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Detail for ZS11_C04G57140.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C04G57140.t1
ZS11_v0: BnaC04T0492200ZS
WE: WE_C04G60110.t1
WE_v0: BnaC04T0479500WE
Darmor: C04p58360.1_BnaDAR
BH: BnaA05T152200BH
Quinta: BnaC04T0435000QU
ZS2: BnaA04T192900ZS2
SW: BnaA04T207400SW
Express61: C04p040260.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC04G0495200XY
P202: BnaC04G040820P202.3
BL: BnaA05T152200BH
TA: BnaC04T184500TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g27480D
RB: BnaA04T205900RB
No2127: BnaC04T0450300NO
P130: BnaC04G060810P130.1
Length: 263
KOG ID: KOG0725
KOG E-value: 1.010000e-169
KOG Score: 470.0
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: GO:0016491(oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K08081 TR1; tropinone reductase I [EC:1.1.1.206]
NR Protein: CDY62820.1
NR E-value: 2.100000e-146
NR Score: 523.5
NR Annotation: CDY62820.1 BnaC04g56400D [Brassica napus]
SwissProt Protein: O49332|TRNHE_ARATH
SwissProt E-value: 4.280000e-169
SwissProt Score: 470.0
SwissProt Annotation: Tropinone reductase homolog At2g30670 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g30670 PE=3 SV=1
CDS Sequence (803 bp)
ATGGATAATAGATGGAGTCTTGAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGCATG
CCATAGTAGAGGAGCTAGCCAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGCGACATATCTGAAACACTGCTCAA
TCAGAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCCATATGTGATGTATCCTCTCGT
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GTTTACCTGCAGCTTCATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTT
CTCCTATCAGCCAAAGGCTTGA
Upstream Sequence
ATGGATAATAGATGGAGTCTTGAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGCATG
CCATAGTAGAGGAGCTAGCCAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGCGACATATCTGAAACACTGCTCAA
TCAGAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCCATATGTGATGTATCCTCTCGT
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ATTGTCATGATTTCCTCTGTTGGAGGGGTTGTATCAATGTGCTGTGGATCCATCTATAGTCTGGCGAAAG
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TGCTCCTAATTTTGTCAACAATACTACTATGGCAAAACCTTTTTTCAAAGACGCTGATTACGAGAAGAGT
TTGTTAAACAGAACTCCACTTGGTCGGGCTGGAGAGCCAAACGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTCCTGT
GTTTACCTGCAGCTTCATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTT
CTCCTATCAGCCAAAGGCTTGA
Downstream Sequence
GGTTTGCCTTACTACTCTATTGCTACATCATATTTCTTACCCATTGTTTTGATTTTATTC
AAGATTCTCTAAATTAATTTTATTTGATTTTGTGAAATTTTATAGGCATGCCATAGTAGA
GGAGCTAGCCAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGCGACATATCTGAAACACTGCTCAA
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GCTGAGTATACTTGTAAGAAACTAAGCATATTCTCACAGGAAAAATTCTATTAAGTTGCA
AAATATATAGTGCGTAAGGTTTATGTTACTCTTTTTGTTCAACATAGGTGAACAACGTTG
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CTGGATTTGGAAGCATTGTCATGATTTCCTCTGTTGGAGGGGTTGTATCAATGTGCTGTG
GATCCATCTATAGTCTGGCGAAAGGTACGCAGACTTCACTTACGTATATAATTCCCAAAT
GATGTTTGGTAAAAATGAATTATATTTTGAGTTAACGTTAATAAGTTATTTTACAGTGGT
ACGTCAAAATTTATAGTTGGAACGGTTAATATTTGAAATTTGCACTTGTATATTATATAT
TATTTTAGATCCTATAATTTATATATGAGATTCCCATTATAGTAAGTGCAAGCACTTTTT
ATCAAATATATATGATCCCAGTGTCAGAATTCGTTTAACTCTGATTAATTAGCTCGATGG
ATAATCCTTAATTTCACCAGAAATTACTTCCAACGGCTAGTTGATTTGATCATTCATTTC
TGTAAAACCTTGTTGTGTAACGTTCAGTCTAATTTTTCGTTTTCTTTGTGTGTGTATGCG
CAGGAGCTTTGAACCAACTAGCCAAAAATTTGGCGTGTGAATGGGCAAGAGATGGCATAA
GAACCAACTCTGTTGCTCCTAATTTTGTCAACAATACTACTATGGCAAAACCTGTAACTA
AAGACACCCTCCAGATTCTTTGTTTTTTTTTTTCTAAGTTTTCAGTTAACGCTATGCACT
TCTCATTCTTATGTCTATCTTGTGAATAACCAGTTTTTCAAAGACGCTGATTACGAGAAG
AGTTTGTTAAACAGAACTCCACTTGGTCGGGCTGGAGAGCCAAACGAGGTTGCATCACTT
GTGGCTTTCCTGTGTTTACCTGCAGCTTCATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGAT
GGAGGTCTCACTGTCAATGGTTTCTCCTATCAGCCAAAGGCTTGAGCTGTGACTTGTGTG
TGTTGGTGATGCAGCGTACAAGTATGTTTTAAATTGTTGTTGGGTTTTGTTTTAACCTTT
GCTTCTATCACTAATAAAAACAAAAATAAGAAACTCTAGTTTCTATTACTATTGCACTCT
TTGAGAATTCAATAGATTTGTGATGGTTTGGTTAACAGTTGTCTCTGAAATCAATGTTTA
TCCATATCTTGCATCTATTATTTGGTGTTCAAGTTAGTTGTTTTTTTTATTTACCATGTG
GTTTAGAAGTTTTTTTTTATTAATCAAGAGCAAGAGTTCTGGACCCTTAAGCGGATACTT
CTTCCTTCTTGGGTCGGAATGAGCATTTCAAGATTACTCTCAAGTACTGAACCTAAGACC
TGACTTTTCACTCTTTTGGAAGGGTCATATATATTTGATCTCTAGCTCTTAAATCTTAAT
TTTATGGTTTTGTTTTACTTGTTAGTTATTTTCTCAAACTCTCTCAAACAATATGGCCCT
TATTAGTCAAAACTATATTTGAAGAAACCTTTATAAAAACGATTAAGGGGCTGAATGCGA
GACAAAAATATATTTCTGAT
Pro Sequence
MDNRWSLEGMTALVTGGASGIGHAIVEELASFGARIHVCDISETLLNQSL
SEWEKKGFQVSGSICDVSSRPERETLMQTVSAIFDGKLSILVNNVAVVHT
KPTTEYDANDFSFQISTNLESAYHLSQLSHPLLKASGFGSIVMISSVGGV
VSMCCGSIYSLAKGALNQLAKNLACEWARDGIRTNSVAPNFVNNTTMAKP
FFKDADYEKSLLNRTPLGRAGEPNEVASLVAFLCLPAASYITGQTICVDG
GLTVNGFSYQPKA
mRNA Sequence
ATGGATAATAGATGGAGTCTTGAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGCATG
CCATAGTAGAGGAGCTAGCCAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGCGACATATCTGAAACACTGCTCAA
TCAGAGTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCCATATGTGATGTATCCTCTCGT
CCCGAGAGAGAAACACTTATGCAAACCGTCTCAGCGATATTTGATGGCAAGCTGAGTATACTTGTGAACA
ACGTTGCCGTGGTTCACACTAAGCCAACAACCGAATATGACGCAAACGATTTCTCGTTCCAAATTTCAAC
AAACTTGGAATCTGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTCACATCCTCTCCTCAAGGCTTCTGGATTTGGAAGC
ATTGTCATGATTTCCTCTGTTGGAGGGGTTGTATCAATGTGCTGTGGATCCATCTATAGTCTGGCGAAAG
GAGCTTTGAACCAACTAGCCAAAAATTTGGCGTGTGAATGGGCAAGAGATGGCATAAGAACCAACTCTGT
TGCTCCTAATTTTGTCAACAATACTACTATGGCAAAACCTTTTTTCAAAGACGCTGATTACGAGAAGAGT
TTGTTAAACAGAACTCCACTTGGTCGGGCTGGAGAGCCAAACGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTCCTGT
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CTCCTATCAGCCAAAGGCTTGA