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Detail for ZS11_C07G14140.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C07G14140.t1
ZS11_v0: BnaC07T0108700ZS
WE: WE_C07G13990.t1
WE_v0: BnaC07T0086900WE
Darmor: C07p12650.1_BnaDAR
BH: BnaC06T304700BH
Quinta: BnaC07T0099500QU
ZS2: BnaA07T253000ZS2
SW: BnaA07T264200SW
Express61: C07p002350.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC07G0114600XY
P202: BnaC07G035680P202.1
BL: BnaC06T304700BH
TA: BnaA07T255200TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaA07T269200RB
No2127: BnaC07T0099700NO
P130: BnaC07G016770P130.1
Length: 103
KOG ID: KOG1223
KOG E-value: 2.100000e-22
KOG Score: 91.3
KOG Annotation: Amino acid transport and metabolism
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K02552 menF; menaquinone-specific isochorismate synthase [EC:5.4.4.2]
NR Protein: CDY52716.1
NR E-value: 5.300000e-45
NR Score: 185.3
NR Annotation: CDY52716.1 BnaCnng23220D [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9S7H8|ICS1_ARATH
SwissProt E-value: 1.000000e-21
SwissProt Score: 91.3
SwissProt Annotation: Isochorismate synthase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ICS1 PE=1 SV=2
CDS Sequence (316 bp)
ATGATCTCGATGCGGTTTCTGATTCCAGGGAAGTTATCGACAGATATAGTGAATGGGAATGATTTTGAGG
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Upstream Sequence
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Downstream Sequence
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Pro Sequence
MISMRFLIPGKLSTDIVNGNDFEDGSQRLQPQNEIQPRCFFSCCSDVGCP
HLLPDLANENENSNRGSSDRDLISVGMRLDPNGKIAVEWDPVGAFYFSVP
QIP
mRNA Sequence
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ATGGATCACAACGGCTTCAGCCCCAAAACGAGATTCAGCCTCGCTGCTTCTTCTCTTGCTGTAGCGACGT
TGGTTGTCCCCATCTTCTTCCCGACTTGGCCAACGAGAATGAGAACAGTAACAGAGGCTCATCAGATCGT
GATCTGATTTCTGTCGGCATGCGGTTGGATCCTAACGGTAAAATCGCTGTGGAATGGGACCCCGTTGGTG
CATTTTACTTTTCAGTGCCTCAGATACCTTAA