BrassicaPanDB

CDS Sequence (261 bp)

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GTCGAAATATGGTTAGGGCTCTTATGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTTAATATGAATCTCGTAAC
ATTTGCTGATTTTTTTGATAATTCCCAACTAAAAGGGATATTTTCTGCATTTTGTTATAGCAATTGCAGC
CGCTTAAGCACCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAA

Upstream Sequence

ATGATACTCGAGCATGTACTTGTTTTGAGTGCCTATTTATTTTTGATTGGTCTTTATGGATTGATCACGA
GTCGAAATATGGTTAGGGCTCTTATGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTTAATATGAATCTCGTAAC
ATTTGCTGATTTTTTTGATAATTCCCAACTAAAAGGGATATTTTCTGCATTTTGTTATAGCAATTGCAGC
CGCTTAAGCACCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAA

Downstream Sequence

ACAGAAAATCAACTCGCCTCAACCAATCGACCTTATTAAATAAGTAGCATAAATCCAAAA
ATTATAGGTTTAAATTTGCATATATGATAGGTTATGACTTACTAGATTAAATTTGTGAAA
ATCTAAGAAATCAAAGTATTTTAGCCCGTTTTTACCAATTGAGCCAGAATTCATTAAAAA
ATTCTATTAAAGGAAATCATTGCTTCATCTAGTATTTTAATTTAATATATCATTTAGTTA
TAAGTGTACTAGATTGAAAATTTATGACATTCAAAAACTATAGATCCTATGTCACATTCA
GTAACAATTTATGATACATGTATAGGATGTACTCAGTGTGTCCGAGCATGTCCTACAGAC
GTATTAGAAATGATACCTTGGGATGGATGTAAAGCTAAGCAAATAGCTTCTGCCCCAAGA
ACCGAGGATTGTGTTGGTTGTAAGAGAAGTGAATCTGCCTGTCCAACGGATTTTTGAGCG
TTCGAGTTTATTTATGGCATGAAACAACTCAAGCATGGGTCTAGCTTATTGATACGTTAC
CGAAAACCTGATTTGAATAAATTTGGAATATATTTTATTTTTTATTGACAAGTACTCGTA
CTCAAAGAAGTTCAATTATATTTTTTATTTATATATTTTTTGAGTACGCGTTCTTTGGAC
CTGGTGTATCTTGTCTTTACCACGAATGATTTTCCTTGGTTAACAATAATTGTTGTTTTT
CCAATATCTGCCGGTTCATTAATGTTATTTCTCCCGCATAGGAAATAAAGTTAATAAGTG
GTATACTATATGCATTTGTATCTTAGAACTTCTTCTAACGACTTACGCTTTTGTTATAAT
TTTAAACTGGACGATCCATTAATTCAACTGTCCAAGATTATAAATGGATCATTTTTTTAT
TTTTATTGGAGACTGGGAATAGATGGACTTTCTATAGGATCGATTTTACTGACCGGATTT
ATTACTACTTTAGCTACTTTAGCGGCTTTTCCAGTTACTCGGGATTCCCGATTATTCTAT
TTCCTGATGTTAGCAATGTACAGCGCCAAATAGGATCATTTTCTTCTCGGATATTTTACT
TTTTTCATCATGTGGGAATTAGAATTAATTCCGTTTATCTCCTTTTATCCATGTGGGGTG
GAAAGAAACGTTTGTATTCAGCTACAAAATTTATTTTATACACTGCAGGAAGTTCTATTT
TTATTAATAGGAGTTTTAGGTATAAGTTTATATGGTTCGAACGAACCAACATTAAATTTA
GAACTATTAGGGAATCAAGCCTATCCGGTCACACTCGAAATACTATTTTATATTGGATTT
CTTATTGCTTTTGCCGTCAAATCACCGATTATACCTTTACATACTTGGTTACCTAACACC
CACGGCGAGGCACATTACAGTACCTGTATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAAATGGGA
GCATATGGATTGGTTCGAATCAATATGTAATTATTACCTCACGCTCATTCTCTGTTTTCT
CCTTGGTTGATGGTAGTCGGTACAATCCAAATAATTTATGCAGCTTCAACATCTACCGGT
CAACGTAATTTAAAAAAGAGAATAACCTATTCTTCTGTATCTCATATGAGTTTTATAATT
ATAGGTATTGGTTCTATAACGGATCATGGGCTTAATGGAGCTATTTTACAAATAATCTCT
CATGGATTTATTGGCGCTGCACTTTTTTTCTTGGCAGGAACTAGTTATGATAGAATCCTA
CTTGTTTATCTTGATGAAATGGGTGGAATGGCTATCTGCATTCCAAAGATATTTACAATG
TTCACTATCTTATTGATGGCTTCCCTTGCATTACCGGGCATGAGTGGTTTTGTTGCAGAA
TTAATCGTTTTTTTGGAATAATTACCAGACAAAAATATTTCTTAATTTCAAAAATTTTAA
TTATTTTTGTAATGGCAATTGGAATGATATTAACTCCTATATATTTATTATCTATGTCAC
GTCAAATGTTCTATGGATAC

Pro Sequence

MILEHVLVLSAYLFLIGLYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNLVTFAD
FFDNSQLKGIFSAFCYSNCSRLSTYWISYSLVNLS

mRNA Sequence

ATGATACTCGAGCATGTACTTGTTTTGAGTGCCTATTTATTTTTGATTGGTCTTTATGGATTGATCACGA
GTCGAAATATGGTTAGGGCTCTTATGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTTAATATGAATCTCGTAAC
ATTTGCTGATTTTTTTGATAATTCCCAACTAAAAGGGATATTTTCTGCATTTTGTTATAGCAATTGCAGC
CGCTTAAGCACCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAA

Genome:
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No2127:	BnaC02T0398500NO
P130:	Not available
Length:	85
KOG ID:	KOG4669
KOG E-value:	7.160000e-35
KOG Score:	115.0
KOG Annotation:	Energy production and conversion
Biological Process:	GO:0042773(ATP synthesis coupled electron transport)
Cellular Component:	-
Molecular Function:	GO:0016651(oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H)
KEGG Ortholog:	-
NR Protein:	VDD26824.1
NR E-value:	1.400000e-27
NR Score:	127.1
NR Annotation:	VDD26824.1 unnamed protein product [Brassica rapa]
SwissProt Protein:	A4QL73\|NU4LC_DRANE
SwissProt E-value:	6.550000e-35
SwissProt Score:	117.0
SwissProt Annotation:	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic OS=Draba nemorosa OX=171822 GN=ndhE PE=3 SV=1

DETAIL

Detail for ZS11_C07G35770.t1

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