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Detail for ZS11_C04G34640.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C04G34640.t1
ZS11_v0: BnaC04T0299500ZS
WE: WE_C04G35250.t1
WE_v0: BnaC04T0291100WE
Darmor: C04p35020.1_BnaDAR
BH: BnaC04T310500BH
Quinta: BnaC04T0275600QU
ZS2: BnaC04T290300ZS2
SW: BnaC04T305900SW
Express61: C04p024860.2_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC09G0231400XY
P202: BnaC04G024650P202.1
BL: BnaC04T310500BH
TA: BnaC04T293400TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g16770D
RB: BnaC04T300000RB
No2127: BnaC04T0287000NO
P130: BnaC04G038780P130.1
Length: 146
KOG ID: KOG3135
KOG E-value: 2.760000e-35
KOG Score: 122.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K03809 wrbA; NAD(P)H dehydrogenase (quinone) [EC:1.6.5.2]
NR Protein: CDY31000.1
NR E-value: 1.900000e-64
NR Score: 250.4
NR Annotation: CDY31000.1 BnaC04g24240D [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q6NQE2|FQRL1_ARATH
SwissProt E-value: 6.130000e-35
SwissProt Score: 123.0
SwissProt Annotation: Probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27270 PE=1 SV=1
CDS Sequence (447 bp)
ATGGTATCGACTAATGGTAATGGAACTACTCTCTTGAGAGCTGTCAAGCCATTCAAAACCGGATGGAAGG
TTGAAATCAAAGCACTGCACTCATGGACTCAACACTCATCGTATGGTGGTGGAGACACTCCTGAATTCAT
TCTCGCAGATGCAACGGGCGATAAGATACACTGCACATGTAAGCGAGTCTTCACTCCCCGTGCCAAGAAA
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CTCTTATCACCTCCAACGACCTTGCCGAAGCTGATGCGTTTGTCTTTGGCTTCCCAACAAGGTTCAGTAT
GATGGATGCTCAGTTCAAGGCATTCTTAGGTGCAACTGGTGGCCTCAGGAGGACTCAACAACTTGCTGGT
AAGCCAGCCAGAATATTATAG
Upstream Sequence
ATGGTATCGACTAATGGTAATGGAACTACTCTCTTGAGAGCTGTCAAGCCATTCAAAACCGGATGGAAGG
TTGAAATCAAAGCACTGCACTCATGGACTCAACACTCATCGTATGGTGGTGGAGACACTCCTGAATTCAT
TCTCGCAGATGCAACGGGCGATAAGATACACTGCACATGTAAGCGAGTCTTCACTCCCCGTGCCAAGAAA
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AAGCCAGCCAGAATATTATAG
Downstream Sequence
GGTAAGTGTTCAAAATATTTGCTAATTATTGTGTTCTTATAATTGATTAATACCACTCTT
TAACTATGTTTATATGCTTAACGTAGGGCGATAAGATACACTGCACATGTAAGCGAGTCT
TCACTCCCCGTGCCAAGAAACACATGCAGATTGGTCAGTGGTGTTTCATCGAGAATTTCG
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AAATTTTCGATTTTTCGATCTGGGTTTCTTTAGTTTGATTAATAATTTGAAGTTCTCAGT
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CTTAGGATTTTTAGTGATCTATTGCAGGATTCAGCAGAGGCAGAGGCAACAGCTTAGAGC
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TTTTTTCTTTTATATTTCTTAAATTTGTGGAGACAGCCCTAATGTCTCCTGATTTGGTTT
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GCTTCTGTTGATATGGTGTCGTTGCCAAACTATGGCTGGTCAGTCAGTACTCTTTTACTG
GCTTTTCTATGGAGCATATCTGACAATTCTAGGCTACAATGAGACACATAAACTGATAAT
GAAATCATTGAAACAGAATAGGAGTCGAAGTTAGAAATAAGTTCTTATGTCTGAATGAAA
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TAGGCTATGTGATAATCTTTTGAGTGATATAACACTTATCATCTCAGATTCATGTTTTCA
GCTACCTTAAATTTTACTTGCATCCTCTCAAAGAAACAAGAAGACACTCATACATAAGCA
TCGAGCTAAGAGTTTGTTCTTGACAGGTACCAGGGACGCTCCAAGAAGATCTGCTCTCCA
AAATGAGTGCACCGCCAAAGAGTGATGCTCCTCTTATCACCTCCAACGACCTTGCCGAAG
CTGATGCGTTTGTCTTTGGCTTCCCAACAAGGTTCAGTATGATGGATGCTCAGTTCAAGG
CATTCTTAGGTGCAACTGGTGGCCTCAGGAGGACTCAACAACTTGCTGGTAAGCCAGCCA
GAATATTATAGAGCACCAGGGTCTCAAGGTGTTGGTCAAGAAACCACCGCGTATGTTTCT
TTTCCAAACCAACACCTCACTAACTACACTTGTTTCGGTTCTTACGTTTTGTAGTGTTTA
CTTGTGTTATCATTGATTTCTAACACAATTTGGTTTTGTAATATTTTTTATCAGGAGCCA
AAAACTATATCTTTAGAACTAACTCTATTTTTATAAATCGTGATCTTATACCAGTTATTT
GTCTGGGCTTTGCTCAAAAA
Pro Sequence
MVSTNGNGTTLLRAVKPFKTGWKVEIKALHSWTQHSSYGGGDTPEFILAD
ATGDKIHCTCKRVFTPRAKKHMQIGTLQEDLLSKMSAPPKSDAPLITSND
LAEADAFVFGFPTRFSMMDAQFKAFLGATGGLRRTQQLAGKPARIL
mRNA Sequence
ATGGTATCGACTAATGGTAATGGAACTACTCTCTTGAGAGCTGTCAAGCCATTCAAAACCGGATGGAAGG
TTGAAATCAAAGCACTGCACTCATGGACTCAACACTCATCGTATGGTGGTGGAGACACTCCTGAATTCAT
TCTCGCAGATGCAACGGGCGATAAGATACACTGCACATGTAAGCGAGTCTTCACTCCCCGTGCCAAGAAA
CACATGCAGATTGGGACGCTCCAAGAAGATCTGCTCTCCAAAATGAGTGCACCGCCAAAGAGTGATGCTC
CTCTTATCACCTCCAACGACCTTGCCGAAGCTGATGCGTTTGTCTTTGGCTTCCCAACAAGGTTCAGTAT
GATGGATGCTCAGTTCAAGGCATTCTTAGGTGCAACTGGTGGCCTCAGGAGGACTCAACAACTTGCTGGT
AAGCCAGCCAGAATATTATAG