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Detail for ZS11_A02G23880.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A02G23880.t1
ZS11_v0: BnaA02T0212800ZS
WE: WE_C02G37550.t1
WE_v0: BnaC02T0274600WE
Darmor: A02p19540.1_BnaDAR
BH: BnaA02T242300BH
Quinta: BnaA02T0208500QU
ZS2: BnaA02T224400ZS2
SW: BnaC02T016200SW
Express61: C02p027450.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA02G0208300XY
P202: BnaA02G016040P202.2
BL: BnaA02T242300BH
TA: BnaA02T203500TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaA02T162400RB
No2127: BnaC02T0235600NO
P130: BnaC02G031470P130.1
Length: 564
KOG ID: KOG1223
KOG E-value: Not available
KOG Score: 907.0
KOG Annotation: Amino acid transport and metabolism
Biological Process: GO:0009058(biosynthetic process)
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0008909(isochorismate synthase activity)
KEGG Ortholog: K02552 menF; menaquinone-specific isochorismate synthase [EC:5.4.4.2]
NR Protein: VDC88779.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1105.5
NR Annotation: VDC88779.1 unnamed protein product [Brassica rapa]
SwissProt Protein: Q9S7H8|ICS1_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 992.0
SwissProt Annotation: Isochorismate synthase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ICS1 PE=1 SV=2
CDS Sequence (1719 bp)
ATGGCCTCACTTCAACTCTCCTCTCATTTTCTTGGCACAAACACTAAGAAACACAGCTCCATGTCCATCT
CTCGTACTTACTCTCCTGTCCCATGCACCAGATTATTCTCCCGCAAGTTTATGTCGTGTTCCATGTCTAT
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AGAGTGGAATGAGCTTGATCTAAAGATATCTCAGTTTACCAAGTCAATTGAATATAAGTCAACAAGTCTA
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Upstream Sequence
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TCTTGGCACAAACACTAAGAAACACAGCTCCATGTCCATCTCTCGTACTTACTCTCCTGTCCCATGCACC
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TGCAGTGCCTCAGGTTGAGTTTAATGAGTTTGGGGGAAGCTCAATGTTGGCTGCAACTCTTGCTTGGGAC
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AGAGTGAAGGGCATGATGCGTATCAGTTCTGTCTTCAGCCACCAGGTGCACCAGCTTTTATCGGAAACAC
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TGGTCAAGAGAGTGAATTTGCAGTTGGGATCAGATCAGCTCTGGTTGAAAAGGGTCTTGGAGCATTGATC
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TATCACTACCAAAGACCTTGTATTAATGGATACGAATACAATCTCTTTTCTTTTC
Downstream Sequence
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GGTTTTAAATGATATCGTTCTCTAGTTCGTTTCCTTGGTATCGTTTATGCCTTTGACCAA
AAAAAAAAAAAAAAAGGTATCGTTTATGCCTAACATTAAAGTTTATACTTTTATAATAGA
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GATAAAAAAAAACTACCGTTTTTTAGTTCACAAAAAAAAAACAGTATACCATAATTTTTT
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GCTAATAACCAACAAGAAAGAACATATGACTATTATAATATGATTACTACCAGTTTACTC
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ATGGACGTCAAAATGGAATAATCTTTCTCCTAGTCAAAATAACGTTGACCAAATCAGCTT
TGACCTAAAAAGTCCAATTAACAAACAAAAAACATTCGAGAAAATATAAAAGAAAAAGAG
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ATGTCCAGAGATTTTAAGCAAGAAAAAAAAAACAATGATTGAGCTTGTGGACCAAAAAAC
AAACAAAATAAAGAATAATAAATGTCTGGAAAAGCGGGTCAATCATCATCACTCACTCAT
TAACAGACCCAACCGTTTTGTTCCCGCGCAATACTAATTTCGGTTTGATTCGGTTTAGGT
ACCAATCAACCAGCAAATCGGAGCAATCGATTGGCTCCAAGCGCAAAACGAGACTCATCC
TCGCTGCTTCTTCTCTCGCCGTAGCGACGTTGGTCGTCCTGATCTTCTTCTCGACTTAGC
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TATCGGTTCAGCAGTGTTCTTTCGTGACCTTGACCCGTTCTCTCATGATGACTGGAGATC
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TATCTGATTGTTGAATGGTTGAAACATTTGTGAAGGTTTTTGTCGTCTACGTCACCTTTG
ATTCGTGCCTATGGTGGCATGAGGTTTGATCCTAACGGCAAGATCTCTGTGGAGTGGAAA
CCCTTTGGTGCATTTTACTTTGCAGTGCCTCAGGTACCTTCAAATTTTGATCTGTTTTAA
GAGAGTGTATGGAGTGGGCATGGCATTTTGGAAATCAGTTCGGTTTGGATAGGGTATTAG
TTAGTTCGAATATGGGGCTAGAGGATCCATATATGAACCAACAAATTTTTGGTTCAAATC
GGTTTGGGTAATGTTGTGCTTGGTTGGTTTTGATAGTAAAATTAGAAACTGGTTCAGTTA
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ATTCGGATAAAAACATCGGACAATTCAGATTTTCTCGGATACTTCAAAAAAAGTCTTAAA
CTTTCAGATAATTTCGAGTAGCTTAATTGTTTTTTGATAATTTGAGTTTTTCAAATACTT
TTAGATATTTTTAATAGATTTTTaaattataatatatatatggttatgttatatgtatat
aattaatatTTTATATATTC
Pro Sequence
MASLQLSSHFLGTNTKKHSSMSISRTYSPVPCTRLFSRKFMSCSMSMNGC
EGDFKTPLGTVETRTMAAVLSPTSATESLISAVSELKSQPPPFSSGVVRL
EVPINQQIGAIDWLQAQNETHPRCFFSRRSDVGRPDLLLDLASEKDNNNG
GSSGRDLVSVAGIGSAVFFRDLDPFSHDDWRSIRRFLSSTSPLIRAYGGM
RFDPNGKISVEWKPFGAFYFAVPQVEFNEFGGSSMLAATLAWDDELSWTL
ENAVESLQETMLQVSSIVMKLRKESLGVSVLSKNHVPTKGAYYPAVEKAL
EMINQKSSSLNKVVLARNSRVITDTDIDPIAWLAQLQSEGHDAYQFCLQP
PGAPAFIGNTPERLFQRKQLGVCSEALAATRPRGASAARDKEIEDDLRTS
LKDDLEFSIVRDNIQEKFNSICDNVVVKPQKSVRKLARVQHLYSQLAGRL
RREDDEFDILAALHPTPAVCGLPAEEARLLIKEIESFDRGMYAGPIGFFG
GQESEFAVGIRSALVEKGLGALIYAGTGIVAGSNPTSEWNELDLKISQFT
KSIEYKSTSLQRVP
mRNA Sequence
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TTTTTAAGTTCACTCACCATCTCTCTTTCTTTCGTTCTCCAATGGCCTCACTTCAACTCTCCTCTCATTT
TCTTGGCACAAACACTAAGAAACACAGCTCCATGTCCATCTCTCGTACTTACTCTCCTGTCCCATGCACC
AGATTATTCTCCCGCAAGTTTATGTCGTGTTCCATGTCTATGAATGGATGCGAAGGTGATTTCAAGACGC
CACTTGGTACAGTTGAGACGAGGACTATGGCGGCAGTTTTATCTCCAACATCCGCCACTGAGAGTCTAAT
CTCCGCCGTCTCTGAGCTTAAGTCTCAACCTCCGCCGTTTTCCTCCGGCGTCGTCCGCTTAGAGGTACCA
ATCAACCAGCAAATCGGAGCAATCGATTGGCTCCAAGCGCAAAACGAGACTCATCCTCGCTGCTTCTTCT
CTCGCCGTAGCGACGTTGGTCGTCCTGATCTTCTTCTCGACTTAGCGAGCGAGAAGGATAACAATAACGG
AGGCTCATCAGGTCGTGATCTGGTCAGCGTTGCTGGTATCGGTTCAGCAGTGTTCTTTCGTGACCTTGAC
CCGTTCTCTCATGATGACTGGAGATCCATCAGAAGGTTTTTGTCGTCTACGTCACCTTTGATTCGTGCCT
ATGGTGGCATGAGGTTTGATCCTAACGGCAAGATCTCTGTGGAGTGGAAACCCTTTGGTGCATTTTACTT
TGCAGTGCCTCAGGTTGAGTTTAATGAGTTTGGGGGAAGCTCAATGTTGGCTGCAACTCTTGCTTGGGAC
GATGAACTCTCTTGGACTTTGGAAAATGCCGTTGAATCACTTCAAGAGACTATGCTTCAGGTTTCTTCTA
TTGTGATGAAGTTGCGGAAGGAATCTCTAGGAGTATCTGTTCTTAGCAAGAACCATGTTCCTACAAAAGG
AGCGTATTACCCTGCCGTAGAGAAGGCTTTGGAGATGATAAATCAAAAGAGTTCATCCCTTAACAAGGTT
GTGCTTGCTCGCAACAGCAGAGTGATCACAGATACCGACATTGATCCCATCGCATGGCTTGCACAGTTAC
AGAGTGAAGGGCATGATGCGTATCAGTTCTGTCTTCAGCCACCAGGTGCACCAGCTTTTATCGGAAACAC
GCCTGAGAGACTTTTCCAAAGGAAACAGTTAGGCGTCTGCAGTGAAGCTCTGGCTGCAACTAGGCCTCGA
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TTTCTATTGTACGAGATAATATACAAGAAAAATTTAACTCTATATGTGACAACGTAGTTGTTAAGCCTCA
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CCAGGCTTTTAATCAAGGAAATAGAATCATTCGATAGAGGAATGTATGCCGGACCTATTGGATTTTTTGG
TGGTCAAGAGAGTGAATTTGCAGTTGGGATCAGATCAGCTCTGGTTGAAAAGGGTCTTGGAGCATTGATC
TATGCAGGGACAGGGATAGTAGCAGGAAGCAACCCAACCTCAGAGTGGAATGAGCTTGATCTAAAGATAT
CTCAGTTTACCAAGTCAATTGAATATAAGTCAACAAGTCTACAGAGGGTTCCTTGAAGAAGAGTAAACAA
CATTTGTATTGTATGGGAATGTGGGTTACAGTAAAATTCACTGTGTTGTCATTTGTCAATGTATCTTTGT
AACTAGAAAGAATAATTTATGTAACTTTAGTCTCTCTTTTTTTTTGTCAAAAGATTTATGTAAGTTAGTC
TGTTTCTGATTGTTAATGGGTCTAGTCTCTCTTGGTTGTAACTAGGCCTTTATGATTGTTAATTTGATTC
TATCACTACCAAAGACCTTGTATTAATGGATACGAATACAATCTCTTTTCTTTTC