTAG

Downstream Sequence

TGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTAATATGAATTTTGCTGATTTTTTTGATAATTC
CCAACTAAAAGGGGATATTTTCTGCATTTTTTTATAGCAATTGCAGCCGCTGAAGCAGCT
ATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAACAGAAAATCAACTCGCATCAACCAA
TCGACCTTATTAAATAAGTAGCATAAATCCAAAAATTATAGGTTTAAATTTGCATATATG
ATAGGTTATGACTTACTAGATTAAATTTGTGAAAATCTAAGAAATCAAAGTATTTTAGCC
CCGTTTTTTACCAATTGAGCCAGACTTCATTCAAAAAATTCTATTAAAGGAAATCCTTGC
TTCATCTAGTAGTTTAATTTAATATATCATTTAGTTATAAGTGTACTAGATTGAAAATTT
ATGACATTCAAAAAACTATAGATCCTATGTCACATTCAGTAAAAATTTATGATACATGTA
TAGGATGTACTCAATGTGTCCGAGCATGTCCTACAGACGTATTAGAAATGATGCCTTGGG
ATGGATGCAAAGCTAAGCAAATAGCTTCTGCCCCCAGAACCAAGGATTGTGTTGGTTGTA
AAAGATGTGAATCTGCCTGTCCAACGGATTTTTTGAGCGTTCGAGTTTATTTATGGCATG
AAACAACTCGAAGCATGGGTCTAGCTTATTGATACGTTACCGAAAACCTGATTTGAATAA
Atttggaatacattttatttttttattgacaagtactgcactcaaaagttcaattatatt
ttttatttatatattttttgagtgcagcgttctttggacctggtgtatcttgtctttacc
acgaatgattttccttggttaacaataattgttgtttttccaatatatgcggttcattaa
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ttagaacttcttctaaggacttacgtttttgttataattttaaactggacgatccattaa
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GCGGCTTTTCCAGTTACTCGGGATTCCCGATTATTCTATTTCCTGATGTTAGCAATGTAC
AGCAGCCAAATAGGATCATTTTCTTCTCGGGATATTTTACTTTTTTTCATCATGTGGGAA
TTAGAATTAATGCCCCGTTATCTCCTTTAAGCCATGTGGGGTGGAAAGAAACGTTTGTAG
CTACAAAATTTATTTTATAAACTGCAGGAAGTTCTATTTTTTTATTAATAGGAGTTTTAG
GTATAAGTTTATATGGTTCGAACGAACCAACATTAAATTTAGAACTATTAGGGAATCAAG
CCTATCCGGTCACACTCGAAATACTATTTTATATTGGATTTCTTATTGGTTTTGCCGTCA
AATCACTGATTATACCTTTACATACTTGGTTACCTGACACCCACGGCGAGGCACAATACA
GTACATGTATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAAATGGGAGCATATGGATTGGTTCGAA
TCAATATGGAATTATTACCTCACGCTCATTCTATGTTTTCTCCTTGGTTGATGGTAGTCG
GTACAATCCAAATAATTTATGCAGCTTCAACATCTATCGGTCAACGTAATTTAAAAAAGA
GAATAGCCTATTCTTCTGTATCTCATATGGGTTTTATAATTATAGGTATTGGTTCTATAA
CGGCTCCTGGGCTTAATGGAGCTATTTTACAAATAATTTCTCATGGATTTATTGGCGCTG
CACTTTTTTCCTTGGCAGGAACTAGTTATGATAGAATCCGGCTTGTTTATCTTGATGAAA
TGGGTGGAATAGCTATCTCCATTCCAAAGATATTTACAATGTTCACTATCTTATCgctgg
cttccttgcattacggcaTG

Pro Sequence

MILEHVLVLSAYLFLIGLYGLITSRIMVRALMGYFLHFFIAIAAAEAAIG
LAIVSSIYRNRKSTRINQSTLLNK

mRNA Sequence

ATGATACTCGAACATGTACTTGTTTTGAGTGCCTATTTATTTTTGATTGGTCTTTATGGATTGATCACGA
GTCGAATTATGGTTAGGGCTCTTATGGGATATTTTCTGCATTTTTTTATAGCAATTGCAGCCGCTGAAGC
AGCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAACAGAAAATCAACTCGCATCAACCAATCGACC
TTATTAAATAAGTAG

Genome:
ZS11:	ZS11_C04G21570.t1
ZS11_v0:	Not available
WE:	WE_C04G23300.t1
WE_v0:	BnaC02T0431600WE
Darmor:	C02p52240.1_BnaDAR
BH:	Not available
Quinta:	Not available
ZS2:	Not available
SW:	Not available
Express61:	C09p041950.1_BnaEXP
Xiaoyun:	BnaC01G0351100XY
P202:	Not available
BL:	Not available
TA:	Not available
Da-Ae:	Not available
RB:	Not available
No2127:	BnaC02T0398500NO
P130:	Not available
Length:	74
KOG ID:	KOG4669
KOG E-value:	1.390000e-21
KOG Score:	81.6
KOG Annotation:	Energy production and conversion
Biological Process:	GO:0042773(ATP synthesis coupled electron transport)
Cellular Component:	-
Molecular Function:	GO:0016651(oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H)
KEGG Ortholog:	-
NR Protein:	YP_009540172.1
NR E-value:	6.100000e-19
NR Score:	98.2
NR Annotation:	YP_009540172.1 NADH dehydrogenase subunit 4L (chloroplast) [Lunaria rediviva]
SwissProt Protein:	A4QL73\|NU4LC_DRANE
SwissProt E-value:	3.120000e-22
SwissProt Score:	84.7
SwissProt Annotation:	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic OS=Draba nemorosa OX=171822 GN=ndhE PE=3 SV=1

DETAIL

Detail for ZS11_C04G21570.t1

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