SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_A02G49660.t1

Genome:
ZS11: ZS11_A02G49660.t1
ZS11_v0: BnaA02T0418000ZS
WE: WE_C02G72430.t1
WE_v0: BnaA02T0408800WE
Darmor: A02p44410.1_BnaDAR
BH: BnaA02T500300BH
Quinta: BnaC02T0516100QU
ZS2: BnaA02T434000ZS2
SW: BnaA02T446500SW
Express61: C02p042680.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA02G0420800XY
P202: BnaA02G033440P202.1
BL: BnaA02T500300BH
TA: BnaC02T551200TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g30070D
RB: BnaA02T427600RB
No2127: BnaA02T0408500NO
P130: BnaA02G044550P130.1
Length: 448
KOG ID: -
KOG E-value: Not available
KOG Score: Not available
KOG Annotation: -
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: -
NR Protein: VDC93495.1
NR E-value: 2.100000e-255
NR Score: 886.3
NR Annotation: VDC93495.1 unnamed protein product [Brassica rapa]
SwissProt Protein: O82663|SDHA1_ARATH
SwissProt E-value: 1.440000e-31
SwissProt Score: 130.0
SwissProt Annotation: Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit 1, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SDH1-1 PE=1 SV=1
CDS Sequence (1366 bp)
ATGAGGAAGCTGTGTCCGAACGTAGACAGAGACGATGGTTTGGAGACGGTTTTGGAAATTCCGATACCGG
AGGAGTTGTTCTCCGGTATGGGCAATAACGTAGCATTGAGGTGTCAGAATATGATGACGTGGATGAAAGC
TCAAACGGCTGATAAATTGTCGCAACCGCTAATCGCTGCTCGTATCAACGAGCTTCGTTTTCTTCTCTAC
CTCGTTGGATCGCCTCTTATACCTCTCCAGGTTCAAGTTGGTCACTCTGTTCATAAGCCTGTCAAAGATT
CCTCCATTCAAGCTTCCACGGCGAAATACATAGTGCAGCAATACATAGCGGCGACGGGAGGACCTGCAGC
GTTAAACGCCGTGAACAGTATGTGCGTTATTGGACAAGTGAAGATGACGGCGTCAGAGTTTCACCAAGGA
GACGATTCCAACGTTAACCTTAAAAGCAACGATGAAATGGGTGGTTTCATATTGTGGCAGAAAGATCCAG
ATCTGTGGTGTTTGGAGCTCGTTGTGTCTGGATGTAAAGTCATATGCGGTAGTAACGGTCGGCTTTCGTG
GCGACATTCTTCTAACCAGCAAACACCGTCGTCCACCGGAACACCGAGACCTCTCCGCCGTTTTTTACAG
GGTTTAGATCCTCGTTCGACCGCTAATATGTTCCTCGACGCAACGTGCATCGGAGAGAAGATTATCAACG
GTGAGGATTGCTTTATACTGAAACTTGAGACGAGTCCGGCGGTTAGAGAGGCTCAAAGCGGTCCAGAGTT
CGAGATCATTCATCACACGATATGGGGTTATTTCAGCCAGAGATCGGGACTGTTGATACAGTTTGAGGAC
TCGAGGCTTCTGAGTATGCGGACCAAGGAAGGCGATGTATTTTGGGAGACTAGCGCCGAATCGGTGATGG
ATGATTATCGGTACGTGGATGATGTGAACATCGCTCACGGTGGGAAAACTACAGTTACGGTTTTTAGGTA
TGGTGAAGCCTCGGCGAACCATCGGAGACAGATGACGGAGAAGTGGCGGATCGAGGAAGTTGATTTTAAC
ATTTGGGGTCTCTCGGTGGGCAGGCCTATCGTTGTGCCTGATCGGACTGGGCATGCTCTCTTGCCTACCC
TTTATGGACAAGCTATGAAGCATAACACACACTTCTTTGTTGAATACTTGGCTCTCGATTTGCTCATGGC
TAGTGATGGCAGTTGCCAGGGTGTTATTGCACTAAACATGGAAGATGGAACACTCCATCGTTTCCGCTCT
GCACAAACAATTTTGGCCACTGGGCACATACATGCACATAACCTCTCATCACCGAAGGATCCCGAGGTGA
AGGTGTGGTATTCTTAG
Upstream Sequence
ATGAGGAAGCTGTGTCCGAACGTAGACAGAGACGATGGTTTGGAGACGGTTTTGGAAATTCCGATACCGG
AGGAGTTGTTCTCCGGTATGGGCAATAACGTAGCATTGAGGTGTCAGAATATGATGACGTGGATGAAAGC
TCAAACGGCTGATAAATTGTCGCAACCGCTAATCGCTGCTCGTATCAACGAGCTTCGTTTTCTTCTCTAC
CTCGTTGGATCGCCTCTTATACCTCTCCAGGTTCAAGTTGGTCACTCTGTTCATAAGCCTGTCAAAGATT
CCTCCATTCAAGCTTCCACGGCGAAATACATAGTGCAGCAATACATAGCGGCGACGGGAGGACCTGCAGC
GTTAAACGCCGTGAACAGTATGTGCGTTATTGGACAAGTGAAGATGACGGCGTCAGAGTTTCACCAAGGA
GACGATTCCAACGTTAACCTTAAAAGCAACGATGAAATGGGTGGTTTCATATTGTGGCAGAAAGATCCAG
ATCTGTGGTGTTTGGAGCTCGTTGTGTCTGGATGTAAAGTCATATGCGGTAGTAACGGTCGGCTTTCGTG
GCGACATTCTTCTAACCAGCAAACACCGTCGTCCACCGGAACACCGAGACCTCTCCGCCGTTTTTTACAG
GGTTTAGATCCTCGTTCGACCGCTAATATGTTCCTCGACGCAACGTGCATCGGAGAGAAGATTATCAACG
GTGAGGATTGCTTTATACTGAAACTTGAGACGAGTCCGGCGGTTAGAGAGGCTCAAAGCGGTCCAGAGTT
CGAGATCATTCATCACACGATATGGGGTTATTTCAGCCAGAGATCGGGACTGTTGATACAGTTTGAGGAC
TCGAGGCTTCTGAGTATGCGGACCAAGGAAGGCGATGTATTTTGGGAGACTAGCGCCGAATCGGTGATGG
ATGATTATCGGTACGTGGATGATGTGAACATCGCTCACGGTGGGAAAACTACAGTTACGGTTTTTAGGTA
TGGTGAAGCCTCGGCGAACCATCGGAGACAGATGACGGAGAAGTGGCGGATCGAGGAAGTTGATTTTAAC
ATTTGGGGTCTCTCGGTGGGCAGGCCTATCGTTGTGCCTGATCGGACTGGGCATGCTCTCTTGCCTACCC
TTTATGGACAAGCTATGAAGCATAACACACACTTCTTTGTTGAATACTTGGCTCTCGATTTGCTCATGGC
TAGTGATGGCAGTTGCCAGGGTGTTATTGCACTAAACATGGAAGATGGAACACTCCATCGTTTCCGCTCT
GCACAAACAATTTTGGCCACTGGGCACATACATGCACATAACCTCTCATCACCGAAGGATCCCGAGGTGA
AGGTGTGGTATTCTTAG
Downstream Sequence
TGTAAGTCATTAGGCCCCGACTTAGAGACCAGCCTATAGTTTAACTGATGACGTCTAATC
AGTACTCTCACTTATTTCATTTAATTAGCAAGCTTCCACGGCGAAATACATAGTGCAGCA
ATACATAGCGGCGACGGGAGGACCTGCAGCGTTAAACGCCGTGAACAGTATGTGCGTTAT
TGGACAAGTGAAGATGACGGCGTCAGAGTTTCACCAAGGAGACGATTCCAACGTTAACCT
TAAAAGCAACGATGAAATGGGTGGTTTCATATTGTGGCAGAAAGATCCAGATCTGTGGTG
TTTGGAGCTCGTTGTGTCTGGATGTAAAGTCATATGCGGTAGTAACGGTCGGCTTTCGTG
GCGACATTCTTCTAACCAGCAAACACCGTCGTCCACCGGAACACCGAGACCTCTCCGCCG
TTTTTTACAGGTAAACCAACACGTTTATTATTTATTAATTTAATGTAGTTTGTAGGGTTA
TGCTGAACCGGGGCTGGTTTATTATTAATTGTTACCAGGGTTTAGATCCTCGTTCGACCG
CTAATATGTTCCTCGACGCAACGTGCATCGGAGAGAAGATTATCAACGGTGAGGATTGCT
TTATACTGAAACTTGAGACGAGTCCGGCGGTTAGAGAGGCTCAAAGCGGTCCAGAGTTCG
AGATCATTCATCACACGATATGGGGTTATTTCAGCCAGAGATCGGGACTGTTGATACAGT
TTGAGGACTCGAGGCTTCTGAGTATGCGGACCAAGGAAGGCGATGTATTTTGGGAGACTA
GCGCCGAATCGGTGATGGATGATTATCGGTACGTGGATGATGTGAACATCGCTCACGGTG
GGAAAACTACAGTTACGGTTTTTAGGTATGGTGAAGCCTCGGCGAACCATCGGAGACAGA
TGACGGAGAAGTGGCGGATCGAGGAAGTTGATTTTAACATTTGGGGTCTCTCGGTCGATC
ATTTTCGTCCTCCCGCCTTTTTGCTCACCGGAAACTGATTTTTTGTTATCCGTTCCAATT
GCATGATCCGATTTCCATTCTCTCTTTTTTTTTTTGCTACTAGGTTTTAAAAGTATCAAC
CAGCGAGCCGGTGTAATAAATTAATATTGATCTTGATGACTGAATCTTGCGTTACAAGCT
AACAATAATATTACAAGGTTTCCATACAAATGTCATACTTTGTAGTATATGACATTTGTA
GTATACTGGACCCACTAAACTGATCTATAAAATAAACACTGCATGGAAACATAATACTTC
CCACTGTAGGGGTGAGCGTTCAGGTACCCGTTCGGATTCAGATCAGGTATTTTGGATTTT
CAGGTATTTCAGCCGTTCGGATATTTATGTACTTCGGATTAGGTTCGGGTATTTTTAGTT
GGGGTTCGGTTATTTCAGATCGGGTTCGAATATTTAGATTTTGAAAAAAAAAATTAAATT
TTTTATTTCTCAAATTTTTTTGTATTTAAAAATATAACTTTCACTTAACTATTTTTTATT
TTTAATAGATTGAATGGTTAATAGATTTGGACATAACATTTTGAAACTAAAAAAGACATT
AATTTGGTTATTGTTTTTAAATTTTGGATATAACTTTTTGTTGATTCTTGAAATAAAAAG
TTTGATATGCATTTTAAGTAAGTAGCAAATCATTTTCTCTGTAATTCTATGTCTCTCTCT
CTAACGTCTTAATCCTAGCTCTTTGTTTCGAAAGCTTCTCATATTTGGCTTTCTTTTTCT
TTTACCATCAGGTGGGCAGGCCTATCGTTGTGCCTGATCGGACTGGGCATGCTCTCTTGC
CTACCCTTTATGGACAAGCTATGAAGCATAACACACACTTCTTTGTTGAATACTTGGCTC
TCGATTTGCTCATGGCTAGTGATGGTATGTGTCTGGGAGCTATTTTCTTTCTTTCTTTCT
TTCTTTTTTTGCTGTCGGTATTCATGCAACATTGTTACTTCATTCATATGCAGGCAGTTG
CCAGGGTGTTATTGCACTAA
Pro Sequence
MRKLCPNVDRDDGLETVLEIPIPEELFSGMGNNVALRCQNMMTWMKAQTA
DKLSQPLIAARINELRFLLYLVGSPLIPLQVQVGHSVHKPVKDSSIQAST
AKYIVQQYIAATGGPAALNAVNSMCVIGQVKMTASEFHQGDDSNVNLKSN
DEMGGFILWQKDPDLWCLELVVSGCKVICGSNGRLSWRHSSNQQTPSSTG
TPRPLRRFLQGLDPRSTANMFLDATCIGEKIINGEDCFILKLETSPAVRE
AQSGPEFEIIHHTIWGYFSQRSGLLIQFEDSRLLSMRTKEGDVFWETSAE
SVMDDYRYVDDVNIAHGGKTTVTVFRYGEASANHRRQMTEKWRIEEVDFN
IWGLSVGRPIVVPDRTGHALLPTLYGQAMKHNTHFFVEYLALDLLMASDG
SCQGVIALNMEDGTLHRFRSAQTILATGHIHAHNLSSPKDPEVKVWYS
mRNA Sequence
ATGAGGAAGCTGTGTCCGAACGTAGACAGAGACGATGGTTTGGAGACGGTTTTGGAAATTCCGATACCGG
AGGAGTTGTTCTCCGGTATGGGCAATAACGTAGCATTGAGGTGTCAGAATATGATGACGTGGATGAAAGC
TCAAACGGCTGATAAATTGTCGCAACCGCTAATCGCTGCTCGTATCAACGAGCTTCGTTTTCTTCTCTAC
CTCGTTGGATCGCCTCTTATACCTCTCCAGGTTCAAGTTGGTCACTCTGTTCATAAGCCTGTCAAAGATT
CCTCCATTCAAGCTTCCACGGCGAAATACATAGTGCAGCAATACATAGCGGCGACGGGAGGACCTGCAGC
GTTAAACGCCGTGAACAGTATGTGCGTTATTGGACAAGTGAAGATGACGGCGTCAGAGTTTCACCAAGGA
GACGATTCCAACGTTAACCTTAAAAGCAACGATGAAATGGGTGGTTTCATATTGTGGCAGAAAGATCCAG
ATCTGTGGTGTTTGGAGCTCGTTGTGTCTGGATGTAAAGTCATATGCGGTAGTAACGGTCGGCTTTCGTG
GCGACATTCTTCTAACCAGCAAACACCGTCGTCCACCGGAACACCGAGACCTCTCCGCCGTTTTTTACAG
GGTTTAGATCCTCGTTCGACCGCTAATATGTTCCTCGACGCAACGTGCATCGGAGAGAAGATTATCAACG
GTGAGGATTGCTTTATACTGAAACTTGAGACGAGTCCGGCGGTTAGAGAGGCTCAAAGCGGTCCAGAGTT
CGAGATCATTCATCACACGATATGGGGTTATTTCAGCCAGAGATCGGGACTGTTGATACAGTTTGAGGAC
TCGAGGCTTCTGAGTATGCGGACCAAGGAAGGCGATGTATTTTGGGAGACTAGCGCCGAATCGGTGATGG
ATGATTATCGGTACGTGGATGATGTGAACATCGCTCACGGTGGGAAAACTACAGTTACGGTTTTTAGGTA
TGGTGAAGCCTCGGCGAACCATCGGAGACAGATGACGGAGAAGTGGCGGATCGAGGAAGTTGATTTTAAC
ATTTGGGGTCTCTCGGTGGGCAGGCCTATCGTTGTGCCTGATCGGACTGGGCATGCTCTCTTGCCTACCC
TTTATGGACAAGCTATGAAGCATAACACACACTTCTTTGTTGAATACTTGGCTCTCGATTTGCTCATGGC
TAGTGATGGCAGTTGCCAGGGTGTTATTGCACTAAACATGGAAGATGGAACACTCCATCGTTTCCGCTCT
GCACAAACAATTTTGGCCACTGGGCACATACATGCACATAACCTCTCATCACCGAAGGATCCCGAGGTGA
AGGTGTGGTATTCTTAG