BrassicaPanDB

CDS Sequence (231 bp)

ATGGTTAGGGCTCTTATGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTTAATATGAATCTCGTAACATTTGCTG
ATTGTTTTGATAATTCCCAACTAAAAGGGGATATTTTCTCCATTTTTGTTATAGCAATTGCAGCCGCTGA
AGCAGCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAACAGAAAATCAACTCGCATCAACCAATCG
ACCTTATTAGATAGGTAG

Upstream Sequence

ATGGTTAGGGCTCTTATGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTTAATATGAATCTCGTAACATTTGCTG
ATTGTTTTGATAATTCCCAACTAAAAGGGGATATTTTCTCCATTTTTGTTATAGCAATTGCAGCCGCTGA
AGCAGCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAACAGAAAATCAACTCGCATCAACCAATCG
ACCTTATTAGATAGGTAG

Downstream Sequence

GCATAAATCAAAAATGATAGGTTTAAATTTGCATATATGATAAATGAGTTACTATATTAA
ATTTGTGAAAATCTAAGAAATCAAAGTATTTTAGCCCCATTTTTTACCAATTGAGCCAGA
ATTGATTAAAAAAATTTTATTAAAGGAAATCATTGCTTCATCTAGTATTTTAATTTAATA
TATCATTTAGTTATAGGTTTACTAAATTGAAAATTTATGACATTAAAAAAATTATAGATC
CTATGTCACATTCAGTAAAAATTTATGATACATGTATAGGATGTACTCAGTGTGTCCGAG
CATGTCCTACAGACGTATTAGAAATGATACCTTGGGATGGATGTAAAGCTAAGCAAATAG
CTTCTGCCCCAAGAACCGAGGATTGTGTTGGTTGTAAGAGATGTGAATCTGCCTATCCAA
CGGATTTTTTGAGAATTCGAGTTTATTTATGACATGAAACAACTCGAAGCATGGGTCTAG
CTTATTGATACGTTACCGAAAACCTAATTTGAATAAATTTGGAATACATTTTTTTTTATT
GACAAGTACTCGTACTCAAAAAAGTTCAATTATATTTTTTATTTATATATTTTTTTGAGT
AGCGTTCTTTGGACCTGGTGTATCTTGTCTTTACCACGAATGATTTTCCTTGGTTAGCAA
TATTTGTTGTTTTTCCAATATCTGCCGGTTCATTAATGTTATTTCTCCCGTGTAGGGAAA
ATAAAGTTAATAAGTGGTATACTATATGCATTTGTATTTTAGAACTTCTTCTAACGACTT
ATGCTTTTTGTTATAATTTTAAACTGGACGATCCATTATTTCAACTGTCCGAATATTATA
AATGGATCATTTTTTTTATTGGAGACTGGGAATAGATGGACTTTCTATAGGAATGATTTT
ACTGACCGAATTTATTACTACTTTAGCTACTTTAGCGGCTTTTCCAGTTACTTGGGATTC
CCGATTATTCTATTTCCTGATGTTAGCAATGTACAGCGGCCAAATATGATCATTTTCTTC
TCGGGATATTTTACTTTTTTCATCATGTGGGAATTAGAATTAATTTCCGTTTATCTCCTT
TTATCCATGTGGGGTGGAAAGAAACGTTTGTATTCAGCTACAAAATTTATTTTATACACT
GCAGGAAGTTCTATTTTTATTAATAGGAGTTTTACGTAGAAGTTTATATCGTTAGAACGA
ACCAACATTAAATTTAGAACGATTAGGGAATCAAGCCTATCCGGTCACACTTGAAATACT
ATTTTATATTGGATTTTTTATTGCTTTTGCCGCAAATCACCGATTATACCTTTACATATT
TGGTTACCTGACACCCACGGCGAGGCAAATTACAGTACATGTATGCTTCTCGCTGGAATC
TTATTGAAAATGGGAGCATATGGATTGGTTCGAATCAATATGAAATTATTACCTCAAGCT
CATTCTATGTTTTCTCCTTGGTTGATGGTAGTCGGTACAATCCAAATAATTTATGCAGCT
TCAACATCTCCAGGTCAATGTAATTTAAAAAAGAGAATAGCCAATTCTTCTGTATCTCAC
ATGGGTTTTATAATTATACGTATTGGTTCTATAACAGATCATGGGCTTAATGGAGCTATT
TTACAAATAATCTCTCATGGATTTATTGGCGCTGCACTTTTTTCTTGGCAGAAACTAGTT
ATGATAGAATCCGGCTTGTTTATCTTGATGAAATGGGTGGAATGGCTATCTTCATTCCAA
AGATATTTACAATGTTCACTATCTTATCGATGGTTTCCCTTGCATTACCGGGCACGAGTG
GTTTTGTTGCAGAATTAATCGTTTTTTTGGAATAATTACCAGCCAAAAATATTTCTTAAT
TTCAAAAATTTTAATTATTTTTGTAATGGCAATTGAAATGATATTAACTCCTATATATTT
ATTATCTATGTCACGTCAAATGTTTTATGGATACAAGTTAATTAATGCTAAAAACTTTTT
TTTTTTTTGATTCTGGACCC

Pro Sequence

MVRALMCLELILNAVNMNLVTFADCFDNSQLKGDIFSIFVIAIAAAEAAI
GLAIVSSIYRNRKSTRINQSTLLDR

mRNA Sequence

ATGGTTAGGGCTCTTATGTGCCTTGAACTTATACTCAATGCAGTTAATATGAATCTCGTAACATTTGCTG
ATTGTTTTGATAATTCCCAACTAAAAGGGGATATTTTCTCCATTTTTGTTATAGCAATTGCAGCCGCTGA
AGCAGCTATTGGATTAGCTATAGTCTCGTCAATTTATCGTAACAGAAAATCAACTCGCATCAACCAATCG
ACCTTATTAGATAGGTAG

Genome:
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KOG E-value:	7.520000e-31
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KOG Annotation:	Energy production and conversion
Biological Process:	GO:0042773(ATP synthesis coupled electron transport)
Cellular Component:	-
Molecular Function:	GO:0016651(oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H)
KEGG Ortholog:	-
NR Protein:	YP_005090005.1
NR E-value:	5.600000e-28
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NR Annotation:	YP_005090005.1 ndhE gene product (chloroplast) [Brassica napus]
SwissProt Protein:	A4QL73\|NU4LC_DRANE
SwissProt E-value:	2.680000e-32
SwissProt Score:	110.0
SwissProt Annotation:	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic OS=Draba nemorosa OX=171822 GN=ndhE PE=3 SV=1

DETAIL

Detail for ZS11_C09G25020.t1

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