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Detail for ZS11_C07G00870.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C07G00870.t1
ZS11_v0: BnaC07T0009600ZS
WE: WE_C07G00840.t1
WE_v0: BnaC07T0033100WE
Darmor: C07p00720.1_BnaDAR
BH: BnaC07T006400BH
Quinta: BnaC07T0007100QU
ZS2: BnaC07T005300ZS2
SW: BnaC07T006500SW
Express61: A07p000390.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC07G0007000XY
P202: BnaC07G001510P202.1
BL: BnaC07T006400BH
TA: BnaC07T005800TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaC07T006200RB
No2127: BnaC07T0008500NO
P130: BnaA07G006960P130.1
Length: 402
KOG ID: KOG2865
KOG E-value: Not available
KOG Score: 706.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K03953 NDUFA9; NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex subunit 9
NR Protein: XP_013675982.1
NR E-value: 5.100000e-229
NR Score: 798.5
NR Annotation: XP_013675982.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial-like [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9SK66|NDUA9_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 723.0
SwissProt Annotation: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g20360 PE=1 SV=2
CDS Sequence (1226 bp)
ATGCAGGCAGTTTCAAGGAGATTGATCCAGCGGCCTCTCGCCGGAGGAGCTTCGATTTATTCGTCATCTT
CTCTCAGATCGCTCCATGGAGTCTCAGATCACTTCAATGGGAATGATAATCGTCGCTACTCGTCTTCCCT
GGCTACAAAGGGCGTTGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCCTCCGTGAGTGGCATTGTA
GCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCTAGCTAAAATGGGATCGC
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GGTTGTACCGATGAAATTTGATCCAAGAGACGAAGACTCTATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTC
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AGCTTCTGTATCATCCCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTGAGCGCG
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CAAAGTCCCCTTCCCTCTACCCTCTCCCCAGATCTTCAACCTTGATCAAATCAATACGCTTACGACAGAT
ACACTTGTATCAGACAAGGCCTTGACGTTTCAGGATTTGGACCTTGTCCCTCATAAGTTGAAGGGATATC
CAGTGGAGTTTCTTATCCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAATTTCGGTTCTACTGTCAGTGAAAAGATTCC
AACAGACTTCTACAATTGA
Upstream Sequence
GGCCCATATACCTGTATTCTCTCACATCTGCGTTTGTTGTGTTTCTCTCAATCAATCGTGTAAGTGATGC
AGGCAGTTTCAAGGAGATTGATCCAGCGGCCTCTCGCCGGAGGAGCTTCGATTTATTCGTCATCTTCTCT
CAGATCGCTCCATGGAGTCTCAGATCACTTCAATGGGAATGATAATCGTCGCTACTCGTCTTCCCTGGCT
ACAAAGGGCGTTGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCCTCCGTGAGTGGCATTGTAGCTA
CGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCTAGCTAAAATGGGATCGCAAGT
GCTAGTTCCTTTCCGCGGCTCAGAGGACAATCCTCGACATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTT
GTACCGATGAAATTTGATCCAAGAGACGAAGACTCTATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTA
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TCTGTATCATCCCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTGAGCGCGCTGC
CTGAGGCGACAGTCATGCGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGAATCTTGAACCCCTGGGCAAT
GTTTGTTAAGAAATATGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACCAACAAATTCCAGCCCGTATATGTG
GTTGATGTTGCTGCTGCGATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGACGGCTCCAGCATGGGGAAAACGTATGAGT
TGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCATGATTTGGCAGAGATCATGTTTGATATGATCCGTGAATGGCC
TCGATATGTGAAGCTTCCATTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTACTCGGGATTTCATGGTCAACAAA
GTCCCCTTCCCTCTACCCTCTCCCCAGATCTTCAACCTTGATCAAATCAATACGCTTACGACAGATACAC
TTGTATCAGACAAGGCCTTGACGTTTCAGGATTTGGACCTTGTCCCTCATAAGTTGAAGGGATATCCAGT
GGAGTTTCTTATCCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAATTTCGGTTCTACTGTCAGTGAAAAGATTCCAACA
GACTTCTACAATTGATGCTGCTTCTGCTCAAAGGTCGTTGCCCTGGACTAATTTTTTTCATGCAAGTCTC
ACAATGAAATTGCGGAAACCAGATTTGATATTTTGATGCCTTTTCATTTGCTTCTGTCAATAATAAAATG
GTTCTCTCCTCGTTGTGTTCTGGAAAAGAAAGCATAACCAATCAATGGGATCATAAGTTAGAGAGGGGAT
GTCATCTGGCTTGAAGGGGTGATTTTGGCCCCCTAAGGAATTATGGAGTTTCTGGTTCATGTGTTACTTT
GCTATTGAGTGCAACTATAAAGCCATGGG
Downstream Sequence
TGTTAAGTTTCTACTATTGATTTAATTTGATTCGCATTTCTAGGGTTCTTAATATATGGT
TCCCTTCTTCAGTCAATGGGAATGATAATCGTCGCTACTCGTCTTCCCTGGCTACAAAGG
GCGTTGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCCTCCGTGAGGTATATCATTT
TTTCTCTTATAAGGGTTTTGGTCCCCAAAGGAATGCTGTCAAGACAAATTGTGTTAGGAT
AATCCATGATTACATGTTTGTTTAGCTTTCATGAAATTTAATTTACTTTATGGAGAAATG
TATCATCTTTAGGTTTTATGTCGCTTCAGTATAGAGAATTTGTCAAGTTTGCTTGAGATC
TTTCTGTTTACAAATTAAATGTATCATCTTTTGATTTCTCCTCCTTTGCATTGGCAGTGG
CATTGTAGCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCT
AGGTGATTTGGGAGATTCAGTCTTGTTTTCTTCCTTGACATTTGGTGGTTTTCTAATTAC
TTCAAATCAATCTCCTTGCTCCAGCTAAAATGGGATCGCAAGTGCTAGTTCCTTTCCGCG
GCTCAGAGGACAATCCTCGACATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTAACTGTGT
TCTTTTGTTTAGCACAATGTTTTAGGGGTATGCCACAAACACACACCTTTTTGTTTCTTT
GTTTCCAGGTTGTACCGATGAAATTTGATCCAAGAGACGAAGACTCTATTAAGGCTGTCA
TGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAATCTAATTGGTACTTATTTTCCCTATATTATTAGAT
CTTTTAAGTAGCAACACTGTCCTTTTACCTTGTGGATGATATCTGTTCTAATTCTCAGGA
AGAGAGTACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCAAAGAGGTGAATCATCACATGGCCGAGAAA
CTTGCATTGGTACGTGTTTAATTCCTGACAAGTTATCCCCGGAAACTCTGGTGAAGAGGT
TTCCACTTTTTACTCCTCGGACAGTTGTGTGCTTCTGAAATGAGCTACACTTTTTTCACC
TTCAGGACGATAGTGCTCTTTTGGTTATGTCTAACTAGATTGGGGATTTTTGTTTTAGGT
GGCCAAAGAACATGGTGGAATAATGAGATTTATTCAAGTTTCTTGTCTGGGAGCTTCTGT
ATCATCCCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTGAGCGC
GCTGCCTGAGGTAAACTGATCCTAGCTTTCAGCTCACATCACGCTCTCTTCTGTAATTAT
CAGCCTAATGTATGATTCTACTTTTTCAGATATAGGGTAGTTCCGTTACTTTTTCTTTCC
TTGTGTAGAACTGTAAAACTGTTATTCATGAACTCTAGAATCTCTTAAAGCAACAATGTA
GGCTTGCATATGCATTTTGTCATCAGCCTGCTGCTTCTAGACATTTCCTGATGTATATTT
GTTTCCTAGGCGACAGTCATGCGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGAATCTTG
AACCCCTGGGCAATGTTTGTTAAGAAATATGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACC
AACAAGTATGTTCTAAACCTTTATCTTATTCTTTTTACCCGTTCATTGCAACTTATAGTG
ACTATGATCCATTTCTTTCGCTAAACTTAACTTCATTGCAGATTCCAGCCCGTATATGTG
GTTGATGTTGCTGCTGCGATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGACGGCTCCAGCATGGGGAAA
ACGTATGAGTTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCATGATTTGGTAAATTCTTATGGT
TCTTTATTCTCTTTGTCACTGTGGCAACCCAATGGCCTTGATTTTCAAGTTCTTTCTTGC
AGGCAGAGATCATGTTTGATATGATCCGTGAATGGCCTCGATATGTGAAGCTTCCATTTC
CAATTGCTAAGGTAACAGCT
Pro Sequence
MQAVSRRLIQRPLAGGASIYSSSSLRSLHGVSDHFNGNDNRRYSSSLATK
GVGHLARKGTGGRSSVSGIVATVFGATGFLGRYLVQQLAKMGSQVLVPFR
GSEDNPRHLKLMGDLGQVVPMKFDPRDEDSIKAVMAKANVVINLIGREYE
TRNFSFKEVNHHMAEKLALVAKEHGGIMRFIQVSCLGASVSSPSRMQRAK
AAAEEAVLSALPEATVMRPATMIGTEDRILNPWAMFVKKYGFLPLIGGGT
NKFQPVYVVDVAAAIVAALKDDGSSMGKTYELGGPDVFTPHDLAEIMFDM
IREWPRYVKLPFPIAKAMAGTRDFMVNKVPFPLPSPQIFNLDQINTLTTD
TLVSDKALTFQDLDLVPHKLKGYPVEFLIQYRKGGPNFGSTVSEKIPTDF
YN
mRNA Sequence
GGCCCATATACCTGTATTCTCTCACATCTGCGTTTGTTGTGTTTCTCTCAATCAATCGTGTAAGTGATGC
AGGCAGTTTCAAGGAGATTGATCCAGCGGCCTCTCGCCGGAGGAGCTTCGATTTATTCGTCATCTTCTCT
CAGATCGCTCCATGGAGTCTCAGATCACTTCAATGGGAATGATAATCGTCGCTACTCGTCTTCCCTGGCT
ACAAAGGGCGTTGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCCTCCGTGAGTGGCATTGTAGCTA
CGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCTAGCTAAAATGGGATCGCAAGT
GCTAGTTCCTTTCCGCGGCTCAGAGGACAATCCTCGACATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTT
GTACCGATGAAATTTGATCCAAGAGACGAAGACTCTATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTA
TCAATCTAATTGGAAGAGAGTACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCAAAGAGGTGAATCATCACATGGCCGA
GAAACTTGCATTGGTGGCCAAAGAACATGGTGGAATAATGAGATTTATTCAAGTTTCTTGTCTGGGAGCT
TCTGTATCATCCCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTGAGCGCGCTGC
CTGAGGCGACAGTCATGCGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGAATCTTGAACCCCTGGGCAAT
GTTTGTTAAGAAATATGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACCAACAAATTCCAGCCCGTATATGTG
GTTGATGTTGCTGCTGCGATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGACGGCTCCAGCATGGGGAAAACGTATGAGT
TGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCATGATTTGGCAGAGATCATGTTTGATATGATCCGTGAATGGCC
TCGATATGTGAAGCTTCCATTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTACTCGGGATTTCATGGTCAACAAA
GTCCCCTTCCCTCTACCCTCTCCCCAGATCTTCAACCTTGATCAAATCAATACGCTTACGACAGATACAC
TTGTATCAGACAAGGCCTTGACGTTTCAGGATTTGGACCTTGTCCCTCATAAGTTGAAGGGATATCCAGT
GGAGTTTCTTATCCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAATTTCGGTTCTACTGTCAGTGAAAAGATTCCAACA
GACTTCTACAATTGATGCTGCTTCTGCTCAAAGGTCGTTGCCCTGGACTAATTTTTTTCATGCAAGTCTC
ACAATGAAATTGCGGAAACCAGATTTGATATTTTGATGCCTTTTCATTTGCTTCTGTCAATAATAAAATG
GTTCTCTCCTCGTTGTGTTCTGGAAAAGAAAGCATAACCAATCAATGGGATCATAAGTTAGAGAGGGGAT
GTCATCTGGCTTGAAGGGGTGATTTTGGCCCCCTAAGGAATTATGGAGTTTCTGGTTCATGTGTTACTTT
GCTATTGAGTGCAACTATAAAGCCATGGG