SEARCH

DETAIL

Detail for ZS11_C08G51740.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C08G51740.t1
ZS11_v0: BnaC08T0459600ZS
WE: WE_A09G60160.t1
WE_v0: BnaC08T0408000WE
Darmor: C08p42260.1_BnaDAR
BH: BnaC08T465400BH
Quinta: BnaC08T0459600QU
ZS2: BnaC08T428500ZS2
SW: BnaC08T459800SW
Express61: C08p041410.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC08G0450200XY
P202: BnaA07G000430P202.2
BL: BnaC08T465400BH
TA: BnaA09T506900TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaC08T460000RB
No2127: BnaC08T0403200NO
P130: BnaA07G006960P130.1
Length: 384
KOG ID: KOG2865
KOG E-value: Not available
KOG Score: 633.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K03953 NDUFA9; NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex subunit 9
NR Protein: XP_013664471.1
NR E-value: 5.500000e-204
NR Score: 715.3
NR Annotation: XP_013664471.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9SK66|NDUA9_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 640.0
SwissProt Annotation: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g20360 PE=1 SV=2
CDS Sequence (1171 bp)
ATGCAGGCAGTTTCCAGGAGACTAGTCCAACGTCCCCTCGGCGGAGGAGCTTCGATCTATTCGTCGTCTT
CTATCAGATCGCTCTATGGAGTCTCCGATCACCACCTGAATGGAGCTGATAACCGTCGATACTCGTCCTC
CCTTGCTACAAAGGGCGTGGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCTTCCGTCAGTGGCATT
GTAGCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCTTGCTAAAATGGGAT
CACAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCAGAGGACAATCCTCGACATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGG
ACAGGTAGTACCGATGAAATTTGATCCAAGAGATGAAGACTCGATTAAGGCCGTCATGGCAAAGGCTAAT
GTCGTTATCAATCTAATTGgaagagagtacgagaccagaaatttcagtttcaaaggtgaatcatcacatg
gccgagaaacttgcaTTGGTGGCCAAAGAACATGGTGGGATAATGAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGA
AGCTGTCTTGAACGCGCTGCCTGAGGCGACAGTGATGAGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGA
ATCTTGAACCCCTGGGCAATGTTCGTTAAAAAATATGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACCAACA
AATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTTGCTGCAGCAATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGATGGCTCCAG
CATGGGGAAAACCTATGAATTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCACGATTTGGCAGAGATCATGTTT
GATATGATTCGTGAATGGCCTCGATATGTGAAGCTTCCGTTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTCCTC
GGGATTTCATGGTGAACAAAGTCCCGTTCCCTCTACCCTCTCCCCAGATATTCAATCTGGATCAAATCAA
TGCCCTTACAACCGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACGTTTCAGGATTTGGACCTTGTCCCTCAT
AAATTGAAGGGATATCCAGTCGAGTTTCTTATCCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAACTTCGGTTCCACTG
TCAGTGAAAAGATACCAACAGACTTCTACAATTGA
Upstream Sequence
ATGCAGGCAGTTTCCAGGAGACTAGTCCAACGTCCCCTCGGCGGAGGAGCTTCGATCTATTCGTCGTCTT
CTATCAGATCGCTCTATGGAGTCTCCGATCACCACCTGAATGGAGCTGATAACCGTCGATACTCGTCCTC
CCTTGCTACAAAGGGCGTGGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCTTCCGTCAGTGGCATT
GTAGCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCTTGCTAAAATGGGAT
CACAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCAGAGGACAATCCTCGACATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGG
ACAGGTAGTACCGATGAAATTTGATCCAAGAGATGAAGACTCGATTAAGGCCGTCATGGCAAAGGCTAAT
GTCGTTATCAATCTAATTGgaagagagtacgagaccagaaatttcagtttcaaaggtgaatcatcacatg
gccgagaaacttgcaTTGGTGGCCAAAGAACATGGTGGGATAATGAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGA
AGCTGTCTTGAACGCGCTGCCTGAGGCGACAGTGATGAGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGA
ATCTTGAACCCCTGGGCAATGTTCGTTAAAAAATATGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACCAACA
AATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTTGCTGCAGCAATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGATGGCTCCAG
CATGGGGAAAACCTATGAATTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCACGATTTGGCAGAGATCATGTTT
GATATGATTCGTGAATGGCCTCGATATGTGAAGCTTCCGTTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTCCTC
GGGATTTCATGGTGAACAAAGTCCCGTTCCCTCTACCCTCTCCCCAGATATTCAATCTGGATCAAATCAA
TGCCCTTACAACCGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACGTTTCAGGATTTGGACCTTGTCCCTCAT
AAATTGAAGGGATATCCAGTCGAGTTTCTTATCCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAACTTCGGTTCCACTG
TCAGTGAAAAGATACCAACAGACTTCTACAATTGA
Downstream Sequence
CGTTAAGTTTTCTGCCATTTGATTTTAATCCCATTCGCATTTTTCTAGGTTGCTTAATGA
GATATATAGGTTTTGTGCTTCAGTGAATGGAGCTGATAACCGTCGATACTCGTCCTCCCT
TGCTACAAAGGGCGTGGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCTTCCGTCAG
GTATCTCATTTCTCTCTTATAGCGGTTTCGAATCCTGAAGAAATGTTAATTGTGTGTGTT
AGGATAACGCAAGCTTAGACTGTATCACCTTTGTGTGGTTTTGAGCTCTTAAAGACTGCT
TTTCATTGATTTAGCTGACTTTATAGAGAAATGTATCATCTCTTAGGGGTTTTGCAGCAG
CTTTAGTATAATGAGATCTTGATTCCTCCTTTGCTTTGGCAGTGGCATTGTAGCTACGGT
GTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCTTGGTGAGTTTGGTTT
AACACATTGCTATTACCCAGCCGCGTAAATCAATCTTGTTCTTCCTTTACATTTTTTTGG
GTTTCTAATTACTTGCAAATGAATCTCTTTTTTTTCAGCTAAAATGGGATCACAAGTGCT
AGTTCCTTTCCGAGGCTCAGAGGACAATCCTCGACATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGG
ACAGGTAATGTTTTTTCTTCTTTGTTTAACACATTGCTTTTAAGGTTATGTCACAAACAC
ACTTTTGATGTGTGTTGACTGTATATACCAGGTAGTACCGATGAAATTTGATCCAAGAGA
TGAAGACTCGATTAAGGCCGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAATCTAATTGGTAC
TTATTTTTTTTTATATTATTAGATCTTTTAATAAGCAACACTGTTCTTTTAATTTGTGGA
Tgatatatcttcaatccctcaggaagagagtacgagaccagaaatttcagtttcaaaggt
gaatcatcacatggccgagaaacttgcaTTGGTATGTGTTTGCATCCTGATAGACCATCT
CCGGAAACTCTGTTGAAGATGTTTCCATTTTTTAACTCATGATATTGTTGTGCGCTTCTG
AAATGAGCTAAACATTTTTAACCTTCAGGATGATACGATCTGCAGTGTCATGCTCTTTTG
TTTATGTCTAATTATGGTGGGGCTTGGTGGATTTGTTGTTTCAGGTGGCCAAAGAACATG
GTGGGATAATGAGGTTTATTCAAGTTTCTTGTCTTGGAGCTTCTTTGTCATCTCCTTCAA
GAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTGAACGCGCTGCCTGAGGTAA
ACTTATTCCAAATTTTGGCACACGGTACTCTCATCTGTAATCACCACTGTAATATTTTTG
TTCATTATTGTCATGATCCTACTTATTTTCAGATATAAGGTAGATCCTTTAGATTTTTTT
TCTTGTGTTGGACTGGAAAAACagtatatgATGTTATTATTGAACTCTAAAATCGTACCT
GGGATGGCTTGCATATGCATTTTTTCATCAGACTTCTGCTTCTAGTCAGTTCCTGATGTA
TATTTTTTTACTAGGCGACAGTGATGAGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGAA
TCTTGAACCCCTGGGCAATGTTCGTTAAAAAATATGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTG
GGACCAACAAGTATGTCCTAAACCTTTGTCTAATTCTTTTCACCAGTTCATAGCAATTTA
CAGTGACCATGATCAATTTCTTTCCCTAACCATAACTTCATTGCAGATTCCAGCCCGTAT
ATGTGGTTGATGTTGCTGCAGCAATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGATGGCTCCAGCATGG
GGAAAACCTATGAATTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCACGATTTGGTATAATCAT
AGAGTCCTTCTTTCTCTCTGTCACTGCATTAGCTCAATGGGCTTGATTTTCAAGTTTTTT
CCTTGCAGGCAGAGATCATG
Pro Sequence
MQAVSRRLVQRPLGGGASIYSSSSIRSLYGVSDHHLNGADNRRYSSSLAT
KGVGHLARKGTGGRSSVSGIVATVFGATGFLGRYLVQQLAKMGSQVLVPF
RGSEDNPRHLKLMGDLGQVVPMKFDPRDEDSIKAVMAKANVVINLIGREY
ETRNFSFKGESSHGRETCIGGQRTWWDNERAKAAAEEAVLNALPEATVMR
PATMIGTEDRILNPWAMFVKKYGFLPLIGGGTNKFQPVYVVDVAAAIVAA
LKDDGSSMGKTYELGGPDVFTPHDLAEIMFDMIREWPRYVKLPFPIAKAM
AGPRDFMVNKVPFPLPSPQIFNLDQINALTTDTLVSDKALTFQDLDLVPH
KLKGYPVEFLIQYRKGGPNFGSTVSEKIPTDFYN
mRNA Sequence
ATGCAGGCAGTTTCCAGGAGACTAGTCCAACGTCCCCTCGGCGGAGGAGCTTCGATCTATTCGTCGTCTT
CTATCAGATCGCTCTATGGAGTCTCCGATCACCACCTGAATGGAGCTGATAACCGTCGATACTCGTCCTC
CCTTGCTACAAAGGGCGTGGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCTTCCGTCAGTGGCATT
GTAGCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAGCTTGCTAAAATGGGAT
CACAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCAGAGGACAATCCTCGACATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGG
ACAGGTAGTACCGATGAAATTTGATCCAAGAGATGAAGACTCGATTAAGGCCGTCATGGCAAAGGCTAAT
GTCGTTATCAATCTAATTGgaagagagtacgagaccagaaatttcagtttcaaaggtgaatcatcacatg
gccgagaaacttgcaTTGGTGGCCAAAGAACATGGTGGGATAATGAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGA
AGCTGTCTTGAACGCGCTGCCTGAGGCGACAGTGATGAGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGA
ATCTTGAACCCCTGGGCAATGTTCGTTAAAAAATATGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGGACCAACA
AATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTTGCTGCAGCAATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGATGGCTCCAG
CATGGGGAAAACCTATGAATTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCACGATTTGGCAGAGATCATGTTT
GATATGATTCGTGAATGGCCTCGATATGTGAAGCTTCCGTTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTCCTC
GGGATTTCATGGTGAACAAAGTCCCGTTCCCTCTACCCTCTCCCCAGATATTCAATCTGGATCAAATCAA
TGCCCTTACAACCGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACGTTTCAGGATTTGGACCTTGTCCCTCAT
AAATTGAAGGGATATCCAGTCGAGTTTCTTATCCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAACTTCGGTTCCACTG
TCAGTGAAAAGATACCAACAGACTTCTACAATTGA